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功能化寡核苷酸，合成催化剂作为酶模拟
遗传信息的存储和转移[1，2]。 DNA甚至没有主要考虑，假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。 要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍（大部分是沃森和克里克基料配对），在糖的2'位置下没有羟基。 又花了十年的时间证明了dnazymes，单链的脱氧乙烯核苷酸（ODN），而没有体内对应物，也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。 可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体（能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6]，依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐（DNTP）。 这些核苷酸是（突变）DNA 的底物遗传信息的存储和转移[1，2]。DNA甚至没有主要考虑，假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍（大部分是沃森和克里克基料配对），在糖的2'位置下没有羟基。又花了十年的时间证明了dnazymes，单链的脱氧乙烯核苷酸（ODN），而没有体内对应物，也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体（能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6]，依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐（DNTP）。这些核苷酸是（突变）DNA
人工酶中远端突变的计算引导的工程
需要特定的c c类型的转换类型，这些转换不是天然发生的。5为了利用这些过程中的巨大酶良好的益处，已经设计了人工酶来产生新的催化反应性。6 - 8个促酶，从而产生基本的酶，然后可能会受到定向进化的能力，以实现通常与酶催化相关的高活性和选择性。9,10然而，尽管有明显的进展，但大多数人促酶的催化效率尚未与天然酶相媲美。11迄今为止，使用人工酶的大多数定向进化运动仅针对催化中心近距离的残留物，以直接影响其化学环境。越来越清楚的是，就像天然酶一样，整个蛋白质的12个结构合作也需要与人工酶促进酶进行催化。例如，刘易斯和同事观察到在模型环丙烷化反应中，在引入脱离活性位点的突变后，由人工hodios的模型环化反应提高了对映选择性。13 o s，远端突变的引入产生由蛋白质的先天结构动力学决定的细微结构重排，该结构动力学已在天然酶的进化中被逐渐构成。18,19是Hilvert等人设计的KEMP消除酶HG3.17的局部示例。14,15那些可以间接地通过调节结构动力学的催化活性的残基称为动力学的远端位点或热点。16,17针对定向演化算法中这些热点的16,17可以将构象动力归为催化生产构象，从而导致高度效率高的设计师酶。能够通过开发具有催化能力的构象合奏的速率加速度提高10 8倍。20当前，它们的鉴定阳离子o cen依赖于广泛的分子动力学（MD）模拟，这对工作的吞吐量构成了显着的限制。21尽管最近已经描述了基于机器的新策略并保持了大大减轻计算费用的希望，但对大型培训数据集的需求阻碍了他们在鲜为人知的系统中的应用。为了确定远端突变和远距离网络在人工酶中的作用，我们以23,24的lactocococococcal多药耐药性调节剂（LMRR）为示例，是探讨了以较广泛的新型到Nature Adectivitivitivities量身定制的混杂蛋白SCA效率的示例。该蛋白质属于padr遗传因素的PADR家族，并调节乳酸乳酸菌中LMR操纵子的表达。lMRR的特征是独特的构象thimational质量和结构可塑性25,26，在其大型恐惧孔中引起了宽阔的配体滥交。然后将这些基本酶定向进化，从而导致专业酶显着增加活性和（对映）的选择性。引入各种人工催化部分，金属复合物，27个非典型氨基酸（NCAA），28甚至两者均为29个具有多种新型催化性活性的endow LMRR。但是，迄今为止，迄今为止，定向进化仅集中在孔内的残基上，以优化新创建的活性位点的结构。在这里，我们展示了如何通过利用LMRR的构象动力学来进一步增加这些设计师酶之一的活性。
与药物处方相关的因素血管紧张素转换酶抑制剂或血管紧张素受体阻滞剂及其对延缓患者肾衰竭的影响
摘要 目的：探讨影响药物处方的相关因素。血管紧张素转换酶抑制剂（ACEI）或血管紧张素受体阻滞剂（ARB）对Photharam医院慢性肾病患者延缓肾衰竭的效果。研究方法：回顾性研究。通过收集2018年10月1日至2020年9月30日期间HOSxP计划中慢性肾病患者的数据，根据慢性肾病的分期、年龄、糖尿病、高血压等对患者进行分组。尿液蛋白质含量接受服务的诊所然后使用多元逻辑回归分析来分析与 ACEI 或 ARB 处方相关的比率和因素。并比较肾滤过率接受药物治疗和未接受药物治疗的组在研究结束时，为了显示延迟肾衰竭的效果，结果如下：共纳入 3,994 名患者，其中 1,560 名（39%）接受了 ACEI 或 ARB 治疗。按慢性肾病 1、2、3a、3b 和 4 期分层时，接受药物治疗的百分比分别为 48.5、58.9、40.5、32.4 和 15.9。与处方 ACEI 或 ARB 相关的因素包括：慢性肾病 2 期，比值比为 1.39（95% 置信区间 (CI) 1.02–1.91，p = .04），慢性肾病 4 期 0.43（95% CI 0.23–0.80，p = .01），糖尿病 2.92（95% CI 1.72–4.94，p < .001），高血压 5.66（95% CI 3.23–9.92，p < .001）糖尿病。
