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通过抑制针对外源 DNA 的防御系统将大肠杆菌 MG1655 转化为化学过量生产者
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2020 年 8 月 15 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.08.15.251348 doi：bioRxiv preprint
分析城市能源以实现净零能源社区
在转基因作物中表达的外源蛋白的细胞定位不仅决定了其稳定性，而且还决定了它们对作物生长和发育的影响，包括在压力条件下；然而，潜在的分子机制仍然未知。在这里，我们通过亚细胞定位，免疫组织化学，免疫流畅和蛋白质印迹分析确定了抗昆虫的转基因水稻huahui-1（HH1）细胞中外源表达的Cry1Ab/c蛋白的细胞分布。通过酵母两杂交，双分子分子荧光互补（BIFC）和辅助药物分析研究了CRY1AB/C蛋白与初筛选的内源性质膜Ca 2+ ATPase之间的相互作用。通过比较CRY1AB/C和Ca 2+ ATPase之间的细胞定位和相互作用位点分析了潜在的相互作用机制。表型指数和Ca 2+ -ATPase活性在转基因HH1和父母线Minghui-63在无压力和盐压力的条件下确定，可以由CRY1AB/C-Ca 2+ -ATPase相互作用调节。结果表明，Cry1ab/C不仅分布在细胞质和核中，而且还分布在质膜上，在质膜上与质膜Ca 2+ -ATPase相互作用。通过BIFC实验，这种相互作用部分保留了细胞核中的质膜蛋白Ca 2+ ATPase，因此可能会通过改变蛋白质的细胞位置来影响膜上Ca 2+ -ATPase活性。一致地，我们的结果证实了转基因HH1中Cry1ab/c的存在导致Ca 2+ -ATPase活性的降低，并对植物表型造成不利影响，包括显着降低的植物高度和生物量，与亲属MH63相比；并且这些有害作用在盐应力条件下更明显，从而影响转基因
基于人工智能结合气候外生变量预测巴西和美国的新冠肺炎病例
根据世界卫生组织的数据，新型冠状病毒病（COVID-10）曾是一个公共卫生问题，截至 2020 年 6 月 10 日，全球已有超过 710 万人感染，40 多万人死亡。在当前情况下，巴西和美国每天的新增病例和死亡人数都很高。因此，预测一周时间窗口内的新增病例数非常重要，这可以帮助公共卫生系统制定应对 COVID-19 的战略规划。预测人工智能（AI）模型的应用有可能处理像 COVID-19 这样的时间序列的困难动态行为。在本文中，贝叶斯回归神经网络、立体回归、k 最近邻、分位数随机森林和支持向量回归可单独使用，并结合最近的预处理变分模态分解（VMD）将时间序列分解为几个固有模态函数。所有 AI 技术均在时间序列预测任务中进行评估，预测巴西和美国五个州的累计 COVID-19 病例数提前一、三和六天，截至 2020 年 4 月 28 日，病例数较高。所有预测模型均采用先前累计的 COVID-19 病例数和每日温度和降水等外生变量作为输入。根据性能标准评估模型的有效性。一般而言，VMD 的混合在准确性方面优于单一预测模型，特别是当预测时间范围提前六天时，混合 VMD-单一模型在 70% 的案例中实现了更好的准确性。关于外生变量，作为预测变量的重要性排名从高到低依次为过去病例、温度和降水。因此，由于评估模型能够有效地预测长达六天的累计 COVID-19 病例数，因此
大肠杆菌亮氨酸响应调节蛋白在体内桥接 DNA，并在外源亮氨酸存在下可调地解离
