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Twist Bioscience 文库制备和靶标富集检测试剂盒是一款高度模块化的靶标富集下一代测序 (NGS) 试剂盒，具有
Twist Bioscience 文库制备和靶向富集检测是一种高度模块化的靶向富集下一代测序 (NGS) 试剂盒，具有从固定面板到全外显子组测序的各种应用。该试剂盒利用基因组 DNA (gDNA) 的片段化、连接和扩增来制备 NGS 文库，并利用基于珠子的杂交文库捕获来富集文库。Twist Bioscience 为用户提供了高度的灵活性，以满足实验室的需求，包括酶促或机械片段化、使用 Twist 全长组合双 (CD) 索引适配器或通用双索引 (UDI) 引物的两组不同的索引化学反应、单重或多重富集选项、用于文库富集的市售固定面板和定制面板选项，以及“标准”16 小时杂交选项或可运行 15 分钟至 4 小时的“快速”杂交选项。整个手动文库制备和靶向富集方案可以在最短一天或最多三天内完成。
croft-seq
图1。Croft-seq的示意图。（a）具有gDNA（橙色）的链球菌Cas9的示意图，与距离dsDNA（绿色）结合，其中包含与NGG PAM序列（黄色）近端的错配（红色）。（b）Croft-Seq工作流的简化示意图。人类基因组DNA在用Cas9核酸酶消化之前用磷酸酶处理。将所得的DNA末端选择性地绑扎到生物素化衔接子上。然后除去适配器的过量，然后将连接的DNA富含磁珠富集。除去互补的非生物素化DNA链，并合成新的第二个DNA链。所得的DNA从珠子中释放出来，并通过PCR扩增进行测序。（c）Croft-seq生物信息学分析的工作流程。成对末端读数，测序和清洁残留适配器序列，首先与参考基因组保持一致。对齐的读数，该脚本使用4 bp读取窗口搜索陡峭的读取深度变化，并优先考虑潜在的脱离目标脱离靶向的读数和目标序列相似性的双向。只有靶向位置
使用EXO-CIP™快速PCR清理套件处理的PCR扩增子对基因组编辑效率进行快速分析，然后是Sanger测序
对于CRISPR/CAS工作流程，核酸酶和相应GRNA的选择直接影响基因组编辑后的indel频率的计算。当前用于评估编辑效率的当前METH OD使用来自转染的细胞的合并GDNA的PCR扩增，然后是基于测序或基于测序的基于测序或基于不匹配的裂解的分析分析的变性和重新启动的indneal indneal indneal DNA（4）。为加快编辑效率的确定并避免昂贵的NG测序，“通过分解来跟踪Indels”（Tide）（5）和“ CRISPR编辑的推断”（ICE）方法（6）是开发用于使用sanger sequenc dna sequenceenc dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna dna（ice）方法（ICE）方法（ICE）方法（ICE）。但是，要使这些方法可靠，分析的PCR产品必须具有高质量（例如，单个频带，没有底漆和DNTP）。在本文中，我们证明了通过Exo-CIP快速PCR清洁套件方法清理的扩增子质量匹配，该方法是通过使用ICE软件工具进行批处理分析的传统基于旋转柱的套件来实现的，从而启用了更快，更高的推出方法，以制备旋转后的样品，用于旋转后的样品。
噬菌体DNA隔离试剂盒
图1。有效的宿主基因组DNA去除，而无需降低噬菌体DNA产量。 使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从四个富集的噬菌体培养物中分离总DNA。 在添加提供的裂解之前，进行了DNase I预处理。 布里液，将20单位的DNase I添加到1 ml富集的噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育20分钟。 DNAase I处理后，遵循该过程。 作为对照，使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从相同4个培养物的等分试样中分离DNA，而无需进行DNase I处理。 进行DNA分析，将10 µL的每50 µL洗脱加载到1x TAE琼脂糖凝胶上。 可以看出，噬菌体DNA被其外套蛋白安全地保护了DNase I治疗，而宿主基因组DNA则被DNase I有效降解。 因此，DNase I预处理导致最终噬菌体洗脱中的宿主GDNA污染较少，而不会影响总噬菌体DNA产量。 车道M是Norgen的Highranger 1 Kb DNA梯子（Cat。 