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组织中无细胞的DNA甲基化位点在肌萎缩性侧面硬化症
1。神经病学系，加州大学洛杉矶分校，洛杉矶，加利福尼亚2。基因组健康研究所，伊坎医学院位于纽约，纽约州西奈山3. 分子，细胞和发育生物学系，加州大学洛杉矶分校；洛杉矶，加利福尼亚4。 化学，生命科学和环境可持续性系，意大利帕尔马大学5。 澳大利亚布里斯班昆士兰州大学分子生物学研究所6。 心血管研究所，加州大学旧金山UCSF 7。 系统和合成生物学，基因组调节中心，西班牙巴塞罗那8。 内科学系III，维也纳医科大学风湿病学系，奥地利，奥地利9。 马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌症研究所医学肿瘤学系10. 计算和系统生物学跨部门计划，加州大学洛杉矶分校，加利福尼亚州洛杉矶11。 澳大利亚生物工程和纳米技术学院，澳大利亚布里斯班昆士兰州大学12。 皇家布里斯班和妇女医院神经病学系，澳大利亚昆士兰州布里斯班， 生物医学科学学院，澳大利亚布里斯班昆士兰州大学医学院 昆士兰州脑研究所，昆士兰州昆士兰州，布里斯班，澳大利亚15。 Mater公立医院，澳大利亚布里斯班16。 神经病学系，加州大学旧金山，加州大学，加利福尼亚州17。 加利福尼亚大学洛杉矶分校的人类遗传学系，加利福尼亚州洛杉矶基因组健康研究所，伊坎医学院位于纽约，纽约州西奈山3.分子，细胞和发育生物学系，加州大学洛杉矶分校；洛杉矶，加利福尼亚4。化学，生命科学和环境可持续性系，意大利帕尔马大学5。澳大利亚布里斯班昆士兰州大学分子生物学研究所6。心血管研究所，加州大学旧金山UCSF 7。 系统和合成生物学，基因组调节中心，西班牙巴塞罗那8。 内科学系III，维也纳医科大学风湿病学系，奥地利，奥地利9。 马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌症研究所医学肿瘤学系10. 计算和系统生物学跨部门计划，加州大学洛杉矶分校，加利福尼亚州洛杉矶11。 澳大利亚生物工程和纳米技术学院，澳大利亚布里斯班昆士兰州大学12。 皇家布里斯班和妇女医院神经病学系，澳大利亚昆士兰州布里斯班， 生物医学科学学院，澳大利亚布里斯班昆士兰州大学医学院 昆士兰州脑研究所，昆士兰州昆士兰州，布里斯班，澳大利亚15。 Mater公立医院，澳大利亚布里斯班16。 神经病学系，加州大学旧金山，加州大学，加利福尼亚州17。 加利福尼亚大学洛杉矶分校的人类遗传学系，加利福尼亚州洛杉矶心血管研究所，加州大学旧金山UCSF 7。系统和合成生物学，基因组调节中心，西班牙巴塞罗那8。内科学系III，维也纳医科大学风湿病学系，奥地利，奥地利9。马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌症研究所医学肿瘤学系10.计算和系统生物学跨部门计划，加州大学洛杉矶分校，加利福尼亚州洛杉矶11。澳大利亚生物工程和纳米技术学院，澳大利亚布里斯班昆士兰州大学12。皇家布里斯班和妇女医院神经病学系，澳大利亚昆士兰州布里斯班，生物医学科学学院，澳大利亚布里斯班昆士兰州大学医学院昆士兰州脑研究所，昆士兰州昆士兰州，布里斯班，澳大利亚15。Mater公立医院，澳大利亚布里斯班16。神经病学系，加州大学旧金山，加州大学，加利福尼亚州17。加利福尼亚大学洛杉矶分校的人类遗传学系，加利福尼亚州洛杉矶
保守的DNA甲基转移酶：细菌表观遗传调节基本机制的窗口
越来越多的研究报告说，细菌DNA甲基化具有重要的功能，超出了其在限制性修饰系统中的作用，包括影响临床相关的表型，例如毒力，宿主定殖，孢子孢子，生物膜形成等。尽管有洞察力，但此类研究在很大程度上具有临时的性质，并且将从系统的策略中受益，从而实现微生物学界对细菌甲基瘤的联合功能表征。在这种意见中，我们建议高度保守的DNA甲基转移酶（MTases）代表了细菌表观基因组学研究的独特机会。这些MTases在细菌中很常见，跨越各种分类法，并且存在于多种人类病原体中。除了具有良好特征的核心DNA MTase，例如来自Vibrio Cholera，Salmonella Enterica，梭状芽胞杆菌艰难梭菌或化脓性链球菌的核心MTase，在许多人类病原体中也发现了多个高度保守的DNA MTase，其中包括属于Burkholderia属的人和阿科氏菌。我们讨论了为什么以及如何优先考虑这些MTase，以使社区范围内的综合方法进行功能基氏症研究。最终，我们讨论了一些高度保守的DNA MTases如何成为开发新型表观遗传抑制剂以用于生物医学应用的有希望的靶标。
