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虽然核分型，鱼类，RT-PCR和微阵列是检测融合基因的常规研究技术，但它们都有局限性。随着基于NGS的方法的改进，DNA和RNA测序迅速成为选择方法。ngs面板促进了同时发现新的变化，以及已知的突变以及基因组研究的结构改变。这种突变检测能力的发展快速增长已超越SNV和Indels，现在包括易位。
利拉替尼（一种高选择性 FGFR2 抑制剂）对患有 FGFR2 融合或
1 法国巴黎古斯塔夫鲁西研究所；2 美国宾夕法尼亚州费城福克斯蔡斯癌症中心；3 美国伊利诺伊州芝加哥芝加哥大学；4 西班牙瓦伦西亚瓦伦西亚大学医院；5 英国伦敦莎拉坎农研究所；6 美国佛罗里达州杰克逊维尔梅奥癌症中心；7 美国佛罗里达州坦帕 H. Lee Moffitt 癌症中心和研究所；8 韩国首尔首尔国立大学医院；9 法国第戎 Georges François Leclerc 中心；10 西班牙马德里 START 马德里 - CIOCC；11 澳大利亚悉尼圣文森特医院金霍恩癌症中心；12 美国德克萨斯州休斯顿德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心；13 美国马萨诸塞州波士顿麻省总医院；14 美国亚利桑那州斯科茨代尔梅奥癌症中心；15 法国里昂 Léon Bérard 中心； 16 Relay Therapeutics, Inc. 美国马萨诸塞州剑桥市；17 纪念斯隆凯特琳癌症中心，美国纽约州纽约市
STAT6融合和基因组范围的DNA甲基化分析
全基因组DNA甲基化分析（n = 80）和靶向TERT促进突变测试（n = 98）。使用NAB2 :: STAT6融合状态（n = 101案例; 51 = ex5-7 :: ex16-17，26 = ex4 :: ex4 :: ex2-3; 12 = ex2-3 :: ex2-3 :: ex2-3 :: ex2-3 :: Ex2-3 :: extany/extany/of fusion and 12 = no fusion）检查的关联。 nab2 :: STAT6融合断点（融合类型）与无转移的表面（MFS）显着相关（P = 0.03），并且在调整级别的CNS时，在多元分析中，疾病特异性生存（DSS）（p = 0.03）。 DNA甲基化分析显示了三个不同的簇：群集1（n = 38），群集2（n = 22）和簇3（n = 20）。 甲基化簇与融合类型（p <0.001）显着相关，其中2个集群携带EX4 :: EX2-3 16中的Ex2-3融合（属于20; 80.0％），几乎所有TERT启动子突变（8; 87.5％），以及主要的“ SFT”“ SFT”“ SFT”“ SFT”组织学现象（15 of 22 of 22; 68.68.68.68.2％）。 簇1和3的区别较小，均由具有EX5-7 :: EX16-17融合的肿瘤（分别为33; 75.8％的25个； 75.8％和12个; 66.7％）和可变的组织学表型。 甲基化簇与MFS显着相关（p = 0.027），但总体存活率（OS）无关。 总而言之，NAB2 :: STAT6融合类型与MFS和DSS显着相关，这表明具有EX5 :: EX16-17融合的肿瘤可能具有较低的患者结局。 甲基化簇与融合类型，TERT启动子的状态，组织学表型和MF显着相关。的关联。nab2 :: STAT6融合断点（融合类型）与无转移的表面（MFS）显着相关（P = 0.03），并且在调整级别的CNS时，在多元分析中，疾病特异性生存（DSS）（p = 0.03）。DNA甲基化分析显示了三个不同的簇：群集1（n = 38），群集2（n = 22）和簇3（n = 20）。甲基化簇与融合类型（p <0.001）显着相关，其中2个集群携带EX4 :: EX2-3 16中的Ex2-3融合（属于20; 80.0％），几乎所有TERT启动子突变（8; 87.5％），以及主要的“ SFT”“ SFT”“ SFT”“ SFT”组织学现象（15 of 22 of 22; 68.68.68.68.2％）。簇1和3的区别较小，均由具有EX5-7 :: EX16-17融合的肿瘤（分别为33; 75.8％的25个； 75.8％和12个; 66.7％）和可变的组织学表型。甲基化簇与MFS显着相关（p = 0.027），但总体存活率（OS）无关。总而言之，NAB2 :: STAT6融合类型与MFS和DSS显着相关，这表明具有EX5 :: EX16-17融合的肿瘤可能具有较低的患者结局。甲基化簇与融合类型，TERT启动子的状态，组织学表型和MF显着相关。