11900）。有效的宿主基因组DNA去除，而无需降低噬菌体DNA产量。使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从四个富集的噬菌体培养物中分离总DNA。在添加提供的裂解之前，进行了DNase I预处理。布里液，将20单位的DNase I添加到1 ml富集的噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育20分钟。DNAase I处理后，遵循该过程。作为对照，使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从相同4个培养物的等分试样中分离DNA，而无需进行DNase I处理。进行DNA分析，将10 µL的每50 µL洗脱加载到1x TAE琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体DNA被其外套蛋白安全地保护了DNase I治疗，而宿主基因组DNA则被DNase I有效降解。因此，DNase I预处理导致最终噬菌体洗脱中的宿主GDNA污染较少，而不会影响总噬菌体DNA产量。车道M是Norgen的Highranger 1 Kb DNA梯子（Cat。11900）。
噬菌体DNA隔离试剂盒
图1。有效的宿主基因组DNA去除，而无需降低噬菌体DNA产量。 使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从四个富集的噬菌体培养物中分离总DNA。 在添加提供的裂解之前，进行了DNase I预处理。 布里液，将20单位的DNase I添加到1 ml富集的噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育20分钟。 DNAase I处理后，遵循该过程。 作为对照，使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从相同4个培养物的等分试样中分离DNA，而无需进行DNase I处理。 进行DNA分析，将10 µL的每50 µL洗脱加载到1x TAE琼脂糖凝胶上。 可以看出，噬菌体DNA被其外套蛋白安全地保护了DNase I治疗，而宿主基因组DNA则被DNase I有效降解。 因此，DNase I预处理导致最终噬菌体洗脱中的宿主GDNA污染较少，而不会影响总噬菌体DNA产量。 车道M是Norgen的Highranger 1 Kb DNA梯子（Cat。 11900）。有效的宿主基因组DNA去除，而无需降低噬菌体DNA产量。使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从四个富集的噬菌体培养物中分离总DNA。在添加提供的裂解之前，进行了DNase I预处理。布里液，将20单位的DNase I添加到1 ml富集的噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育20分钟。DNAase I处理后，遵循该过程。作为对照，使用Norgen的噬菌体DNA分离试剂盒从相同4个培养物的等分试样中分离DNA，而无需进行DNase I处理。进行DNA分析，将10 µL的每50 µL洗脱加载到1x TAE琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体DNA被其外套蛋白安全地保护了DNase I治疗，而宿主基因组DNA则被DNase I有效降解。因此，DNase I预处理导致最终噬菌体洗脱中的宿主GDNA污染较少，而不会影响总噬菌体DNA产量。车道M是Norgen的Highranger 1 Kb DNA梯子（Cat。11900）。
原始的多壁碳纳米管，可快速有效的质粒DNA澄清
基于核酸调节细胞活性的治疗方法最近引起了人们的注意。这些分子来自复杂的生物技术过程，需要有效的制造策略，高纯度和精确的质量控制才能用作生物制药。基于核酸的生物治疗剂制造的最关键和最耗时的步骤之一是它们的纯化，这主要是由于提取物的复杂性。在这项研究中，描述了一种简单，有效且可靠的方法，用于分离和阐明复杂样品的质粒DNA（pDNA）。该方法基于使用原始碳纳米管（CNT）的选择性捕获RNA和其他杂质的选择性捕获。研究了带有不同直径的多壁CNT（MWCNT），以确定其吸附能力，并解决其相互作用和区分核酸之间的能力。结果表明，MWCNT优先与RNA相互作用，并且较小的MWCNT具有较高的吸附能力，如较高的特定表面积所预期的那样。总体而言，这项研究表明，与初始水平相比，MWCNT显着降低了杂质（即RNA，GDNA和蛋白质）的水平约为83.6％，从而使溶液中澄清的pDNA在整个恢复过程中保持稳定性。此方法促进了治疗应用中pDNA的预纯化。
