使用医疗保健数据客观地评估可自由可用的数据分析软件工具的抽象目标。使用公开可用的信息和数据表评估了设计数据分析工具的功能。从初步评估开始,使用1000名患者的合成数据集对医疗保健数据的应用进行了进一步的详细评估,并使用共同的健康数据模型进行了相关数据,并根据该数据集的功能进行了评分。设置改善研究用途的医疗保健数据的质量是优先事项。分析工具可以通过评估一系列质量维度的数据集来提供帮助。可以使用几个具有分析功能的免费软件包,但是医疗保健组织通常具有有限的数据工程能力和专业知识。参与者28个分析工具,8对1000名患者的合成数据集进行评估。最初确定的28个潜在分析工具的结果,有8个显示了基于可用文档的医疗保健数据集的高潜力,其中两个在多个任务中都始终如一地表现出色,包括确定完整性,一致性,独特性,有效性,准确性,准确性,精度和分配度量。结论许多免费的分析工具可用于与健康数据集的潜在使用,其中至少两个基于合成健康数据集和常见数据模型的测试,在一系列技术数据质量维度上表现出了高性能。适当的工具选择取决于包括基本组织基础架构,数据工程水平和编码专业知识的因素,但是有免费的工具可帮助个人资料健康数据集用于研究使用和为策划活动提供信息。
用于自由行为受试者的功能性大脑监测的可穿戴技术将促进我们对认知处理和适应性行为的理解。现有技术缺乏这种能力,或者需要侵入性程序和/或以其他方式阻碍在社交行为条件、运动和睡眠期间进行大脑评估。为此,我们开发了一个完整的系统,结合了脑血流量 (CBF) 测量、O 2 和 CO 2 供应以及行为记录,用于清醒、自由行为的小鼠。创新的弥散散斑对比流量计 (DSCF) 设备和相关硬件被小型化并针对小受试者应用进行了优化。安装和使用这种可穿戴、无光纤、近红外 DSCF 头台/探头不需要开颅、侵入性探头植入或对清醒动物进行约束。使用新的 DSCF 设计与光学标准进行的测量之间存在显著相关性。该系统成功且反复地检测到麻醉和移动小鼠对 CO 2 诱导的高碳酸血症的 CBF 反应。在自然行为过程中收集 CBF 和活动信息可以提供真实的生理结果,并为探索它们与病理生理状况的相关性开辟道路。
缩写 ADB — 亚洲开发银行 修订契约 — 契约第二阶段(密克罗尼西亚联邦和马绍尔群岛共和国),2004 财年 - 2023 财年 CARES — 新冠病毒援助、救济和经济安全 CDC — 疾病控制中心 COLA — 生活成本调整 COVID — 新冠病毒病 CoM — 密克罗尼西亚学院 契约 — 与美国自由联合契约(密克罗尼西亚联邦、马绍尔群岛共和国和帕劳) 契约 I — 契约前 17 年,1987 财年 - 2003 财年(密克罗尼西亚联邦和马绍尔群岛共和国),以及帕劳,1995 财年 - 2009 财年 CPI — 消费者价格指数 CPRO — 新冠病毒疫情救济方案 CRA — 契约审查协议(帕劳),2010 财年 - 2024 财年 CTF — 契约信托基金 DOE — 教育部 DOI — 内政部(美国) DRP — 灾害恢复计划 DSA — 债务可持续性分析 EAG — 经济顾问小组(帕劳) FAA — 美国联邦航空管理局 FAS —自由联合州 FDI — 外国直接投资 FDIC — 联邦存款保险公司 FPA — 联邦程序协议 FPUC — 联邦疫情失业补偿 FSM — 密克罗尼西亚联邦 FSMa — 密克罗尼西亚联邦安排
图 1. Neuro-stack 平台。a、用于单神经元和局部场电位 (LFP) 记录以及闭环可编程锁相 (PLS) 刺激的 Neuro-stack 和基于 GUI 的平板电脑。平板电脑可以选择记录和刺激通道、采样率、单极/双极记录和其他参数。显示的是封装(左)和未封装(右)版本。b、Neuro-stack 由三个堆叠层组成:1)通信 (Comm)、2) 数字和 3) 模拟。展示的是印刷电路板 (PCB,尺寸 = 90×60 mm 2 ) 和 5×2 引脚(8 个通道、1 个参考和 1 个接地,共 10 个引脚)Omnetics 探头连接器,可连接微电极(仅连接顶部模拟层)。请注意,每个模拟层最多接收两个 Omnetics 连接器,以通过一个探头连接最多 4 个电极。显示了每层的高级框图(右)。通信层包含一个 FPGA(现场可编程门阵列),用于介导外部软件和集成电路 (IC) 芯片之间的命令和数据传输(通过 USB)。数字层包含 PLS IC。模拟层包含用于感测(Sense IC)和刺激(Stim IC)的芯片。显示三个模拟层以允许记录 192 个通道(64 x 3 层)。串行外围设备接口 (SPI) 用于 FPGA 与 Sense 和 Stim IC 的通信,移位寄存器用于 FPGA 与 PLS 和 Spike IC 的通信。c,神经堆栈连接到佩戴眼动追踪系统的参与者的微电极。d,显示用于宏电极的 10 针防触摸跳线和用于微电极记录的 10 针连接器(例如 Adtech)。e,使用临床监测系统(Nihon Kohden,灰色)和神经堆栈(黑色)同时记录的示例数据显示信号相似。 f,数据(e)中功率谱图示例,显示一致的活动模式。使用对数刻度显示频率(0.1-32 Hz)。g,数据(e)中归一化功率谱密度(PSD)图示例。
