1 莱布尼茨神经生物学研究所,学习和记忆遗传学系,马格德堡,39118,德国,2 莱比锡大学生物研究所动物生理学系,莱比锡,04103,德国,3 莱比锡大学生物研究所遗传学系,莱比锡,04103,德国,4 魏茨曼科学研究所分子细胞生物学系,雷霍沃特,7610001,以色列,5 亚琛工业大学成像和计算机视觉研究所,亚琛,52074,德国,6 波多黎各大学医学科学园区神经生物学研究所,旧圣胡安,波多黎各,00901,7 剑桥大学生理学、发育和神经科学系,剑桥,CB2 3EL,英国,8 珍妮莉亚研究园区,霍华德休斯医学研究所,阿什本, 20147,弗吉尼亚州,9 莱布尼茨神经生物学研究所,组合神经影像核心设施,马格德堡,39118,德国,10 加利福尼亚大学,分子,细胞和发育生物学系,加利福尼亚州洛杉矶 90095-1606,11 巴黎萨克雷大学,国立科学研究中心,巴黎萨克雷神经科学研究所,萨克雷,91400,法国,12 行为脑科学中心,马格德堡,39106,德国,13 奥托冯格里克大学生物学研究所,马格德堡,39120,德国
摘要 精确确定大脑细胞类型的数量和身份是详细概述中枢神经系统 (CNS) 基因和蛋白质表达的先决条件。然而,目前仅对秀丽隐杆线虫的神经系统实现了细胞数量的严格量化。本文,我们描述了一种协同分子遗传、成像和计算技术流程的开发,旨在实现高通量、精确定量,并以细胞分辨率对具有复杂细胞结构的完整组织(如大脑)中的基因表达报告基因进行定量。我们已采用该方法精确确定整个完整的果蝇幼虫 CNS 中的功能性神经元和神经胶质细胞的数量,结果发现神经元数量比之前预测的要少,神经胶质细胞数量要多。我们还发现在这个幼虫发育阶段,两性之间存在意想不到的差异,雌性 CNS 的神经元数量明显多于雄性。对我们的数据的拓扑分析表明,这种性别二态性延伸到 CNS 组织的更深层特征。我们还扩展了分析范围,以量化整个中枢神经系统中电压门控钾通道家族基因的表达,并发现丰度方面的巨大差异。我们的方法能够可靠而准确地量化完整器官内细胞的数量和定位,从而促进对细胞身份、多样性和基因表达特征的复杂分析。
摘要 扩大可用于蛋白质可视化和操作的试剂库将有助于了解其功能。与目标蛋白质相连并被现有结合剂(如纳米抗体)识别的短表位标签有助于进行蛋白质研究,因为无需分离针对它们的新抗体。纳米抗体比传统抗体有几个优势,因为它们可以表达并用作体内蛋白质可视化和操作的工具。在这里,我们描述了两个短(<15aa)纳米标签表位 127D01 和 VHH05,以及它们相应的高亲和力纳米抗体。我们展示了它们在果蝇体内蛋白质检测和重新定位、直接和间接免疫荧光、免疫印迹和免疫沉淀中的应用。我们进一步表明,CRISPR 介导的基因靶向提供了一种用纳米标签标记内源性蛋白质的直接方法。纳米标签的单个副本,无论其位置如何,都足以进行检测。这种多功能且经过验证的标签和纳米抗体工具箱将作为广泛应用的资源,包括果蝇及其他物种的功能研究。
图2。堆栈条形图的细胞命运倾向(ISC),肠和基础隔室,肠细胞(EBS)和肠细胞(EC)(ECS)中的肠道干细胞(ISC)表示。(a)ISC - apical细胞采用九种不同的细胞命运,而在三个环境条件下仍然没有表征。在正常条件下,观察到挤压的最高倾向,然后按顺序进行细胞凋亡,增殖和EB命运。在压力的情况下,最高的倾向是挤出,其次是EB命运和增殖。在癌症中,最高的倾向是多层的倾向,其次是细胞凋亡和挤压。(b)ISC – Basal采用九种不同的细胞命运,在正常条件下,EE命运的倾向最高,在癌症情况下,在压力条件下凋亡,而在癌症,多层和凋亡的倾向上显示出最高的倾向。(c)EB中的七个细胞命运,在正常情况下挤出,压力凋亡和癌症多层的倾向最高。(d)EC中的五个细胞命运,在正常,压力和癌症条件下,DPP产生的倾向最高。
Hanadi Chammout 1、Delia L. Adkins 2、Aleece K. Al-Olimat 2、Zeinab Alsaad 1、Beatrice M. Altopp 3、Tuqa Amer 3、Feyi O. Apampa 3、Gwendolyn R. Avery 2、Isaac I. Bazzi 1、Emilia D. Beck 2、Elise L. Beier 3、B. Shafer Belisle 3、Lane Benton 2、Madison M. Bolyard 2、Olivia E. Brain 2、Eldon T. Buckner 2、Shria Roy Chowdhury 1、Jennifer R. Cifranic 2、Liam Cleary 3、Tyler R. Clum 2、Autumn M. Cruz 2、Meghan V. DeGray 3、Isabel L. Echeverry 3、 Haya El dana 1 、 Sarah K. Elkadri 1 、 Paige L. Estep 2 、 Luke R. Falke 2 、 Hannah J. Foor 2 、 Anika S. Gullapalli 1 、 Sandro S. Hakim 1 、 Hussein B. Hazime 1 、 Lauren E. Heininger 2 、 Emma G. Hoeft 2 、 Lauren