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GeNNius：一种基于图神经网络的超快药物-靶标相互作用推理方法
药物-靶标相互作用 (DTI) 预测是药物再利用领域中一项相关但具有挑战性的任务。计算机模拟方法引起了特别的关注，因为它们可以降低传统方法的相关成本和时间投入。然而，当前最先进的方法存在几个局限性：现有的 DTI 预测方法在计算上成本高昂，从而阻碍了使用大型网络和利用可用数据集的能力，并且 DTI 预测方法对未见数据集的推广仍未探索，这可能会在准确性和稳健性方面改善 DTI 推断方法的开发过程。在这项工作中，我们介绍了 GE NN IUS（图嵌入神经网络相互作用发现系统），这是一种基于图神经网络 (GNN) 的方法，在各种数据集的准确性和时间效率方面均优于最先进的模型。我们还通过评估每个数据集中以前未知的 DTI 展示了其发现新相互作用的预测能力。我们通过在不同数据集上训练和测试 GE NN IUS 进一步评估了其泛化能力，结果表明该框架可以通过在大型数据集上训练并在较小的数据集上测试来潜在地改进 DTI 预测任务。最后，我们定性地研究了 GE NN IUS 生成的嵌入，发现 GNN 编码器在图卷积之后保留了生物信息，同时通过节点传播这些信息，最终在节点嵌入空间中区分蛋白质家族。
重新设计神经技术：以患者为中心
测量和调节大脑活动的神经技术对改善脑部疾病的诊断和治疗大有裨益 1 。全世界十大主要致残原因中有六种可以通过神经技术方法 2 解决，例如直接侵入式和/或非侵入式调节大脑活动，或通过刺激周围神经间接调节大脑活动（图 1 ）。抑郁和焦虑症、疼痛状态和听力损失位居这份非详尽清单的首位。其他具有感觉、认知和情感症状的疾病，例如物质使用障碍、中风、自闭症和痴呆症（包括阿尔茨海默病），也是值得追求的神经技术目标的进一步例子。最近在选定的患者群体中取得了显著进展。例如，脑机接口在替换和/或恢复截肢、脊髓损伤或脑损伤患者的运动和言语功能方面越来越有效 3、4。然而，这些方法仅适用于相对较少的患者。因此，与公众的看法相反，神经技术尚未达到广泛临床应用的阶段。为了找到加速转化为患者护理的方法，我们组建了一个跨学科专家组，涵盖神经科学、神经内科、神经外科和精神病学、伦理学和社会科学、工程学和计算机科学等领域。我们建议在神经技术研究和开发方面进行三项战略调整，旨在克服目前在范围、可扩展性和利益相关者领域的限制（“3S 原则”；图 2）。拟议的 3S 原则旨在为研究人员以及资助和指导神经技术研究的人员提供指导方针，最终加速神经技术转化为患者护理。
科学文摘 1091
目的：我们的工作旨在调查影响 RA 焦虑和抑郁的因素。方法：这是一项针对 49 名 RA 患者的横断面研究。我们使用医院焦虑和抑郁量表 (HAD) 来评估焦虑症。结果：我们纳入了 24 名女性和 5 名男性，平均年龄为 54.1 岁。69% 的患者失业，81% 的患者有健康保险。RA 平均发展时间为 11.43 ± 7.32 年，平均诊断时间为 2.35 年。93.8% 的病例为侵蚀性。4.1% 的病例出现寰枢椎脱位，8.2% 的病例出现髋炎。83% 的患者正在接受 cs-DMARDs 治疗，14.2% 的患者正在接受生物疗法。大多数患者的疾病活动性较低（53%），平均 DAS28CRP 评分为 2.74 ± 0.81。12% 的患者可能有焦虑症，18% 的患者可能有抑郁症。诊断延迟时间长与焦虑症风险增加有关。工作患者的抑郁症风险较低，而来自农村的患者风险较高。焦虑症和抑郁症的风险与 VAS 疼痛、EGP 和 DAS28 增加有关。在这项多变量研究中，EGP 是焦虑症和抑郁症发展的独立风险因素。结论：焦虑症和抑郁症是 RA 中常见但被低估的后果。诊断一经宣布，就需要接受适当的精神科护理。利益披露：未声明 DOI：10.1136/annrheumdis-2021-eular.2066
关键环境问题的概述
土地使用是人类存在和对地球的物理影响最引人注目的表现之一。从根本上说，人类改变了物种和生态系统的全球模式和流行率。最近的几个研究证实，人类主导的生态系统现在涵盖了地球的土地表面，而不是自然或“野生”生态系统。根据一个估计，超过75％的无冰土地显示出人类居住和活动改变的证据，剩余的野生地剩下不到四分之一。一起，农田和牧场已成为土地使用类别之一。它们占地约40％。完整的景观，几乎没有或根本没有人类活动的影响迹象，例如农业，砍伐，采矿，高速公路，管道或电力线越来越少。衡量完整景观程度的一种方法是人类影响力指数，该指数使用人口密度，定居点，土地利用和基础设施的数据来衡量人类对陆地生态学的直接影响（请参阅地图）。直接人类影响力在沿海地区和划船农业区，交通走廊和人口中心附近。尽管北美的土地数量是恒定的，但使用土地的使用方式不断变化。土地使用与土地覆盖之间的关系很复杂，因为特定的土地覆盖物可能与多种土地用途相对应。例如，林地可用于木材生产，栖息地，再生或分水岭保护。同样，一些
MIT 开放获取文章环境和定向......
