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活性污泥中的细胞外聚合物 - 抗生素相互作用：评论
抗生素是最常开处方的药物，已广泛用于预防或治愈人类和兽医疾病，无疑导致大量释放到下水道网络和废水处理系统中，这是一种热点，其中抗生素转化的发生和转化。细胞外聚合物物质（EPS），通过微生物活性分泌的生物聚合物，在细胞粘附，养分保留和毒性耐药性中起重要作用。然而，与抗生素的耐药性和去除相关的污泥EP的潜在作用尚不清楚。这项工作总结了最先进的微生物EPS的组成和物理化学特征，突出了EPS在去除抗生素中的关键作用，评估其在不同的抗生素暴露下的防御性能，并分析可能影响抗抗生素的吸附和生物转化行为的典型因素。接下来，分析了微生物EPS与抗生素抗性基因之间的相互作用。未来的观点，尤其是微生物EPS在抗生素毒性检测和防御方面的工程应用也受到了强调。©2022作者。由Elsevier B.V.代表中国环境科学研究所，中国环境科学学院出版。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
ProbeInterface：细胞外电生理学中探针处理的统一框架
使用穿透式细胞外多通道电极阵列（通常称为神经探针）记录神经元活动是探测神经元活动最广泛的方法之一。尽管有大量可用的细胞外探针设计，但尖峰分类软件要求的电极通道顺序和相对几何形状的映射这一耗时过程总是留给最终用户。因此，这个手动过程容易出现错误映射，进而导致不良的尖峰分类误差和效率低下。在这里，我们介绍了 ProbeInterface，这是一个开源项目，旨在通过消除在尖峰分类之前手动进行探针映射的步骤来统一神经探针元数据描述，以分析细胞外神经记录。ProbeInterface 首先是一个 Python API，使用户能够以任何所需的复杂度级别创建和可视化探针和探针组。其次，ProbeInterface 有助于以可重现的方式生成任何特定数据采集设置的全面接线描述，这通常涉及使用记录探头、探头、适配器和采集系统。第三，我们与探头制造商合作编译了一个可用探头的开放库，可以使用我们的 Python API 在运行时下载。最后，使用 ProbeInterface，我们定义了一种用于探头处理的文件格式，其中包含 FAIR 探头描述的所有必要信息，并且与神经科学中的其他开放标准兼容且互补。
使用 CMOS 纳米电极阵列进行细胞外直接突触信号的记录
完整作者列表： Abbott, Jeffrey；哈佛大学，化学与化学生物学 Ye, Tianyang；哈佛大学，SEAS Krenek, Keith；哈佛大学，SEAS Gertner, Rona；哈佛大学，化学与化学生物学 Wu, Wenxuan；哈佛大学，SEAS Jung, Han Sae；哈佛大学，SEAS Ham, Donhee；哈佛大学，SEAS Park, Hongkun；哈佛大学，化学与化学生物学系 + 物理系
间充质干细胞衍生的人类疾病的细胞外囊泡
抽象的干细胞疗法是一种治疗各种严重疾病的新方法，包括自身免疫性疾病，器官移植，肿瘤和神经退行性疾病。尽管如此，干细胞的广泛利用受到潜在的肿瘤性，精确分化的挑战，排斥关注和道德考虑。细胞外囊泡具有从干细胞中携带多种生物活性因子并将其输送到特定靶细胞或组织的能力。此外，它们提供了低免疫原性的优势。因此，它们有可能促进干细胞的治疗潜力，从而减轻与直接干细胞应用相关的风险。因此，在临床疾病中使用干细胞细胞外囊泡已受到越来越多的关注。本综述总结了使用间充质干细胞（MSC）使用细胞外囊泡的进步。MSC细胞外囊泡用于治疗炎性疾病，例如类风湿关节炎，肝损伤，Covid-19和过敏；在修复心脏病，肾脏损伤和骨关节炎疾病中的组织损伤中；作为治疗肿瘤的携带者；作为
细胞外囊泡是否具有特定的靶细胞？
细胞外囊泡（EV）是细胞间通信的使者，但是受体细胞解释EV消息的确切机制仍未完全理解。在这项研究中，我们探讨了电动汽车的起源，它们的蛋白质货物的起源以及受体细胞类型如何影响胚胎植入模型中对EV的细胞反应。我们使用定量聚合酶链（QPCR）对受体细胞中锌纤维蛋白81（ZNF81）基因表达的两种类型的EV进行了处理。还分析了EV货物的蛋白质组学含量。结果表明，Znf81基因的下调是接受性子宫内膜上皮细胞对滋养细胞衍生的EV的特定细胞反应。蛋白质货物分析表明，电动汽车的蛋白质组学因素取决于其原产细胞，因此可能会影响受体细胞对EV的反应。