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2024 UBC IGEM PR软件包
巨型Jamboree是IGEM年度，全球，合成生物学竞争的最终事件，旨在使用基因工程来解决世界各地的本地问题。每年，竞赛都汇集了来自全球的6,000多名参与者，以探索和创建合成生物学的独特应用，使使命是为其社区和整个社会带来积极的贡献。除了技术之外，参与者还会对团队合作，责任，企业家精神，共享，安全等进行评估。UBC Vancouver团队的项目旨在通过创建基于DNA的数据存储平台来满足全球对可持续，高容量数据存储的需求，这是受自然在DNA中的有效数据编码的启发。传统数据中心在环境上是昂贵的，消耗了大量的能量和水，并产生了大量的碳排放，因此Nucloud使用独立于模板的DNA聚合酶的热稳定变体提供了更绿色的替代方案，以有效的数据存储DNA合成。nucloud的自定义数据编码和解码管道使用户可以在二进制数据和DNA序列之间转换，从而实现具有内置误差校正的高密度，耐用的存储以维持数据完整性。通过使用Nucloud的自定义模块化硬件组件，包括其生物反应器和微流体芯片，Nucloud展示了其具有可伸缩性和可及性的潜力，与行业需求和环境责任保持一致。
香港-Cuhk Igem 2024团队赢得了金牌！
为了进行人类实践，该团队咨询了广泛的利益相关者，以了解抗生素抗性基因的复杂性以及在现实世界中实施其工具包的挑战。这些互动提供了宝贵的见解，从而指导了他们的探测选择，套件设计，目标市场标识和教育计划。与包括玛格丽特IP教授和Tsui Kwok-Wing Stephen教授在内的传染病和生物医学领域专家的团队。此外，与受人尊敬的医生兼前立法委员Pierre Chan博士以及卫生保护中心的抗生素抵抗专家Edmond Ma博士进行了讨论。该团队还咨询了科学教育者Helen Ma博士和Lau Kwok-Chi Victor博士，以塑造他们的教育计划。
nigem主题功能 - 重新访问英国退欧的效果
自2016年全民公决以来，离开欧盟的决定已经显着塑造了英国的经济格局。在随后的几年中，英国经历了一种经济环境，其特征是增长较低，并且自COVID-19大流行以来，高通货膨胀率高。当我们接近正式离开欧盟四周年时，我们可以更好地评估其对经济的影响。NIESR的预测表明，如果英国国内生产总值可能会大大更大，如果不遭受金融危机，英国退欧，联盟19日大流行和俄罗斯对乌克兰的入侵的主要经济冲击（图TF1）。，如果维持2010 - 19年的实际收入和私人消费趋势，那么英国普通居民可能会增加8-9％（每年约1,700英镑），而到2023年，到2023年，每年的收入约为1,700英镑（每年约1,700英镑）（每年约2,300英镑）（图TF2）。然而，鉴于Covid-19 Pandemic（Mortimer-Lee and Pabst，2022）和俄罗斯在乌克兰（Liadze et ex-ex-brex）造成的明显经济损害，GDP的前循环趋势与最新的NIESR预测之间的巨大差距不能完全归因于英国脱欧。因此，需要一种基于模型的方法来开始解析英国退欧的影响并将其与其他冲击区分开来。
DTiGEMS+：使用图嵌入、图挖掘和基于相似性的技术预测药物-靶标相互作用
摘要 在可持续药物开发过程中，药物-靶标相互作用的计算机预测是一个关键阶段，特别是当研究重点是利用现有药物的重新定位时。然而，开发这样的计算方法并非易事，但却非常必要，因为当前预测潜在药物-靶标相互作用的方法存在高假阳性率。在这里，我们介绍了 DTiGEMS +，一种使用图嵌入、图挖掘和基于相似性的技术预测药物-靶标相互作用的计算方法。DTiGEMS + 结合了基于相似性和基于特征的方法，并将新型药物-靶标相互作用的识别建模为异构网络中的链接预测问题。DTiGEMS + 通过使用另外两个互补图（即：药物-药物相似性、靶标-靶标相似性）扩充已知的药物-靶标相互作用图来构建异构网络。DTiGEMS + 结合了不同的计算技术来提供最终的药物靶标预测，这些技术包括图嵌入、图挖掘和机器学习。 DTiGEMS+ 在应用相似性选择程序和相似性融合算法后，将多种药物-药物相似性和靶标-靶标相似性集成到最终的异构图构造中。使用四个基准数据集，我们表明 DTiGEMS+ 与其他用于预测药物-靶标相互作用的最先进的计算机模拟方法相比，显著提高了预测性能，在所有数据集中实现了最高的平均 AUPR（0.92），与最先进方法比较中表现第二好的模型相比，错误率降低了 33.3%。关键词：药物重新定位、药物-靶标相互作用、机器学习、图嵌入、异构网络、基于相似性、相似性集成、生物信息学、化学信息学