∗ Acemoglu：麻省理工学院和加拿大高等研究院，daron@mit.edu。Aghion：哈佛大学斯德哥尔摩经济学院和加拿大高等研究院，paghion@fas.harvard.edu。Bursztyn：加州大学洛杉矶分校，leonardo.bursztyn@anderson.ucla.edu。Hemous：哈佛大学，hemous@fas.harvard.edu。我们感谢 Robert Barro、Emmanuel Farhi、Elhanan Helpman、Dirk Krueger、Per Krusell、David Laibson、Ariel Pakes、Torsten Persson、Nicholas Stern、Nancy Stokey、Martin Weitzman 和三位匿名审稿人提出的宝贵建议。我们还受益于哈佛大学、麻省理工学院、斯坦福大学、伯克利大学、斯德哥尔摩 IIES、苏黎世、美国国家经济研究局暑期学院、中西部宏观会议、加拿大高级研究院、计量经济学会拉丁美洲会议、TSE 和西蒙弗雷泽大学的研讨会和会议参与者的评论。Daron Acemoglu 和 Philippe Aghion 分别感谢图卢兹信息技术网络 (http://idei.fr/tnit/) 和 CIFAR 以及 CIFAR 和 Bruegel 提供的资金支持。 1 例如，请参阅 Peter A. Scott、Dáithí A. Stone 和 Myles R. Allen (2004) 关于人类活动对 2003 年欧洲热浪的影响、Kerry Emanuel (2005) 和 Christopher W. Landsea (2005) 关于过去几十年间热带气旋和大西洋飓风的影响和破坏力增强的文章，以及 Robert J. Nicholls 和 Jason A. Lowe (2006) 关于海平面上升的文章。 2 例如，请参阅 William D. Nordhaus (1994)、Christopher N. MacCracken、James A. Edmonds、Son H. Kim 和 Ronald D. Sands (1999)、Nordhaus 和 Joseph Boyer (2000)。
管理
1991；Levy，2010）。从这个角度来看，公共管理面临的问题与私营企业面临的问题非常相似：与企业管理一样，公共管理负责领导政府机构，被委托管理一批资产，其工作是在动态环境中创造这些资产的价值（Bryson & Roering，1987；Hansen，2010；Ring & Perry，1985）。因此，公共管理中的战略是对私营部门商业战略基本思想的简单改编，它与竞争机制和市场激励有关（Bryson，2004；Hood & Dixon，2015；Walker，2013）。其他学者则认为，私营部门管理者的主要目标是创造经济利润方面的私人价值，而公共部门管理者的目标是创造公共服务方面的公共价值（Agostino & Arnaboldi，2015；Dunleavy，Margetts，Bastow & Tinkler，2006；Stoker，2006）。从这个角度来看，公共部门有自己的条件，面临的情况与私营企业截然不同：首先，公共服务和权力不是由市场驱动的，而是为了维持福利社会而存在的；其次，目标和任务是由政治或公共界定的责任和义务决定的，而不是以利润为导向，因此受政治优先事项的支配，并依赖于集体提供的税收而不是私人消费者选择的年度分配资源（Christensen & Lægreid，2011；Moore，1995，2013）。因此，公共管理中的战略与私营部门公司的战略并不相似，而是与公共部门组织的条件相关（Ferlie，2003；Hansen，2010）。
IUCN报告“基于自然的健康解决方案”IUCN报告“基于自然的健康解决方案”
气候变化的健康含义是深远的，在全球范围内加剧了不平等现象和弱势群体。Heavie r rainfal l and risin g temperature s undermin e acces s t o cle an wate r, amplifyi ng t he spre ad of waterbo rne disea ses l ike chole ra, diarrho ea, and typh oid, w hile also dri vin g an incr eas e in vector- borne di sease su ch as de ngue.cl imate ch ange对食品系统的破坏增强了其形式的营养脂肪腐烂离子，在最严重的情况下，以强迫流离失所[1]。clipat e ch ange and Biod cors loss也威胁了医疗素的质量，这些疾病在全球初级保健系统中都发挥了作用，并且在全球初级卫生保健系统中发挥了作用。Heatwaves，现在以Grea ter频率和Int Ensi Ty的形式出现，遇到中风和心血管疾病的风险，尤其是在Frastru ctur E的绿色有限的城市地区[2]。对身体健康的影响，气候变化对精神上的风险构成风险，尤其是在年轻人中。攀登变化与高度的气候焦虑，抑郁症和p ost-trau matic应力障碍（PTSD）相关联。
人工智能算法需要可解释——...
