4。AI伦理,责任,法规•讨论各种与AI相关的伦理风险:算法偏见,人与AI决策难题,虚假信息,网络安全和隐私,心理健康,环境。•知识,概念和工具董事会成员需要知道,以促进其组织中公平,负责和道德的AI系统和流程的发展。•AI的最新监管框架概述;客人法律专家的观点。
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摘要:晚期肝细胞癌 (HCC) 患者的预后极差,主要是由于病情进展迅速和有效药物匮乏。全基因组分析允许基于差异表达基因 (DEG) 探索潜在药物。然而,HCC 中的候选药物和 DEG 在很大程度上是未知的。在本研究中,我们使用癌症基因组图谱 (TCGA)、国际癌症基因组联盟 (ICGC)、基因表达综合 (GEO) 和免疫组织化学染色研究了 DEG 和预后。还分析了 DEG 之间的蛋白质-蛋白质相互作用网络,以阐明 12 个枢纽基因并查询在线数据库以寻找潜在的 HCC 治疗药物。我们发现 TCGA 数据集中的 3219 个 DEG 中有 885 个与预后相关。我们阐明了在肿瘤样本中过表达的 12 个枢纽基因,它们与 HCC 患者的总体生存率 (OS) 较差显着相关。这些发现已通过 GEO 和 ICGC 队列得到验证。此外,还使用在线数据库预测了针对 HCC 的有希望的候选药物。总的来说,12 个中心基因的上调与 HCC 患者的预后不良有关,关注它们的表达可能会推动针对 HCC 的治疗努力。
•布里斯班乳房(BBB)BBB最初是由UQ/Pathology昆士兰(PQ)的Lakhani教授于2005年建立的,目的是从皇家布里斯班和妇女医院(RBWH)的每位接受治疗的患者中收集冷冻肿瘤样本。现在,这是澳大利亚和国外乳腺癌研究的宝贵资源。BBB的独特之处在于它提供了银行组织样品的高度详细策划,截至2017年4月,它包括来自2167名同意捐助者的标本(Bioresources Open Journal of Bioresources,2015年)。BBB已与澳大利亚乳腺癌组织库,澳大利亚生物含量网络协会,脑癌生物群体和国际癌症基因组联盟(ICGC)建立了合作,并为180多家出版物做出了贡献。
肿瘤内异质性和肿瘤进化导致癌症患者的治疗衰竭1。在疾病过程中,这些过程受到细胞突变性的影响和增强,包括整体基因组的相互作用和癌细胞存活2,代谢和稳态机制,微环境因素(例如,缺氧)和药物选择压力(包括适应性突变性3、4)的分布和特征的细胞和典型的特征,这些因素和药物选择压力的范围是tamor的范围和流体,这些细胞和典型的特征是均无作用的细胞,并且是造成的,这些因素和药物选择压力均为变化的范围,这些均受范围的细胞和流体,这些细胞是造成的。时间5。通过大型协作努力使用不同的OMICS技术来阐明肿瘤内和肿瘤间异质性,用于原始和转移性肿瘤分析,包括国际癌症基因组联盟(ICGC)6,癌症基因组基因组ATLAS(TCGA)(TCGA)7的分析,全基因组
胰腺癌的每年发病率在全球范围内增加,预计到2040年在美国成为癌症死亡的第二大原因(1)。胰腺导管腺癌(PDAC)约占胰腺癌的90%,是一种侵略性疾病,其特征是惨淡的预后,5年生存率为12%(2)。不良预后可以归因于诊断延迟,侵入性肿瘤性质,频繁转移和对所有常规疗法的高耐药性(3)。PDAC细胞周围的肿瘤免疫微环境(TME)显着决定肿瘤的生长,转移能力和治疗耐药性(4)。此外,累积证据表明神经信号传导,神经调节和神经递质在PDAC的TME和发育中的重要作用(5-7)。2012年,国际癌症基因组学联盟(ICGC)发现PDAC富含轴突引导基因家族遗传改变。这表明神经系统可能参与PDAC癌变,并导致对神经元机制的这一方面的兴趣不断增加(8)。轴突引导家族分子已在血管生成,肿瘤发生和免疫调节中的作用研究(9-12)。semaphorins(SEMA)是轴突引导分子的大型家族,已被认为是神经发育的关键因素,免疫
