虽然存在多种研究 CRISPR 脱靶 (OT) 编辑的方法,但在临床相关编辑过程后,很少有方法在原代细胞中进行过头对头比较。因此,我们在体外造血干细胞和祖细胞 (HSPC) 编辑后比较了计算机模拟工具 (COSMID、CCTop 和 Cas-OFFinder) 和经验方法 (CHANGE-Seq、CIRCLE-Seq、DISCOVER-Seq、GUIDE-Seq 和 SITE-Seq)。我们使用 11 种与 Cas9 蛋白复合的不同 gRNA(高保真 [HiFi] 或野生型版本)进行编辑,然后对通过计算机模拟和经验方法确定的指定 OT 位点进行靶向下一代测序。我们平均每个向导 RNA (gRNA) 识别出少于一个 OT 位点,使用 HiFi Cas9 和 20-nt gRNA 生成的所有 OT 位点都可通过除 SITE-seq 之外的所有 OT 检测方法识别。这导致大多数 OT 提名工具具有高灵敏度,并且 COSMID、DISCOVER-Seq 和 GUIDE-Seq 获得了最高的阳性预测值 (PPV)。我们发现经验方法无法识别生物信息学方法未识别的 OT 位点。这项研究支持可以开发出既能保持高灵敏度又能保持 PPV 的精细生物信息学算法,从而能够更有效地识别潜在的 OT 位点,而不会影响对任何给定 gRNA 的彻底检查。
摘要 — 现有的下肢机器人外骨骼控制策略对用户意图的侧重点有所不同,这些意图的分辨率各不相同,从高级目标(提高速度)到中级动作(增加步幅)再到低级关节行为(增加髋关节屈曲)。虽然外骨骼上的传感器只能通过人机界面间接感知人类,但它们在穿戴设备所需的时间方面比更直接的方法更具优势。在本研究中,要求外骨骼用户(包括身体健全和脊髓损伤)改变他们的预期步行速度。机载传感器测量结果用于离线测试基于马哈拉诺比斯距离的意图识别算法。该算法的目标是识别意图变化并正确分类其类型,但不是通过外骨骼实现该变化。该算法正确识别了用户希望以比设备标称速度更快或更慢的速度行走的情况。对于体格健全的受试者,已知意图变化与算法正确识别之间的平均延迟为 0.63 秒。对于体格不健全的受试者,这一延迟平均为 0.93 秒。这些概念验证结果表明,基于马哈拉诺比斯距离的意图识别是可能的,而对该方法的分析表明,还有进一步改进的空间。
摘要:粘弹性的护理止血复苏方法,例如Rotem或TEG,对于决定时间柔性的个性化凝结干预措施至关重要。国际输血指南强调患者的安全性增加和降低治疗成本。我们分析了护理提供者对Rotem的看法,以识别感知的优势和改进领域。我们进行了一项单中心,混合的定性 - 定量研究,包括访谈,然后进行在线调查。使用模板方法,我们在护理提供商对Rotem的响应中首先识别主题。后来,参与者根据在线问卷中的五点李克特量表上的六个陈述对六个陈述进行了评分。接受了七十七名参与者的采访,52名参与者完成了在线调查。通过分析用户感知,我们确定了十个主题。最常见的积极主题是“高准确性”。最常见的负面主题是“需要培训”。在在线调查中,有94%的参与者同意监控实时Rotem Temograms有助于更快地启动目标治疗,而81%的人同意重复的ROTEM培训将是有益的。麻醉护理提供者发现Rotem是准确且迅速可用于支持动态和复杂止血情况下的决策。但是,临床医生认为解释Rotem是一项复杂且认知要求的任务,需要明显的培训需求。
目的:本研究旨在根据药理网络策略确定姜黄素在牙周炎上的分子机制。方法:鉴定出姜黄素和差异表达基因的潜在治疗靶标。随后,我们提取了共同的分子并分析了它们。进行了代谢途径富集和基因本体分析,并推断了蛋白质E蛋白质相互作用网络。这些分析允许识别关键蛋白质。最后,用姜黄素对主密钥蛋白进行了分子对接。结果:我们的结果表明,在牙周炎中差异表达了55个基因,并且是姜黄素的潜在靶标。此外,我们观察到这些基因参与细胞运动和免疫反应,并且与趋化因子受体(CXCR)和酶活性有关,例如蛛网膜酸5-脂氧酶(Alox5)。我们识别了六个关键蛋白,IL1B,CXCL8,CD44,MMP2,EGFR和ITGAM;分子对接表明,这六种蛋白质自发与姜黄素结合。结论:这项研究的结果有助于我们了解牙周炎中姜黄素的分子机制。我们提出姜黄素会影响促炎细胞因子,ALOX5和细胞通过趋化因子受体迁移,并作用于细胞膜上。此外,我们确定了在这种机制中必不可少的六个关键蛋白,所有这些蛋白质都自发地与姜黄素结合。©2023日本口腔生物学协会。由Elsevier B.V.保留所有权利。
