基因组对于理解微生物生态学和进化至关重要。高通量、长读长 DNA 测序的出现使得从环境样本中大规模恢复微生物基因组成为可能。然而,由于这些环境极其复杂,扩大土壤和沉积物的微生物基因组目录一直具有挑战性。在这里,我们对在丹麦收集的 154 个土壤和沉积物样本进行了深度、长读长纳米孔测序,并通过优化的生物信息学流程恢复了 15,314 个新微生物物种的基因组,其中包括 4,757 个高质量基因组。恢复的微生物基因组涵盖 1,086 个新属,并为 612 个先前已知的属提供了第一个高质量参考基因组,将原核生物生命树的系统发育多样性扩大了 8%。长读长组装体还能够恢复数千个完整的 rRNA 24 操纵子、生物合成基因簇和 CRISPR-Cas 系统,而这些系统在之前的陆地基因组目录中都未被充分代表且高度碎片化。此外,将恢复的 MAG 整合到公共基因组数据库中可显著提高土壤和沉积物宏基因组数据集的物种级分类率,从而增强陆地微生物组表征。通过这项研究,我们证明了长读长 29 测序和优化的生物信息学能够以经济高效的方式从高度复杂的生态系统中恢复高质量的微生物 30 基因组,而生态系统仍然是最大的未开发生物多样性来源,可用于扩展基因组数据库和填补生命之树的空白。32
The reserve consists of a mosaic of wetland and extensive habitats, home to remarkable biodiversity, including unique biotopes such as a remnant of alkaline Molinia meadows, as well as rare and endangered plants like Blue Sedge (Carex panicea), Creeping Willow (Salix repens), and Broad- Leaved Marsh Orchid (Dactylorhiza majalis).该地点还为迁徙和筑巢的鸟类提供了避难所,例如沼泽莺(Acrocephalus Palustris)。
与新加坡植物园雨林连接................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. .............................. 46 Tan Yit Chuan & Low Bing Wen Chapter 6: Enhancing Habitats in Bidadari ............................................................................. 61 Lee Jia Hwa, Jason Yong Wai Weng & Oh Cheow Sheng Chapter 7: Nature Ways – Habitat Enhancement in Streetscape for Biodiversity ............ 76 Sharon Chan, Sunia Teo, Chong Han Wei,Chung Yi Fei和Cheryl Chia第8章:Eco-Link@bke:恢复连接............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 90 DAMIAN TANG&MAYURA PATIL第9章:Kallang River Restoration B.
关于保护自然栖息地和野生动植物的栖息地指令(92/43/EEC)(“栖息地指令”为栖息地和物种提供法律保护,其中第 3 至 9 条为欧盟范围内的被称为 Natura 2000 站点网络的站点网络提供立法保护。Natura 2000 是一个保护区网络,包括特别保护区 (SAC) 和特别保护区 (SPA)(在本报告中称为欧洲站点)。SAC 是根据栖息地指令指定的保护区。它们是高质量的站点,对保护大量栖息地和物种做出了重大贡献。
关于自然栖息地和野生动物和动植物的栖息地指令(92/43/eec)(“栖息地指令”为栖息地和物种提供了法律保护,第3至9条为欧盟广泛的网站提供了立法,称为Natura 2000 Site Network。Natura 2000是一个受保护地点的网络,包括特殊的保护区(SAC)和特殊保护区(SPA)(本报告中称为欧洲站点)。囊是在栖息地指令下指定的保护位置。它们是高质量的地点,可为众多栖息地和物种的保护产生重大贡献。
适当评估 (AA) 是欧洲联盟 (EU) 栖息地指令 (92/43/EEC) 的一项要求,该指令关于保护自然栖息地和野生动植物,并通过 2011 年欧洲共同体 (鸟类和自然栖息地) 条例转化为爱尔兰法律,该条例整合了 1997 年至 2005 年欧洲共同体 (自然栖息地) 条例和 2010 年欧洲共同体 (鸟类和自然栖息地) (娱乐活动控制) 条例。SEA 和 AA 报告均与 CMATS 同时制定,应与本战略同时阅读和考虑。
FAPP地区包含各种栖息地和物种,这些栖息地和物种受到保护,并受到许多欧洲和国家指定的保护。特殊保护区(SPA)在欧盟指令下指定有关野生鸟类的保护(EC/79/409),“鸟类指令”,为对稀有和脆弱鸟类的繁殖,喂养,冬季或迁移至关重要的地区。迄今为止,北爱尔兰有16个水疗中心。特殊的保护区(SAC)根据栖息地指令(92/43/eec)指定,以保护某些栖息地和物种。迄今为止,北爱尔兰有59个囊。北爱尔兰在栖息地指令的附件I附件I中列出了49个栖息地,其中13个被认为是欧洲一级的优先栖息地,在该指令的附件II中列出了18种。在北爱尔兰有20个拉姆萨尔遗址,这些地点是“拉姆萨公约”下指定的,这是一项国际湿地保护和可持续使用的条约。
保护和恢复河岸-洪泛区植物群落和河狸改造栖息地是俄勒冈州洄游鲑鱼保护和恢复计划 [银鲑、奇努克鲑、虹鳟、鲑鱼;2-7] 和全州七鳃鳗保护计划 [太平洋、西河、西溪;8] 中确定的策略。俄勒冈州保护战略 [战略;9] 将美洲河狸及其栖息地改造视为战略栖息地的重要组成部分,包括流水和河岸栖息地、湿地栖息地和白杨林地栖息地以及河道外专门栖息地和当地栖息地 [9]。河狸改造栖息地解决了由于干扰机制破坏和洪泛区功能改变而导致的关键保护问题 [9]。河狸改造栖息地的好处是该战略确定的许多保护机会区建议采取的保护行动的组成部分 [9]。此外,俄勒冈州的连通性和评估制图项目 (OCAMP) 选择了海狸作为湿地和相关木本溪流植被结构栖息地的替代物种,以模拟栖息地连通性并确定俄勒冈州多物种优先野生动物连通性区域 [10]。所有这些保护计划都设定了恢复物种及其栖息地的目标,以平衡部落、农村和城市社区的社会文化需求。