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全基因组CRISPR-CAS9屏幕显示
Olivier Petitjean，Erika Girardi，Richard Patryk Ngondo，Vladimir Lupashin，SébastienPfeffer。全基因组CRISPR-CAS9筛查揭示了乙par硫酸盐途径和保守的低聚高尔基复合物对合成DSRNA摄取和信德氏病毒感染的重要性。2020。hal-03003129
Streamline your discovery with premade mRNAs
TriLink's premade mRNAs are manufactured following leading-edge in vitro transcription (IVT) processes such as our CleanScript™ method, reducing double-stranded RNA (dsRNA) levels and enhancing in vivo protein expression. To provide confidence in using our mRNAs, standard analytical tests are performed and provided on their certificates of analysis.
抑制 DNA 甲基化和 RNA 编辑可上调免疫原性 RNA，从而改变肿瘤微环境并延长卵巢癌患者的生存期
摘要 背景 卵巢癌 (OC) 是女性第五大致命癌症，迫切需要新型疗法。临床前研究表明，DNA 甲基转移酶抑制剂 (DNMTis) 可以逆转 OC 中的免疫抑制肿瘤微环境。抑制 DNA 甲基转移酶可激活双链 (ds)RNA 的转录，包括转座因子。这些 dsRNA 激活细胞质中的传感器并触发 I 型干扰素 (IFN) 信号传导，招募宿主免疫细胞杀死肿瘤细胞。腺苷脱氨酶 1 (ADAR1) 由 IFN 信号传导诱导，并通过 A 到 I 核苷酸变化编辑哺乳动物 dsRNA，这在测序数据中读取为 A 到 G 的变化。这些编辑后的 dsRNA 无法被 dsRNA 传感器感知，因此 ADAR1 在负反馈回路中抑制 I 型 IFN 反应。我们假设减少 ADAR1 编辑将增强 DNMTi 诱导的免疫反应。方法用 DNMTi 体外处理人类 OC 细胞系，然后进行 RNA 测序以测量 RNA 编辑。Adar1 在 ID8 Trp53 -/- 小鼠 OC 细胞中被稳定敲低。用模拟或 DNMTi 处理测试对照细胞 (shGFP) 或 shAdar1 细胞。使用流式细胞术对肿瘤浸润免疫细胞进行免疫表型分析，并分析细胞培养上清液中分泌的趋化因子/细胞因子。给小鼠注射同源 shAdar1 ID8 Trp53 -/- 细胞并用四氢尿苷/DNMTi 处理，同时每 3 天给予抗干扰素 α 和 β 受体 1、抗 CD8 或抗 NK1.1 抗体。结果我们表明，在体外 DNMTi 处理后，ADAR1 会编辑人类 OC 细胞系中的转座因子。与单独干扰相比，将 ADAR1 敲低与 DNMTi 相结合可显著增加促炎性细胞因子/趋化因子的产生和对 IFN- β 的敏感性。此外，DNMTi 治疗和 Adar1 缺失可减轻肿瘤负担并延长 OC 免疫功能正常的小鼠模型的生存期。将 Adar1 缺失和 DNMTi 相结合可引发最强大的抗肿瘤反应，并通过增加 CD8+ T 细胞的募集和激活来改变免疫微环境。
农业发展基金 (ADF) 作物项目 2025
• 该项目旨在测试基于 dsRNA 的杀菌剂在田间试验中控制镰刀菌穗枯病 (FHB) 的有效性。它还将评估这些杀菌剂对作物产量的影响。研究人员将测量影响 FHB 发展和杀菌剂有效性的因素。此外，该项目将确定 dsRNA 分子在田间条件下的持续时间，并致力于改善其输送。 • 预期结果是一种可以商业化用于控制 FHB 的基于 RNA 的杀菌剂。共同资助方：艾伯塔谷物、曼尼托巴作物联盟、萨斯喀彻温省小麦发展委员会、西部谷物研究基金会 ADF 资助：320,000 美元 谷物和豆类疾病中的燕麦镰刀菌毒素和毒力因子 - 旨在改进缓解策略。（20240704）首席研究员：Nora Foroud，加拿大农业和农业食品部
从荷兰角度看生物农药的监管
– 在荷兰至少有一种新用途 – 所有活性物质至少属于以下类别之一：• 低风险物质（包括基于 COM 清单 2018 的初步 LR）• 活微生物• 信息素• 其他非化学 PPP，不包括具有广谱毒性的 PPP（例如，可能包括 dsRNA、肽和无毒植物提取物或其他无毒生物物质）• 注意：区域应用的摄入量限制（仍然）有效
SUMO对神经系统发展的控制
