每个成核细胞中存在的二十三对染色体,一个人分别从母亲那里遗传了23个染色体,分别通过OVA和精子传播的父亲23对染色体。在每个细胞分裂时,染色体复制,一组送给每个子细胞。关于身体的内部组织,身体特征和生理功能的所有信息均以四个核苷酸或碱基的语言(序列)的语言(序列)编码:腺嘌呤(A),鸟嘌呤(G),胸腺氨酸(T),胸腺氨酸(T)和胞嘧啶(C)以及糖磷酸磷酸盐back骨。人类单倍体细胞包含30亿个基础。人体的所有细胞都具有完全相同的DNA,但在核苷酸序列中,它因单个到个体而异。线粒体DNA(mtDNA)在线粒体中大量副本中发现的是圆形的,双链,16,569个碱基对,并显示出母亲的遗传。这在通过母体线路相关的人的研究中特别有用。也比核DNA大量副本,可用于分析降解样品。同样,Y染色体显示出父亲的遗传,并被用来追踪男性谱系并从性侵犯混合物中解析雄性DNA。
DNA是一个复杂的多分辨率分子,其理论研究是一个挑战。其内在的24多尺寸性质需要化学和量子物理学才能了解结构和25个量子信息学,以将其操作解释为完美的量子计算机。在这里,我们提出了26个DNA的理论结果,可以更好地描述其结构及其在遗传信息的传输,编码和解码中的操作过程27。芳香性通过28个相关电子和孔对的振荡谐振量子状态来解释,这是由于量化的29个分子振动能充当吸引力的。相关对在单个带𝜋-分子轨道(𝜋 -MO)中的氮基碱基中形成30个超电流。Mo Wave 31函数(φ)被认为是N组成原子轨道的线性组合。腺嘌呤(a)和胸腺氨酸(T)或鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)之间的32个中央氢键像理想的约瑟夫森连接一样。正确描述了两个34个超导体之间约瑟夫森效应的方法,以及氮基碱的凝结到35,获得了形成量子的两个纠缠量子状态。将36个复合系统的量子状态与经典信息相结合,RNA聚合酶传递了四个钟形37个状态之一。DNA是一台完美的量子计算机。38
系统已被探索作为有效的选择剂来消除未编辑的细胞,从而大大简化了细菌中的基因操作过程。9尽管基于 CRISPR/Cas 的基因组编辑方法简单且高效,但它们仍然依赖于细菌中的 HR 来实现精确的基因操作,因此难以在某些缺乏强大 HR 系统的细菌(如结核分枝杆菌)中建立。最近,脱氨酶介导的碱基编辑系统的发展为生物学中的精确基因操作提供了新策略。10 – 12碱基编辑系统使用脱氨反应和随后的 DNA 复制过程直接转换目标碱基,而不是前面提到的基于 CRISPR/Cas 的基因组编辑方法中所利用的 HR。已经建立了两种主要类型的碱基编辑系统:胞嘧啶碱基编辑器(CBE)10,11 和腺嘌呤碱基编辑器(ABE)。 12,13 CBE 已广泛用于各种生物体(包括真核生物 10,11,14 - 17 和一些细菌物种 17 - 22)中的可编程胞嘧啶到胸腺嘧啶的转化,而 ABE 主要在真核生物中建立,例如哺乳动物细胞 12,23 和植物 24,25,用于精确的腺嘌呤到鸟嘌呤的转化。最近,在链霉菌中开发了一种名为 CRISPR-aBEST 的 ABE 系统。13 此外,还开发了可编程的腺苷到肌苷和胞苷到尿苷的 RNA 编辑器。26,27
