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人类特异性保守元件缺失的功能和进化影响
结果：我们通过检查不同脊椎动物基因组中的保守区域并与可靠注释的人类特异性固定缺失重叠，确定了 10,032 个 hCONDEL。我们发现这些 hCONDEL 富含删除源自干羊膜动物的保守序列。与转录、表观基因组和表型数据集的重叠都暗示了神经元和认知功能的影响。我们使用 MPRA 在六种不同的人类细胞类型中表征了这些 hCONDEL，包括诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞。我们发现 800 个 hCONDEL 显示出物种特异性的调节效应。虽然许多 hCONDEL 会扰乱活性增强子中的转录因子结合位点，但我们估计 30% 会创建或改善结合位点，包括激活剂和抑制剂。
使用基于T细胞受体的细胞疗法的癌症生物学的年度审查靶向驱动器癌基因和其他公共新抗原
我们对感染的防御能力取决于免疫系统将入侵病原体与自我区分开的能力。在逆转录病毒几乎无缝整合到主机中，这项任务是异常的挑战，即使不是不可能的。与理论期望相反，内源性追溯质量保留了实质性的免疫原性，当它们的表观遗传抑制受到损害时，最深刻的是，这是最深刻的。尽管如此，最近的证据表明，对内源性恢复元件的影响是免疫系统发育和功能不可或缺的，是癌症免疫监测，对感染的依赖以及对微生物群的反应。阐明与内源性追溯元件的相互作用点将加深我们对免疫系统功能和对疾病的贡献的理解。
基于代理的建模，以整合来自不同学科的元素的雄心勃勃的气候政策
避免危险气候变化所需的严格政策很难实施，这主要是由于相当大的社会和政治抵抗（Klenert等，2018）。除其他外，这部分是通过废除澳大利亚的碳定价而创建的（Crowley，2017年），两次公开全民投票拒绝在华盛顿州引入碳税的倡议（Reed等人，2019年），以及诸如Fab fab affice and for Fab a Fuel and carbone and Carnecn and carbone and Commente and and and and and and and Carnement（Reed ver）（car）。在澳大利亚，在美国和法国的化石燃料大厅率领的虽然是抵抗运动，但政策的高度感知成本和潜在的回归效果驱动了普通大众的负面影响。其他气候政策工具，例如可再生能源，燃料排放标准和公路通行费的补贴，也看到了公众抵抗（Aasen＆Sælen，2022； Benegal＆Holman，2021; Stokes; Stokes，2016）。要克服这种抵抗，我们需要更好地理解此类政策的后果。目前有许多用于评估气候政策的环境，社会和经济影响的模型，但其中大多数遭受了纪律偏见。说明了：在经济平衡模型中，理性代理的操作狭窄；对公司和跨部门联系在心理学和社会学研究中的作用以及跨部门联系的关注；对既得利益的力量的了解有限（Farmer等，2015； Stern，2016）。反过来，这可能会削弱对气候政策的社会和政治支持（Sarewitz，2011年）。例如，Adger等人。这种偏见会导致忽视重要的政策影响，这使对所有相关标准的平衡评估变得复杂，例如有效性，效率，公平性和可接受性。要仔细比较气候政策工具，我们建议整合来自不同社会科学的要素，尤其是心理学，社会学，经济学和政治学（图1）。这些要素可能涉及特定学科的重点，机制，指标和政策工具。对这些的核算将有助于对潜在政策的影响以及认识和价值在学科之间的差异和价值上的差异（Klenk＆Meehan，2015年）。在本文中，我们认为基于代理的模型（ABM）构成了一种适当的工具，可以启用这种集成并将其性能与替代建模方法进行比较。几项早期的研究承认ABM在此类任务中的潜在作用。（2013）认为，他们“整合了关于变革的传统和科学观点[…]，以特别支持自适应管理系统的设计[用于气候变化适应]”。
基于代理的建模，以整合来自不同学科的要素以供雄心勃勃的气候政策
避免危险气候变化所需的严格政策很难实施，这主要是由于相当大的社会和政治抵抗（Klenert等，2018）。除其他外，这部分是通过废除澳大利亚的碳定价而创建的（Crowley，2017年），两次公开全民投票拒绝在华盛顿州引入碳税的倡议（Reed等人，2019年），以及诸如Fab fab affice and for Fab a Fuel and carbone and Carnecn and carbone and Commente and and and and and and and Carnement（Reed ver）（car）。在澳大利亚，在美国和法国的化石燃料大厅率领的虽然是抵抗运动，但政策的高度感知成本和潜在的回归效果驱动了普通大众的负面影响。其他气候政策工具，例如可再生能源，燃料排放标准和公路通行费的补贴，也看到了公众抵抗（Aasen＆Sælen，2022； Benegal＆Holman，2021; Stokes; Stokes，2016）。要克服这种抵抗，我们需要更好地理解此类政策的后果。目前有许多用于评估气候政策的环境，社会和经济影响的模型，但其中大多数遭受了纪律偏见。说明了：在经济平衡模型中，理性代理的操作狭窄；对公司和跨部门联系在心理学和社会学研究中的作用以及跨部门联系的关注；对既得利益的力量的了解有限（Farmer等，2015； Stern，2016）。