在自然界中越来越多的抗生素抗性菌株选择,寻找替代性抗菌策略的搜索变得越来越重要。肠球菌CUS粪cv167是本公告中突出的菌株,已经证明了对各种病原体的体外活性,包括金黄色葡萄球菌,表皮球菌,apisterpococcus agalactiae,链球菌,链球菌Uberis uberis uberis,coliica coli coli coli coli coli,使用斑点测定法(1)的抑制活性结果如图1。该细菌是从2022年2月在巴西米纳斯Gerais的Coronel Xavier Chaves的牛奶罐中存储在散装牛奶箱中的原始牛奶样品中分离出来的。用于细菌分离,将1 ml等分试样的牛奶样品串联在磷酸盐缓冲溶液(pH 6.2; Merck,德国)中串联稀释(10°至10°),并将100 µL铺在M17琼脂(美国Sigma-Aldrich,USA)上。在35°C下孵育48小时后,将分离的细菌菌落条纹划分到新鲜的M17琼脂上以进行纯化。分离株指定的CV167被识别为无氧化氢酶活性的革兰氏阳性球菌。然后使用苯酚 - 氯仿法提取细菌的DNA(2)。使用Nanodrop 1000 UV/VIS(Thermo Scientific,Massachusetts,EUA)评估了DNA数量和质量,并使用Illumina DNA Prep套件制备了测序文库。使用Illumina NextSeq 2000平台上的300 bp配对末端测序对DNA进行了测序,从而产生了1,169倍的序列深度。修剪过程导致仅删除1.37%的读数。确认fastQC 0.12.1(3)最初用于评估测序数据的质量,该质量总共产生了11,863,824读。这些读取使用三型0.39(4)进行修剪,并具有以下参数:尾随:10;领导:10;滑动窗口:4:20;最小长度为50 bp。使用黑桃3.15.4(5)进行简短读数的从头组装,将覆盖范围参数设置为“自动”,而K-Mers则将21、33、55、77、99和127。较短的重叠群从最终组装中排除了500 bp。使用Quast 5.2.0(6)评估组装质量。总共产生了61个重叠群,合并长度为2,736,418 bp,鸟嘌呤 - 环氨酸(GC)含量为37.93%,N50的N50为156,530。基因组完整性,揭示了杆菌类的完整性99.3%。
肠球菌是肠球菌的成员,由于其潜在的致病性和抗生素耐药性,在水产养殖方面已成为一个重要的关注。这项研究旨在研究从公共鲤鱼(Cyprinus parpio)和罗非鱼(Oreochromis niloticus)中分离出的六种不同的肠球菌物种的分子诊断和表征,并评估了它们的遗传多样性,抗生素抗性谱谱以及潜在的毒素性因子。在分离株中,有65.3%的普通鲤鱼和60.8%的罗非鱼被鉴定为粪肠球菌。所有六个物种都证明了代谢各种碳水化合物的能力,表明代谢能力广泛。某些物种在特定碳水化合物的利用中显示出可变性。例如,粪肠球菌和粪肠球菌具有独特发酵的adonitol,而E. avium和E. hirae是唯一能够发酵D-弧菌醇的人。此外,在粪肠球菌中仅观察到voges-proskauer阳性。在生长条件下,除了粪肠球菌外,所有物种在4°C和45°C的繁殖中都繁殖,而大肠球菌未能在10°C下生长。E.粪便和E.粪便在pH 9.6生长良好。 溶血测试揭示了该物种之间的差异:粪肠球菌显示β-溶解性,而Gallinarum大肠杆菌表现出α-溶解。 仅在gallinarum大肠杆菌中观察到运动,而Esculin水解是粪肠球菌独有的。 环境适应性在物种之间有所不同。 E.鸟在6.5%NaCl中的生长有限,一些物种在0.1%甲基蓝牛奶中几乎没有生长。E.粪便和E.粪便在pH 9.6生长良好。溶血测试揭示了该物种之间的差异:粪肠球菌显示β-溶解性,而Gallinarum大肠杆菌表现出α-溶解。仅在gallinarum大肠杆菌中观察到运动,而Esculin水解是粪肠球菌独有的。环境适应性在物种之间有所不同。E.鸟在6.5%NaCl中的生长有限,一些物种在0.1%甲基蓝牛奶中几乎没有生长。粪肠球菌和大肠杆菌在60°C下显示生存15分钟,粪肠球菌在30分钟时显示出有限的生存率,使它们与其他物种区分开。从巴斯拉市当地养鱼场收集的cyprinus腕牛和尼洛菌分离的菌株被证实为16S rRNA基因测序的粪肠球大肠杆菌。使用特定引物的PCR研究将所有分离株鉴定为粪肠球菌。