背景:先天性心脏病(CHD)是最常见的先天缺陷,并且是全球发病率和死亡率显着的。对约旦中冠心病的流行病学或确定冠心病的方式相对较少。方法:对在第三级转诊医院进行的所有超声心动图异常的新生儿进行了回顾性病历审查。全部包括新生儿的超声心动图由同一儿科心脏病专家酌情决定。描述性统计数据用于描述CHD发病率,鉴定的CHD类型和识别机理。结果:先天性心脏病的发病率为每1000例活产17.8。如果包括早产儿中的专利动脉导管,则升至每1,000人24.6。最常见的识别异常是PDA,心房间隔缺陷,持续性肺动脉高压,间隔肥大和心室间隔缺陷。由于其他合并症或危险因素,对大多数儿童进行了考试中的杂音或作为筛查的一部分进行评估。少于1%的儿童患有产前诊断。在19009年大流行期间,持续性肺动脉高压率高于之前(p <0.001)。结论:约旦的CHD发病率很高。增加产前和围产期筛查的CHD可能允许更早的检测。
mung bean是一种重要的经济作物,被认为是一种植物蛋白成分含量较高的作物,被视为蔬菜和谷物。在各种与产量相关的性状中,一百种种子重量(HSW)对于确定绿豆的产生至关重要。这项研究采用了200条线的重组植物线(RIL)人群,这些线群是通过全基因组重新取代进行基因分型的,以在四个环境中鉴定出HSW相关的定量性状基因座(QTL)。我们识别了HSW的5个QTL,每个QTL都解释了2.46 - 26.15%的表型差异。其中,QHSW1在所有四个环境中均在1号染色体上映射,解释了表型变化的16.65-26.15%。精细的映射和基于地图的克隆程序,以及重组的后代测试,有助于将QHSW1的候选间隔缩小到506 kb。QHSW1基因组间隔和与QHSW1紧密联系的标记的这种识别对于改善种子重量较高的绿豆品种的繁殖工作可能是有价值的。
信息丰富的数据通过自动化识别和线性区域的选择来赋予发现,我们完全利用了完整的进度曲线启用:•从进度曲线的任何线性曲线中确定多个IC 50 s,从而深刻了解整个反应中酶和抑制剂活性的深刻理解。•TDI的全面表征和定量利用整个剂量响应中多个进度曲线的全局曲线。•化合物特异性滞后的识别和表征,这表明了激酶抑制的特定模式(MOI)。
培养的花生被用作识别Ahmlo基因座的参考。我们的结果表明,鉴定了25个Ahmlo基因座,并分布在培养花生的铬味上。11个Ahmlo基因座位于A基因组上,其余14位在B-Genome上。在Ahmlo基因座的编码序列中观察到插入的内含子序列(4-14)和跨膜螺旋(4-8)的可变数量。此外,Ahmlo基因座的系统发育分析以及来自其他物种的同源物将Ahmlo基因座聚集成六个进化枝。将三个Ahmlo基因座聚集在已知的进化枝V中,以重新组合粉状易感性位点。此外,在特定AHMLO的启动子区域预测了四个核心启动子以及与PM敏感性有关的顺式调节元件。这些结果提供了有力的证据表明MLO基因座在培养的花生基因组中的鉴定和分布,并且可以使用识别的AHMLO基因座进行识别的特定ahmlo基因座,可用于丧失易感性研究。
植物病原体通常通过它们可能引起的典型疾病症状来识别。有效的早期检测和病原体鉴定是采用有效的管理实践的重要程序,以减少或预言其传播,以减轻疾病的负面影响。在这篇综述中,提出和讨论了提出植物病原体的早期发现的传统和创新方法。用于植物病原体鉴定的诊断的传统技术通常集中在DNA,RNA(当分子方法),蛋白质或肽(当血清学方法的情况下)(当血清学方法)上。基于酶联免疫吸附测定(ELISA)的血清学方法是由于其高吞吐量和低成本而用于病原体检测的最常见方法。在无症状的感染阶段,该技术对许多病原体检测并非特别可靠且非常敏感。对于实验室中的不可培养的病原体,基于核酸的技术是一致的病原体检测或鉴定的最佳选择。横向流量系统是创新的工具,即使在现场条件下,也可以快速准确的结果,但是它们具有要克服的敏感性问题。对最后一代便携式热循环器进行的PCR分析可能会在原位提供快速检测结果。便携式工具的出现可以加快病原体检测,降低商业成本并可能彻底改变植物病理学。©2023作者。本综述提供了有关当前方法和程序有效检测不同植物病原体的信息。害虫管理科学由约翰·威利(John Wiley&Sons Ltd)代表化学工业协会发表。