最近的单细胞转录组学的发展强调了人类肠上皮中成熟吸收细胞的新谱系的存在。该亚群的特征在于Bestrophin 4(Best4)和其他标记基因(包括OTOP2,CA7,GUCA2A,GUCA2A,GUCA2B和SPIB)的特定表达。最佳4Þ细胞出现在发育的早期,并且存在于小肠和大肠的所有区域,<所有上皮细胞的<5%)。位置特异性基因表达在Best4Þ细胞中的表达素纤维表明它们在每个肠道区域中的功能专业化,如离子通道CFTR的小细胞特异性表达所示例。最佳4Þ细胞的推定作用包括腔内pH的传感和调节,对鸟叶基环酶-C信号的调节,电解质的运输,粘液的水合以及抗菌肽的分泌。但是,这些假设中的大多数缺乏功能验证,尤其是因为小鼠中没有最佳4Þ细胞。人类肠道器官中最佳4Þ细胞的存在表明该体外模型应适合研究其作用。最近的研究表明,最佳4Þ细胞也存在于猕猴,猪和斑马鱼的肠上皮中,在这里我们报告它们在兔子中的存在,这表明这些物种可以是适当的动物模型,以研究疾病发展过程中最佳4Þ细胞及其与饮食或饮食饮食或微生物局部饮食的相互作用期间的最佳动物模型。在这篇综述中,我们总结了有关最佳细胞的现有文献,并强调了其在健康和疾病中肠道上皮中预测的作用的描述。
肠上皮是一种多任务组织,拥有多种不同类型的细胞,可确保食物的消化并保护身体免受管腔内容物中有毒微生物和致癌物的侵害。它是体内更新最快的上皮,每 4-5 天完全更新一次。1 肠上皮的微环境复杂而动态。它的特点是特定的 3D 结构、一组生化梯度和机械线索,它们共同强烈影响细胞行为。2,3 多年来,源自肿瘤的细胞系以及最近的原代肠细胞已被广泛用作研究肠道生理和疾病的体外模型。然而,大多数这些模型都不能忠实地重现关键的体内特征。在这种背景下,人们越来越有兴趣以跨学科的方式结合组织工程和微制造技术,以创建更相关的组织模型。与传统的 2D 或 3D 模型相比,这些所谓的“微生理系统”提供了更复杂、更相关的系统,允许控制和标准化生产。4,5 我们将重点介绍为准确重建肠道环境的关键特征(例如 3D 结构、机械刺激或生化梯度)而开发的生物工程系统。6,7 这些模型有可能提高我们对
关于研讨会的肠上皮是一种坚固的自我更新组织,由有效的茎和祖细胞支持。在流行模型中,隐窝碱中的LGR5+细胞是唯一维持稳态再生的肠道干细胞(ISC)。我们已经确定了以FGFBP1表达为特征的新型上层crypt ISC,它不同于基部的LGR5+细胞,它们是多功能的,并且支持长期的组织自我更新。在这里,我们提出了一个修订后的组织再生模型,该模型将LGR5+干细胞模型与FGFBP1+ ISC的命运图研究对帐。我们还将讨论我们关于干细胞异质性的未发表研究。
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黄斑疾病是西方世界视力丧失的主要原因之一。仅在英国,将近150万人患有这些毁灭性疾病,这些疾病主要影响黄斑,这是视网膜中的一个造成详细中央愿景的地区。在许多患者中,可归因于衰老或遗传突变的细胞变化与视网膜色素上皮(RPE)有关,这是一种维持和支持光敏感视网膜的单层细胞。在没有功能性RPE的情况下,视网膜被损坏并视力恶化。目前,这些疾病没有治疗方法。在过去的二十年中,诱导的多能干细胞彻底改变了我们对视网膜疾病的研究,使研究人员能够在菜肴中产生以前无法接近的RPE细胞。从患者中重新创建这些细胞的能力已提供了新的模型系统,以了解疾病背后的机制,并加速新疗法以治疗视力丧失。
。CC-BY-ND 4.0 国际许可证下提供(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2023 年 8 月 12 日发布。;https://doi.org/10.1101/2023.08.11.553035 doi:bioRxiv 预印本
02115,美国4美国麻省理工学院和哈佛大学,马萨诸塞州剑桥市02142,美国5生物物理学研究生课程,哈佛大学,马萨诸塞州剑桥,马萨诸塞州02138,美国6哈佛大学MD-PHD计划,哈佛大学医学院,波士顿,波士顿,波士顿,马萨诸塞州,美国马萨诸塞州72115哈佛大学学院,剑桥,马萨诸塞州02138,美国9内分泌学,糖尿病和代谢部,贝丝以色列
药物再利用有可能使现有的去风险药物对正在发生的流行病——COVID-19 进行有效干预。截至 2021 年 4 月 4 日,该流行病已感染超过 1.31 亿人,全球有 280 万人死于该疾病。我们使用了一种基于“基因特征”的新型药物重新定位策略,即应用广泛接受的基因排序算法来优先考虑 FDA 批准或正在试验的药物。我们使用 CLC Genomics Workbench 20 (QIAGEN) 挖掘了公开可用的 RNA 测序 (RNA-Seq) 数据,并在对基于严重急性呼吸综合征相关冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 感染原发性人呼吸道上皮细胞的三项独立研究进行荟萃分析后,确定了 283 个差异表达基因 (FDR < 0.05, log2FC > 1)。独创性通路分析 (IPA) 显示,SARS-CoV-2 激活了关键的典型通路和基因网络,这些通路和基因网络错综复杂地调节一般的抗病毒以及特定的炎症通路。从 Metacore 和 IPA 中提取的药物数据库确定了 15 个药物靶点(包含有关 COVID-19 发病机制的信息),其中 46 种现有药物可作为 COVID-19 治疗的潜在新型候选药物。我们发现 35 种抑制靶点(ALPL、CXCL8 和 IL6)的新型药物已经在 COVID-19 的临床试验中。此外,我们发现 6 种现有药物针对 4 个潜在的抗 COVID-19 靶点(CCL20、CSF3、CXCL1、CXCL10),这些靶点可能具有新的抗 COVID-19 适应症。最后,根据基因排名算法对这些药物靶点进行计算优先排序,结果显示 CXCL10 是与 2 种现有药物最常见且最强的候选药物。此外,283 种 SARS-CoV- 2 相关蛋白列表不仅可以作为抗 COVID-19 靶点,而且对于 COVID-19 生物标志物的开发也很有用。