一种甲基营养细菌，伴有抗糖尿病药物二甲双胍作为其唯一碳，氮和能源
摘要：二甲双胍是全球规定的抗糖尿病药物之一，也被认为是其他治疗应用，包括癌症和内分泌疾病。它在很大程度上是由人类酶及其在环境中的存在无代谢的，这引起了人们的关注，据报道，对水生生物的有毒作用以及对人类的潜在影响。我们报告了菌株MD1的分离和表征，菌株MD1是一种用二甲双胍生长为唯一的碳，氮和能源的有氧甲基营养细菌。菌株MD1将二甲双胍降解为用于生长的二甲基胺，而鸟苷脲作为副产品。对其完全组装的基因组的序列分析表明其对氨基杆菌的影响。差异蛋白质组学和转录组学，以及菌株的微型转poson诱变，指向二甲双胍生长必不可少的基因和蛋白质，并可能与二甲双胍的水解C-N裂解有关，或与二甲甲甲酸和七一个甘表示的细胞转运有关。获得的结果表明，菌株MD1降解二甲双胍的生长支持能力的最新演变。我们的结果确定了菌株MD1中二甲双胍转化的酶系统的候选蛋白质，并将为未来关于二甲双胍及其降解产物在环境和人类中的降解产物的命运提供信息。
PPARγ（PPARγ）基因的甲基化动力学在人骨骨髓间充质干细胞的成脂分化过程中PPARγ（PPARγ）基因的甲基化动力学在人骨骨髓间充质干细胞的成脂分化过程中
在过去的十年中，干细胞分化和修复组织的显着能力吸引了大幅关注。这些细胞已被证明具有多能分化的显着潜力，在精确定义的条件和特定的环境提示下，具有分化为成骨，脂肪生成，软骨和肌生成细胞谱系的能力（1）。尽管在整个身体的几个组织中已经鉴定出间质干细胞（MSC），包括脂肪组织，肌肉和牙髓，但骨髓仍然是这些细胞的主要储层（2）。因此，源自骨髓的MSC被广泛认为是研究和表征MSC的基准。关于MSC的实验室研究显着有助于理解这些细胞，从而为研究人员提供了宝贵的见解和知识（3，4）。今天，研究人员采用定义明确的培养条件和生长因素来指导MSC分化为特定的细胞谱系。这可以利用MSC用于再生医学和组织工程中的各种应用（5，6）。脂肪形成是一个严格控制的过程，其中间充质干细胞将分化为成熟和功能性脂肪细胞（7）。在最佳条件下，这些间充质细胞表现出不同的形态特征，并表达与脂肪细胞成熟相关的特定基因。必须考虑到分化过程是一种多阶段和协调的现象，涉及间充质干细胞，前脂肪细胞和成熟的脂肪细胞作为关键参与者（8）。有效的细胞内和细胞外微环境的有效细胞通信对于脂肪形成必须是必不可少的（9）。生长因子，分子信号和转录因子介导这种复杂的通信。此过程中涉及的转录因子之一是过氧化物酶体增殖物激活的受体伽马（PPARγ）。pPARγ属于配体激活的转录因子家族，在基因表达的调节中起着重要作用（10）。先前的研究已经证明，PPARγ基因对于将间充质干细胞区分为完全成熟的脂肪细胞至关重要（11）。它被认为是此过程中的一个基本因素。PPARγ包括两个同工型，两种同工型都在脂肪细胞中表达。对与该转录因子相关的调节区域的分析表明，它参与了参与脂肪生成的许多基因的转录调控（12，13）。衍生自骨髓的间充质干细胞
FEMA：大型样品全脑成像数据的快速有效的混合效应算法
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在阿尔茨海默氏病中揭示了DNA甲基化
摘要越来越多地通过探索表观遗传机制，尤其是DNA甲基化来阐明阿尔茨海默氏病发病机理的复杂性。本综述全面调查了最新以人为中心的研究，这些研究研究了整个基因组DNA甲基化在阿尔茨海默氏病神经病理学中。对各种大脑区域的检查揭示了与Braak阶段和阿尔茨海默氏病进展相关的独特DNA甲基化模式。内嗅皮层由于其早期的组织学改变以及随后对海马等下游区域的影响而成为焦点。值得注意的是，在内嗅皮层中复杂地鉴定出与神经纤维缠结形成有关的Ank1高甲基化。此外，颞中回和前额叶皮层显示出对Hoxa3，Rhbdf2和MCF2L等基因的显着高甲基化，这可能会影响神经炎症过程。BIN1在晚期阿尔茨海默氏病中的复杂作用与改变的甲基化模式相关。尽管在研究之间存在差异，但这些发现突出了表观遗传修饰与阿尔茨海默氏病病理学之间的复杂相互作用。未来的研究工作应解决方法论上的差异，结合多样的人群，并考虑环境因素，以揭示阿尔茨海默氏病进展的细微表观遗传景观。关键词：阿尔茨海默氏病； ank1; bin1; DNA甲基化；全基因组的关联研究； Hoxa3; MCF2L; RHBDF2
DNA甲基化发作性gabriele-de vries综合征
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石墨烯在润滑油，乙二醇和甘油中的粘度