噬菌体DNA分离试剂盒
图 1. 有效去除宿主基因组 DNA，同时不降低噬菌体 DNA 产量。使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从四种富集噬菌体培养物中分离总 DNA。在添加提供的裂解缓冲液之前进行 DNase I 预处理。简而言之，将 20 单位 DNase I 添加到 1 mL 富集噬菌体培养物中，并将混合物在室温下孵育 20 分钟。DNAase I 处理后，按照程序进行。作为对照，使用 Norgen 的噬菌体 DNA 分离试剂盒从相同 4 种培养物的等分试样中分离 DNA，而无需进行 DNase I 处理。对于 DNA 分析，将每 50 µL 洗脱液中的 10 µL 上样到 1X TAE 琼脂糖凝胶上。可以看出，噬菌体 DNA 被其外壳蛋白安全地保护起来，免受 DNase I 处理的影响，而宿主基因组 DNA 则被 DNase I 有效降解。因此，DNase I 预处理导致最终噬菌体洗脱中宿主 gDNA 污染较少，而不会影响总噬菌体 DNA 产量。M 号泳道为 Norgen 的 Highranger 1 kb DNA Ladder（货号 11900）
可视化摩尔长读测序的DNA，而不是质量
NGS库准备期间的传统测量包括在特定尺寸范围内确定样品质量。该分析很容易用安捷伦自动电泳仪器进行，该仪器以数字凝胶图像和电图图的形式提供视觉结果。电文件图显示荧光信号作为图形表示，X轴上的大小和Y轴上的相对荧光单元（RFU）。因此，荧光信号的高度与给定尺寸的样品质量成正比。虽然该表示形式已被广泛用于剪切GDNA和最终NGS库的质量控制，但检查样品的摩尔性可能会提供更好的视觉表示，以显示样品可以产生的测序读数数量，尤其是用于长阅读测序。高分子重量样品。优势允许用户通过将Y轴从RFU切换到Nmole/L来可视化电处理图像作为质量或摩尔度的产物。通过可视化摩尔数中的数据并使用涂片分析，可以使用FEM脉冲来确定不同尺寸括号内发现的样品的摩尔数，并提供更好的长阅读测序读取长度的预测。
nuc-off核酸酶和DNA去除喷雾
图1。在去除RNase和dNase中，MP生物医学Nuc-Off核酸酶和DNA去除喷雾剂和竞争者T溶液的性能比较。A. RNase消除。在室温下孵育5分钟，将4μl的去除试剂和不同量的RNase（以1μl为单位）的混合物孵育；之后，加入1μlRNA，并在室温下进一步孵育15分钟，然后在含有甲醛的琼脂糖凝胶中变性和最终混合物的电泳。B. DNase消除。在室温下孵育4μl的去除试剂和不同量的DNase（以1μl）的混合物5分钟；之后，将1μl10X反应缓冲液和1μgDNA和无核酸酶的水加入总体积10μl，并在室温下进一步孵育15分钟，然后是最终混合物的琼脂糖凝胶电泳。C.去除试剂对DNA稳定性的影响。在室温下孵育15分钟，将4μl的去除试剂和1μl基因组DNA的混合物进行孵育，然后通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。D.去除试剂对RNA稳定性的影响。在室温下孵育4μl的去除试剂和1μlRNA的混合物，然后变性添加含有甲醛的琼脂糖凝胶电泳。此处显示的图仅供参考，它可能会根据不同的实验条件而有所不同。
样本提交指南 DNA、RNA 和 RTR
订单。确保每个管都有正确且清晰的标签，标明客户 ID 或 GenomeScan ID。• 每个样品板都必须贴上您的 GenomeScan 项目 ID。确保位置 A1-H12 中的样品与 SSF 上指示的样品 ID 准确对应。• 样品板应放在密封袋或盒子中，并放在聚苯乙烯容器内运输。• 为确保基因组 DNA (gDNA) 的最佳保存，我们建议使用冰袋运输。• 对于 RNA 样品，请在运输过程中使用干冰以保持其完整性。• 请记住，国际运输的运输时间可能会比预期的更长。确保您的包裹包含足够的冷却材料，以在运输过程中保持样品的质量。我们强烈建议对合理和/或独特的样品使用冷链运输。• 避免在周末或国定假日运输的日子安排样品运输。作为一家位于荷兰的公司，我们在以下公认的公共假期休息：元旦、复活节星期一、国王节（4 月 27 日）、耶稣升天节、圣灵降临节星期一和圣诞节（12 月 25 日和 26 日）。