利用最近开发的 (J. Chem. Theory Comput. 2020, 16, 1215 – 1231) Ad − MD | gVH 方法模拟了乙腈溶液中苝二酰亚胺 (PDI) 染料的光吸收光谱。这种混合量子-经典 (MQC) 方法基于软(经典)/刚性(量子)核自由度的绝热 (Ad) 分离,并将光谱表示为通过广义垂直 Hessian (g VH) 振动电子方法获得的振动电子光谱(对于刚性坐标)的构象平均值(在软坐标上)。该平均值是使用特定参数化的量子力学衍生力场 (QMD-FF) 执行的,针对从经典分子动力学 (MD) 运行中提取的快照进行的。本文对旨在重现灵活分子光谱形状的不同方法的可靠性进行了全面的评估。首先,通过将特定 QMD-FF 和通用可转移 FF 获得的结果与参考气相从头算 MD (AIMD) 的结果进行比较,评估采样构型空间的差异及其对吸收光谱预测的影响,包括纯经典方案(集合平均)和 Ad − MD | gVH 框架。接下来,还获得了溶液中 PDI 动力学的经典集合平均和 MQC 预测,并将其与基于对单个优化苝二酰亚胺结构进行的振动电子计算的“静态”方法的结果进行了比较。在经典的集合平均方法中,用两个 FF 获得的显著不同的采样导致预测光谱的位置和强度都发生了相当大的变化,其中沿 QMD-FF 轨迹计算的光谱与 AIMD 对应光谱非常接近。相反,在 Ad − MD | gVH 理论水平上,不同的采样提供非常相似的振动电子光谱,这表明用通用 FF 获得的吸收光谱中的误差主要与刚性模式有关,因为它可以通过 g VH 执行的二次外推来有效地校正,以沿此类坐标定位基态和激发态势能表面的最小值。此外,从研究PDI染料的自组装过程和大尺寸聚集体的振动电子光谱的角度来看,使用针对分子的QMD-FF似乎也是强制性的,因为在柔性侧链群体中发现的GAFF轨迹存在显著误差,这决定了超分子聚集特性。
背景 晚期不可切除和/或转移性癌症患者迫切需要治疗。粘蛋白 1 (MUC1) 是一种特征明确的异二聚体糖蛋白,在许多上皮源性肿瘤中过表达,由非共价连接的 N 端 (MUC1-N) 和 C 端 (MUC1-C) 单体组成。MUC1-C 表位选择性地出现在乳腺癌、结直肠癌、卵巢癌、胃癌、肺癌等上皮源性实体瘤中。由于细胞极性的丧失,MUC1-C 也广泛且易于在整个肿瘤组织中表达,这是肿瘤发生的标志之一。 P-MUC1C-ALLO1 是一种针对 MUC1-C 表位的完全同种异体 CAR-T,采用非病毒转座子整合(piggy-Bac ® DNA 递送系统)制造,可产生高度富集的 T 干细胞记忆 (T SCM) 产品。它含有 3 个转基因:基于抗 MUC1-C 人源化 scFv 的 CAR、用于提高产品同质性的 DHFR 药物选择基因和基于 iCasp9 的安全开关基因(可在需要时快速消融 CAR-T)。这些细胞使用 Cas-CLOVER ™ 位点特异性基因编辑系统进行基因编辑,通过敲除 T 细胞受体 β 链 1 基因来消除所有细胞中内源性 T 细胞受体的表达以防止移植物抗宿主 (GvH) 反应,并敲除 b2-微球蛋白基因以消除 MHC I 类的表达,从而减弱宿主抗移植物反应。在小鼠三阴性乳腺癌和卵巢癌模型中观察到 P-MUC1C-ALLO1 的临床前疗效,这为这项首次人体 (FIH) 1 期试验提供了理论依据。方法这是一项 1 期、多中心、开放标签、FIH、3+3 设计,旨在评估 P-MUC1C-ALLO1 对 RECIST 1.1 可测量且对标准治疗有抵抗力/不适合的晚期或转移性上皮源性癌症患者的作用。最多 100 名患者将被纳入 4 个单次和周期性给药组,使用两种不同的淋巴细胞清除 (LD) 方案(环磷酰胺/氟达拉滨 ± 利妥昔单抗)。每个组的计划剂量递增范围为 0.75 至 15 x 10 6 细胞/kg。本研究的主要目标包括确定最大耐受剂量 (MTD)、评估总体安全性和耐受性、初步疗效和疾病反应。探索性终点将包括 MUC1-C 肿瘤表达和与反应的相关性、P-MUC1C-ALLO1 细胞动力学和生物标志物分析,包括 MUC1 相关肿瘤标志物 CA15-3 和 CA27-29 和 CTC。结果迄今为止,已有三名患者接受了 P-MUC1C-ALLO1 治疗(食管腺癌、结直肠腺癌和乳腺癌)。迄今为止,P-MUC1C-ALLO1 治疗耐受性良好,未观察到剂量限制性毒性、CRS 或 GvH 疾病。本研究继续招募受试者,并将提供更新的数据。试验注册 NCT05239143
1 妇科肿瘤学系,乌得勒支大学医学中心乌得勒支癌症中心,乌得勒支大学,3584 CX 乌得勒支,荷兰;JFRoze@umcutrecht.nl(JR);JWGroeneweg-11@umcutrecht.nl(JG);rene.hmverheijen@gmail.com(RV);G.Monroe@umcutrecht.nl(GM)2 遗传学系,分子医学中心,乌得勒支大学医学中心,Oncode 研究所,乌得勒支,3584 CX 乌得勒支,荷兰;e.sendinogarvi@uu.nl(ESG);E.Stelloo@umcutrecht.nl(ES);CSStangl-2@umcutrecht.nl(CS);ferdinando.sereno@studenti.unipd.it(FS); KJDuran@umcutrecht.nl (KD);G.vanHaaften@umcutrecht.nl (GvH) 3 格罗宁根大学医学中心妇产科,格罗宁根大学,9713 GZ 格罗宁根,荷兰;stpaijens@umcg.nl (SP);hwnijman@umcg.nl (HN) 4 阿姆斯特丹妇科肿瘤中心妇科肿瘤科,阿姆斯特丹大学医学中心,1105 AZ 阿姆斯特丹,荷兰;hsvanmeurs@amsterdamumc.nl (HvM);lrvanlonkhuijzen@amsterdamumc.nl (LvL) 5 凯瑟琳娜医院妇产科,5623 EJ 埃因霍温,荷兰; jurgen.piek@catharinaziekenhuis.nl 6 荷兰阿姆斯特丹妇科肿瘤中心妇科肿瘤科,Antoni van Leeuwenhoek 医院癌症研究所,1066 CX 阿姆斯特丹,荷兰;c.lok@nki.nl 7 荷兰乌得勒支大学医学中心病理学系,乌得勒支大学,3584 CX 乌得勒支,荷兰;GNJonges@umcutrecht.nl 8 荷兰乌得勒支大学医学中心肿瘤内科系,3584 CX 乌得勒支,荷兰;POWitteveen@umcutrecht.nl * 通信地址:R.Zweemer@umcutrecht.nl;电话:+31-887-555-555 † 上述作者贡献相同。