简介:微生物在牙髓疾病的发病机制中起着重要作用。在提高牙髓样本中微生物检测、鉴定和计数的灵敏度方面取得了重大进展。本研究的目的是比较培养和全基因组扩增(WGA)随后进行 PCR 检测在根管化学机械制备(CMP)之前和之后的细菌检测中的效果。方法:分析了 10 颗患有原发性牙髓感染的单根牙。在 CMP 之前和之后用纸尖收集微生物样本,将其分成两组:(i)将培养测定样本接种到含有 5% 脱纤维羊血、甲萘醌和血红素的布鲁氏菌琼脂上,并在 36°C 下厌氧孵育 14 天; (ii) 从分子测定样本中提取 DNA,并用 Phi29 DNA 聚合酶通过等温链置换进行 WGA,然后进行 PCR 以确定细菌的存在。结果:在两种测定中,CMP 之前的样本都显示所有 10 颗牙齿中都存在细菌。然而,在 CMP 之后,在进行的测定中细菌检测有所不同(p = 0.0198)。通过 WGA 随后的 PCR 在 70%(10 个中的 7 个)的样本中检测到细菌的存在,而只有 10%(10 个中的 1 个)在培养方法中显示细菌生长。结论:在使用 NaOCl 作为 CMP 冲洗剂进行根管治疗后,WGA 随后的 PCR 相结合增加了从根管样本中检测到的微生物。因此,这种技术组合可以成为一种重要的工具,以提高根管研究中的微生物检测率。
对整个大脑细胞结构的无偏表征是理解大脑功能的宝贵工具。为此,将组织学标记从二维切片精确映射到三维大脑图谱上至关重要。在这里,我们介绍了两种促进这一过程的新型软件工具:对齐大脑和图谱 (ABBA),旨在简化二维切片与三维参考图谱的精确高效配准;以及 BraiAn,一套用于多标记自动分割、全脑统计分析和数据可视化的集成套件。结合这些工具,我们对三种最广泛使用的立即早期基因 (IEG) 的全脑表达进行了全面的比较研究。由于其神经活动依赖性表达,IEG 几十年来一直被用作神经活动的代理,以生成行为后活动的无偏映射,但它们对整个大脑神经元激活的各自诱导仍不清楚。为了解决这个问题,我们系统地比较了三种广泛使用的 IEG(cFos、Arc 和 NPAS4)在三种与记忆相关的不同行为条件下的全脑表达。我们的研究结果突出了它们在分布和诱导模式方面的主要差异,表明它们并不代表大脑区域或活动状态下的等效标记,而是可以提供互补信息。简介
基因组技术的快速演变已大大改变了医学和药物基因组研究的景观。在可用的众多方法中,整个外显子组测序(WES)是一种强大的工具,可以全面分析基因组的蛋白质编码区域。从WES中受益的最重要领域之一是研究ADME(吸收,分布,代谢和排泄)基因的遗传变异。这些基因在药物的药代动力学中起着至关重要的作用,从而影响了它们的效率和安全性。本文深入研究了ADME基因中遗传变异的重要性,探讨了WES在识别这些变体方面的影响,并突出了这项研究对个性化医学的未来影响[1-3]。
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摘要:(1) 背景:在毒理学实验室中,可以使用各种筛选方法来识别与中毒有关的化合物。由于其灵敏度和可靠性,高分辨率质谱法在过去几年中在这方面的应用越来越广泛。本文,我们介绍了一种使用液相色谱与高分辨率质谱联用的筛选方法的开发和验证。(2) 方法:该方法仅需要 100 µ L 全血或血浆样品。预处理包括使用甲醇/乙腈和硫酸锌进行快速简便的去蛋白质化。根据国际指南对这种新测定法进行了验证。(3) 结果:为了进行方法验证,选择了 53 种化合物。选择标准如下:各种化学结构和治疗家族(>15)、大的 m/z 分布、正或负电离模式以及各种洗脱时间。测定法显示出高选择性和特异性,具有最佳的工艺效率。使用预定标准确定的鉴别限度设定为亚治疗浓度或治疗浓度。使用加标血浆对照和外部质量对照评估适用性。(4)结论:新方法已成功应用于常规临床和法医样品。
1 苏黎世大学药理学和毒理学研究所,瑞士苏黎世。2 Acuitas Therapeutics Inc.,加拿大不列颠哥伦比亚省温哥华。3 Oncode 研究所,马克西玛公主儿科肿瘤中心,荷兰乌得勒支。4 苏黎世功能基因组学中心,苏黎世联邦理工学院/苏黎世大学,瑞士苏黎世。5 苏黎世联邦理工学院分子健康科学研究所生物系,瑞士苏黎世。6 苏黎世大学医院和大学病理学和分子病理学系,瑞士苏黎世。7 苏黎世联邦理工学院生物系统科学与工程系,瑞士苏黎世。8 Synthego Corporation,美国加利福尼亚州雷德伍德城。9 苏黎世大学生物化学系,瑞士苏黎世。10 苏黎世联邦理工学院基因组工程与测量实验室,瑞士苏黎世。 11 宾夕法尼亚大学医学系,美国宾夕法尼亚州费城。12 苏黎世大学儿童医院代谢与儿童研究中心分部,瑞士苏黎世。13 苏黎世综合人体生理学中心,瑞士苏黎世。14 苏黎世神经科学中心,瑞士苏黎世。15 苏黎世大学分子生命科学研究所,瑞士苏黎世。✉ 电子邮件:ssemple@acuitastx.com;schwank@pharma.uzh.ch
