XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemidenti
微生物
摘要：非结核分枝杆菌（NTM）识别对于建立分离株的相关性和适当的抗菌治疗至关重要。传统上，NTM识别是通过使用线探针测定（LPA）进行的，这是一种昂贵且耗时的技术，需要训练有素的人员。maldi-tof MS是NTM识别的有前途的工具，其使用正在迅速增长。我们使用LPA结果评估了NTM MALDI-TOF MS鉴定，评估了新引入的MBT MYCOBACTERIA试剂盒（MBT）和Mycoex Prepaparation方案（Bruker Daltonics，Germany，德国），以参考为参考。在7H11琼脂上生长的五十个NTM和MGIT肉汤使用Bruker Micro-flip®LtMaldi-Tof MS（Bruker Daltonics）仪器分析了两种方案。MBT和Mycoex分别提供了97.0％和95.0％的病例识别结果。使用这两个协议，提供的结果的100％与LPA一致，没有注册不匹配。与Mycoex相比，MBT的高度可能识别率（88.0％比83.0％）和更高的可重复性率（86.6％对75.8％）相比，MBT的数量升高。本研究提供了有关液体和固体培养基的MBT性能的结果，从而强调了不同条件下的优势和劣势。我们的结果表明，MALDI-TOF MS可以为及时和节省成本的NTM识别提供巨大的优势，并可能对患者结局产生影响。
![arXiv:2208.10341v3 [quant-ph] 2023 年 3 月 3 日](/simg/0\05c1fadfbec6d7050f9084bb8e023692af386ba5.webp)
arXiv:2208.10341v3 [quant-ph] 2023 年 3 月 3 日
（b）集合 S { X , Y } 可等同于区间 [− 1 , 1 ] ，而（b）集合 S { X , Y } 可等同于圆盘 {( x,y ) ∶ x 2 + y 2 ≤ 1 } 。
SARS的T细胞表位多样性的生物信息学分析 -
表位保护估计为87.6％ - 96.5％，在膜（M）中为92.5％ - 99.6％，Nucleocapsid（N）为94.6％ - 99％。随着病毒的突变，越来越多的s表位降低了预测的结合功能：70％的Omicron BQ.1-XBB.1-XBB.1-XBB.1.5 S的表位经历了预测的结合降低，相比之下，早期的STRAINS DELTA AY.100 - AY.100 - AY.44和OMICICRON。Additionally, we identi fi ed several novel candidate HLA alleles that may be more susceptible to severe disease, notably HLA-A*32:01 , HLA-A*26:01 , and HLA-B*53:01 , and relatively protected from disease, such as HLA-A*31:01 , HLA- B*40:01 , HLA-B*44:03 , and HLA-B*57：01。我们的发现支持以下假设：影响CD8 T细胞表位免疫原性的病毒遗传变异有助于确定急性Covid-19的临床严重程度。实现长期COVID-19免疫将需要了解T细胞，SARS-COV-2变体和宿主MHC I类遗传学之间的关系。该项目是探索SARS-COV-2 CD8 +表位多样性的第一个项目之一，它对美国大部分人口进行了影响。
自发犬粘膜黑色素瘤的积极潜力可以决定其初始大小和膨胀能力的独特癌症干细胞室行为
粘膜黑色素瘤代表了黑色素瘤最高度转移和侵略性的亚型之一。粘膜黑色素瘤的生物学记录很少，缺乏实验模型使设计和测试新疗法很难。狗经常受口腔黑色素瘤的影响，使自发的犬黑色素瘤成为其人类对应物的潜在可预测模型。我们最近建立并表征了两种新的犬粘膜黑色素瘤细胞系，名为OCR_OCMM1和OCR_OCMM2。Here, we identified quiescent cancer stem cell (CSC) subpopulations in both canine cell lines that displayed similarities to human quiescent CSCs: canine melanoma CSCs had the ability to self-renew, produced nonstem cell (SC) progeny, and formed melanospheres that recapitulated the phenotypic profile of the parental tumor.这些CSC还形成了免疫型小鼠中的黑色素瘤，PI3K/AKT信号的抑制膨胀了CSC池。一个非CSC的子集转换为CSC。OCR_OCMM1和OCR_OCMM2在其初始尺寸和扩展能力方面显示出不同的CSC分配行为。总体而言，这项研究表明，OCR_OCMM1和OCR_OCMM2犬黑色素瘤细胞系是研究黑色素瘤SC的强大细胞工具，不仅用于粘膜，而且对于更常见的人皮肤黑色素瘤。
生理监测以防止潜水障碍
深入了解人类生理是维持水下操作环境中潜水员安全的关键。在下降期间，深度，上升时间以及潜水后可能带来持久后果的时间时，可能发生许多危险的生理现象。尽管安全措施和严格遵守潜水方案使这些事件很普遍，但仍会出现潜水障碍，通常不足以了解触发事件的因素。本综述首先研究了最常见的潜水障碍及其在娱乐和美国军事潜水活动中的发病率。The review then identi fi es physiological biomarkers (e.g., heart rate, heart rate variability, blood pressure, respiration rate, temperature, oxygen saturation) that may provide a holistic view of the diver ' s current physiological state and potentially detect the most concerning diving disorders (e.g., decompression illnesses, gas mixture- related disorders, barotraumas, and environment exposure).尽管仍然需要进行大量研究来验证在潜水环境中使用这些生物识别技术的使用，但本评论中描述的研究为开发系统的有前途的途径提供了一种可以检测到未决潜水障碍的系统，并在发生不事故之前向潜水员和其他必要的当事方提供预警。
