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三聚体BET v 1特异性纳米化引起对IgE结合的强抑制
胚胎干细胞通过形成细菌层具有多能力的潜力和自我恢复能力，从而为胚胎发生提供了主要贡献。这些干细胞多能的保留取决于转录因子的表达/水平，即SOX2，OCT4和NANOG。在器官发生过程中，分子的表达变化也会影响这些干细胞失去多能性并转向谱系选择。随着分化的进展，包括口腔鳞状细胞在内的体细胞的维持也取决于转录因子的差异表达。最近，许多实验性和观察性研究记录了各种人类癌症的致癌作用的重要贡献。在这篇综述中，我们试图总结说明这些主要多能调节剂在口服癌变阶段的推定作用的证据，即口服鳞状细胞癌的起始，进展和预后。
空间转录组学揭示了胚胎人动脉瓣重塑期间的新基因
。cc-by 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本发布的版权所有，于2023年5月9日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.05.09.539950 doi：Biorxiv Preprint
四邻苯酚对分化小鼠胚胎干细胞的影响揭示了对免疫系统的意外影响
四抗苯酚A（TBBPA）是用于多种设备中使用的有效的木质阻滞剂，是家庭和生态系统中的主要污染物。在脊椎动物中，它被证明会影响神经发育，下丘脑 - 垂体 - 基达轴和甲状腺信号传导，但其毒性和作用方式仍然是争论的问题。暴露于TBBPA引起的分子表型仅描述了很差，尤其是在转录组重编程水平上，这进一步限制了我们对其分子毒性的理解。在这项工作中，我们将功能基因组学和系统生物学结合在一起，提供了对作用于MESC的TBBPA引起的转录组改变的系统描述，并提供了潜在的新毒性标记。我们发现TBBPA诱导的转录组重编程会影响生物途径网络中的大量基因集合，表明对生物过程的广泛干扰。我们还发现了两个作用热点：在神经元分化标记的水平上，令人惊讶的是，在免疫系统功能的水平上，到目前为止，它们在很大程度上被忽略了。这种效果特别强，因为髓样和淋巴样谱系的末端分化标记均大大降低：膜T细胞受体（CD79A，CD79B），白介素七受体（IL7R），巨噬细胞粒细胞因子受体（CSF1R），单细胞激素受体（CCR2）。此外，强烈诱导了高属性IgE受体（FCER1G），是过敏反应的关键介体。因此，TBBPA诱导的分子不平衡可能比最初实现的强。
TAF8 区域对于 TFIID B 叶组装或 TAF2 相互作用很重要，是胚胎干细胞存活所必需的
人类通用转录因子 TFIID 由 TATA 结合蛋白 (TBP) 和 13 个 TBP 相关因子 (TAF) 组成。在真核细胞中，TFIID 被认为在所有蛋白质编码基因启动子上形成 RNA 聚合酶 II (Pol II) 前启动复合物，因此对 Pol II 转录至关重要。TFIID 由三个叶组成，分别称为 A、B 和 C。5TAF 核心复合物可以在体外组装，构成 TFIID 中叶 A 或 B 进一步组装的构建块。结构研究表明，TAF8 与叶 B 中的 TAF10 形成组蛋白折叠对，并参与叶 B 和叶 C 的连接。为了更好地了解 TAF8 在 TFIID 中的作用，我们研究了 TAF8 不同区域对叶 B 和 C 体外组装的要求以及某些 TAF8 区域对小鼠胚胎干细胞 (ESC) 活力的重要性。我们已经确定了 TAF8 的一个区域，该区域不同于组蛋白折叠结构域，对于与叶 B 中的 5TAF 核心复合物组装非常重要。我们还划定了另外四个 TAF8 区域，每个区域都单独需要与叶 C 中的 TAF2 相互作用。此外，CRISPR/Cas9 介导的基因编辑表明，与 5TAF 核心相互作用的 TAF8 结构域和与 TAF2 相互作用的 TAF8 富含脯氨酸的结构域都是小鼠胚胎干细胞存活所必需的。因此，我们的研究确定了参与连接 TFIID 叶 B 和叶 C 的不同 TAF8 区域，这些区域似乎对 TFIID 功能和随之而来的 ESC 存活至关重要。
幼稚的人类多能干细胞保持胚胎，胚外和胚泡产生潜力
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助者，它是根据预印本提供的（未经同行评审的认证），他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年1月28日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2025.01.17.633522 doi：Biorxiv Preprint
morphoHeart：胚胎发育过程中心脏和 ECM 的综合 3D 形态分析的定量工具
心脏发育涉及从线性心管到不对称环状和气球状器官的复杂结构重塑。先前的研究已将细胞外基质 (ECM) 空间的区域扩张与发育过程中的组织形态发生联系起来。我们开发了 morphoHeart，这是一款 3D 组织分割和形态测量软件，具有用户友好的图形界面 (GUI)，可首次提供活体胚胎中心脏和 ECM 形态的集成 3D 可视化和多参数分析。morphoHeart 揭示了 ECM 在心脏发育过程中经历区域动态扩张和缩小，同时伴有腔室特异性的形态成熟。我们使用 morphoHeart 证明由 ECM 交联剂 Hapln1a 驱动的区域化 ECM 扩张会促进心脏发育过程中的心房腔扩张。最后，morphoHeart 的 GUI 将其用途扩展到心脏组织之外，允许将其分割和形态分析工具应用于任何荧光标记组织的 z 堆栈图像。
幼稚的人类多能干细胞保持胚胎，胚外和胚泡产生潜力
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年1月20日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.01.17.633522 doi：Biorxiv Preprint
胚胎生殖细胞的高分辨率多尺度分析...