我们将SOCS1识别为试剂盒受体酪氨酸激酶信号通路的下游成分。我们表明,暴露于钢因子后,SOCS1 mRNA的表达迅速增加,而SOCS1通过其SRC同源性2(SH2)结构域与Kit受体酪氨酸激酶结合。先前的研究表明,SOCS1抑制了抑制Janus家族激酶的M1细胞的细胞因子介导的分化。相比之下,SOCS1的本构表达抑制了试剂盒的有线剂潜力,同时保持依赖钢因子的细胞存活信号。与Janus激酶不同,SOCS1不抑制KIT酪氨酸激酶的催化活性。为了定义SOCS1介导的抑制KIT依赖性有丝分裂发生的机制,我们证明SOCS1与信号蛋白GRB-2和Rho-family鸟嘌呤核苷酸交换因子VAV VAV结合。我们表明,GRB2通过其SH3结构域结合SOCS1与位于SOCS1 N末端的假定二苯胺决定因素,SOCS1与VAV的N末端调节区域结合。这些数据表明SOCS1是一个可诱导的开关,它调节增生信号,有利于细胞存活信号,并用作受体酪氨酸激酶信号途径中的衔接蛋白。关键字:grb2/sh2/sh3/信号转导/vav
3伊拉克库法大学药学学院,伊拉克库法大学4护理学院,摘要:脱氧核糖核酸(DNA)带有遗传性代码,这些代码由细胞翻译而成,可以同步核糖核酸(RNA)和多肽(RNA)和多肽,这些核酸(RNA)和多肽可以产生和表演VITARE VILATE和PERRACE VITAR。 双螺旋结构是Watson和Crick提出的DNA的最多研究的模型。 DNA作为遗传物质起作用的能力可以在细胞分裂过程中存储和进行,以使该信息加倍并传输到传入的一代。 DNA结构中的任何损害是癌症和其他疾病进展的基本直接原因。 DNA损伤的因素可以归类为外源性和内源性因素。 在本文文章中,我们重点介绍了有关DNA的结构,功能和临床意义的证据支持的信息。 1。 引言DNA的发现可以追溯到1869年,当时一位名叫Friedrich Miescher的瑞士生物化学家正在研究其化学成分来源的白细胞。 他从干净的手术敷料中获得了这些白细胞。 尽管他在细胞的所有细胞器和结构中都是原始的,但他很快将其范围缩小到细胞核,因为在用酸治疗后,出现了他称为“核素”的沉淀物。 大多数分子生物科学学生都会在实验室中进行该实验的某种版本,在这些实验室中,它们将DNA与细胞分离。 DNA的优雅结构,从核苷酸到染色体,是使其充当遗传信息的载体的原因。3伊拉克库法大学药学学院,伊拉克库法大学4护理学院,摘要:脱氧核糖核酸(DNA)带有遗传性代码,这些代码由细胞翻译而成,可以同步核糖核酸(RNA)和多肽(RNA)和多肽,这些核酸(RNA)和多肽可以产生和表演VITARE VILATE和PERRACE VITAR。双螺旋结构是Watson和Crick提出的DNA的最多研究的模型。DNA作为遗传物质起作用的能力可以在细胞分裂过程中存储和进行,以使该信息加倍并传输到传入的一代。DNA结构中的任何损害是癌症和其他疾病进展的基本直接原因。DNA损伤的因素可以归类为外源性和内源性因素。在本文文章中,我们重点介绍了有关DNA的结构,功能和临床意义的证据支持的信息。1。引言DNA的发现可以追溯到1869年,当时一位名叫Friedrich Miescher的瑞士生物化学家正在研究其化学成分来源的白细胞。他从干净的手术敷料中获得了这些白细胞。尽管他在细胞的所有细胞器和结构中都是原始的,但他很快将其范围缩小到细胞核,因为在用酸治疗后,出现了他称为“核素”的沉淀物。大多数分子生物科学学生都会在实验室中进行该实验的某种版本,在这些实验室中,它们将DNA与细胞分离。DNA的优雅结构,从核苷酸到染色体,是使其充当遗传信息的载体的原因。其他研究人员后来进一步表征了“核素”,并将其更名为核酸,因为研究表明该核酸由嘌呤和嘧啶碱,糖和磷酸盐组成。核酸,包括确定四个碱基以及它们含有脱氧核糖核酸的发现 - 因此被称为脱氧核糖核酸(DNA)。发现形成DNA分子主链结构的含氮碱基是对:鸟嘌呤(g)的胞嘧啶(C)和与胸腺氨酸(T)相同量的腺苷(A)(Minchin&Lodge,2019)。