随着人工智能 (AI) 在放射学领域的作用日益增强，人们对现代 AI 算法的黑箱性质感到担忧。AI 用户通常无法知道算法如何或为何得出预测，这使得用户很难评估或批评预测的质量。统称为可解释 AI (XAI) 的一组方法旨在通过提供算法输入和输出之间因果关系的人类可理解的解释来克服这一限制。XAI 的动机包括促进临床医生和 AI 系统之间的信任、实现错误检测和促进知情同意。然而，有人认为，XAI 实际上可能无法满足临床医生的需求，还可能带来意想不到的后果，从而可能损害 XAI 的预期价值 ( 1 )。在 2022 年核医学和分子成像学会年会上，我们就 XAI 的临床需求进行了辩论。我们在此通过讨论 5 个关键论点来总结这场辩论。对于每个论点，我们从数据科学、临床实践和生物伦理的角度提出支持和反对使用 XAI 的理由。首先，应该认识到，XAI 一词指的是多种方法，其中大多数最初是为医学以外的用途开发的 ( 2 )。XAI 包括可解释方法，其中 AI 算法被设计为本质上可解释，以及应用于已训练算法的事后方法。解释的呈现方式也可能有所不同 ( 3 )。在放射学中，XAI 通常通过显着图呈现，其突出显示对模型预测影响最大的图像部分。例如，Miller 等人。展示了显着图如何突出显示心肌中对 SPECT 图像中基于 AI 的冠状动脉疾病诊断影响最大的区域 ( 4 )。
多Xy分析探索牙科和疾病的模式在牙科和骨骼残留中，来自19世纪的荷兰人口
牙科演算是有关过去人群饮食模式的绝佳信息来源，包括食用植物性物品。检测植物来源的残基，例如生物碱及其在牙科积极中的代谢产物，提供了人群中个体消费的直接证据。我们对19世纪荷兰考古遗址Middenbeemster的41个人进行了研究。进行骨骼和牙科分析，以探索病理病变与生物碱的存在之间的潜在关系。牙科积分。我们能够检测到尼古丁，可替宁，茶碱，茶碱和水杨酸，这表明在单独的尺度上消费茶，浓缩和吸烟，这也可以通过历史文献和牙齿牙科污染物的识别来证实。尼古丁和/或可替宁存在至少一个可见管道缺口的56％。骨骼保存对生物碱的检测有一些影响，从保存良好的个体中提取了较高数量的化合物，我们观察到积极样品的重量与检测到的化合物的重量之间存在正相关关系，以及慢性上皮鼻窦炎与Mul- tiple-tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-Tiple-tiple-the。尽管存在局限性，但这项初步研究表明，使用微积分来瞄准可以用作药物或饮食的各种化合物。这种类型的分析需要解决许多局限性；我们强调需要对含生物碱物品的消费进行更多系统的研究及其随后在牙科计算中的浓度和保留，此外，除了消费方式如何影响牙列中的浓度。这种方法使我们能够直接解决特定的个人，这对于在历史文献中并不总是有据可查的个体（例如农村人口，尤其是儿童和妇女）中特别有用。
探索耦合-Extreme-environments-via-in-in-situ- ...
为了开发高级材料解决方案并改善预测模型，必须充分了解对广泛的外部刺激的基本材料反应[1]。在极端温度，机械应力，放射线和其他恶劣条件下的系统对未来的工程应用（例如深空探索[2]和先进的核反应堆[3]）引起了人们的兴趣。单独的这些条件会带来重大挑战，尽管材料很少受到单个压力源。要捕获在这种环境中可能出现的协同作用，有必要将材料暴露于相关条件的组合中，以揭示基本机制之间的复杂相互作用[4]。sub-nm解决能力和应用刺激的组合使原位传输电子显微镜（TEM）成为探索Mateiales Science基本机制的强大工具[5]。通过将电子束成像与样品持有人的变量和外部硬件耦合，直接观察材料如何响应耦合的极端条件的响应。与建立硬件，进行实验和解释结果相关的挑战使原位tem成为研究的动态和活跃领域。近几十年来，原位显微镜的能力范围已实际增长，允许化学反应期间的纳米力学测试[6,7]，用于放射损伤研究的离子辐射[8,9]，紫外线可见光光照明光催化的光照明用于光催化[10]，超级进程[10]，超级进程[10]，nano-sace [10] [10] [10] [10] [10] [12–15]。近几十年来，原位显微镜的能力范围已实际增长，允许化学反应期间的纳米力学测试[6,7]，用于放射损伤研究的离子辐射[8,9]，紫外线可见光光照明光催化的光照明用于光催化[10]，超级进程[10]，超级进程[10]，nano-sace [10] [10] [10] [10] [10] [12–15]。Sandia国家实验室是经过重大修改的所在地，被称为原位辐射TEM（I 3 TEM）[16]。三个离子加速器的集成，激光暴露，加热和冷却功能，机械测试平台和高速成像功能使I 3 TEM唯一