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标题星形胶质细胞衍生的MFG-E8促进小胶质...
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。根据作者/资助者，它是根据预印本提供的（未经同行评审的认证），他已授予Biorxiv的许可证，以在
在由稀有特异性激动剂驱动的神经元腹腔细胞命运期间解码转录身份
。CC-BY-NC 4.0国际许可证的永久性。根据作者/资助者，它是根据预印本提供的（未经Peer Review的认证），他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年12月24日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.12.23.630055 doi：Biorxiv Preprint
使用机器学习对小胶质细胞进行分类
项目详情：机器学习：通常，只需根据生物细胞的形状即可预测其状态。人类尝试这样做既耗时又容易受到无意识偏见和人为错误的影响。相反，人们更喜欢自动计算方法，而这正是机器学习可以实现的。我们的初步结果已经开发出一种高精度（>93%）的小胶质细胞方法。这篇博士论文的目的是改善这一点。应用：小胶质细胞是大脑中的常驻免疫细胞。它们采用多种表型来控制大脑的免疫反应，包括吞噬有害物质和释放信号化学物质。科学界在过去五十年中天真地将小胶质细胞分为两种类型。然而，最近的研究（包括我们的合作者）带来了革命性的想法，即小胶质细胞状态是一个连续体。重要性：拥有一种可以准确确定小胶质细胞状态的诊断工具至关重要。首先，小胶质细胞在抑郁症和精神分裂症等精神健康状况中起着至关重要的作用。其次，小胶质细胞在神经退行性疾病（包括运动神经元、帕金森氏症和阿尔茨海默氏症）中很重要。第三，这种工具可用于脑外科手术期间，以持续监测脑细胞状况。第四，这项工作可以扩展到其他巨噬细胞，如肺部的肺泡巨噬细胞。 项目关键目标：（1）开发一种机器学习方法来自动分类小胶质细胞状态（2）确定该方法如何依赖于图像大小、成像条件和不完善的训练数据（3）优化该方法以实时运行并同时在多个细胞上运行 方法：这项博士学位将利用我们与 Kate Harris 博士（纽卡斯尔）、Ian Wood 教授（利兹）和 Andrew Dick 教授（布里斯托尔）合作提供的机会。它将采用一种真正的多学科方法研究小胶质细胞状态，包括机器学习、图像分析和延时成像。这将使学生学习到非常理想的定量和实验技能组合，从而为未来的职业前景带来良好的前景。项目计划：（1）创建新的机器学习方法，特别是卷积神经网络（CNN），使用我们现有的 >20,000 个小胶质细胞的大型数据集自动对小胶质细胞状态进行分类。这将涉及探索多个数据集和 CNN 架构（VGG-16、ResNet、Inception、Xception、DenseNet、ResNeXt-50）。（2）设计图像分析软件，自动从原始显微镜图像中分割细胞。这将基于我们小组现有的代码，并将为机器学习生成输入数据。相关技术将包括形态学操作、边缘检测、距离变换和分水岭变换。（3）培养和成像人类小胶质细胞 HMC3 细胞系，以生成更多数据用于训练 CNN 并测试机器学习模型的准确性。细胞
多路复用的单细胞测序屏幕鉴定了增加鼠类穆林·穆勒胶质的神经源重编程的化合物
哺乳动物的抽象视网膜变性导致永久视力丧失，因为无法自然再生。一些非哺乳动物脊椎动物通过Muller Glia（MG）显示出强大的再生。，我们最近通过刺激性转录因子ASCL1的转基因表达来刺激成年小鼠MG以再生功能神经元的重生。这些结果表明MG可以作为神经元替代的内源性来源，但该过程的功效是有限的。为了在哺乳动物中改善这一点，我们设计了一个小分子筛选，一种使用SCI-plex，一种将多达数千个单核RNA-seq条件多路复用到单个实验中的方法。我们使用这项技术筛选了92种化合物的库，鉴定并验证了两种在体内促进神经发生的库。我们的结果表明，高通量单细胞分子分析可以基本上改善可以刺激神经再生的分子和途径的发现过程，并进一步证明了这种方法在视网膜疾病患者中恢复视力的潜力。
对患有...的儿科患者的基底神经节进行评估
