Alcantara,Marion; Simonin,Mathieu; Ludovic的Lhermitte; Touzart,Aurore;杜尔,玛丽·埃米莉(Marie Emilie); Latiri,Mehdi;灰色,纳塔莉; Cayuela,Jean Michel;查兰登,伊夫; Graux,卡洛斯; Dombret,Hervé; Ifrah,诺伯特;小,阿诺德; MacIntyre,&nbspelizabeth [还有3个]Alcantara,Marion; Simonin,Mathieu; Ludovic的Lhermitte; Touzart,Aurore;杜尔,玛丽·埃米莉(Marie Emilie); Latiri,Mehdi;灰色,纳塔莉; Cayuela,Jean Michel;查兰登,伊夫; Graux,卡洛斯; Dombret,Hervé; Ifrah,诺伯特;小,阿诺德; MacIntyre,&nbspelizabeth [还有3个]
endcript 2是一款友好的Web服务器,用于以符合方式提取和渲染对第四纪蛋白质结构信息的全面分析。这一重大升级已全面设计,以通过交互式3D可视化提高速度,准确性和USABIL。它需要对我们众所周知的序列比对渲染器Espript的新版本3进行优势,以减少计算时间来处理大量数据。从单个PDB输入或文件中,端目构图显示出与查询同源的蛋白质多种蛋白质对齐的高质量图,并根据残基保守性颜色。此外,还描述了实验二级结构元素以及一组相关的生物物理和结构数据。现在,所有这些信息和更多信息都在交互式3D Pymol表示上映射。多亏了其自适应和严格的算法,专家用户的初学者可以将设置修改为满足他们的需求。endcript也已被升级为开放平台,用于可视化来自外部Biotool Web服务器的多个生化和结构数据,并具有2D和3D表示。endcript 2和es- pript 3分别在http://endscript.ibcp.fr和http://espript.ibcp.fr上免费获得。
最近,时空变压器结构已被广泛应用于3D人类姿势估计的问题,从而实现了最新的性能。这些方法中的许多方法都将单个框架中的单个关节视为令牌,并且在同一框架或相同轨迹的令牌上施加注意力。尽管这种结构可有效地计算单个关节之间的相关性,但它过于限制,因为诸如帧或轨迹之类的全局特征无法很好地传达。在本文中,我们建议Galformer解决此问题。Galformer由局部和全局变压器块组成,前者基于关节令牌,如先前的方法一样,而后者,即全局混合变压器,将所有关节混合在特定框架范围内的所有关节,以实施特征交换的电感偏见。在提出的方法中交替重复这两个变压器块,以计算关节,形状和轨迹之间的相关性。实验表明,与人类36M,MPI-INF-3DHP和HUMANEVA数据集的现有方法相比,我们的方法具有优越或至少具有竞争性能。
了解人类大脑如何处理听觉输入仍然是一个挑战。传统上,人们会区分低级和高级声音特征,但它们的定义取决于特定的理论框架,可能与声音的神经表征不匹配。在这里,我们假设构建一个数据驱动的听觉感知神经模型,对相关声音特征做出最少的理论假设,可以提供一种替代方法,并可能更好地匹配神经反应。我们收集了六名观看长时间故事片的患者的皮层脑电图记录。原始电影配乐用于训练人工神经网络模型以预测相关的神经反应。该模型实现了高预测准确率,并且很好地推广到第二个数据集,其中新参与者观看了不同的电影。提取的自下而上的特征捕捉了特定于声音类型的声学特性,并与各种响应延迟曲线和不同的皮质分布相关。具体而言,一些特征编码了与语音相关的声学特性,其中一些特征表现出较短的延迟曲线(与后外侧裂皮质中的反应相关),而另一些特征表现出较长的延迟曲线(与前外侧裂皮质中的反应相关)。我们的研究结果支持并扩展了当前对语音感知的看法,证明了外侧裂皮质中存在时间层次,并且在视听语音感知过程中涉及该区域以外的皮质部位。
<。 170,巴塞罗那08036,西班牙和研究所,老师,Dimitrie Gerota Genomics博士,CNRS,CNRS,CNRS,斯德哥尔摩,瑞典
访问微生物学是一个开放的研究平台。可以通过本文的在线版本找到预印刷,同行评审报告和编辑决策。收到2024年1月5日; 2024年6月4日接受;于2024年6月27日出版了作者分支:1个细菌学实验室,马达加斯加antananarivo的Chu Joseph Raseta Befelatanana; 2马达加斯加antananarivo的马达加斯加的巴斯德学院实验细菌学单元; 3小儿服务,楚约瑟夫·拉塞塔·贝菲拉塔纳(Chu Joseph Raseta Befelatanana),马达加斯加的安塔纳里沃(Antananarivo); 4 Madagascar Antananarivo的中心医院的细菌实验室Mère -enfantTsaralàlana; 5巴斯德研究所,感染部门的生物学,巴黎大学,INSERM U1117,巴黎,75015,法国; 6巴斯德研究所,国家参考中心以及法国巴黎的李斯特菌中心合作; 7传染病和热带医学司,Institut Imagine,APHP,Necker-Enfants Malades Malades University Hospital,法国巴黎,法国。*信函:Mamitina Alain Noah Rabenandrasana,Rabalainnoah@gmail。com关键字:致命案例;基因组表征;李斯特氏病;马达加斯加;脑膜炎。缩写:Bdal,Bruker Daltonics图书馆; BigSDB,细菌分离株基因组序列数据库; CGMLST,核心基因组多分解序列分型; CSF,脑脊液; IVD,体外诊断; MALDI-TOF MS,基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱; MLST,多级别序列键入; MSP,主要光谱曲线; PCR,聚合酶链反应。在Bioproject PrjNA1032442下,组件和SRA数据存放在NCBI上。000764.v3©2024作者†这些作者对这项工作也同样贡献了本文的在线版本提供补充表。