粪肠球菌是人类中可以调节宿主免疫1但也获得了抗生素耐药性的一种微生物群,并且是医院相关感染2的主要原因2。值得注意的是,粪肠球菌的多种菌株产生传奇,这是一种高度保守的肽聚糖水解酶,足以促进肠道免疫3 - 5和免疫检查点抑制剂抗肿瘤活性6。然而,粪便中传奇的基本功能尚不清楚。在这里我们报告说,由于肽聚糖的裂解和细胞分离有缺陷,粪便的粪便损害受损,并导致肠球菌膨胀和聚集。此外,δ传奇显示出抗生素敏感性的增加,产生较低水平的活性杂肽,显示出肽聚糖型模式识别受体NOD2的激活降低,并且未能促进癌症免疫疗法。重要的是,基于质粒的传奇表达,而不是其催化活性突变体,恢复了δ传奇的生长,活性杂肽的产生和NOD2激活。传奇对于粪便生长,应激性抗性和宿主免疫的激活至关重要。
纤毛属均成为微生物真核遗传学中的第一个模型系统之一,这在很大程度上有助于早期理解与基因组重排,隐秘形成,细胞质遗传性和内生物植物的多种多样的现象,以及在interns of interns of Small and small and cons of shime and cons of sym and cons of sym and of n os of small and of necne and small and of necne and small。最近在科学和人口基因组学领域取得了实质性进展。Parmecium物种将一些最低的已知突变率与一些已知有效人群以及可能非常高的重组率相结合,从而使人口遗传环境促进了异常有效的选择能力。因此,基因组非常精简,具有很小的基因间区域与少量的微小内含子相结合。大部分黑质研究的主题,古代的aurelia物种复合物,是两个
Pediococcus酸ATCC 8042和粪肠球菌NRRL B-2354被研究为使用热宠物食品等产物中的热死亡时间动力学的沙门氏菌血清射手的潜在替代物。酸性P.酸性ATCC 8042,E。Faeciumnrrl B-2354的D-值和七种与低摩斯疗法产品相关的七种沙门氏菌血清的鸡尾酒,在无防腐剂的干宠物食品中,在9.1、17.9.9和27.0%和27.0%和27.0%和87.7和87.7的湿度水平上,均为9.1、17.0%和87.8 U. C.线性回归。酸性P.酸性ATCC 8042的D值高于沙门氏菌血清鸡尾酒的d-值,但低于粪肠球大肠杆菌NRRL 2354。At 9.1 % moisture, D -values of 6.54, 11.51, and 11.66 min at 76.7 u C, 2.66, 3.22, and 4.08 min at 82.2 u C, and 1.07, 1.29, and 1.69 min at 87.8 u C were calculated for Salmonella serovars, P. acidilactici ATCC 8042, and E. faecium NRRL B-2354分别。数据表明,可以将酸性P.酸性ATCC 8042的热灭活特性用作替代物来预测沙门氏菌在干燥的宠物食品中的响应,这些食品在90 U C.
粪肠球菌129 BIO 3B是一种乳酸细菌,已安全用作益生菌产品已有100多年了。最近,由于某些粪肠球菌属于万古霉素的肠球菌。致病潜力较少的粪肠球菌组已被分为一个单独的物种(乳糖肠球菌)。在这项研究中,我研究了粪肠球菌129 Bio 3b以及粪肠球菌129 BIO 3B-R的系统发育分类和安全性,该含有天然对氨苄西林具有抗性。使用特定基因区域的质谱和基本局部比对搜索工具分析无法将3B和3B-R区分为E.粪肠球大肠杆菌或乳酸菌。然而,成功识别3B和3B-R的多焦点序列与乳酸螺旋体相同。总体基因组相关性指数表明,3B和3B-R与乳酸乳乳酵母具有很高的同源性。用E.乳酸性乳核e物种特异性引物证实了3B和3B-R的基因扩增。氨苄青霉素的最低抑制浓度被证实为3B为2 µg/ml,这是欧洲食品安全局设定的粪肠球大肠杆菌的安全标准。基于上述结果,将粪肠球菌129 Bio 3b和E.粪肠球菌129 BIO 3B-R分类为乳酸菌。除了FMS21之外,没有致病基因的缺乏表明这些细菌可安全用作益生菌。
摘要动物体内的激素信号传导通常涉及直接转录因子-激素相互作用,从而调节基因表达。相比之下,植物激素信号传导最常见的是基于通过转录阻遏物的降解来解除阻遏。最近,我们发现了一种植物激素生长素的非典型信号传导机制,其中生长素直接影响非典型生长素反应因子 (ARF) ETTIN 对靶基因的活性,而无需蛋白质降解。在这里,我们表明 ETTIN 直接结合生长素,导致与 TOPLESS/TOPLESS-RELATED 家族的辅阻遏蛋白分离,随后组蛋白乙酰化并诱导基因表达。这种机制让人想起动物激素信号传导,因为它影响对靶基因的调节活性,并提供了植物中 DNA 结合激素受体的第一个例子。虽然生长素通过促进 Aux/IAA 阻遏物的降解间接影响典型的 ARF,但 ETTIN-生长素直接相互作用允许以可立即逆转的方式在抑制和去抑制染色质状态之间切换。