摘要：虫害在全球农业生产中的主要限制因素之一。除了对农作物的直接作用外，一些植物昆虫是植物性疾病传播的有效载体。需要大量的常规杀虫剂才能在全球范围内确保粮食生产，并对经济和环境产生很大影响，尤其是当有益的昆虫还受到经常缺乏所需特殊特定院子的化学物质的影响时。RNA干扰（RNAi）是一种自然机制基因表达调控，并保护包括昆虫在内的大多数真核生物中存在的外源性和内源性遗传元件。双链RNA（DSRNA）或高度结构化RNA的分子是细胞酶的底物，可产生几种类型的小RNA（SRNA），在靶向转录或转录后基因沉积物的靶向序列中起着至关重要的作用。基于RNAi调节的基础的相对简单规则，主要基于Watson -Crick互补性，具有基于这些细胞机制的生物技术应用。这包括使用工程的DSRNA分子的承诺，即在农作物植物中生产的内源性或外源合成并应用于农作物上，作为新一代高度特定，可持续和环保杀虫剂的新一代。在这一期望下，本文回顾了有关昆虫中RNAi途径的当前知识，以及其他一些应用的问题，例如重组RNA的生产和交付，这对于将RNAi建立为作物植物中昆虫控制的可靠技术至关重要。
编辑的作用是什么？了解腺苷脱氨酶作用于 RNA 的 A-to-I RNA 编辑的生理功能
腺苷到肌苷 (A-to-I) 编辑是一种 RNA 转录后修饰，可改变其序列、编码潜力和二级结构。在作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 蛋白 ADAR1 和 ADAR2 的催化下，A-to-I 编辑发生在小鼠的约 50 000 – 150 000 个位点上，而人类的位点则达到数百万个。绝大多数 A-to-I 编辑发生在重复元素中，这解释了物种间位点总数的差异。ADAR1 在哺乳动物中编辑的主要物种保守作用是抑制未编辑的细胞来源的内源性 RNA 引起的先天免疫激活。在没有编辑的情况下，反向配对序列（例如 Alu 元素）被认为会形成稳定的双链 RNA (dsRNA) 结构，从而触发 dsRNA 传感器（例如 MDA5）的激活。一小部分编辑位点位于编码序列内，并且在后生动物中进化保守。已证明 ADAR2 编辑对于大脑神经递质受体的重新编码具有生理重要性。此外，RNA 编辑的变化与各种病理状态有关，从严重的自身免疫性疾病 Aicardi-Goutières 综合征到各种神经发育和精神疾病以及癌症。但是，检测到编辑位点是否意味着功能重要性？人类和转基因小鼠模型中的遗传学研究以及进化基因组学已开始阐明 A-to-I 编辑在体内的作用。此外，最近的发展表明在癌症等病理条件下编辑可能具有不同的功能。
引文：Rathore, S.、Hassert, J.、Clark-Hachtel, CM、Stahl, A.、Tomoyasu, Y.、Bushbeck, EK RNA 干扰在水生甲虫中作为一种强大的工具
RNA 干扰 (RNAi) 仍然是一种强大的技术，可通过 mRNA 降解来有针对性地减少基因表达。该技术适用于多种生物，在物种丰富的鞘翅目 (甲虫) 中非常有效。在这里，我们总结了在新生物中开发该技术的必要步骤，并说明了它在水生潜水甲虫 Thermonectus marmoratus 的不同发育阶段中的应用。可以通过针对已知基因组的近亲或从头组装转录组来经济高效地获得目标基因序列。候选基因克隆利用特定的克隆载体 (pCR4-TOPO 质粒)，该载体允许使用单个通用引物为任何基因合成双链 RNA (dsRNA)。合成的 dsRNA 可以注射到胚胎中用于早期发育过程，也可以注射到幼虫中用于后期发育过程。然后，我们说明如何使用琼脂糖固定将 RNAi 注射到水生幼虫中。为了演示该技术，我们提供了几个 RNAi 实验示例，生成具有预测表型的特定敲低。具体来说，晒黑基因 laccase2 的 RNAi 会导致幼虫和成虫的角质层变浅，而眼色素沉着基因 white 的 RNAi 会导致眼管变浅/缺乏色素沉着。此外，关键晶状体蛋白的敲低会导致幼虫出现视力缺陷和捕猎能力下降。综合起来，这些结果体现了 RNAi 作为一种工具的强大功能，可用于研究仅具有转录组数据库的生物体的形态模式和行为特征。
AccuBlue® 宽范围 RNA 定量试剂盒
该试剂盒非常适合定量 RNA，用于下一代测序 (NGS) 或逆转录 PCR (RT-PCR) 等敏感应用。与基于吸光度的测量不同，RNA Broad Range Dye 对 RNA 的选择性高于双链 DNA (dsDNA)，并且可以耐受样品中等摩尔量的 dsDNA，而不会对 RNA 定量产生显著影响（图 4）。仍然建议使用纯化的 RNA 样品。该测定还可用于定量小 RNA，例如 miRNA（图 5）以及单链 DNA (ssDNA)，尽管与 RNA 相比，ssDNA 发出的荧光信号较低（图 6）。与总 RNA 相比，该测定对 dsRNA 发出的信号非常低（图 7）。