但是这种复杂性并非一无所获。沃森(Watson)和克里克(Crick)在1953年的论文中揭示了两个关键方面,这些方面构成了这种美丽的设计:以互补的方式配对核苷酸碱基(与胺的腺嘌呤,胰鸟嘌呤的鸟嘌呤)和双螺旋(Watson&Crick,1953年)。结构DNA结构是众所周知的,许多几何参数被认为是它们的特征,这些参数包括:螺旋弯曲,凹槽宽度,骨干和糖苷扭转角,糖冰瓶,螺旋桨扭曲,螺旋桨扭曲,滚动,滚动,倾斜,倾斜度,螺旋式上升和旋转和扭曲(Sagenger,Sagenger,1984年)。如图(1)所示,脱氧核糖核酸是聚合分子。它是由识别为核苷酸的单体单元的重复而形成的。核苷酸由5-碳糖(脱氧核糖),氮基碱和一个或多个磷酸基团组成。但是,在通过这些充当构建基块的核苷酸形成的DNA中,将三个磷酸基团相互引入。(Lamprecht等,2015)。在此过程中丢失了两种磷酸盐;因此,最后,DNA链每个核苷酸具有一个磷酸基团。
DNA 是一种复杂的多分辨率分子,其理论研究是一项挑战。其内在的多尺度性质需要化学和量子物理学来理解其结构,以及量子信息学来解释其作为完美量子计算机的运行。在这里,我们展示了 DNA 的理论结果,这些结果可以更好地描述其结构和在遗传信息的传输、编码和解码中的运行过程。芳香性可以通过关联电子和空穴对的振荡共振量子态来解释,这是由于量化的分子振动能量充当了引力。关联对在单带 𝜋 -分子轨道(𝜋 -MO)中的含氮碱基中形成超电流。MO 波函数(Φ)被假定为 n 个组成原子轨道的线性组合。腺嘌呤 (A) 和胸腺嘧啶 (T) 或鸟嘌呤 (G) 和胞嘧啶 (C) 之间的 32 中心氢键 33 的功能类似于理想的约瑟夫森结。正确描述了两个 34 超导体之间的约瑟夫森效应方法,以及含氮碱基的凝聚以获得形成量子比特的两个纠缠量子态。将复合系统的量子态与经典信息相结合,RNA 聚合酶传送四个贝尔 37 状态之一。DNA 是一台完美的量子计算机。38
摘要i-motifs(IMS)是在富含细胞质的DNA序列中形成的次级str uct uct uct,在基因组中的多个功能中均在v olv中。尽管Putativ e Im forming序列被广泛分布在人类基因组中,但推定的IMS的折叠状态和强度变化了。muc h先前的研究IM已重点是使用生物含量xperiments评估IM折叠特性。ho w e v er,没有专门的计算工具来预测IM结构的折叠状态和强度。在这里,我们介绍了一条机器学习管道,即IM-Weeker,以预测DNA IMS的折叠状态和结构性折叠状态。该程序Im-seeker结合了一个平衡的随机森林分类器,该森林分类器在全基因组IMAB抗体基于基于IMAB的剪切和标记测序数据中训练,以预测折叠状态和极端的梯度增强回归器,以根据文献生物物理数据和我们的内部生物物理实验来估算折叠强度。im-seeker以81%的分类精度预测DNA IM F旧状态,并在测试集上以0.642的确定系数(R 2)估算了F旧强度。模型的解释证实,富含C的序列的核苷酸组成显着影响Im stabilit Y,与含有胞嘧啶和胸腺氨酸的序列具有正相关,并且与鸟嘌呤和腺嘌呤的负相关。