图 1. Neuro-stack 平台。a、用于单神经元和局部场电位 (LFP) 记录以及闭环可编程锁相 (PLS) 刺激的 Neuro-stack 和基于 GUI 的平板电脑。平板电脑可以选择记录和刺激通道、采样率、单极/双极记录和其他参数。显示的是封装(左)和未封装(右)版本。b、Neuro-stack 由三个堆叠层组成:1)通信 (Comm)、2) 数字和 3) 模拟。展示的是印刷电路板 (PCB,尺寸 = 90×60 mm 2 ) 和 5×2 引脚(8 个通道、1 个参考和 1 个接地,共 10 个引脚)Omnetics 探头连接器,可连接微电极(仅连接顶部模拟层)。请注意,每个模拟层最多接收两个 Omnetics 连接器,以通过一个探头连接最多 4 个电极。显示了每层的高级框图(右)。通信层包含一个 FPGA(现场可编程门阵列),用于介导外部软件和集成电路 (IC) 芯片之间的命令和数据传输(通过 USB)。数字层包含 PLS IC。模拟层包含用于感测(Sense IC)和刺激(Stim IC)的芯片。显示三个模拟层以允许记录 192 个通道(64 x 3 层)。串行外围设备接口 (SPI) 用于 FPGA 与 Sense 和 Stim IC 的通信,移位寄存器用于 FPGA 与 PLS 和 Spike IC 的通信。c,神经堆栈连接到佩戴眼动追踪系统的参与者的微电极。d,显示用于宏电极的 10 针防触摸跳线和用于微电极记录的 10 针连接器(例如 Adtech)。e,使用临床监测系统(Nihon Kohden,灰色)和神经堆栈(黑色)同时记录的示例数据显示信号相似。 f,数据(e)中功率谱图示例,显示一致的活动模式。使用对数刻度显示频率(0.1-32 Hz)。g,数据(e)中归一化功率谱密度(PSD)图示例。
DNA 可视化软件必须 1) 注释特征并以图形方式描述 DNA 特征,2) 模拟分子克隆技术,3) 生成具有视觉吸引力的图形输出。优秀的 DNA 可视化软件将意义赋予 DNA 碱基串。从根本上讲,这需要灵活的注释 - 将名称应用于区域,以及功能区域的可视化 - 应用图片来显示序列区域之间的空间关系。每一段 DNA 都应标注其生物学相关属性。此外,生物学家必须能够识别对特定重组技术有用的子序列,例如限制性酶识别序列、重组酶识别序列和重叠末端序列。优秀的 DNA 软件还提供对常见 DNA 操作(例如限制性消化或 Gibson 克隆)的强大计算机模拟。通过计算机操作 DNA,生物学家可以确保重组构建体包括功能完整的片段,这些片段具有顺序和框架内的 DNA。换句话说,优秀的软件允许研究人员综合工作计划。这可能是从所需产品开始在计算机上反向工作以确定所需的输入。相反,它允许研究人员从给定的一组可用质粒开始,并在虚拟实验室中工作以生成可能的产品。最后,可视化软件对于确定分析结果(DNA 序列、诊断 PCR 或限制性消化)是否产生了预期的产品非常有用。科学家可以使用该软件来比对序列或模拟每个步骤的凝胶以确认他们的工作。最后,好的 DNA 软件可以生成具有灵活细节级别的视觉上令人愉悦的输出。这种表示应该可以轻松地以开放且广泛使用的文本或图形格式导出。例如,文本输出可用于生成课堂报告、学生论文或供出版的手稿。同样,图形输出可用于生成会议海报或课堂报告或会议演示的幻灯片。
1 佛罗里达大学电气与计算机工程系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,2 佛罗里达大学呼吸研究与治疗中心,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,3 佛罗里达大学物理治疗系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,4 佛罗里达大学生理学与功能基因组学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,5 佛罗里达大学生物统计学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,6 佛罗里达大学麦克奈特脑研究所,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,7 佛罗里达大学 J. Crayton Pruitt 家族生物医学工程系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,8 佛罗里达大学材料科学与工程系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,9 佛罗里达大学神经病学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611,10 佛罗里达大学神经科学系,佛罗里达大学,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611