TWAS 通过大豆基因表达、结构变异和可变剪接促进基因尺度性状遗传解剖
全基因组关联研究 (GWAS) 可以识别与性状相关的基因座，但识别致病基因可能是一个瓶颈，部分原因是连锁不平衡 (LD) 衰减缓慢。全转录组关联研究 (TWAS) 通过识别基因表达-表型关联或将基因表达数量性状基因座与 GWAS 结果整合来解决这一问题。在这里，我们使用自花授粉大豆 (Glycine max [L.] Merr.) 作为模型来评估 TWAS 在 LD 衰减缓慢的植物物种性状遗传解析中的应用。我们为大豆多样性面板生成了 RNA 测序数据，并识别了 29 286 个大豆基因的遗传表达调控。不同的 TWAS 解决方案受 LD 的影响较小，并且对表达源具有稳健性，可以识别与来自不同组织和发育阶段的性状相关的已知基因。通过 TWAS 鉴定出新的豆荚颜色基因 L2，并通过基因组编辑对其进行了功能验证。通过引入新的外显子比例特征，我们显著提高了由结构变异和可变剪接导致的表达变异的检测。因此，通过我们的 TWAS 方法鉴定出的基因表现出多种多样的因果变异，包括 SNP、插入或缺失、基因融合、拷贝数变异和可变剪接。使用这种方法，我们鉴定出与开花时间相关的基因，包括以前已知的基因和以前未与此特性关联的新基因，从而为 GWAS 的见解提供了补充。总之，这项研究支持将 TWAS 应用于 LD 衰减率较低的物种的候选基因鉴定。
MALDI-TOF质谱法，用于鉴定从法国奶酪中分离出的乳酸细菌：Maroilles
在这项研究中，我们使用MALDI-TOF质谱法（MS）鉴定了法国奶酪马洛斯（MS），用原始或巴氏杀菌牛奶制成的法国奶酪马罗奶油（MS）鉴定了可培养的中介乳酸细菌（LAB）。使用Maroilles奶酪的皮和心脏的样品，在30°C的琼脂夫人上选择实验室，并通过MALDI-TOF MS PRO填充对197克阳性和过氧化氢酶阴性菌株进行鉴定。所有菌株均已明确鉴定：用原牛奶制成的马洛雷斯（Maroilles）的105种菌株（在果皮上为38株，心脏中有67个），以及用巴氏杀菌牛奶制成的马洛雷斯（Maroilles）的92株（在果皮上为39株，心脏为39株，心脏中的53株）。MALDI-TOF MS识别允许识别属于实验室的三个属，包括乳杆菌，肠球菌和leuconostoc。乳酸杆菌是七个物种的最多代表的属：植物学植物（L. plantarum），L。Paracasei，L。Curvatus，L。Rhamnosus，L。Fructivorans，L。Parabuchneri，Parabuchneri，L。Brevis，在Maroilles中，由Maroilles组成的两种牛奶。在选定菌株上进行的16S基于RDNA的识别和Maldi-Tof-Ms获得的识别表明，这种快速，经济上负担得起的，可靠的，可靠的和可靠的细菌表征方法是与常用方法及其在食品行业中应用的有吸引力的选择。©2016 Elsevier B.V.保留所有权利。
环境微生物学中的单细胞技术
摘要：环境微生物学一直是环境研究的重要组成部分，因为它为大多数污染物提供了有效的解决方案。因此，有兴趣研究微生物行为，例如观察，识别，污染物降解者的分离以及微生物物种之间的相互作用。为了全面了解细胞异质性，需要在单细胞水平上采用多种方法。到目前为止，诸如培养皿等传统的散装生物工具对于单细胞在技术上具有挑战性，这可能掩盖异质性。单细胞技术可以通过检测个体细胞之间的异质性来揭示复杂且稀有的细胞种群，从而提供了更高分辨率，更高吞吐量，更准确的分析等的优势。在这里，我们从方法和应用方面概述了几种有关观察，隔离和识别的单细胞技术。显微镜观察，测序识别，流量细胞仪识别和隔离，基于拉曼光谱的识别和隔离以及其应用主要讨论。在单细胞水平上进行多技术整合的进一步发展可能会大大推动环境微生物学的研究进度，从而在环境微生物生态学中提供更多的指示。
遗传基础和在野生大豆中的甘油蛋白诱导的选择
Glyceollins是一种在豆类物种中引起的植物毒素家族，在环境压力反应（例如防御病原体）和人类健康中起着至关重要的作用。However, little is known about the genetic basis of glyceollin elicitation.在本研究中，我们采用了一种基于代谢物的基因组 - 宽缔合方法（MGWA）方法来鉴定在遗传多样的甘油蛋白诱导的候选基因，并正在研究遭受大豆囊肿线虫的野生大豆。In total, eight SNPs on chromosomes 3, 9, 13, 15, and 20 showed signi fi cant associations with glyceollin elicitation.六个基因分为两个基因簇，它们在苯基丙烷途径中编码糖基转移酶，并在物理上接近染色体9。此外，还发现转录因子（TFS）基因（例如MYB和WRKY）是有前途的候选基因，与染色体上的显着SNP紧密联系。Notably, four signi fi cant SNPs on chromosome 9 show epistasis and a strong signal for selection.The fi ndings describe the genetic foundation of glyceollin biosynthesis in wild soybeans; the identi fi ed genes are predicted to play a signi fi cant role in glyceollin elicitation regulation in wild soybeans.此外，自然种群中的上皮相互作用和选择影响甘油蛋白的变异如何应进一步研究以阐明甘糖苷生物合成的分子机制。