我们使用van der waals(vdw) - 纠正的密度函数理论和非平衡绿色的功能方法研究了DNA核苷酸酶[腺嘌呤(A),鸟嘌呤(g),胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)]与单层Ti 3 C 2 MXEN的相互作用。所有计算均针对石墨烯进行了基准测试。我们表明,取决于Ti 3 C 2表面上方的核碱基的初始垂直高度,可能是两个相互作用机制,即物理吸附和化学吸附。对于石墨烯,与石墨烯片上方核碱基的初始垂直高度无关,DNA核碱始终将物理呈现在石墨烯表面上。石墨烯的PBE + VDW结合能高(0.55-0.74 eV),并遵循G> a> t> C的顺序,吸附高度在3.16–3.22Å的范围内,表明强大的物理学。对于Ti 3 C 2,PBE + VDW结合能相对较弱(0.16-0.20 eV),并遵循A> g = T> C的阶,吸附高度在5.51–5.60Å的范围内,表明弱物理吸收。化学物质的结合能遵循g> a> t> c的顺序,这是相同的物理学顺序。结合能值(5.3-7.5 eV)表示非常强的化学吸附(约为物理吸附结合能的40倍)。此外,我们的频带结构和电子传输分析表明,对于物理吸附,频带结构没有显着变化,也没有调制状态的传输函数和设备密度。相对较弱的物理吸附和强烈的化学吸附表明,Ti 3 C 2可能无法使用物理吸附方法鉴定DNA核碱基。
背景:识别与冠心病 (CHD) 相关的 DNA 甲基化环境反应基因位点可能揭示 CHD 的新途径或治疗靶点。我们对亚洲人群中与发病 CHD 相关的 DNA 甲基化进行了首次前瞻性表观基因组范围分析。方法:我们进行了一项嵌套病例对照研究,包括发病 CHD 病例和从中国嘉道理生物库的 10 年随访中确定的 1:1 匹配对照。通过 Infinium Methylation EPIC BeadChip 测量基线血液白细胞 DNA 的甲基化水平。我们进行了单胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤 (CpG) 位点关联分析和网络方法来识别与 CHD 相关的 CpG 位点和共甲基化基因模块。结果:经过质量控制,保留了 982 名参与者(平均年龄 50.1 岁)。基因组中 25 个 CpG 位点的甲基化水平与 CHD 发病率相关(全基因组错误发现率 [FDR] < 0.05 或模块特定 FDR < 0.01)。已识别 CpG 的甲基化水平每增加一个标准差,CHD 风险就会有所不同,从降低 47% 到增加 118% 不等。中介分析显示,与吸烟相关的 CHD 风险增加的 28.5% 是由 ANKS1A 基因启动子区域的甲基化水平介导的(中介效应的 P = 0.036)。SNX30 启动子区域的甲基化水平与血压和随后的 CHD 风险相关,中介比例为 7.7%(P = 0.003),通过
12.2解锁DNA的秘密DNA分子必须以某种方式指定蛋白质的组装,蛋白质会调节细胞功能,而不会因细胞而变化。了解DNA的结构对于掌握基因的工作方式至关重要。DNA是一种由共价键连接为长链或链的核苷酸的核酸。核酸是最初在细胞核中发现的略微酸性分子。它们由形成长链的核苷酸组成。DNA的核苷酸由三个组成部分:脱氧核糖,磷酸基团和氮基。后者有四种类型:腺嘌呤(a),鸟嘌呤(G),胞嘧啶(C)和胸腺素(T)。这些基部从链条向侧面突出。可以按任何顺序排列碱的顺序,从而允许多种组合。科学家使用了多个线索来解决DNA的结构。富兰克林的X射线图案显示出一个X形图案显示出扭曲的链,表明两条链和一个角度,指示中心附近的氮基。Watson和Crick使用这些线索建立了三维模型,最终创建了双螺旋模型。双螺旋螺旋解释了夏尔加夫的基本配对规则以及两条线如何缠绕在一起。这个突破模型帮助科学家掌握了DNA的特性和功能。DNA的双螺旋结构由两条链组成,它们像螺旋楼梯一样互相扭曲。