标题 1 闭环颈部硬膜外刺激在自由活动大鼠脊髓损伤后诱发呼吸神经可塑性 2 3 缩写标题 4 硬膜外刺激诱发呼吸神经可塑性 5 6 作者姓名及所属机构 7 Ian G. Malone 1,2 , Mia N. Kelly 2,3 , Rachel L. Nosacka 4 , Marissa A. Nash 4 , Sijia Yue 5 , Wei Xue 5 , Kevin J. Otto 1,2,6,7,8,9,10 , 8 和 Erica A. Dale 2,4,6 9 1 佛罗里达大学电气与计算机工程系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 10 2 佛罗里达大学呼吸研究与治疗中心,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 11 3 佛罗里达大学物理治疗系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 12 4 佛罗里达大学生理学和功能基因组学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 13 5 佛罗里达大学生物统计学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 14 6 佛罗里达大学麦克奈特脑研究所,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 15 7 J. Crayton Pruitt Family 佛罗里达大学生物医学工程系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 16 8 佛罗里达大学材料科学与工程系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 17 9 佛罗里达大学神经病学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 18 10 佛罗里达大学神经科学系,佛罗里达州盖恩斯维尔 32611 19 20 通讯作者电子邮件地址 21 电子邮件:ericadale@ufl.edu 22 23 内容信息 24 图表数量:9 25表格数量:0 26 多媒体数量:0 27 字数:28 x 摘要:235 29 x 意义陈述:119 30 x 引言:660 31 x 讨论:2,003 32 33 致谢 34 作者要感谢佛罗里达大学 Dale 实验室、NeuroProstheses 研究实验室和 35 Mitchell 实验室的所有成员提供的技术指导。我们感谢 Raphael Perim 博士、Kaitlynn Olczak 博士和 Yasin Seven 博士提供的技术支持、帮助和指导;感谢 Larry Shupe 博士、Chet Moritz 博士和 Eberhard Fetz 博士提供的 Neurochip3 硬件并协助排除故障;最后,感谢 Jennifer Bizon 博士、Jada Lewis 博士、Peter Sayeski 博士、38 David Fuller 博士、Gordon Mitchell 博士、Charlie Wood 博士和 Stephen Sugrue 博士的支持和指导。 39 40 利益冲突 41 本稿件的作者声明他们没有利益冲突。 42 43 资金 44 这项工作得到了 Craig H. Neilsen 基金会、麦克奈特脑研究所和佛罗里达大学脑 45 和脊髓损伤研究信托基金、NIH T32 HL134621 呼吸研究和治疗培训计划、46 HL147554、NIH U01 NS099700 和佛罗里达大学学者计划的支持。 47 48
1的记录细胞的商和估计的细胞总数(植入电极覆盖的区域近似于植入电极覆盖的区域,假设皮质厚度为2mm,密度为90K神经元每毫米3(26))。
a 亚利桑那大学生物医学工程系,亚利桑那州图森市 85721;b 西北大学神经生物学系,伊利诺伊州埃文斯顿市 60201;c 西北大学生命过程化学研究所,伊利诺伊州埃文斯顿市 60208;d 西北大学生物集成电子中心辛普森奎里研究所,伊利诺伊州埃文斯顿市 60201;e 亚利桑那大学航空航天与机械工程系,亚利桑那州图森市 85721;f 西北大学机械工程系,伊利诺伊州埃文斯顿市 60208;g 西北大学高级分子成像、放射学和生物医学工程中心,伊利诺伊州埃文斯顿市 60208;h 西北大学材料科学与工程系,伊利诺伊州埃文斯顿市 60208;i 西北大学生物医学工程系,伊利诺伊州埃文斯顿市 60208; j 西北大学范伯格医学院神经外科系,伊利诺伊州芝加哥 60611;k 亚利桑那大学电气与计算机工程系,亚利桑那州图森 85721;l 亚利桑那大学 Bio5 研究所,亚利桑那州图森 85721;m 亚利桑那大学神经科学研究生跨学科项目 (GIDP),亚利桑那州图森 85721