Furthermore, trophoblastic EVs were found to be speci fi cally enriched with transcription factors such as CTNNB1 (catenin beta- 1), HDAC2 (histone deacetylase 2), and NOTCH1 (neurogenic locus notch homolog protein 1), which are known regulators of ZNF81 gene expression.当前的研究提供了支持EV特异性存在的令人信服的证据，在这种情况下，电动汽车和受体细胞类型的特征共同有助于调节EV目标特定。此外，EV蛋白货物分析表明，转录因子与滋养细胞EV的特定功能之间存在潜在的关联。这种体外胚胎植入模型和ZNF81读出提供了一个独特的平台来研究自然细胞 - 细胞通信中的EV特定功能。
改变的脂质稳态与SNX14缺乏症中的小脑神经变性有关
引言急性肾脏损伤（AKI）是一种常见疾病，由于其诊断率低和缺乏及时治疗而对人类健康构成严重威胁，这大大增加了严重的AKI和慢性儿童疾病（CKD）（1，2）。缺血 - 再灌注损伤（IRI）被认为是临床儿童损伤的主要原因，并且始终伴有单核吞噬细胞（MP）入侵和炎症（3-6）。对IRI诱导的炎症基础的细胞病理生理过程的更好理解可能会导致寻找新的治疗靶标，以减少损伤并防止CKD进展。iri诱导的AKI主要集中在皮质囊肿结的近端管状细胞（PTS）中。单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）结果表明，PT受损的细胞具有促炎和纤维化特性，最终导致了肾小管病理修复，例如肾小管萎缩和间质纤维化（6，7）。有趣的是，MP浸润和炎症的大量损伤的皮质甲状腺结与最大的PT损伤结合在一起，表明两者之间的串扰。浸润免疫细胞的数量和免疫炎症反应的程度确定了AKI的结果。先天和适应性免疫都参与了iri引起的AKI的损害和修复（8）。一项空间转录测序研究表明，正常儿童中的巨噬细胞主要局限于髓质血液供应丰富的区域。IRI发生后，在IRI 2小时后，外周血巨噬细胞子集特异性地趋化与皮质中的交界处，而在败血症引起的IRI中，这些细胞具有弥漫性分布，表明MPS在上述IRI过程中起着更为重要的作用（9-11）。具体而言，在AKI的早期阶段，驻留在肾脏和血液中的MP被顺序激活，释放单核趋化蛋白-1（MCP-1）（MCP-1），趋化因子（CXC Motif）Ligand-1（CXCL1）（CXCL1）和CSF1，以及CSF1，以招募更多MP，这可能
脑细胞中不可移动的阴离子成分取代细胞外氯离子
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 10 月 28 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.12.28.522113 doi：bioRxiv 预印本
细胞外基质结构和信号在黑色素瘤治疗耐药中的作用
细胞外基质 (ECM) 对维持组织稳态至关重要，因此其产生、组装和机械刚度在正常组织中受到严格调控。然而，在实体肿瘤中，异常 ECM 结构变化导致的刚度增加与疾病进展、转移风险增加和生存率低有关。作为肿瘤微环境的动态和关键组成部分，ECM 越来越被认为是肿瘤的重要特征，因为它已被证明通过生化和生物力学信号传导促进癌症的多种特征。在这方面，黑色素瘤细胞对 ECM 成分、刚度和纤维排列高度敏感，因为它们通过细胞表面受体、分泌因子或酶直接与肿瘤微环境中的 ECM 相互作用。重要的是，鉴于 ECM 主要由肌成纤维细胞基质成纤维细胞沉积和重塑，它是促进它们与黑色素瘤细胞旁分泌相互作用的关键途径。本综述概述了黑色素瘤，并进一步描述了 ECM 特性（例如 ECM 重塑、ECM 相关蛋白和硬度）在皮肤黑色素瘤进展、肿瘤细胞可塑性和治疗耐药性中所起的关键作用。最后，鉴于 ECM 动力学在黑色素瘤中的重要性日益凸显，本文讨论了使肿瘤中 ECM 正常化的治疗策略的未来前景。
酒精对发病机理中炎症，免疫，感染和细胞外囊泡的影响
饮酒是一种广泛的社会活动，对人类健康产生了复杂而多方面的影响。尽管中度饮酒与某些潜在的健康益处有关，但过度或慢性饮酒会破坏人体的免疫平衡，促进炎症并增加对感染的敏感性。与酒精毒性相关的有害作用包括细胞完整性的丧失。当细胞失去完整性时，他们也失去了与其他系统进行通信的能力。受酒精毒性干扰的系统之一是细胞外囊泡（EV）介导的通信。电动汽车是细胞间通信的关键介体。它们在酒精引起的发病机理，促进细胞之间的通信和分子交换中起着重要作用，从而可能导致与酒精相关的健康问题。调查它们在这种情况下的参与是解决酒精使用健康后果背后的复杂机制的基础，并可能为减轻酒精对免疫健康的不利影响的创新方法铺平道路。了解电动汽车在酒精引起的发病机理背景下的作用对于理解与酒精相关的健康问题背后的机制至关重要。