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解锁分子领域：识别临床和环境相关细菌的高级方法
临床和环境细菌病原体的快速，有效和特定鉴定对其控制至关重要。传统上，通过基于形态学，生化和代谢特性的表型方法鉴定了细菌。尽管这些方法在临床实践中非常有用，但它们的局限性包括在物种内部和耗时工作和耗时的工作流中差的能力差。新开发的分子方法可以极大地提高分类表征的准确性，从而确定医学或环境重要性的特定菌株。但是，由于高昂的成本和对训练有素的专业人员的需求，这些方法在诊断实验室中尚未常规。因此，传播有关分子识别技术进步的知识是使这些方法可访问的关键。这项工作的目的是审查和讨论细菌识别的当前分子技术，旨在跟踪和监测临床和环境样品中的微生物剂。
关节置换术杂志
背景：下一代测序（NGS）在可疑的假肢感染的情况下，可以证明可以通过传统的基于文化的技术鉴定出的生物以外的生物。但是，人们担心一些微生物可能代表天然关节微生物组，而不是致病剂。这项工作试图评估双侧天然中NGS鉴定的微生物的存在，假定具有骨关节炎的“无菌”膝盖。方法：有40例接受原发性单侧（30）或双侧（10）总膝关节置换术的患者前景。在手术期间，从手术膝盖中获得了流体和组织的样品，并从非手术膝盖中获得了关节流体。样品被发送进行NGS分析，并根据制造商协议进行处理。患者年龄，体重指数，合并症，先前的注射史和关节炎等级与阳性NGS结果相关。结果：80个样本中有3个（3.8％）显示了阳性NG。其中有两种具有多种微生物（1个膝盖，有4个微生物； 1个带有2种微生物的膝盖）。另外2个样本的NGS结果低于制造商的报告阈值。最常见的生物体是Cutibacterium痤疮，这是3个阳性样品中的2个。没有患者基线特征与阳性NGS结果相关。结论：某些骨关节炎的天然膝关节具有阳性的微生物，鉴定为NGS。在天然膝盖中存在微生物具有重要意义，这对于在怀疑的假体感染的情况下更好地培养了天然关节微生物组以及NGS的利用。
使用增强型细胞破碎协议改进结核分枝杆菌的 MALDI-TOF MS 鉴定
摘要：结核分枝杆菌是导致结核病的微生物，这种疾病影响着全世界数百万人。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 是一种快速、可靠且经济高效的微生物鉴定方法，已用于鉴定分枝杆菌分离株。然而，分枝杆菌细胞壁富含脂质，这使得获取蛋白质进行 MALDI-TOF MS 分析变得困难。在本研究中，比较了两种细胞制备方案：MALDI-TOF 仪器制造商 Bruker Daltonics 推荐的 MycoEx 和本文描述的 MycoLyser 方案，后者使用 MagNA Lyser 仪器通过乙醇增强细胞破碎。使用两种方案对结核分枝杆菌 H37Rv 菌株进行细胞破碎和蛋白质提取步骤，并比较 MALDI-TOF MS 结果。MycoLyser 方案可以提高结核分枝杆菌的 Biotyper 鉴定率，因为使用此方案获得的 log(score) 值大多≥1.800，并且明显高于经过 MycoEx 处理的 log(score) 值。考虑到布鲁克标准，鉴定可靠性也提高了。鉴于这些结果，可以得出结论，MycoLyser 分枝杆菌细胞破碎和蛋白质提取方案提高了 MALDI-TOF MS 方法鉴定结核分枝杆菌的效率。
泛素依赖性蛋白酶体降解的机制及其在与年龄相关的神经退行性疾病中的作用
神经退行性疾病的特征是神经元结构和功能的进行性分解以及错误折叠的蛋白质聚集体和有毒蛋白质低聚物的病理积累。神经元生理恶化的主要因素是蛋白酶体介导的蛋白质分解代谢途径的破坏，蛋白酶体是一种大多数细胞蛋白质降解的大蛋白酶复合物。以前，人们认为蛋白酶体需要用多泛素链标记蛋白质靶标，这是一种称为泛素蛋白 - 蛋白酶体系统（UPS）的途径。因此，大多数关于蛋白酶体在神经变性中作用的研究历史上都集中在UPS上。然而，越来越多地认识到额外的泛素独立途径及其在神经变性中的重要性。In this review, we discuss the range of ubiquitin-independent proteasome pathways, focusing on substrate identi fi cation and targeting, regulatory molecules and adaptors, proteasome activators and alternative caps, and diverse proteasome complexes including the 20S proteasome, the neuronal membrane proteasome, the immunoproteasome, extracellular proteasomes, and hybrid蛋白酶体。在衰老，氧化应激，蛋白质聚集和与年龄相关的神经退行性疾病的背景下进一步讨论了这些途径，并特别关注阿尔茨海默氏病，亨廷顿病和帕金森病。对神经退行性中泛素独立的蛋白酶体功能的机理理解对于开发治疗这些毁灭性疾病的疗法至关重要。本综述总结了神经变性中泛素独立的蛋白酶体研究的当前状态。
合成生物学识别植物底盘中紫杉醇生物合成所需的最小基因集