限制性核酸内切酶消化质粒DNA
此过程描述了如何用各种限制性核酸内切酶消化纯化的质粒DNA。使用各种缓冲液和盐条件，将质粒DNA切成各种长度DNA片。然后，可以使用E-Gel功率SNAP电泳和SAP-23132 Chemidoc MP Imaging Imaging Systems使用E-Gel Power Snap Extrophoresis和SP-23132 Chemidoc Imaging Systems使用E-Gel Power Snap Systems和SEOP-23132 ChemIdoc Imaging Systems，并具有来自Bio-Rad的Image Lab touch软件。限制性核酸内切酶识别短的DNA序列，然后在识别序列内或附近的特定位点上裂解双链DNA。限制性核酸内切酶将DNA裂解为离散片段是分子生物学中最基本的过程之一。基本协议描述了如何为任何酶和缓冲液条件切割DNA。这些包括用一个以上的内切酶消化给定的DNA样品，并用相同的内切酶消化多个DNA样品。
4 酶抑制剂在计算机模拟研究中潜在的抗
摘要 糖尿病是一种与血糖代谢受损有关的慢性疾病。黑蒜具有作为抗糖尿病药物的潜力，因为它含有多种可以控制血糖水平的化合物，例如酚酸、黄酮类化合物和 S-烯丙基-L-半胱氨酸 (SAC)。DPP-4 是一种酶，在治疗 II 型糖尿病中作为格列汀的治疗靶点发挥着重要作用。这项研究旨在通过分子对接方法证明黑蒜中的化合物作为 DPP-4 酶的计算机抑制剂的效力。根据研究结果，SAC 的键能值为 -5.36 kcal/mol，抑制常数值为 118.08 μM。这表明 SAC 化合物与 DPP-4 酶之间的键是稳定的，并且与其他四种测试化合物相比，具有作为 DPP-4 酶抑制剂的潜力。然而，SAC 化合物并不比天然配体更好，因为它具有较小的键能值和抑制常数。因此可以得出结论，黑蒜中的 SAC 化合物并不比其天然配体维达列汀更有效，但它仍然具有作为 DPP-4 酶抑制剂的潜力。关键词：抗糖尿病、黑蒜、DPP-4
结构引导抑制癌症DNA-氧化酶Apobec3a
。CC-BY 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2023年2月17日发布的此版本中在版权所有者中显示预印本。 https://doi.org/10.1101/2023.02.17.528918 doi：Biorxiv Preprint
细胞色素P450酶在植物微生物中的作用...
摘要：细胞色素P450是古老的酶，这些酶在属于所有生命王国（包括病毒）的生物中扩散，其中植物中发现的P450基因数量最多。在哺乳动物中已经广泛研究了细胞色素P450的功能表征，在该哺乳动物中，这些酶参与了药物的代谢以及污染物和有毒化学物质的排毒。这项工作的目的是概述细胞色素P450酶在介导植物与微生物之间相互作用中的作用。最近，几个研究小组开始研究P450酶在植物和（微）生物之间的相互作用中的作用，重点是Holobiont Vitis Vitis vinifera。葡萄藤与大量微生物密切相关，并相互相互作用，从而调节了几种藤蔓生理功能，从生物和非生物胁迫耐受性到收获时的水果质量。
由酶催化驱动的基于合成DNA的游泳者
摘要：在这里，我们报告了用酶（以下称为DNA-酶游泳者）装饰的基于DNA的合成纳米结构，可以通过将酶促底物转换为溶液中的产物来进行自propel。DNA-酶游泳者是从通过DNA瓷砖杂交自发地组装的管状DNA结构中获得的。我们用两种不同的酶，尿素酶和过氧化酶使这些DNA结构官能化，并表明它们在添加酶促底物（即尿素和H 2 O 2）后表现出浓度依赖性运动并增强扩散。为了证明这种基于DNA的游泳者的可编程性，我们还设计了从DNA支架中取代酶的DNA链，从而充当DNA游泳者的分子“制动器”。这些结果是开发基于合成DNA的酶驱动游泳者的原理的第一个证明，这些游泳者可以在流体中自行自行。■简介
功能化寡核苷酸，合成催化剂作为酶模拟
遗传信息的存储和转移[1，2]。 DNA甚至没有主要考虑，假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。 要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍（大部分是沃森和克里克基料配对），在糖的2'位置下没有羟基。 又花了十年的时间证明了dnazymes，单链的脱氧乙烯核苷酸（ODN），而没有体内对应物，也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。 可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体（能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6]，依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐（DNTP）。 这些核苷酸是（突变）DNA 的底物遗传信息的存储和转移[1，2]。DNA甚至没有主要考虑，假设惰性化学性质将通过确保没有不希望的遗传指示改变来提供进化优势。要克服的主要障碍是四个具有有限功能的规范性障碍（大部分是沃森和克里克基料配对），在糖的2'位置下没有羟基。又花了十年的时间证明了dnazymes，单链的脱氧乙烯核苷酸（ODN），而没有体内对应物，也能够具有可以匹配酶的催化活性[3,4]。可以通过迭代且功能强大的SELEX方法在体外选择dnazymes的适体（能够结合催化特性但没有催化特性的寡核苷酸[5,6]，依赖于使用未修饰的核苷5' - 三磷酸盐（DNTP）。这些核苷酸是（突变）DNA