骨骼肌收缩肌纤维的形成是一个复杂过程,若受到干扰则会导致肌营养不良。在此,我们提供了三种不同斑马鱼突变体的 mRNAseq 数据集,这些突变体在胚胎发生过程中影响肌肉组织。这些突变体包括肌球蛋白折叠伴侣 unc45b (unc45b/)、热休克蛋白 90aa1.1 (hsp90aa1.1/) 和乙酰胆碱酯酶 (ache/) 基因。在受精后 72 小时 (hpf) 对这三个突变体进行了重复实验中的转录组分析,并对 unc45b/ 进行了另外两个发育时间 (24 hpf 和 48 hpf)。通过层次聚类分析了总共 20 个样本以查找差异基因表达。本研究的数据支持 Etard 等人的观察结果。 (2015) [1] ( http://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0825-8 ) 肌球蛋白折叠失败会激活骨骼肌中独特的转录程序,该程序与应激肌肉细胞中诱导的程序不同。 & 2016 作者。由 Elsevier Inc. 出版。这是一篇根据 CC BY 许可协议开放获取的文章 ( http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ )。
家族性高胆固醇血症(FH)是最常见的单基因疾病之一,影响了全球250人中的1个。该疾病是由负责脂质代谢中关键途径的突变引起的,例如低密度脂蛋白受体(LDL-R),载脂蛋白B(APOB)或原蛋白蛋白转化蛋白转化酶枯草蛋白/KEKXEN/KEKXIN/KEXKIN型9(PCSK9),导致低密度Lipoprotolote蛋白(1)持续高度高。如果未经治疗,FH会大大增加患动脉粥样硬化心血管疾病的风险,这种疾病通常在成年初甚至童年时表现出来。尽管在理解其病理生理学和治疗方案方面取得了重大进展,但研究估计,在全球诊断出不到10%的FH病例,而在被诊断的患者中,许多病例仍未治疗[2]。
已知流行的阿育吠陀植物Evolvulus Alsinoides具有适应性特性。适应原会减轻压力和焦虑,从而促进个人的整体福祉。由于慢性应激与预期寿命低于正常寿命相关,因此任何已知减少应力的草药都应产生相反的影响。因此,这项研究旨在研究evolvulus alsinoides在良好的老化模型Caenorhabditis elegans中的抗衰老活性。在秀丽隐杆线虫的最佳生长和生存条件下评估了长寿增强的影响。氧化应激,并在转基因秀丽隐杆线虫TJ 356中诱导热应力,该曲杆秀丽隐杆线虫TJ 356在控制热休克蛋白启动子的控制下表达了绿色荧光蛋白(GFP),以可见抗压肿基因诱导的诱导。通过寿命分析分析了应力的影响,并通过Kaplein Meyer统计分析分析了数据。结果表明,在0.1 mg/ml -1和1 mg/ml -1的浓度下,在最佳的生长和生存条件下,在0.1 mg/ml -1和1 mg/ml -1的浓度下,埃及素依赖的剂量依赖性依赖性的剂量将其平均寿命增加18.0%和26.2%。针对热诱导的应激,绿ote虫的E. alsinoides提取的秀丽隐杆线虫的存活率大于未经处理的秀丽隐杆线虫的存活率。对于氧化应激,阿尔西诺伊斯E. alsinoides的处理不是显着的。发现,Evolvulus Alsinoides提取物通过促进抗压力耐受性和修补胰岛素/IGF信号传导途径来促进秀丽隐杆线虫的寿命。
超短激光脉冲是诱导材料改性的有力工具 1–4。特别是在透明电介质中,超短激光脉冲可用于局部修改材料块内的化学结构、折射率、色心密度,光聚合,产生纳米光栅、表面纳米结构或内部空隙。大量应用领域受益于基础性进步:外科和生物医学应用、光子学、微流体学、高速激光制造 2,5–7。将这些应用推进到纳米结构需要数值建模的支持 8。在激光诱导的强场下,束缚电子从价带跃迁到导带 1,9,10,在价带中留下一个空穴。电子-空穴等离子体的粒子在激光场中被加速,通过碰撞电离导致自由载流子密度倍增,并可能产生致密的电子-空穴等离子体。最后,在远大于几皮秒的时间尺度上,材料内部发生热和结构事件 1 。我们的模型侧重于等离子体密度的积累,时间尺度可达几皮秒。已经开发了大量不同的模型来研究超短激光脉冲(约 100 fs)在高强度范围内(约 10 14 W/cm 2 )在介电体中的传播以及随后的电离。这些模型可分为两类。第一类是几种