XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemhdr
肥厚型心肌病大鼠模型中 MYBPC3 基因突变的同源定向修复
对照 1098hom 大鼠的心脏功能受损。对照 1098hom 大鼠的射血分数 (EF) 为 61%，而 WT 组为 78%。对照 1098hom 大鼠的缩短分数 (FS)、最大 dP/dt 和最小 dP/dt 也下降。HDR 治疗部分恢复了受损的心脏功能（图 4a、b、c、d 和表 S2）。此外，心房利钠肽 (ANP) 和脑利钠肽 (BNP) 是心力衰竭的生物标志物，在对照 1098hom 大鼠心脏中升高，通过 HDR 编辑标准化（图 4e、f）。心脏切片的天狼星红染色显示对照 1098hom 大鼠的心脏纤维化增加，HDR 治疗可减轻这种纤维化。有无对照的 1098hom 大鼠的心脏肥大和心脏功能没有显着差异
将论文纳入论文格里菲斯业务...
本文件补充了格里菲斯大学将论文纳入论文指南中的补充，应首先阅读。Griffith商学院（GBS）没有首选用于格式化HDR论文的模型。因此，下面概述了两个模型；论文部分由论文和论文组成，主要由论文组成。虽然要求在候选人酌情酌情和与其监督团队协商时，虽然在候选人期间至少有一篇论文或接受一篇论文出版，但论文/s被包括在论文中。候选人必须不迟于他们确认候选人资格里程碑，因此必须与主管讨论论文的格式。应将候选人与主管之间的重大争议转交给HDR召集人和/或部门负责人。关于在部门层面无法解决的论文格式的争议应转交给GBS Dean Research/HDR主任。
通过 CRISPR-Cas9-POLD3 融合进行快速基因组编辑
摘要 精准 CRISPR 基因编辑依赖于细胞同源性定向 DNA 修复 (HDR) 将定制 DNA 序列引入目标位点。HDR 编辑效率因细胞类型和基因组位点而异，这种差异的来源尚不完全清楚。在这里，我们研究了 450 种 DNA 修复蛋白-Cas9 融合对 CRISPR 基因组编辑结果的影响。我们发现大多数融合只能以特定于位点和细胞类型的方式适度改善精准基因组编辑。我们发现 Cas9-POLD3 融合通过加速 DNA 修复的启动来增强编辑。我们得出结论，虽然 DNA 修复蛋白与 Cas9 的融合可以改善 HDR CRISPR 编辑，但大多数需要针对细胞类型和基因组位点进行优化，这突出了导致位点特异性基因组编辑结果的因素多样性。
社会物质性和信息系统......的案例 - HAL
普罗旺斯地区萨隆 ONERA 主任（HDR） Didier Danet 先生 圣西尔师特种军事学校 HDR 讲师 将军 (2S) Patrick Tanguy 2008 年至 2010 年陆军轻型航空兵司令 准将陆军轻型航空兵司令奥利维尔·古尔雷斯·德拉莫特 (Olivier Gourlez de La Motte) 将军
开发人员程序
• 2K/HD/SD I/O up to 50/60p • 4x bidirectional 3G-SDI BNC with 16-ch embedded audio • HDMI I/O with 8-ch embedded audio • Two Thunderbolt 3 ports with loop through • Multi-channel workflow support for OBS/Wirecast/vMix and other applications • RGB 4:4:4 12-bit up to p30, YCBCR 4：2：2 10位和HFR工作流程支持•通过SDI•PQ，HLG，HDR10和Dolby Vision支持的SDR/HDR传输特征，色彩学和亮度的VPID信号传导•HDR元数据捕获和自动播放•通过HDMIIOR ONDER•进行射击•8-8-8-8-面板音频显示•包括对Apple硅的支持•RS-422 VTR控制，参考，LTC输入和LTC输出t-Tap Pro $ 1,099紧凑型，无声，带有SDI和HDMI的移动4K HDR
通过AAV6介导的供体递送在人诱导的多能干细胞中增强的内源基因标记
在人类诱导的多能干细胞（HIPSC）中，系统地对内源性蛋白进行了带有荧光标记的内源性蛋白，可以观察到不同细胞态中的活细胞动力学。然而，通过CRISPR/CAS9诱导的编辑将氟化蛋白的精确插入到活细胞中依赖于同源指导的修复（HDR）。非同源末端连接（NHEJ）DNA修复途径通常胜过HDR，导致不可逆的内部和缺失（Indels）和低敲门效率。识别成功的HDR介导的标记事件是当目标基因在干细胞中未表达并且成功的标记可能不会立即观察到的靶基因是一个额外的挑战。为了解决这些挑战，我们使用了：1）在优化的感染多重性（MOI）下，与腺相关的病毒血清型6（AAV6）介导的DNA供体以最大的效率提供标签有效载荷； 2）滴定的多重CAS9：GRNA核糖核蛋白（RNP）量确保条件之间的HDR/indel频率平衡； 3）长放大液滴数字PCR（DDPCR），以测量编辑池中HDR产生的等位基因的频率； 4）同时推断CRISPR编辑（ICE）以检测并避免与Indels明显饱和（> 50％）。