反过来，这可能会削弱对气候政策的社会和政治支持（Sarewitz，2011年）。例如，Adger等人。这种偏见会导致忽视重要的政策影响，这使对所有相关标准的平衡评估变得复杂，例如有效性，效率，公平性和可接受性。要仔细比较气候政策工具，我们建议整合来自不同社会科学的要素，尤其是心理学，社会学，经济学和政治学（图1）。这些要素可能涉及特定学科的重点，机制，指标和政策工具。对这些的核算将有助于对潜在政策的影响以及认识和价值在学科之间的差异和价值上的差异（Klenk＆Meehan，2015年）。在本文中，我们认为基于代理的模型（ABM）构成了一种适当的工具，可以启用这种集成并将其性能与替代建模方法进行比较。几项早期的研究承认ABM在此类任务中的潜在作用。（2013）认为，他们“整合了关于变革的传统和科学观点[…]，以特别支持自适应管理系统的设计[用于气候变化适应]”。
基于社区参与式研究的心血管疾病管理计划的关键要素和影响范围审查
根据世界卫生组织的数据，心血管疾病（CVD）是最常见的死亡原因之一，全球每年有 1800 万人死于心血管疾病[1]，给全球健康和全球经济带来了沉重的负担[2]。在许多国家，社会经济地位较低的人群的 CVD 死亡率较高[3,4]。不同收入水平的 CVD 死亡率存在这种差异，是因为影响 CVD 发生和/或由此导致的死亡的因素因收入水平而异[3,5,6]。具体而言，获取资源可促进健康行为，并被视为健康的一个关键社会决定因素[7]。来自社会经济地位低下家庭的儿童更有可能生活在获取和机会稀缺的地区[8]。换言之，健康的社会决定因素分配不均导致整体健康水平的不平等。减少健康不平等是毋庸置疑的议程，世界各地正在为此做出各种努力。以社区为基础的参与式研究（CBPR）就是其中一种。CBPR 让社区成员、组织代表和学术研究人员平等地参与研究[9]。CBPR 的核心在于根据社会不同成员平等参与的原则，在社区参与者之间建立平等、合作的健康促进伙伴关系[10]。由于这些平等的参与者独立地发现问题并提出社区解决方案，因此它赋予了该方法的有效性和可持续性，并证明了其在实践中的实用性[11]。这一过程有助于建立和加强当地社区相关组织网络，提高领导力，从而增强当地社区自主、可持续的健康促进能力[12]。在 CBPR 过程中，当地社区成员的“参与”被强调，但“实践”的概念也同样重要。换言之，CBPR 将利用社区能力和网络取得的成果与面向实践的活动结合起来[13]。因此，CBPR 可以有效地充当将学术研究成果传播到健康项目现场等的联络人。CBPR 旨在培养的社区能力被视为调节社会经济因素与健康水平差异之间差距的一个因素，这是健康不平等的机制之一。基于 CBPR 的健康促进项目以这些健康决定因素机制为基础，旨在利用社会网络、社会支持和社会资本等中介变量加强社区能力，从而减少并最终消除健康不平等，改善健康状况。特别是，为了减少心血管疾病等慢性病的危险因素，消除由此造成的健康不平等，人们更加重视健康的社会决定因素，即个人出生、成长和居住的社会、环境和相关因素[14]。美国心脏协会指出，“减少美国心血管疾病死亡和残疾的最重要机会在于解决心血管结局的社会决定因素”[15]。因此，
内建立的超构成相互作用使高安全性实用
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CRISPR/Cas 介导的顺式调控元件编辑用于作物改良
为了提高未来的农业生产，需要重大技术进步来提高作物的产量和单产。通过成簇的规律间隔短重复序列/CRISPR 相关蛋白 (CRISPR/Cas) 系统靶向基因的编码区已经很成熟，并能够快速产生无转基因植物，从而改善作物。CRISPR/Cas 系统的出现还使科学家能够实现顺式调控元件 (CRE) 编辑，从而设计内源性关键 CRE 来调节靶基因的表达。最近的全基因组关联研究已经确定了天然 CRE 变体的驯化以调节复杂的农学数量性状，并允许通过 CRISPR/Cas 系统对其进行工程改造。虽然工程植物 CRE 有利于驱动基因表达，但其实际应用仍存在许多限制。在这里，我们回顾了 CRE 编辑的当前进展，并提出了未来有效靶向 CRE 进行转录调控以改良作物的策略。
以碱基分辨率 1 对基因调控元件进行综合解剖
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2022 年 10 月 6 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.10.05.511030 doi：bioRxiv 预印本
具有现实元素的血浆超材料设备的逆设计
摘要在先前的研究的扩展中（Rodríguez等2021 Phys。修订版应用。16 014023），我们采用逆设计方法来生成具有逼真的等离子体元件的二维等离子体超材料设备，这些元件结合了石英包络，碰撞（损失），非均匀密度曲线以及对实验误差/扰动的抵抗力。有限差频域模拟与在横向磁极化下运行的波导和弹能器一起使用前向模式分化。具有现实元素的最佳设备与具有理想元素的先前设备进行了比较，并且探索了优化算法的几种参数初始化方案，从而得出了生产此类设备的强大过程。弹能和波导，具有合理的空间平均等离子体频率约为10 GHz，碰撞频率约为1 GHz，从而使未来的现场训练和这些设计的实验实现。