图3。(Ferrante等人2022)用于环境DNA(EDNA)数据提交并显示在美国地质调查局非土著水生物种(NAS)数据库中。粗体文本表示申请人填写的需要在线表格。虚线下方描述了合作机构的通知(申请人代表的实体允许),该通知可能发生在其管辖范围内。计划的左侧显示了未获得批准的申请的过程,而右侧显示了被批准的申请的结果。合作伙伴机构包括在检测区域具有管辖权的地方,部落,州和/或联邦机构。
fi g u r e 2上升后生阿尔法和β多样性模式。(a)在每个深度区域和采样位置,海洋后生动物门的相对读取丰度。(b)香农多样性指数(H')和(c)在所有四个深站组合的每个深度区域的SRS的物种丰富度标准化的Motus数据。Tukey的HSD成对比较与Tukey调整后的P值进行了比较。*表示<0.05的显着差异,****表示显着差异<0.001。(d)基于jaccard距离的Motus社区结构(K = 2)的非线性多维标度。颜色表示海洋区,点形表示站点,地块上显示的应力值。深度区域被定义为上皮(0-99 m),下层(100-200 m),中质质量(201-1000 m)和浴类质(> 1000 m)。
fi g u r e 7在分类级别的海港和储备社区的比较。位点得分(左)和物种得分(右)图代表了由空间坐标来调节的两个第一个DBRDA轴,测试了栖息地对jaccard/bray -curtis距离的影响,在汇集重复和组合所有MOTU(从MOTU级别到订单的重要性);Jaccard差异指数是在MOTU级别(a)计算的,而Bray -Curtis的差异基于MOTU的丰度用于家庭(B)和订单(C)水平。显示出促成约束轴的最高10%分类单元。中,只有那些具有高于97%的分配身份的人才能保持在MOTU级别。SMM,Saintes-Maries-de-la-Mer。
csir-Center用于蜂窝和m“环境DNA(EDNA)A大学/学院/工业和药物科学和药物科学和相关AR应用,用于各种培训,仪器设置,数据C
Meyer, RS、Ramos, MM、Lin, M.、Schweizer, TM、Gold, Z.、Ramos, DR、Shirazi, S.、Kandlikar, G.、Kwan, W.、Curd, EE、Freise, A.、Parker, JM、Sexton, JP、Wetzer, R.、Pentcheff, ND、Wall, AR、Pipes, L.、Garcia-Vedrenne, A.、Mejia, MP、Moore, T.、Orland, C.、Ballare, KM、Worth, A.、Beraut, E.、Aronson, EL、Nielsen, R.、Lewin, HA、Barber, PH、Wall, J.、Kraft, N.、Shapiro, B. 和 RK Wayne。2021 年。《CALeDNA 计划:公民科学家和研究人员清查加州的生物多样性》。加州农业。 https://doi.org/10.3733/ca.2021a0001
细胞和分子生物学的 csir中心应针对来自大学/机构/工业的教职员工/研究人员,以及在生命科学领域,医学科学,药学科学和盟军领域的教师/研究人员进行的“环境DNA(EDNA)及其应用”的动手培训。此培训旨在培训有关EDNA的基础知识及其在各种实验中的研究中的基础知识。它将补充有信息的讲座,培训,仪器设置,数据收集和分析。
DNA(图):https://commons.wikimedia.org/wiki/file:dna_double_helix_%2813081113544%29.jpg edna(dugram): https://tos.org/oceanography/assets/images/content/ocean-observing-2023-govindarajan-f3.jpg ROVs (image): https://nautiluslive.org/album/2021/02/08/exploring-worlds-ocean-rov-hercules#&gid=1&pid=8 AUVs (事实说明):https://oceanexplorer.noaa.gov/edu/materials/auv-fact-sheet.pdf自动抽样器(网页):https://wwwww.aoml.noa.noa.gov/new--eedna-sammpling-upgrade/new-edna-sammpling-upgrade/------ https://oceanexplorer.noaa.gov/okeanos/explorations/seascape-alaska/ex2303/media/interns-edna-hires.jpg efferters(Image): https://www.fisheries.noaa.gov/s3/styles/media_500_x_750/s3/2022-06/304x-4032-done-with-filtration-2022-2022-nefsc.png flsc.png dgs.png beng dgs fristual Suspects(WebPage): https://www.whoi.edu/oceanus/feature/Round-the-the-unusual-suspects/