带有蒙版扩散的离散生成建模
Dieleman等。 （2022）。 分类数据的连续扩散。 Gulrajani＆Hashimoto（2024）。 基于可能性的扩散语言模型。Dieleman等。（2022）。分类数据的连续扩散。Gulrajani＆Hashimoto（2024）。基于可能性的扩散语言模型。
kinome重新编程是ESR1融合型乳腺癌的治疗机会，但在妇科癌症中
结论•在Caris队列中，在乳腺癌（263例），子宫癌（90例）和卵巢癌（87例）中检测到复发性ESR1融合。•与ERα相比，ESR1融合物是独立的，多动并且在生理上稳定的，具有更大的半寿命，并且可能足以足以具有内分泌Tx耐药性。•与没有ESR1变异的患者相比，ESR1融合阳性队列的ESR1的表达和拷贝数明显更高。这在包括乳腺癌，卵巢癌和子宫癌在内的所有适应症中都是一致的•与对照组相比，所有适应症的ESR1融合患者的预后都明显差。•ESR1融合在RET，IGF1R和FGFR3的上调观察到乳腺癌中的致癌激酶信号传导上调。•在ESR1融合病例中未观察到卵巢和子宫内膜癌的肿瘤信号传导的类似上调，这可能是由于缺乏TP53-FoxA1-轴。•靶向致癌激酶信号传导可能是ESR1融合阳性乳腺癌的一种有希望的方法。参考
验证田园基因缩写测定法以检测融合并遇到非小细胞肺癌中的外显子孔
idylla™平台在欧洲符合2017/746年欧盟IVD规定的CE标记，该法规在美国出售，并在许多其他国家进行了注册。idylla™基因输入测定法仅用于研究用途（RUO），而不是用于诊断程序。该产品包含superscript™III逆转录酶，并根据由Life Technologies Corporation拥有或许可的专利或专利申请提供了许可，该公司的许可仅限于人类诊断领域和研究领域，并专门排除在法医学（包括人类认同测试）中的应用。SuperScript™III商标归Life Technologies Corporation拥有。专利美国7,700,339，8,168,383，8,481,279，8,486,645，8,232,060，8,288,102，8,3777,642，9,988,688，9,523,688，9,523,130,130,9,66,130,9,96,85555 9,364,477、9,539,254、10,551,383，并在US申请及其所有各自的外国等价物中获得了Cell Signaling Technology，Inc.。该外部出版物中提供的数据和结论是由第三方在外部得出的，在开发idylla™GeneFusion测定法中尚未得到验证，也没有由Biocartis NV的当前标记中包含。Biocartis NV产品设计为使用特定于产品的使用（IFU）中所述。idylla™可在欧洲，美国和许多其他国家 /地区出售。请与Biocartis代表一起检查可用性。Biocartis和Idylla™是欧洲，美国和许多其他国家的注册商标。Biocartis拥有的Biocartis和Idylla™商标和徽标是使用的。保留所有权利©2024年1月，Biocartis NV。
通过结肠镜检查进行活性溃疡性结肠炎的串行粪便菌群输注：可行性，安全性和转化单体意大利研究
1单元IBD，CEMAD，遥远地区，国际医学和Gasstranterology，医学科学和Chirurgic Sciences，资助大学政策“ A. irccs，L。Go A. Gief 8，00168罗马，意大利； latusloris@gmail.com（l.r.l.r.l ）;光泽。 ）; wortsy.betoty@nats。 ）; syllable.pecer@polyclines.it（S.P. ）; pgpuca@gpoke.com（p.p. ）; helis.sscouvotonum@polyclinicles.it（E.S. ）; giveElele.napoliaum@polyclinical.it（D.N. ）;给它。 ）; Anony.gsbarrinium@nats.it（A.G.）2医学和艾滋病科学系，“ G。 公告” Chieti-Pescara大学，66100 Chiets，意大利3号高级研究与技术中心（CAST），” G。 