M. James 2 , Yeowon Jeon 1 , Megan R. Johnson 2 , Laine P. Jordan 2 , Zayd Khan 1 , Sydney K. Kochensparger 3 , Fadi J. Koria 1 , Ruby M. Krasnow 3 , Veronica Lilly 2 , Eileen Lim 3 , Ian T. MacCormack 3 , Andriy Malesh 3 , Mikayla G. Mariano 2、奥黛丽·C·门策2、Katelyn H. Messner 2、Katlyn C. Myers 2、Emily R. Newman 3、Annie M. Richters 2、Liliana Romero 1、Adam Rotem 3、Reese J. Saho 2、Kaname Sawaki 2、Ashley N. Selders 2、Elizabeth Shockney 2、Farah A. Sobh 1、Isabelle F. Speiser 3、Breanna M. Sproul 2、Veronica J. Sroufe 2、Antonia Tollkuci 3、Cassandra C. Trevino 3、Megan A. Vapenik 2、Erin M. Wagner 2、Kayla L Bieser 4、Jamie L. Siders 2、Justin R. Thackeray 3、Jacob D. Kagey 1§
越来越明显的是,肠道中的无数微生物在细胞内并附着在身体部位(或植物的根)上,对宿主起着至关重要的作用。尽管这已知数十年,但分子生物学的最新发展允许扩大对这些微生物的丰度和功能的洞察力。在这里,我们使用了醋果蝇果蝇(Drosophila Melanogaster),研究了整个苍蝇的适应性度量,分别喂养了从年轻或老蝇中收获的肠道微生物的悬浮液。我们的假设是,苍蝇具有“年轻微生物组”的组成性丰富,在老年时会更长,更敏捷(即的健康状态增加。我们的研究中传来了三个主要的回家信息:(1)年轻蝇和老蝇的肠道微生物群都有明显不同; (2)用年轻和老年微生物组的喂食果蝇改变了受体苍蝇的微生物组,(3)两种不同的微生物饮食对运动运动的活性或受体蝇的寿命没有任何影响,这与我们的工作假设相矛盾。结合在一起,这些结果为宿主与其微生物组之间的相互作用提供了新的见解,并清楚地表明,肠道移植和益生菌的表型作用可能是复杂的,不可预测的。
经历了最大的变化,因为它们与38天大的苍蝇明显分离。年龄被认为是解释组之间的差异(Anosim,p <0.001,r = 0.6281)的最重要因素,而不是对观察到的差异显示影响的饲料(p = 0.429,r = 0.0013)(图2a)。年龄相关的分离似乎是在样品中的几个属的特征2b)。这两个时间点的大多数样品与大多数观察到的OTU一起吸引了Origo,这表明潜在的共享组成。3.2。微生物富集可以调节衰老蝇中的微生物组组成。
非纤维甜味剂(NNS),非热甜味设备,已被广泛商业化以减少糖消耗。这种意图与健康益处相关联,尽管报告与这些替代品与非传染性疾病的消费相关。缺乏对这些相互作用的更广泛含义(例如对寿命)的更广泛含义的研究,例如缺乏研究。这项研究的目的是比较三个最近经FDA批准的NNS-Acesulfame-Potassium(ACE-K),Stevia和Monk Fruit的影响,对Drosophila Melanogaster的生存,这是一种寿命研究的模型,用于寿命研究,以发现对人类寿命的可能影响,并进一步影响了人类的使用,并具有对他们的使用,以及他们的用途。可以假设,如果将D. melanogaster喂食这三个NN,则用ACE-K喂养的人将具有最低的生存率,因为ACE-K与微生物失调有关,这与寿命降低有关。将15个男性和女性同步蝇分配给含有甜味剂的小瓶中,并以蔗糖作为对照为基础饮食。幸存者每三到四天记录32天。每种饮食的存活率显着低于对照,并且使用ACE-K,χ2(9,n = 240)= 244.2,p ﹤.00001最明显。试验期一半(第15天)之间的饮食之间的生存也有显着差异,χ2(3,n = 240)= 78.3,p ﹤.00001。11葡萄糖控制,胰岛素反应和具有长期健康影响的代谢受到饮食选择的严重影响。ace-k对D. melanogaster的寿命产生了不利影响,这表明这种甜味剂在人类中的潜在并行作用。引言不健康的饮食是美国发病率的主要危险因素,在2017年,国际上有1100万人死亡是营养因素不良的结果,例如食用热浓密的食物。12,例如,糖消耗的流行率与代谢综合征的发展,包括2型糖尿病,肥胖,高血压和心血管疾病有关。19糖的摄入还可能通过产生炎症性细胞因子而导致慢性炎症,这可以进一步增加对非传染性疾病的敏感性。3在2017 - 2018年,美国人平均每天消耗17茶匙糖,超过了世界卫生组织提供的最大摄入量建议。19
研究 [12–15],这使得拟谷盗成为比较遗传学、分子生物学、进化和发育等不同生物过程的绝佳模型 [2, 10, 11]。鉴于果蝇的衍生生物学,拟谷盗也
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