这些方法使我们能够确定有效，准确的编辑条件并恢复带有标记的单元，包括在干细胞中未表达的位点标记的单元。这些步骤共同使我们能够开发出有效的方法和工作流程，直接从具有最佳HDR和最小化indel频率的理想细胞池的克隆分离。使用这种方法，我们同时实现了荧光标记物和双重插入到四个基因中的基因，这些基因在差异过程中被打开，但最初在HIPSC中未表达，在HIPSC中，基于荧光基于荧光的标记细胞的直接选择是不可能的：TBR2，TBR2，TBXT，CDH2，CDH2，CDH2，CDH2，CDH2，CDH2（PROFEFFEREDIATION和MEGREDIATION和MEGREGRIATION和MEGRGIAL egratiation and Moggratial Genes and Cdhees and Cdhh5）and Cdhh5（cdh5）和CDH5（cdh）5（cdh）5（cdh）5（cdh5）。通过对各种GRNA序列和RNP浓度的系统评估，我们确定了达到高HDR频率的每个基因的条件，以38.6％的峰值达到峰值，同时还避免了与Inderels相关的条件，在这种情况下，很难在带有统一的等位基因中具有标记等位基因的克隆的隔离。过度，该方法提高了在hipscs中未表达的基因的荧光敲击的效率，对细胞过程的基于可靠的基于图像的观察，并可以恢复精确编辑的单声道和双重标记的克隆。我们将这些方法标准化，以产生有效且一般的工作流程，以将大型HDR介导的敲入引入HIPSC中。
DDX3X 的饱和基因组编辑阐明了生殖系和体细胞变异的致病性
图 1 实验设计 A) 对于每个外显子，在 5' 和 3' 端设计两个独立的 sgRNA 和相关的 HDR 变体文库。B) 将 sgRNA 和 HDR 变体文库一起转染到表达 LIG4 -KO Cas9 的 HAP1 细胞中。sgRNA 指导 Cas9 介导的双链 DNA 切割到目标外显子。HDR 利用质粒文库作为修复模板，将单个感兴趣的 DDX3X 变体整合到每个细胞的内源位点中。每个供体模板还携带 1-3 个 NGG PAM 位点和原型间隔物的同义变化，防止重新切割。由于 DDX3X 是必需的，消除基因功能的变体会导致这些细胞死亡。我们在第 4、7、11、15 和 21 天对细胞进行取样，并对基因组 DNA 进行深度测序以量化变体的丰度。我们预计功能性错义（紫色）和同义变体（Syn，蓝色）仍然丰富，而功能丧失变体（LOF，红色）和有害错义（黄色）变体将从培养物中耗尽。
CRISPR/CAS通过同源重组的第3章基因组编辑
在整个细胞发育中，DNA可能遭受威胁基因组完整性和细胞存活的损害。最有害的病变之一是双链DNA断裂（DSB），因为它可能导致基因组信息的丢失。DSB可能自然发生在细胞代谢期间，也可能是由外部因素触发的（Deriano; Roth，2013）。无论哪种方式，这些损坏都会通过细胞立即修复，主要是通过两种途径：非同源末端连接（NHEJ）或同源指导修复（HDR）。与通过NHEJ进行修复不同，NHEJ仅将裂解的DNA的末端连接起来（请参阅第2章），HDR途径需要存在相同或非常相似的模板，即完整的序列，以准确地修复病变的DNA（Heyer等人，2010年）。提供用于HDR中使用的模板的可能性代表了通过同源重组（HR）途径进行基因编辑的关键元素，该途径可能被利用为几种新的繁殖技术（NBT）之一。
通过细胞周期和 DNA 修复调节在人类 iPS 细胞中进行协同基因编辑
精准基因编辑旨在生成单核苷酸修饰以纠正或模拟人类疾病。然而，由于效率低下和实用性有限，使用 CRIPSR-Cas9 等核酸酶进行精准编辑的成功率有限。在这里，我们在人类诱导多能干细胞 (iPS) 中建立了荧光 DNA 修复检测，以可视化和量化单等位基因和双等位基因靶向期间 DNA 修复结果的频率。我们发现，通过确定的培养条件和小分子调节 DNA 修复和细胞周期阶段可协同增强同源定向修复 (HDR) 的频率。值得注意的是，在纯合报告细胞中进行靶向可产生高水平的编辑，其中绝大多数为双等位基因 HDR 结果。然后，我们利用高效的双等位基因 HDR 和混合 ssODN 修复模板来产生杂合突变。协同基因编辑是产生人类 iPS 细胞中精确基因修饰的有效策略。
通过靶向组蛋白 H2A-K15 泛素化增强 CRISPR-Cas9 诱导的精准基因编辑
修改，例如疾病突变建模或体细胞基因治疗中突变的校正。为了加强精确的基因编辑，需要工具或干预措施使 DSB 修复途径选择偏向 HDR，并通过将 DNA 修复模板靶向递送到 DSB 来促进 HDR 处理。特别是修复模板的可用性可能是 HDR 的限速因素。以前用于靶向递送修复模板的方法使用 Cas9 融合蛋白，其结构域与功能基团结合，该功能基团被掺入合成寡核苷酸或 PCR 片段中作为供体模板，并作为组合的 Cas9-sgRNA-供体复合物递送到细胞中 [3-5]。然而，目前尚不清楚修复模板分子与 Cas9 核酸酶的连接是否是共递送的最有效方式，因为模板在 DSB 修复的后续步骤中是必需的。以前促进 DSB 修复途径选择的方法有利于