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。永久性。预印本(未经同行评审的认证)是作者/资助者,他已授予Medrxiv的许可证,以在2025年2月22日发布的此版本中显示在版权所有者中。 https://doi.org/10.1101/2025.02.19.25322523 doi:medrxiv preprint
a 哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院,哈尔滨,中国 b LINEACT CESI,里昂 69100,法国 c 埃法特大学电气与计算机工程系,吉达 22332,沙特阿拉伯 d Persistent Systems Limited,那格浦尔,印度 e AGH 科技大学生物控制论与生物医学工程系,克拉科夫,波兰 f 克拉科夫理工大学计算机科学与电信学院计算机科学系,华沙 24,31-155,克拉科夫,波兰 g 波兰科学院理论与应用信息学研究所,Ba ł tycka 5,44-100,格利维采,波兰 h EIAS 数据科学实验室,苏丹王子大学计算机与信息科学学院,利雅得 11586,沙特阿拉伯 i 梅努菲亚大学理学院数学与计算机科学系,32511,埃及j 埃及梅努菲亚大学计算机与信息学院信息技术系
在细胞的监督分类中优化特征提取和分类器的组合组合Xhoena polisi duro 1,2*,Arban UKA 2,Griselda alushllari 2,Albana Ndreu Halili 3,Dimitrios A. Karras A. Karras A. Karras 2,Nihal Engin vrana vrana 4 1 Informatics obs s. noli oblia,“ fan nori”,koria,koria,koria,korica,korica,korica,korka,korka,“ korcua”。 xpolisi@epoka.edu.al(X.P.D.)。2埃波卡大学计算机工程系,阿尔巴尼亚蒂拉纳市; auka@epoka.edu.al(a.u.)galushllari@epoka.edu.al(G.A。)dkarras@epoka.edu.al(d.a.k.)3西巴尔干大学医学系,阿尔巴尼亚提拉娜; albana.halili@wbu.edu.al(a.n.h。) 4法国斯特拉斯堡的Spartha Medical; evrana@sparthamedical.eu(N.E.V.) 摘要:医学领域的发展已经开放了在个性化患者层面进行分析的机会。 可以进行的重要分析之一是对工程材料的细胞反应,最合适的非侵入性方法是成像。 这些细胞的图像是未染色的Brightfield图像,因为在存在生物材料和流体的情况下,它们是从多参数微流体室获取的,这些室可能会随着时间的流逝而改变光路的长度,因为细胞的健康状态被监测。 这些实验条件导致具有独特照明,纹理和噪声频谱的图像数据集。 本研究通过将特征提取体系结构和机器学习分类器结合起来,探讨了监督细胞分类的优化,并重点介绍了生物材料风险评估中的应用。 1。 简介3西巴尔干大学医学系,阿尔巴尼亚提拉娜; albana.halili@wbu.edu.al(a.n.h。)4法国斯特拉斯堡的Spartha Medical; evrana@sparthamedical.eu(N.E.V.)摘要:医学领域的发展已经开放了在个性化患者层面进行分析的机会。可以进行的重要分析之一是对工程材料的细胞反应,最合适的非侵入性方法是成像。这些细胞的图像是未染色的Brightfield图像,因为在存在生物材料和流体的情况下,它们是从多参数微流体室获取的,这些室可能会随着时间的流逝而改变光路的长度,因为细胞的健康状态被监测。这些实验条件导致具有独特照明,纹理和噪声频谱的图像数据集。本研究通过将特征提取体系结构和机器学习分类器结合起来,探讨了监督细胞分类的优化,并重点介绍了生物材料风险评估中的应用。1。简介分析了三种细胞类型(A549,BALB 3T3和THP1)的Brightfield显微镜图像,以评估Inception V3,Squeeze Net和VGG16架构与分类器与包括KNN,决策树,随机森林,Adaboost,Adaboost,Neural Networks和Natan bayes的分类器配对的影响的影响。使用信息增益降低维度,以提高计算效率和准确性。使用不同参数的Butterworth过滤器用于平衡图像特征和降噪的增强,从而在某些情况下提高了分类性能。实验结果表明,与神经网络配对时,VGG16体系结构可实现通过不同指标衡量的更高分类精度。与未经过滤的数据集相比,使用Butterworth过滤器时的精度提高了,并且各种Butterworth滤波器之间的差异表明了优化这些类型图像的过滤器参数的重要性。关键字:生物材料风险评估,细胞图像分类,分类器,特征提取,个性化医学,监督分类。