背景：原发性肾病综合征是儿童慢性肾衰竭的重要原因。疾病期间可能会出现重要的神经元并发症。目的：本研究旨在通过纹理分析证明肾病综合征患儿的基底神经节受累情况。方法：分析了 22 例原发性肾病综合征患儿和 40 例年龄相仿的健康儿童的脑 MRI 图像。从丘脑、豆状核和尾状核提取脑 MRI T2 加权图像并进行纹理分析。结果：对 22 例原发性肾病综合征患儿和 40 例对照组患儿的图像进行了评估。患者组和对照组在年龄和性别方面没有显著差异（P 值分别为 0.410；0.516）。丘脑的直方图参数平均值、1.P、10.P、50.P、90.P、99.P值之间存在显著差异（P值分别为0.001；0.000；0.001；0.002；0.004；0.009）；豆状核的直方图参数平均值、1.P、10.P、50.P、90.P、99.P值之间存在显著差异（P值分别为0.031；0.019；0.006；0.006；0.003；0.003；0.001；0.002）。从尾核获得的直方图参数的平均值、1.P、10.P、50.P、90.P、99.P 值之间存在显著差异（P 值分别为 0.002；0.005；0.002；0.002；0.002；0.003；0.003）。结论：纹理分析可能有助于显示原发性肾病综合征儿科患者的脑实质受累情况，因为它可以显示传统图像上无法识别的变化。
小胶质细胞状态容易受到阿尔茨海默氏病的衰老和胆固醇失调
Microglia States are Susceptible to Senescence and Cholesterol Dysregulation in Alzheimer's Disease Boyang Li1, Shaowei Wang1, Bilal Kerman1, Cristelle Hugo1, E Keats Shwab2, 3,4, Chang Shu5, Ornit Chiba-Falek 2, 3,4, Zoe Arvanitakis6, and Hussein Yassine1,7 1南加州大学凯克医学院神经病学系，洛杉矶，北卡罗来纳州杜克大学医学中心神经病学系2分司，美国北卡罗来纳州27710，美国。3美国杜克大学医学中心神经病学系，美国27710，美国。 4基因组和计算生物学中心，杜克大学医学中心，北卡罗来纳州达勒姆，27708，美国。 5遗传流行病学中心，人口与公共卫生科学系，凯克医学院，南加州大学，洛杉矶大学6 RUSH阿尔茨海默氏病中心，拉什大学医学中心，伊利诺伊州芝加哥，伊利诺伊州芝加哥，美国7号，个性化大脑健康中心，南加州大学，洛杉矶，洛杉矶2250年，卢斯2250 caazar cazar stree hyassine@usc.edu作者宣布，不存在资金的利益冲突3美国杜克大学医学中心神经病学系，美国27710，美国。4基因组和计算生物学中心，杜克大学医学中心，北卡罗来纳州达勒姆，27708，美国。5遗传流行病学中心，人口与公共卫生科学系，凯克医学院，南加州大学，洛杉矶大学6 RUSH阿尔茨海默氏病中心，拉什大学医学中心，伊利诺伊州芝加哥，伊利诺伊州芝加哥，美国7号，个性化大脑健康中心，南加州大学，洛杉矶，洛杉矶2250年，卢斯2250 caazar cazar stree hyassine@usc.edu作者宣布，不存在资金的利益冲突
检测汤利亚地区腹泻的大肠杆菌中的耐药性：多药抗性菌株的分析
结果：结果表明，所有40种分离的大肠杆菌菌株均表现出对磺胺嗪钠，Enrorofuins和环丙沙星的耐药性，其中90％的菌株易受多型多糖质B。值得注意的是，应变11、23和24表现出严重的抗性。抗生素耐药性基因TEM-1，TEM-206，Stra，Strb，Qach和Blactx的检测率为100％，表明这些基因的患病率很高。此外，大多数菌株携带抗生素抗性基因与其抗性表型一致。wg菌株11、23和24个揭示了4,897,185 bp，4,920,234 bp和4,912,320 bp的基因组大小。这些菌株分别携带两个，一个和两个质粒。抗生素抗性基因的预测显示了基因组中的这些基因中的大量数量，菌株24具有最高数量，总计77个含有88种抗生素耐药基因的亚种。
神经元中GBA的缺失，而不是小胶质细胞，导致Gaucher小鼠模型中的神经退行性
gaucher病是最普遍的溶酶体储存疾病，是由GBA基因的纯合突变引起的，GBA基因负责编码酶葡萄糖脑培合酶。神经性高刺病与小胶质细胞增多症，星形胶质细胞增多和神经退行性有关。然而，小胶质细胞，星形胶质细胞和神经元在疾病中起着作用仍有待确定。在当前的研究中，我们开发了可诱导的，细胞型特异性的GBA -KO小鼠，以更好地了解GBA缺乏对小胶质细胞和神经元的影响。gba有条件地将仅在小胶质细胞或神经元或整个体内淘汰。这些小鼠模型是使用他莫昔芬诱导的CRE系统开发的，他莫昔芬给药开始于断奶时。小胶质细胞特异性GBA -KO小鼠没有疾病的迹象。然而，神经元特异性的GBA KO导致寿命缩短，体重减轻和共济失调。这些小鼠还具有明显的神经变性，小胶质细胞增多症和星形胶质细胞增多症，伴随着葡萄糖基酰胺和葡萄糖基肾上腺素的积累，概括了类似Gaucher病的症状。这些令人惊讶的发现表明，与神经元特异性的GBA缺乏不同，仅小胶质细胞特异性GBA缺乏并不能诱发疾病。中位生存率为16周的神经元乔ch病小鼠模型可能可用于将来的发病机理研究和疗法评估。
甲状腺激素到大脑的有缺陷导致星形胶质变化