公告” Chieti-pescara大学，66100个Chiets，意大利4药物和traslational Schools，大学，Caree Custerms，L。Go F. F. F. F. Little 1，0016 Rome，0016 Rome，0016 Rome，0016 Rome，0016 Romes（Gg。 ）; Youth.camcrat@nat.it（G.C。） <2 5 5微生物学，大学政策基金会‘A. ICCS，Caree Sacred University，意大利罗马00168； gianluca.perty@polyclinical。 ）; maurice.sanguines@polyclinicles.it（M.S. ）; light.mafes@polyclinical.it（l.m.）1单元IBD，CEMAD，遥远地区，国际医学和Gasstranterology，医学科学和Chirurgic Sciences，资助大学政策“ A.irccs，L。Go A. Gief 8，00168罗马，意大利； latusloris@gmail.com（l.r.l.r.l）;光泽。）; wortsy.betoty@nats。）; syllable.pecer@polyclines.it（S.P.）; pgpuca@gpoke.com（p.p.）; helis.sscouvotonum@polyclinicles.it（E.S.）; giveElele.napoliaum@polyclinical.it（D.N.）;给它。）; Anony.gsbarrinium@nats.it（A.G.）2医学和艾滋病科学系，“ G。公告” Chieti-Pescara大学，66100 Chiets，意大利3号高级研究与技术中心（CAST），” G。公告” Chieti-pescara大学，66100个Chiets，意大利4药物和traslational Schools，大学，Caree Custerms，L。Go F. F. F. F. Little 1，0016 Rome，0016 Rome，0016 Rome，0016 Rome，0016 Romes（Gg。）; Youth.camcrat@nat.it（G.C。）<2 5 5微生物学，大学政策基金会‘A.ICCS，Caree Sacred University，意大利罗马00168； gianluca.perty@polyclinical。）; maurice.sanguines@polyclinicles.it（M.S.）; light.mafes@polyclinical.it（l.m.）6人类微生物组的单位，班比诺GESù儿童医院，IRCCS，00168，意大利罗马； federica.delchierico@opbg.net 7卫生科，大学生命科学系和公共卫生，Cattolica del Sacro Cuore大学，意大利00168，意大利00168； andreaposcia@yahoo.com 8 UOC ISP预防和监视感染和慢性疾病，预防局，地方卫生局（ASUR-AV2），60035 JESI，意大利90035 9 UOC DI GASTROENTEROLOGIA，FONDAZIONE POLICINICO INRICOTIOGemelli” IRCCS, L. Go A. Gemelli 8, 00168 Rome, Italy 10 Unit of Microbiomics and Unit of Human Microbiome, Bambino Ges ù Children's Hospital, IRCCS, 00168 Rome, Italy; lorenza.putignani@opbg.net 11 IBD Center, IRCCS Humanitas Research Hospital, Rozzano, 20089 Milan,意大利; Alessandro.armuzzi@unicatt.it *通信：franco.scaldaferri@policlinicogemelli.it或franco.scaldaferri@unicatt.it
患者血液管理：优化输血效益并识别何时输血有益
