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抗体工程和SpyTag-SpyCatcher技术
间谍肽 - 13个氨基酸标签和间谍蛋白蛋白来自第二个免疫球蛋白样胶原蛋白粘附蛋白结构蛋白，源自pyogenes链球菌的纤连蛋白结合蛋白。胶原蛋白粘合剂结构域自然包含赖氨酸（LYS）侧链和天冬氨酸（ASP）的侧链之间的无肽内键[5,6]。通过拆分该域并进行碎片的合理工程，即肽，即包含反应性ASP残基的spytag和小蛋白质，即含有反应性Lys残基的spycatcher，是含反应性Lys残基和谷氨酸（GLU）残基所必需的，形成型催化剂时，将形成型三重时，该蛋白是键合的。间谍反应在pH，温度和缓冲液的不同条件下以高收率发生，并且自从其概念之后，这两个组件随后被优化，创建版本2和3（spytag2-spycatcher2，spytag3-spycatcher3），在该反应时间从小时缩短到5分钟[5]。
外部简历（工程）11/26/24 - Sean Klein
(609) 535-2541 | seanrk06@gmail.com | 美国公民 | https://seanklein.info/ 教育 普渡大学，610 Purdue Mall，西拉斐特，印第安纳州 47907 预计毕业日期，2028 年 5 月 意向专业：计算机工程；当前学分：33 康瑟尔罗克南高中，毕业班前 10%；GPA：4.3 毕业，2024 年 6 月 相关 AP 课程：计算机原理、微积分 AB、物理 C、计算机科学 A、统计学 工作经历 Action Manufacturing Company，工程实习生 宾夕法尼亚州布里斯托尔 | 2023 年 6 月 - 2023 年 8 月 ● 为 M107 弹头建造和测试武器装备，通过严格评估确保部署可靠性。 ● 将十年前的原理图集成并组织到虚拟目录中，增强可访问性并减少检索时间。 ● 开发了用于 MK60 齿轮系统质量控制的检查系统，通过系统的测试协议确保可靠的现场使用。 阿宾顿神经病学协会，研究助理 宾夕法尼亚州阿宾顿 | 2021 年 6 月 - 2021 年 8 月 ● 审查了 400 多份患者记录，以确定预测偏头痛发作的症状，为研究论文提供了全面的数据集。 ● 管理面向患者的设施，确保设备进行适当的维护并进行细致的检查以维持高标准的患者护理。 活动和领导力 Scope Consulting，顾问 印第安纳州西拉斐特 | 2024 年 9 月 - 至今 ● 咨询 Beta Agency 以确定南加州的商业房地产机会，使用 Power Bi 构建可修改的界面来可视化店面数据，包括销售的商品、净收入和市场份额 技术俱乐部，联席总裁兼联合创始人 宾夕法尼亚州荷兰 | 2021 年 8 月 – 2024 年 6 月 ● 将俱乐部会员人数从成立之初发展到 50 多名活跃学生 ● 协调来自 NASA、普惠、Catalent Pharma Solutions 等公司的全国知名演讲者 ● 开发并组织了一个有 10 多名与会者的 3D 打印研讨会，以提高学生的实践知识和对技术的热情 Sigma Alpha Rho：犹太青年 501(c)(3)，国家和地区委员会主席 宾夕法尼亚州里奇伯勒 | 2021 年 3 月 – 2024 年 6 月 ● 于 2021 年成立分会，会员人数发展到 20 多名学生 ● 与国家校友委员会协调活动，包括与犹太救济署合作的食品募捐活动 ● 通过校友和当地捐款为当地分会筹集了 5,000 美元以上 社区参与 可扩展不对称生命周期参与 (SCALE)，参与者 印第安纳州西拉斐特 | 2024 年 11 月 – 至今 ● 沉浸式教育计划，为国防部和国防工业基地培养微电子劳动力。 ● 将政府和国防工业基地实习与研究和指导相结合。 宾夕法尼亚州 STEM 充实计划 501(c)(3)，创始人兼联合总裁 宾夕法尼亚州里奇伯勒 | 2022 年 11 月 – 2024 年 6 月 ● 成立一家非营利组织，以提高青少年 STEM 素养，与当地企业合作，扩大教育资源。 ● 设计并举办了 Web 开发研讨会，向 10 多名参与者传授基础编码技能，并培养他们对技术的兴趣。 项目与奖项 最终设计评审，在美国宇航局休斯顿举行的最终设计评审中，318 名被选中展示昆虫纳米实验室原型的学生之一，展示了国际空间站 (ISS) 上可持续食物来源的创新解决方案。 个人作品集网站，https://seanklein.info/，展示了三个已完成的黑客马拉松项目，其中一个获得了荣誉奖，此外还介绍了更多关于我自己的信息。 奖学金，获得 Sigma Phi Epsilon Balanced Man 奖学金（440 名申请者中选出 3 名）；因在兄弟会内外的卓越表现获得 Sigma Alpha Rho 奖学金；获得 Zeta Beta Tau 奖学金 威德纳领导力奖，宾夕法尼亚州、新泽西州和特拉华州 129 名被选中的学生之一，因其在学校和社区活动中的卓越领导能力，由威德纳大学与 NBC10 合作表彰。 