二萜紫杉醇（紫杉醇）是一种化学疗法药物，被广泛用作针对几种固体癌的第一线治疗。自然来源的紫杉醇供应有限。然而，关于紫杉醇生物合成的几个特定代谢步骤所涉及的基因的缺失知识使其很难设计完整的途径。在这项研究中，我们使用了转录组学，细胞生物学，代谢组学和途径重建的组合来确定紫杉醇生产所需的完整基因集。我们从紫杉醇生物合成的当前模型中识别了缺失的步骤，并通过尼古拉·本塔米亚纳（Nicotiana Benthamiana）的异源表达确认了大多数缺失酶的活性。值得注意的是，我们确定了一种新的C4 B -C20环氧酶，该酶可以克服最初的代谢工程。We used both previously characterized and newly identified oxomutases/epoxi- dases, taxane 1 b -hydroxylase, taxane 9 a -hydroxylase, taxane 9 a -dioxygenase, and phenylalanine-CoA ligase, to successfully biosynthesize the key intermediate baccatin III and to convert baccatin III into pacli- taxel in N.本塔米亚娜。结合使用，这些方法为分类生物合成建立了代谢途径，并提供了植物用来产生复杂生物活性代谢物的独特化学反应的见解。
Amtco，一种研究药物的新型trans-环环烯衍生物 -
单击化学是指与高热力学力量快速完成的反应，以高收率产生单个产品。4通过使用可点击部分进行功能化，从药物中得出的单击探针通过单击探针和相关疾病模型中选择的记者之间的选择性反应实现结合。In previous work, we demonstrated that this strategy can be used to identify drug targets and off-targets, visualise the cellular localization of the probe and measure target engagement of non-derivatised drug compounds.5 In the same study, different click reactions were compared and the inverse electron demand Diels Alder (IEDDA) reaction between a trans-cyclooctene (TCO) and a tetrazine was identified as the most efficient.在我们的点击探针策略中，IEDDA反应的出色性能归因于其无与伦比的动力学。6TCO与四嗪的选择性和高反应性，结合其在水溶液中的延长稳定性，使其成为非常有吸引力的单击部分。尽管如此，TCO是一个疏水群。连接到药物时，它可能会影响点击探针的物理化学特性以及药物的药理特性。在这种情况下，几个研究小组已经做出了相当大的努力，以开发出具有疏水性降低的新的跨环烯衍生物（例如oxotco）7或更快的动力学（例如STCO，DTCO）.8,9
附件4 WHO药品和相关材料采样指南
当容器在产品的收货人控制之外采样时，应采取以下预防措施。如果打破了防篡改密封以获取样品，则应通知产品的收货人，并用适合篡改的卫生密封件重新密封容器，以及该产品的收货人的类型及其识别。如果袋子被刺穿以取样，则应适当关闭采样孔并将其识别为由授权采样器制成的采样孔。应识别采样容器，因为它们可能不再包含标签上所述的产品数量。根据国家立法，可能有例外，例如在正在进行与假冒药品有关的案件的调查中。
Codewithzichao@DravidianLangTech-EACL2021：探索多语言 Transformers 以对混合代码文本进行攻击性语言识别
攻击性语言识别是近年来受到越来越多关注的研究领域。特别是随着社交媒体平台的兴起，识别混合有代码的社交媒体文本中的攻击性语言至关重要。在社交媒体文本中识别攻击性语言是一项具有挑战性的任务。此外，在英语、希腊语或西班牙语等语言中已经做了大量攻击性语言识别工作（Zampieri 等人，2019 年；Pitenis 等人，2020 年；Ranasinghe 和 Zampieri，2020 年），但对于达罗毗荼语混合代码文本的攻击性语言识别工作却很少。达罗毗荼语（泰米尔语-英语、马拉雅拉姆语-英语和卡纳达语-英语）攻击性语言识别共享任务改变了这一状况。这项共享任务的目标是识别德拉威语混合代码文本中的攻击性语言。混合代码文本是从社交媒体平台收集的。这是一项评论或帖子级别的多语言分类任务，给出混合代码的泰米尔语-英语、马拉雅拉姆语-英语的评论或帖子
数字孪生的语义微服务框架
摘要：工业信息物理系统中的数字孪生 (DT) 是工业 4.0 的关键支持技术。服务是几乎每个 DT 概念的重要组成部分，但由于没有通用的指导方针，它们的交互通常是特定于实现的。这项工作根据相应文献中确定的应用程序确定了 DT 服务框架的一些基本要求。基于这些要求，提出了一种服务框架架构。该架构利用语义网技术和工作流引擎进行服务编排，以支持满足确定的要求。作为工业过程传感器数据评估的案例研究，提出了一个概念验证实现，展示了所提出的 DT 服务框架架构的可行性和适用性。
数学建模，支持可追溯的动态...
摘要。本文重点介绍开发动态压力传感器可追溯校准新主要标准系统所需的数学建模。我们讨论了实现主要标准的两种根本不同的方法，特别是冲击管法和落锤法。本文重点介绍冲击管法，介绍了系统识别的初步结果，并讨论了改进数学和统计模型所需的未来实验工作。我们使用模拟来识别冲击管法和落锤法之间的差异，调查系统识别过程中的不确定性来源，并协助实验人员设计所需的测量系统。我们在实验结果上展示了识别方法并得出结论。