输注血浆可以纠正严重的凝血病，并将出血风险降至最低。在极端情况下，输血的好处是显而易见的，相比之下，任何风险都微不足道，任何并发症都可以作为患者治疗过程的一部分进行管理。然而，大多数情况下不会进行输血。实验室测试值，无论是血红蛋白浓度、血小板计数还是凝血酶原时间/国际标准化比率 (INR)，通常是预防性输血的理由。开具处方的医生经常会说“我不想让我的病人心肌梗塞”或“我不想让我的病人在手术过程中流血”。这些目标当然值得称赞，因为心肌坏死的损害或出血的并发症可能是严重的和/或不可逆的。在任何治疗方案中，特别是在考虑预防性干预时，必须权衡治疗的潜在益处与治疗旨在避免的发病概率以及治疗本身产生不良影响的概率。在输血的情况下，潜在的并发症通常以输血反应的形式考虑。其中最常见的——发热和荨麻疹反应——被一些临床医生认为是微不足道且易于处理的，而最可怕的——输血传播感染 (TTI)——如今被认为极为罕见，超出了大多数医生的经验范围。因此，可以几乎不考虑风险地输血。但是，虽然今天的输血肯定比医学史上的任何时候都安全，但这些公认的风险具有有限的、非零的概率，其后果可能是灾难性的。例如，输血相关循环超负荷 (TACO) 和输血相关急性肺损伤 (TRALI) 仍然是美国食品药品监督管理局 (FDA) 报告的输血相关死亡的两个最常见原因。1 过去 15 年，人们对输血的担忧发生了有趣的变化。随着人类免疫缺陷病毒 (HIV)、丙型肝炎病毒 (HCV) 和乙型肝炎病毒 (HBV) 等最显著病原体的传播风险大幅降低，人们的担忧已转向其他风险，包括 TRALI 和血小板的细菌污染。在美国，大多数血液供应商现在提供男性、从未怀孕的女性或已证实缺乏 HLA 抗体的女性的血浆和单采血小板，以减轻 TRALI 的风险。这一策略已将 TRALI 的发病率降低到 1：10,000 输血单位。2 红细胞现在是与 TRALI 相关的最常见产品。随着 TRALI 发病率的下降，目前输血相关死亡的最常见原因是 TACO。血小板和血浆成分与 TACO 发生率约 1% 有关，红细胞与 TACO 发生率约 2.7%。2 TACO 最常发生在年龄极端的患者和患有充血性心力衰竭的患者中。
DCC-3084 是一种 RAF 二聚体抑制剂，可广泛抑制 BRAF I、II、III 类、BRAF 融合和 RAS 驱动的实体瘤，从而导致
ARAF，丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 A–快速加速纤维肉瘤；ATP，三磷酸腺苷；AUC，浓度时间曲线下面积；AUC 0–last，从时间 0 到最后测量浓度的 AUC；BCRP，乳腺癌耐药蛋白转运蛋白；BID，每日两次；BRAF，v-Raf 鼠肉瘤病毒致癌基因同源物 B1；CNS，中枢神经系统；CRAF，丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 C-Raf；CSF，脑脊液；DFG，天冬氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸；DMSO，二甲基亚砜；ELISA，酶联免疫吸附试验；ERK，细胞外信号调节激酶；GTP，三磷酸鸟苷；hrs，小时；IC 50，半数最大抑制浓度； Kp uu，非结合分配系数（游离脑浓度/游离血浆浓度）；KRAS，Kirsten RAS；M，摩尔；MDR1，多药耐药突变转运体；MEK，丝裂原活化蛋白激酶激酶；NRAS，神经母细胞瘤 RAS；PERK，蛋白激酶 R 样内质网激酶；PK，药代动力学；po，口服；pRSK，磷酸化 RSK；QD，每日一次；RAF，快速加速性纤维肉瘤；RAS，大鼠肉瘤小 GTPase 蛋白；RSK，核糖体 s6 激酶；SEM，均值标准误差；t 1/2，半衰期；TGI，肿瘤生长抑制；T. sol，热力学溶解度；WT，野生型。
泛癌症分析揭示实体肿瘤中反复出现的 BCAR4 基因融合
摘要 ◥ 染色体重排通常会导致活性调控区域与致癌基因上游并列，从而产生表达的基因融合。共同的下游伴侣的反复激活（在患者群体中上游区域不同）表明其具有保守的致癌作用。对 32 种实体瘤类型的 9,638 名患者的分析显示，注释的长链非编码 RNA (lncRNA)——乳腺癌抗雌激素抗性 4 (BCAR4) 是 11 种癌症中最普遍、未表征的下游基因融合伴侣。使用具有内源性 BCAR4 基因融合的多种细胞系证实了其致癌作用。此外，在未转化的细胞系中过度表达临床上普遍存在的 BCAR4 基因融合足以诱导致癌表型。我们表明，所有基因融合的最小共同区域都包含一个驱动增殖所必需的开放阅读框。