Jewish Exponent 文章，接受 Jewish Exponent 采访并被引用，文章内容涉及 Sigma Alpha Rho 的复兴 技能与兴趣 硬件技能：LT-Spice、关键任务应用程序硬件集成 编程：全栈 Web 开发、Power Bi、Java、Python、JavaScript、C、HTML 和 CSS；ReactJS；MongoDB，目前正在攻读 AWS 解决方案架构师认证 项目管理：团队协作、项目时间表；客户沟通 数据分析：具有统计分析、研究方法经验；质量控制系统关键任务应用程序的硬件集成编程：全栈 Web 开发、Power Bi、Java、Python、JavaScript、C、HTML 和 CSS；ReactJS；MongoDB，目前正在攻读 AWS 解决方案架构师认证项目管理：团队协作、项目时间表；客户沟通数据分析：具有统计分析、研究方法的经验；质量控制系统关键任务应用程序的硬件集成编程：全栈 Web 开发、Power Bi、Java、Python、JavaScript、C、HTML 和 CSS；ReactJS；MongoDB，目前正在攻读 AWS 解决方案架构师认证项目管理：团队协作、项目时间表；客户沟通数据分析：具有统计分析、研究方法的经验；质量控制系统
2022 年神经形态计算和工程路线图
Dennis诉Christensen 1，Regina Dittmann 2，Bernabe Linares-Barranco 3，Abu Sebastian 4，Manuel Le Gallo 4，Andrea Redaelli 5，Stefan Slesazeck 6，Thomas Mikolajick 6，7 Iang 12，Feng Miao 12，Mario Lanza 13，Tyler J Quill 14，Scott T Keene 15，Alberto Salleo 14，Julie Grollier 16，Danijela Markovi´ c 16，Alice Mizrahi 16，Peng Yao 17，Peng Yao 17 Datta 20，Elisa Vianello 21，Alexandre Valentian 22，Johannes Feldmann 1，Xuan Li 23，Wolfram HP Pernice 24，25，Harish Bhaskaran 23，Steve Furber 26，Emre Neftci 27 Geun Kim 31，Gouhei Tanaka 32，Simon Thorpe 33，Chiara Bartolozzi 34，Thomas A Cleland 35，Christoph Posch 36，Shihchii Liu 18，Gabriella Panuccio 37，Mufti Mahmud 38，Arnabim Mazumder 39，Mufti Mahmud 38 , Tinoosh Mohsenin 39 , Elisa Donati 18 , Silvia Tolu 14 , Roberto Galeazzi 40 , Martin Ejsing Christensen 41 , Sune Holm 42 , Daniele Ielmini 43 和 N Pryds 1
合成的盘绕螺旋相互作用组为分子工程提供了杂种模块。
引用Reinke，Aaron W.，Robert A.Grant和Amy E. Keating。“合成的盘绕螺旋相互作用组为分子工程提供了杂种模块。”J.am。化学。Soc。，2010，132（17），pp 6025–6031。
逆转整个神经系统
摘要：有许多关于如何由神经元控制行为的理论。测试和完善这些理论将很大程度上促进。此外，模拟神经系统本身就是系统神经科学中的大梦想之一。但是，这样做需要我们确定每个神经元的输出如何取决于其输入，这是我们称之为反向工程的过程。目前对哺乳动物神经系统的关注，但是这些大脑令人难以置信，仅允许记录微小的子系统。在这里，我们认为，系统神经科学的时间已经成熟，可以努力进行较小的系统，而秀丽隐杆线虫是理想的候选系统，因为既定的餐水生理学技术可以捕获和控制每个神经元的活性并扩展到成千上万的实验。可以组合跨种群和行为的数据，因为整个个体神经系统在形式和功能上都在很大程度上保守。现代基于机器学习的建模应该可以对秀丽隐杆线虫的脑状态和行为的令人印象深刻的广度进行模拟。对整个神经系统进行逆向工程的能力将使人工智能系统和所有系统的设计有益于神经科学的设计，从而实现基本见解以及新的方法来研究逐渐更大的神经系统。