摘要 盛宴-饥荒反应蛋白是原核生物中一类广泛保守的全局调节蛋白，其中研究最多的是大肠杆菌亮氨酸反应调节蛋白 (Lrp)。Lrp 能够感知环境营养状况，并随后直接或间接地调节大肠杆菌中多达三分之一的基因。Lrp 主要以八聚体和十六聚体 (16 聚体) 的形式存在，其中亮氨酸被认为会使平衡向八聚体状态移动。在本研究中，我们分析了三种寡聚状态的 Lrp 突变体在其与 DNA 结合和调节外源亮氨酸引起的基因表达的能力方面的影响。我们发现二聚体以上的寡聚化是 Lrp 的调节活性所必需的，并且与之前的推测相反，外源亮氨酸仅通过抑制 Lrp 与 DNA 结合来调节其靶启动子处的 Lrp 活性。我们还证明了 Lrp 结合可以在数千碱基的长度范围内连接 DNA，揭示了 Lrp 介导的转录调控的一系列新机制。
利用 CRISPR-Cas9 同时进行 HDR 过表达和 NHEJ 抑制，在杨树中进行精确的外源插入和序列替换
CRISPR 介导的基因组编辑已成为生物性状遗传修饰的有力工具。然而，开发基于同源定向 DNA 修复 (HDR) 的高效、位点特异性基因敲入系统仍然是植物面临的重大挑战，尤其是在杨树等木本植物中。本文表明，同时抑制非同源末端连接 (NHEJ) 重组辅因子 XRCC4 和过度表达 HDR 增强因子 CtIP 和 MRE11 可以提高基因敲入的 HDR 效率。使用这种方法，BleoR 基因被整合到 MKK2 MAP 激酶基因的 3' 端以产生 BleoR-MKK2 融合蛋白。根据 TaqMan 实时 PCR 评估的完全编辑核苷酸，与没有 HDR 增强或 NHEJ 沉默相比，当使用 XRCC4 沉默结合 CtIP 和 MRE11 过度表达时，HDR 介导的敲入效率高达 48%。此外，HDR 增强子过表达和 NHEJ 抑制的组合还提高了基因组靶向效率，使 CRISPR 诱导的插入和缺失 (InDels) 减少了 7 倍，从而对杨树中基于 MKK2 的盐胁迫反应没有功能性影响。因此，这种方法不仅适用于杨树和植物或农作物，也适用于哺乳动物，以提高 CRISPR 介导的基因敲入效率。
外源 DNA 序列的“同类相食”：适应性免疫的祖先形式，需要识别危险
适应性免疫是一种复杂的免疫反应形式，能够保留大量靶抗原（表位）作为非自身抗原的分子记忆。当它再次遇到具有已知表位的免疫球蛋白或 T 细胞受体抗原结合位点时，它能够重新激活自身，而这些表位之前曾激活过宿主免疫系统。长期以来，人们一直认为适应性免疫是一种高度进化的非自身识别形式，在物种形成过程中出现得相当晚，是对一种更普遍的反应（称为先天免疫）的补充。先天免疫提供了一种相对非特异性的防御（尽管由能够特异性识别病毒或细菌化合物的传感器介导），并且不保留对危险的记忆。但是，这种最近获得适应性免疫的概念受到了挑战，因为原核生物中已经存在另一种形式的特定识别机制，这种机制可能能够特异性地自动防御外部危险。这种识别机制可以被认为是一种原始形式的特定（适应性）非自身识别。它基于这样一个事实：许多古细菌和细菌使用一种基因组编辑系统，该系统赋予原核生物适当的病毒 DNA 序列的能力，使它们能够通过一种与适应性免疫非常相似的机制来防止宿主受到损害。这被模糊地称为“外来 DNA 的内源化”或“病毒 DNA 捕食”，或者更形象地说是“DNA 同类相食”。多年来，证据不断积累，突显了外来 DNA 的内源化在与适应性免疫相关的基本过程中的关键作用，并导致了适应性免疫在物种形成后期出现的教条的改变。
利用 CRISPR-Cas9 同时进行 HDR 过表达和 NHEJ 抑制，在杨树中进行精确的外源插入和序列替换