进行热交换器，制冷系统或发电厂。不幸的是，通常的传热液（例如水和聚合物溶液）具有相对较低的热电导率。改善热萃取的一种方法是将传热液的流量与某些固体材料的高热电导率相结合，例如金属，金属氧化物或不同的碳材料：碳黑[6]，碳纳米管[9]，碳纳米含量[4] [4]或石墨烯Nananoplatelets [29]。然而，使用微米尺寸的固体材料的悬浮液会导致并发症，例如磨损，沉积和堵塞。石墨烯是六角形键合的碳原子的单原子薄片，由Novoselov等人优雅地获得并表征。[18]，现在是研究最多的材料之一。The importance of graphene nanoplatelets and their benefits have been investigated, and the following advantages have been mentioned [ 22 ]: (1) it is relatively easy to synthesize, (2) it has long suspension time (leading to stable particle suspensions), (3) graphene nanoplatelets have large surface area/volume ratio, and (4) present low erosion, corrosion and clogging.这种悬浮液的动态粘度也是传热中实际应用的重要特性。大多数科学文献是关于水中的悬浮液，有时是表面活性剂/分散剂[1、2、10、12、19]，证明了石墨烯纳米片浓度会导致粘度非线性增加。meh-Rali等。伊朗曼什等人。此外，几位作者研究了石墨烯纳米片的粘度[27]，并显示出强大的温度降低。[16]制备的均质石墨烯纳米板 - 让使用高功率超声探针的悬浮液，以浓度为0.025、0.05、0.05、0.075和0.1质量％，对300、500、500、500和750 m 2 g-1的三个不同表面区域进行悬浮液。他们测量了在20至60°C的温度下，水平纳米片的粘度与剪切速率的粘度。观察到粘度随温度降低，但对浓度和特定表面积敏感。在水中，graphene纳米片悬浮液的样品也表现出剪切粉，可以解释如下。在较低的剪切速率下，随着纳米板旋转的液体旋转，它们逐渐使它们沿增加剪切的方向对齐，从而产生较小的耐药性，从而降低粘度。当剪切速率足够高时，达到了最大可能的剪切顺序，骨料分解为较小的尺寸，降低粘度[7，25]。[11]还研究了分散在蒸馏水中的石墨烯纳米片的粘度和热导电，并研究了三个有影响力的参数，包括浓度，温度和特定表面积。他们提出了相对粘度作为不同特定表面积，浓度和温度的函数的相关性。
成人创伤性脑损伤的认知和神经性后遗症的哌醋甲酯：系统评价和荟萃分析
结果：通过元分析记录有利于哌醋甲酯的显着结果，用于五种认知结果指标之一（Trail Make Make Meagry Test a）（P = 0.005，CI [-5.19，-0.91]），以及抑郁域以及抑郁域（P <0.00001，CI [-0.78，-0.39]和patip <0. 0.98，-0.67]）。数据不足，在侵略性，冷漠，躁动，记忆，运动功能，脑抑制综合征和睡眠结构域中可用于荟萃分析。对这些领域中证据的定性审查发现，在小型的随机研究中，在这些各个领域中证明了哌醋甲酯疗效的有限和混合证据。25项研究中有11项被认为包含一些偏见的高风险。 然而，本综述确定了哌醋甲酯对TBI成年人改善抑郁和疲劳的有益作用的支持证据，对认知和其他症状有一些可能的好处。 异质性很高，偏见的风险在整个研究中有所不同，在某种程度上限制了结果的可信度。25项研究中有11项被认为包含一些偏见的高风险。然而，本综述确定了哌醋甲酯对TBI成年人改善抑郁和疲劳的有益作用的支持证据，对认知和其他症状有一些可能的好处。异质性很高，偏见的风险在整个研究中有所不同，在某种程度上限制了结果的可信度。
在Covid-19的情况下识别DNA甲基化模式：一年的前瞻性队列研究的见解
COVID-19条件（PCC）及其长期症状范围的机制尚不清楚。这项研究在一年的非住院COVID-19患者的子集中研究了DNA甲基化模式，该模式持续症状和生活质量降低，称为PCC+（COVID-19疾病后加）。在22个PCC+个体和22个匹配的Covid-19康复（PCC-）的队列中，我们确定了随着时间的推移而减少的组之间的明显DNA甲基化差异。TXNRD1基因的甲基化变化与认知症状和疲劳显着相关，这暗示了PCC病理学中的氧化还原失衡。途径分析显示，PI3K-AKT和AMPK信号通路的富集，可能是二甲双胍在降低PCC发生率中观察到的效力的潜在。尽管我们发现两组之间的表观遗传年龄加速没有差异，但我们观察到RAS和RAP1信号通路的甲基化纵向变化。这些发现提供了对PCC+机制的关键见解，并将氧化应激途径作为治疗干预的有希望的目标。