MOS2中的Moiré工程光 - 摩擦相互作用... 引用了原始发表的论文（记录的版本）：Jafarzadeh，S.，Nooshkam，M.，Qazanfarzadeh，Z。等（2024）。解锁潜在的O 加油否认：气候变化反动运动和瑞典极右媒体 有效的微孔子频率梳 可用性比较拟人化数字人的健康参与者和基于文本的聊天机器人，以此作为对心理健康问题的响应者：随机对照试验 朝着光网络中的可解释的强化学习：RMSA用例 和电热膜蒸馏 基于滑动触摸的探索，用于用多指双手建模未知对象形状 原子能洞察纳米片分裂水的竞争边缘 引用原始发表的论文（记录的版本）：Konzock，O。，Nielsen，J。（2024）。试图评估微生物Biote的生产成本 引用了原始发表的论文（记录的版本）：Bainsla，L.，Zhao，B.，Behera，N。等（2024）。 中的大面外旋转轨道扭矩 引用了原始发表的论文（记录的版本）：Monsel，J。，Ciers，A.，Kini Manjeshwar，S。等（2024）。耗散和色散cav 引用了原始发表的论文（记录的版本）：Kumar，R。，Srivastav，S.，Roy，U。等（2024）。镁的电噪声光谱 用快速电子梁探测光学叠液 基于机器学习的极化签名分析，用于检测和分类窃听事件和有害事件
van der waals异质结构中的Moiré超级晶格代表了高度可调的量子系统，在多体模型和设备应用中都引起了极大的兴趣。然而，在室温下，Moiré电位对光物质相互作用的影响在很大程度上仍然没有。在我们的研究中，我们证明了MOS 2 /WSE 2中的Moiré潜力促进了室温下层间激子（IX）的定位。通过执行反射对比光谱，我们证明了原子力显微镜实验支持的原子重建在修饰内部激子中的重要性。降低扭转角时，我们观察到IX寿命会更长，并且发光增强，表明诸如缺陷之类的非辐射衰减通道被Moiré电位抑制。此外，通过将Moiré超晶格与硅单模腔的整合，我们发现，使用Moiré捕获的IXS的设备显示出明显较低的阈值，与利用DelaCalized IXS的设备相比，较小的一个数量级。这些发现不仅鼓励在升高温度下在Moiré超晶格中探索多体物理学，而且还为利用光子和光电应用中的这些人工量子材料铺平了道路。
耗散工程的单身门操作
抽象不可逆的逻辑与统一的量子进化不一致。通过经典测量模拟此类操作可能会导致干扰和高度资源需求。为了克服这些局限性，我们提出了协议，即利用耗散实现不可逆转的门操作所需的无政府进化。使用其他激发态，可能会衰减，我们设计了在最小稳定的希尔伯特空间上执行所需的门操作的有效衰减过程。这些以确定性和自主的方式运行，而无需进行测量。我们考虑了几种经典逻辑操作，例如OR，NOR和XOR Gates。朝着实验实现，我们讨论了量子点中可能的实现。我们的研究表明，不可逆转的逻辑操作可以在逼真的量子系统上有效地执行，并且耗散工程是获得非洲发展的必要工具。拟议的操作扩展了量子工程师的工具箱，并在NISQ算法和Quantum机器学习中具有有希望的应用。
麻省理工学院生物工程科学与研究学院...
兹证明，Sagarika Khamkar 女士提交的论文“研究噬菌体和纳米颗粒作为生物防治剂在不同栖息地对硫酸盐还原菌 (SRB) 的影响”是生物工程学士学位的部分内容，该论文由我监督和指导，在浦那 Agharkar 研究所生物能源组完成。
对整个神经系统进行逆向工程
摘要：神经科学的主要目标是了解神经系统或神经回路组合如何产生和控制行为。如果我们能够可靠地模拟整个神经系统，从而复制大脑对任何刺激和不同环境的反应动态，那么测试和改进我们的神经控制理论将变得非常容易。更根本的是，重建或建模一个系统是理解它的一个重要里程碑，因此，模拟整个神经系统本身就是系统神经科学的目标之一，实际上是梦想。要做到这一点，我们需要确定每个神经元的输出如何依赖于某个神经系统中的输入。这种解构——从输入输出对理解功能——属于逆向工程的范畴。目前对大脑进行逆向工程的努力主要集中在哺乳动物的神经系统上，但这些大脑极其复杂，只能记录微小的子系统。我们在此认为，现在是系统神经科学开始齐心协力对较小系统进行逆向工程的时候了，而秀丽隐杆线虫是理想的候选系统。特别是，已建立并不断发展的光生理学技术工具包可以非侵入性地捕获和控制每个神经元的活动，并扩展到大量动物群体的数十万次实验。由于个体神经元的身份在形式和功能上基本保持不变，因此可以合并不同群体和行为的数据。然后，基于现代机器学习的模型训练应该能够模拟秀丽隐杆线虫令人印象深刻的大脑状态和行为范围。对整个神经系统进行逆向工程的能力将有利于系统神经科学以及人工智能系统的设计，从而为研究越来越大的神经系统提供根本性的见解和新方法。
通过合成生物学和基因组工程增强噬菌体疗法
目前，噬菌体的抗菌和治疗效果有限，主要是由于噬菌体抗性的快速出现以及大多数噬菌体分离株无法结合和感染多种临床菌株。在这里，我们讨论了如何通过基因工程的最新进展来改进噬菌体疗法。首先，我们概述了如何设计受体结合蛋白及其相关结构域以重定向噬菌体的特异性并避免抗性。接下来，我们总结了如何将噬菌体重新编程为原核基因治疗载体，以递送抗菌“有效载荷”蛋白（例如序列特异性核酸酶）以靶向复杂微生物群中的特定细胞。最后，我们描述了大数据和新型人工智能驱动的方法，这些方法可能会指导未来改进合成噬菌体的设计。