。cc-by-nc 4.0国际许可(未获得同行评审证明),他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2024年1月17日。 https://doi.org/10.1101/2024.01.16.575835 doi:biorxiv preprint
11:00-11:45:计划,抽样和理解您的结果。 艾莉森·瓦茨(Alison Watts),新罕布什尔大学。 11:45-13:00:在您自己的13:00-13:30上午餐:使用环境DNA MetabarCoding评估Chesapeake湾的脊椎动物生物多样性。 劳伦·罗德里格斯(Lauren Rodriguez),因斯布鲁克大学。 13:30-14:00:使用Edna对底栖大型无脊椎动物进行采样的见解。 罗伯特·希尔德布兰德(Robert Hilderbrand),马里兰大学环境科学中心。 14:00-14:15:下午休息14:15-14:45:切萨皮克湾条形码倡议和无效的鱼监测。 Matthew Ogburn,史密森尼环境研究中心。 14:45-15:30:圆桌讨论和总结。 讨论以确定数据需求,方法论挑战,新应用程序,采购这些分析服务时要询问的问题。 15:30:休会11:00-11:45:计划,抽样和理解您的结果。艾莉森·瓦茨(Alison Watts),新罕布什尔大学。11:45-13:00:在您自己的13:00-13:30上午餐:使用环境DNA MetabarCoding评估Chesapeake湾的脊椎动物生物多样性。 劳伦·罗德里格斯(Lauren Rodriguez),因斯布鲁克大学。 13:30-14:00:使用Edna对底栖大型无脊椎动物进行采样的见解。 罗伯特·希尔德布兰德(Robert Hilderbrand),马里兰大学环境科学中心。 14:00-14:15:下午休息14:15-14:45:切萨皮克湾条形码倡议和无效的鱼监测。 Matthew Ogburn,史密森尼环境研究中心。 14:45-15:30:圆桌讨论和总结。 讨论以确定数据需求,方法论挑战,新应用程序,采购这些分析服务时要询问的问题。 15:30:休会11:45-13:00:在您自己的13:00-13:30上午餐:使用环境DNA MetabarCoding评估Chesapeake湾的脊椎动物生物多样性。劳伦·罗德里格斯(Lauren Rodriguez),因斯布鲁克大学。13:30-14:00:使用Edna对底栖大型无脊椎动物进行采样的见解。 罗伯特·希尔德布兰德(Robert Hilderbrand),马里兰大学环境科学中心。 14:00-14:15:下午休息14:15-14:45:切萨皮克湾条形码倡议和无效的鱼监测。 Matthew Ogburn,史密森尼环境研究中心。 14:45-15:30:圆桌讨论和总结。 讨论以确定数据需求,方法论挑战,新应用程序,采购这些分析服务时要询问的问题。 15:30:休会13:30-14:00:使用Edna对底栖大型无脊椎动物进行采样的见解。罗伯特·希尔德布兰德(Robert Hilderbrand),马里兰大学环境科学中心。14:00-14:15:下午休息14:15-14:45:切萨皮克湾条形码倡议和无效的鱼监测。 Matthew Ogburn,史密森尼环境研究中心。 14:45-15:30:圆桌讨论和总结。 讨论以确定数据需求,方法论挑战,新应用程序,采购这些分析服务时要询问的问题。 15:30:休会14:00-14:15:下午休息14:15-14:45:切萨皮克湾条形码倡议和无效的鱼监测。Matthew Ogburn,史密森尼环境研究中心。14:45-15:30:圆桌讨论和总结。讨论以确定数据需求,方法论挑战,新应用程序,采购这些分析服务时要询问的问题。15:30:休会
图3。NEDNA™制造过程。NEDNA™制造过程依赖于不同的酶促和纯化步骤:PHI29聚合酶对前体模板的滚动圆扩增(RCA),通过限制性酶处理前体主链处理,通过teln ProteLomerase和Exonual unucual dna的限制性闭合,并通过exonuluclease semaval闭合。该过程包括色谱和切向流过滤(TFF),以消除酶和DNA残差。