原始生殖细胞（PGC）是配子的胚胎前体。在小鼠和大鼠中，PGC可以通过形成胚胎生殖细胞（EGC）轻松地在体外获得多能性。迄今为止，尽管人类PGC（HPGC）在生殖细胞肿瘤发生的背景下很容易经历多能转化，但在人类中尚未建立可比的体外系统。在这里，我们报告说，HPGC样细胞（HPGCLC）在暴露于先前用于得出小鼠EGC的相同感应信号后经历人类胚胎类细胞（HEGCLC）。这种定义的无馈物培养系统允许有效地推导人EGCLC，可以在标准的人类多能干细胞培养基中扩展和维持。HEGCLC在转录上与人类多能干细胞（HPSC）相似，并且可以区分所有三个细菌层，并再次引起PGCLC，证明了多能状态的互助性。这在表观遗传水平上也很明显，因为在HPGCLC中发生的初始DNA脱甲基化在HEGCLC中很大程度上逆转，将DNA甲基恢复到HPSC中观察到的水平。这种新的体外模型捕获了从多能干细胞状态到生殖细胞身份并再次返回的过渡，因此代表了一个高度可牵引的系统，用于研究多能和表观遗传转变，包括在人类生殖细胞肿瘤发生过程中发生的多能和表观遗传转变。
牛的牛外胚层细胞
了解软细胞发育的机制及其在35植入中的作用对于改善农场动物繁殖至关重要，但由于缺乏36个研究模型而受到阻碍。在这里我们报告说，化学鸡尾酒（FGF4，BMP4，IL-6，XAV939和37 A83-01）可实现从头推导和牛的长期培养，并具有长期的牛外胚膜内胚层38细胞（BXENS）。转录组和表观基因组分析证实了BXENS的身份，39表明它们是早期牛植入植入术胚胎的低成质细胞谱系。40我们表明，Bxens有助于维持牛ESC的干性，并防止它们从41个分化中。在存在信号鸡尾酒的存在下，在发育中的植入前胚胎中也促进了培养细胞的生长和42个e培培养。43此外，通过牛Esc和TSC的Bxens的3D组装，我们开发了一个44个改进的牛胚泡结构（牛胚泡），类似于胚泡。这项研究中建立的45个牛Xens和类囊体代表了可访问的体外模型，可用于46了解牲畜物种中的低纤维细胞发育并提高生殖效率。47
精子衍生的 H2AK119ub1 是非洲爪蟾胚胎发育所必需的
23 多梳抑制复合物-1 沉积的 H2AK119ub1 在体细胞中启动兼性异染色质形成过程中起着关键作用。我们在此评估精子衍生的 H2AK119ub1 对胚胎发育的贡献。我们发现，在非洲爪蟾中，H2AK119ub1 在精子发生过程中以及胚胎发育早期都存在，这突出表明了其在精子向胚胎传递表观遗传信息方面发挥的作用。在注射到卵子之前，用 H2AK119ub1 去泛素化酶 USP21 对精子进行体外处理会导致与基因上调相关的发育缺陷。精子 H2AK119ub1 编辑会破坏卵子因子介导的父系染色质重塑过程。它导致复制后 H2AK119ub1 在基因组重复元件上积累，而不是在 CpG 岛上。精子表观基因组编辑引发的复制后 H2AK119ub1 分布的这种变化导致 USP21 处理精子产生的胚胎中 H2AK119ub1 基因失调。我们得出结论，精子来源的 H2AK119ub1 指导卵子因子介导的父系染色质表观遗传重塑，是胚胎发育所必需的。