先验策略名称和号码,如适用:1。AHS - G2010 - 脂质面板2。AHS - G2050 - 心血管疾病风险评估和管理中的新型生物标志物3。AHS - G2053 - 心血管危险面板4。AHS - G2106 - 血清中间密度脂蛋白的测量5。AHS - M2082 - 脂蛋白,相关磷脂酶A2 6。AHS - G2104 - 长链omega-3脂肪酸的测量7。ahs - G2096 - 同型半胱氨酸测试8。ahs - M2090 - 9p21单核苷酸多态性的基因分型9。ahs - M2102 - 用于预测他汀类药物治疗的心血管风险和/或有效性的KIF6基因分型10。AHS - M2064 - 预测冠状动脉疾病生效日期的遗传表达:04/01/2025政策描述|覆盖范围的适应症和/或限制|术语表|科学背景|指南和建议|适用的州和联邦法规|适用的CPT/HCPCS程序代码|基于证据的科学参考|修订历史记录
™DNA多样本Ultra 2.0套件是开发出可从多种样品矩阵的高质量DNA快速纯化的。DNA可以在下游应用的广泛分子生物学中使用,例如测序,基因分型和qPCR。此协议使用板格式通过手动隔离来引导您。
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1。摘要第3年:在项目的第三年中,小麦繁殖者发布了28种商业品种(7种带有PVP),并在Grin-Global中存放了5种改进的种系。由28个新的同行评审论文证明了小麦库参与者的良好生产率。该项目还生成了HIFI基因组数据,用于在五个组织中为200个辅助的10种小麦和表达数据的10种不同的表达数据。我们还使用了单分子鱼和单细胞转录组学中的定量多路复用,以鉴定发育中的小麦尖峰中的不同细胞群体,并生成小麦峰值发育的表达地图集。探索了几个基因分型平台,并使用实用的单倍型图V1进行了插补,从而集成了T3中存在的不同平台的标记。已经启动了改进的PHG V2的开发。从290次现场试验中收集了57,800个地块的农艺数据,并从119英亩以上的282次UAS航班收集了其他现场数据,其中包括35,376个地块。通过育种程序和基因分型实验室产生> 350 m的数据点,共有48,900个样品。此信息用于在公共小麦育种计划中实施基因组选择,也是宝贵的研究资源。在2024年,有8位学生成功完成了博士学位,另外50名参加了由项目教育协调员组织的多项教育活动,包括面对面的研讨会和在线活动。分别在附录1和2中分别提供已发布品种和出版物的完整列表。学生的个人资料和项目以及项目会议和教育资源的链接可在WheatCap网站(https://www.triticeaecap.org/)上获得。社区资源在附录3中,在附录4中接受培训的学生。附录5提出了基因分型实验室进行的调查结果。
马里兰大学医学学院日期,2024年1月24日,马里兰州医学院医学院纸邮件670 W. Baltimore St. jim.phd@icloud.com教育1973 B.S.堪萨斯州立大学化学(Magna cum Laude)1976年M.S.伊利诺伊大学化学,Urbana-Champaign 1977 Ph.D.伊利诺伊大学分析化学,Urbana-Champaign 2016 M.S. 生物信息学,约翰·霍普金斯大学,巴尔的摩学术任命2014-2016,马里兰州医学院内分泌学和营养部医学系医学系博士后研究员,基于Web大学医学学院开发的基于Web的基于Web的系统,用于注释基因组变体的注释以及用于Amish Phototypes的基因组变体和搜索/搜索协会的结果。 开发了从多个来源组合外显子芯片基因分型的方法,并与Wellcome-Trust-Sanger合作以解决基因分型问题。 开发了用于运行关联分析的自动化管道,生成曼哈顿和QQ图并加载结果到Amish结果数据库中。 2016年至今马里兰大学医学系助理教授伊利诺伊大学化学,Urbana-Champaign 1977 Ph.D.伊利诺伊大学分析化学,Urbana-Champaign 2016 M.S.生物信息学,约翰·霍普金斯大学,巴尔的摩学术任命2014-2016,马里兰州医学院内分泌学和营养部医学系医学系博士后研究员,基于Web大学医学学院开发的基于Web的基于Web的系统,用于注释基因组变体的注释以及用于Amish Phototypes的基因组变体和搜索/搜索协会的结果。开发了从多个来源组合外显子芯片基因分型的方法,并与Wellcome-Trust-Sanger合作以解决基因分型问题。开发了用于运行关联分析的自动化管道,生成曼哈顿和QQ图并加载结果到Amish结果数据库中。2016年至今马里兰大学医学系助理教授
图1。比较次要等位基因频率(MAF)和祖先种群的覆盖范围和准确性。Axiom Pangenomix和Axiom Pangenomix Plus阵列使用插图来提供我们所有主要祖先种群的人类基因分型阵列中的最高准确性和覆盖率。PMDA:Applied Biosystems™Axiom™精密药物多样性阵列; UK BioBank:Applied Biosystems™UK Biobank Axiom™阵列。
许多牲畜物种的高维基因组信息的获取正在加速。这不仅得益于基因分型成本的不断降低,还得益于利用基因组信息创造更高投资回报的可用服务的扩展。单个动物的基因组信息有许多用途,包括 (1) 亲子鉴定和发现、(2) 可追溯性、(3) 核型分析、(4) 性别决定、(5) 报告和监测导致重大影响或先天缺陷的突变、(6) 更好地评估个体的近亲繁殖和个体之间的共同祖先、(7) 交配建议、(8) 确定品种组成、(9) 实现精准管理,以及 (10) 基因组评估;基因组评估利用全基因组的基因型信息来提高预测动物(以及其后代)遗传价值的准确性。基因组数据也为研究提供了巨大的资源,尽管这项研究的成果如果成功,最终应该通过前面提到的十个应用之一来实现。本文描述了从样本采购到识别错误基因型的整个基因型生成过程,以及在开发用于实际应用的定制基因分型面板时应考虑的步骤。2023 作者。由 Elsevier BV 代表动物联盟出版。这是一篇根据 CC BY 许可证开放获取的文章(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
简短的串联重复序列(STR)是在种群遗传学分析中广泛使用的高度信息遗传标记。它们是遗传脱位的重要来源,也可以产生功能影响。尽管有生物信息学方法可用于从整个基因组测序数据中对STR进行大规模全基因组基因分型,但它们以前尚未应用于来自大量疟疾寄生虫田间样品的大量集合数据。在这里,我们使用HIPSTR在3,000多个恶性疟原虫和174疟原虫中使用HIPSTR进行了基因分型STR,从全球收集的样品中发表了全基因组序列数据。最终的呼叫集中的噪声和可变性高,因此需要开发一种新型的STR基因型调用质量控制方法。一组高质量的str基因座(p。falciparum和p。vivax)用于研究疟原虫遗传多样性,种群结构和选择的遗传学特征,并将其与全基因组单核苷酸多态性(SNP)基因分型数据进行了比较。此外,p。含量的遗传变异和其他特征的全基因组信息。恶意和p。Vivax已在基于交互式Web的R Shiny应用程序PlasmoStr(https://github.com/ bahlolab/plasmostr)中可用。