摘要:口服鳞状细胞癌(OSCC)的进展和转移受到癌症干细胞(CSC)的高度影响,因为它们的独特自我更新和可塑性。在这项研究中,从GEO数据库中的单细胞RNA序列数据集(GSE172577)获得数据,并对1344 CSCS相关基因进行了Lasso-Cox回归分析,以建立一个六基因的预后签名(6-GPS),由AMP,POLR1D,PTGH1,PTH11,PT35A,p41,p41,pth5a,p4。高风险得分与不利的生存结果显着相关,这些特征在ICGC中得到了彻底验证。nom图,校准图和ROC曲线的结果证实了OSCC 6-GP的良好预后准确性。此外,ADM或POLR1D基因的敲低可能会显着抑制OSCC细胞通过JAK/HIF-1途径的增殖,迁移和侵袭。此外,通过压缩细胞周期蛋白D1,在G1阶段发生细胞周期停滞。总而言之,6-GP在OSCC的发生和开发中可能起着至关重要的作用,并且有可能作为OSCC的诊断,治疗和预后工具进一步发展。
自噬细胞可以抑制早期肿瘤的形成,并可以在晚期促进肿瘤的发展,在肿瘤的发展中起着重要作用。因此,探索自噬相关基因(AAGS)对肝细胞癌(HCC)预后的影响具有潜在的重要性。从TCGA数据库下载的HCC基因表达数据和临床数据中选择了差异表达的AAG,以及人类自噬数据库(HADB)。通过GO功能注释和KEGG途径富集分析来阐明AAG在HCC中的作用。与临床数据结合在一起,我们选择了年龄,性别,等级,阶段,T状态,M状态和N个状态作为COX模型索引,以构建Kaplan Meier(KM)的多元COX模型和生存曲线,以估算患者在高风险组之间的存活率。通过单变量和多元COX回归分析绘制的ROC曲线,我们发现七个具有高表达水平的基因,包括HSP90AB1,SQSTM1,RHEB,HDAC1,HDAC1,ATIC,ATIC,HSPB8和BIRC5与HCC患者预后不良有关。然后,ICGC数据库用于验证模型的可靠性和鲁棒性。因此,由自噬基因构建的HCC的预后模型可能有效地预测了总体生存率,并有助于发现HCC患者的最佳个性化靶向疗法,这可以为患者提供更好的预后。
在过去的十年中,下一代测序(NGS)的突破导致全基因组中的OMICS数据的体积和复杂性增加(Bulk)(Bulk)(Lander等,2001; Venter等,2001),并且在单细胞水平上更深。NGS allowed the scienti fi c community to study various biological mechanisms such as genetics (whole- genome sequencing), gene expression (RNA-seq), and epigenetics [DNA methylation (e.g., whole-genome bisul fi te sequencing), chromatin accessibility (ATAC-seq), chromatin immunoprecipitation assays with sequencing (e.g., ChIP-seq对于组蛋白标记)]导致高维度数据(Reuter等,2015)。除了基因组范围的方法外,单细胞技术还提供了研究不同模态(例如基因表达(SCRNA-SEQ)和染色质可及性(SCATAC-SEQ))的机会(Heumos等人,2023年)。这项技术比大量数据显示出不同的优势,尤其是在捕获肿瘤微环境的克隆结构和细胞类型组成方面。此外,全球科学社区和财团,例如癌症基因组图集(TCGA)(TOMCZAK等人,2015年),国际癌症基因组联盟(ICGC)(国际癌症基因组等,2010),,Martens和Blueprint(Martens and Stunnenberg,2013),人类Cell Atlas(HCA)(HCA)(HCA)(LINDEN)(LIND),综合。每个人都可以通过发布OMICS数据和元数据提供相关的结果,从而为进一步的探索和数据集成提供了机会。但是,可以通过机器学习(ML)算法来分析大量复杂的OMIC数据,以发现生物标志物或预测性特征,以更好地患者分层和治疗选择。