Allan-Herndon-Dudley综合征（AHDS）是一种罕见的X连锁疾病，会造成严重的神经系统损害，没有有效的治疗。ahDS是由于甲状腺激素转运蛋白MCT8的灭活突变会损害甲状腺激素进入大脑的，从而导致脑甲状腺功能减退症。但是，AHD的病理生理学仍然尚未完全了解，这对于制定治疗策略至关重要。Based on evidence suggesting that thyroid hormone deficit leads to alterations in astroglial cells, including gliosis, in this work, we have evaluated astroglial impairments in MCT8 deficiency by means of magnetic resonance imaging, histological, ultrastructural, and immunohistochemical techniques, and by mining available RNA sequencing outputs.与对照组相比，从磁共振成像中获得的明显扩散系数（ADC）成像值表明，MCT8缺陷型患者（n = 11）的脑细胞牙术结构改变（n = 11）。与来自类似年龄的对照受试者的大脑样本相比，通过针对11岁和30个妊娠期MCT8缺陷受试者的尸检大脑样本中的星形胶质体标志物的免疫组织化学证实了星形胶质细胞的改变。这些发现得到了验证，并在AHD的鼠标模型中进一步探索。我们的发现证实了MCT8缺乏症中大脑皮层的所有星形胶质体种群的变化，影响星形细胞代谢和线粒体细胞呼吸功能。这些障碍在大脑发育早期出现，并在成人阶段一直持续存在，揭示了皮质星形胶质细胞的异常分布，密度，形态，以及转录组的改变，与成人阶段的类似星形胶质细胞衰差表型兼容。我们得出结论，星形胶质细胞是AHDS中潜在的新型治疗靶标，我们建议ADC成像作为监测神经系统障碍进展的工具，以及治疗中MCT8缺乏症的潜在影响。
小胶质细胞调节阿尔茨海默氏病中Aβ依赖性星形胶质细胞反应性
其他声明：是的，存在潜在的竞争利益。WVB担任Novo Nordisk的发言人。SG曾是Cerveau Technologies的科学顾问。GT-B和HCK是Johnson和Johnson Innovative Medicine的员工，并从其母公司Johnson＆Johnson获得薪水和股票。nja在莉莉（Lilly）和昆特利（Quanterix）赞助的座谈会上进行了讲座。HZ has served on the scientific advisory boards and/or as a consultant for Abbvie, Acumen, Alector, Alzinova, ALZPath, Amylyx, Annexon, Apellis, Artery Therapeutics, AZTherapies, Cognito Therapeutics, CogRx, Denali, Eisai, LabCorp, Merry Life, Nervgen, Novo Nordisk, Optoceutics, Passage Bio，Pinteon Therapeutics，Prothena，Red Abbey Labs，Remynd，Roche，Samumed，Samumed，Siemens Healthineers，hearthers，Triplet Therapeutics and Wave在Alzecure，Alzecure，Biogen，Biogen，Biogen，Biogen，Biogen，Cellectricon，Fuujirebio，Novilly，Libiolly，Libioll，Linork和Rocheer and Rooche的座谈会上发表了讲座。 Gothenburg AB（BBS），这是GU Ventures孵化器计划的一部分（外部提交的工作）。kb曾担任ABBVIE，AC IMMUNE，ALZPATH，ARIBIO，BIOANCIC，BIOGON，BIOGEN，EISAI，LILLY，MOLEAC PTE的顾问和咨询委员会。erz在下一家创新治疗学的科学顾问委员会任职。所有其他作者都声明他们没有竞争利益。Ltd，Neurimmune，Novartis，Ono Pharma，Prothena，Roche Diagnostics和Siemens Helthineers；曾在朱利叶斯临床和诺华的数据监测委员会任职；已经进行了讲座，生产教育材料并参加了有关AC免疫，Biogen，Celdara Medical，Eisai和Roche诊断的教育计划；并且是哥德堡AB（BBS）的脑生物标志物解决方案的联合创始人，该解决方案是本文介绍的工作之外的GU Ventures孵化器计划的一部分。