CRISPR 介导的基因组编辑已成为生物性状遗传修饰的有力工具。然而，开发基于同源定向 DNA 修复 (HDR) 的高效、位点特异性基因敲入系统仍然是植物面临的重大挑战，尤其是在杨树等木本植物中。本文表明，同时抑制非同源末端连接 (NHEJ) 重组辅因子 XRCC4 和过度表达 HDR 增强因子 CtIP 和 MRE11 可以提高基因敲入的 HDR 效率。使用这种方法，BleoR 基因被整合到 MKK2 MAP 激酶基因的 3' 端以产生 BleoR-MKK2 融合蛋白。根据 TaqMan 实时 PCR 评估的完全编辑核苷酸，与没有 HDR 增强或 NHEJ 沉默相比，当使用 XRCC4 沉默结合 CtIP 和 MRE11 过度表达时，HDR 介导的敲入效率高达 48%。此外，HDR 增强子过表达和 NHEJ 抑制的组合还提高了基因组靶向效率，使 CRISPR 诱导的插入和缺失 (InDels) 减少了 7 倍，从而对杨树中基于 MKK2 的盐胁迫反应没有功能性影响。因此，这种方法不仅适用于杨树和植物或农作物，也适用于哺乳动物，以提高 CRISPR 介导的基因敲入效率。
在不同姿势下的外源空间注意力的触觉 - 视觉联系：心理物理学和ERP的收敛证据
空间注意力的机制优先考虑与其他位置相对于其他位置的感官信息。这些机制已通过多种方法进行了深入的研究，包括心理物理学，事件型大脑电位，功能成像和单细胞记录（例如，参见Parasuraman，1998年，有关所有这些方法的发现）。这项工作导致了许多可复制的发现和一些重要的区别。的秘密关注转移（例如Mangun，Hillyard和Luck，1993； Posner，1978）。刺激驱动的外源机制已与预期驱动的内源性机制区分开来（例如Hopfinger＆Mangun，1998; Jonides，1981; Posner，1978）。通常通过使用空间非预测的外围提示来研究前者，后者通过中央提示或指示可能目标位置的指令进行研究。两种形式的提示都可以在提示的位置带来性能优势，但是外源和内源性机制被认为在几种方面有所不同，包括其效果的时间过程（例如，外源性效应通常更短暂地遵循
从无易见的碳水化合物和外源形式的结肠细菌发酵中得出的短链脂肪酸的作用，在改善年轻反刍动物的肠粘膜免疫中
短链脂肪酸（SCFA）是一类有机脂肪酸，长度为1至6碳。它们是由非消化碳水化合物（NDC）发酵的主要终产物。它们是断奶后反刍动物的基本能源。SCFA通过肠道菌群向宿主表示饮食的主要碳浮标。它们在调节胃肠道（GIT）的细胞膨胀和基因表达方面也起着至关重要的作用。最近，在理解SCFA及其与宿主的相互作用的免疫调节作用方面取得了显着进展。这项研究所涉及的过程涵盖了浮游性激活，淋巴细胞的增殖以及肠粘膜免疫成熟的成熟。重要的是要注意，肠粘膜免疫系统的建立和成熟与肠上皮细胞（IEC）（IEC）和肠道微生物群的稳态相关。因此，对SCFA在肠胃粘膜免疫反应中的作用的见解将增强我们对它们各种调节功能的理解。本综述旨在分析有关SCFA作为肠道菌群与动物健康之间基本信号分子作用的最新证据。此外，我们还提供了有关乳制犊牛肠粘膜免疫反应中SCFA的当前文献的摘要。
数学经济学在解释经济体经济增长中，内源性和外源技术变革
经济增长是经济经济政策中不同生产力因素之间相互作用的函数，尤其是它可以用劳动力，生产资源（土地，资本）和技术等方面表达。 div>这项工作旨在采用一个模型来解释发展中经济体的经济增长，该模型是根据上述因素提出了这种增长的模型。然后根据资本和工作提出生产，并调整了两个模型，一种具有外在技术变化，另一种暗示了内源性的技术变化。 div>该模型是通过具有恒定替代弹性的生产函数开发的，因此它适用于发达和发展经济体，因为预计在经济体中会发展出替代经济增长的弹性。 div>研究使我们能够开发