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通过晚期胆囊癌中的下一代测序确定的新型Ambra1-Alk Fusion对Crizotinib做出了反应：病例报告
一项研究暗示了自噬1（AMBRA1）的蛋白质过表达（AMBRA1），这是自噬的关键调节剂，促进了胆管癌的细胞浸润和预后不良（15）。与此同时，一种变性淋巴瘤激酶（ALK）是一种调节正常细胞发育中涉及的信号传导途径的酪氨酸激酶受体，是固体肿瘤中常见的肿瘤基因之一，包括非小细胞肺癌（NSCLC）和神经细胞母细胞瘤（16-19）。crizotinib是一种特异性结合与碱酪氨酸激酶结构域的抑制剂，可导致抑制下游信号通路（20）。crizotinib已被批准为ALK -ADACDACDER NSCLC的标准一线治疗。尽管已经报道了胆道癌的ALK过表达，但ALK融合，特别是AMBRA1- ALK仍未报告。此外，关于克唑替尼在GBC携带ALK重排或过表达的GBC有效性的报告仍然有限。在这里，通过使用NGS，我们发现了对Crizotinib具有出色治疗反应的GBC患者的新型AMBRA1- ALK融合。
瓦努阿图（CISRDP）项目的气候信息服务响应于
气候信息和服务（CIS）为人们和组织提供了及时，量身定制的与气候相关的信息和工具，它们可以用来减少气候变化的影响，包括对生活的影响；生计和财产。cis在长期和短期时间内支持更好的政策，计划和决策，国家和社区规模。
原创文章 腺样囊性癌中确定的潜在靶点为进一步研究指明了新方向
摘要：头颈部腺样囊性癌（AdCC）起源于涎腺，具有较高的复发和转移风险，患者预后较差。本研究旨在筛选与AdCC相关的关键基因，以进一步研究其诊断和预后意义。本研究以基因表达综合（GEO）数据库中的AdCC样本数据集GSE36820，GSE59702和GSE88804为样本，探究与正常组织相比，AdCC中基因的异常共表达情况。通过GEO2R和FunRich软件筛选，共获得115个DEG。经Enrichr功能注释分析，这些DEG主要富集在SOX2、AR、SMAD和MAPK信号通路中。利用相互作用基因检索工具 (STRING) 建立了 DEG 的蛋白质-蛋白质网络，并通过基于 WEB 的基因集分析工具包 (WebGestalt) 进行注释，结果显示，DEG 中富集了参与心肌细胞增殖和细胞外基质组织的蛋白质。京都基因与基因组百科全书 (KEGG) 分析显示，ITGA9、LAMB1 和 BAMBI 与 PI3K-Akt 和 TGF-β 通路相关。此外，通过 OncomiR 和 miRNA 通路词典数据库 (miRPathDB) 鉴定出 36 个潜在的靶 miRNA。总之，富集分析显示 SLC22A3、FOXP2、Cdc42EP3、COL27A1、DUSP1 和 HSPB8 起着关键作用；KEGG 分析显示，ITGA9、LAMB1 和 BAMBI 参与了重要通路； ST3Gal4是所有获得的DEGs的PPI网络的关键组成部分；SPARC、COL4A2和PRELP在泛癌症研究中与多种恶性肿瘤高度相关；hsa-miR-29-3p、hsa-miR-132-3p和hsa-miR-708-5p是AdCC中的潜在调控因子。所涉及的通路、生物学过程和miRNA已被证明在AdCC的发生、生长、侵袭和转移中发挥重要作用。在本研究中，这些鉴定的DEG被认为对AdCC具有潜在影响，但尚未在该疾病中进行研究。分析结果有助于我们了解AdCC的分子机制和生物学过程，这可能有助于靶向治疗或诊断。
病史患者：儿童和青少年偶然发现的丘脑病变的影像学特征和自然脑 MRI
缩写：AP = 前后位；EMR = 电子病历；GRE = 梯度回忆回波；PD = 质子密度；TR = 横向 随着 MRI 成像利用率的提高和技术的进步，在用于临床和研究目的的儿科脑 MRI 成像检查中经常会发现偶然发现（可能与临床表现无关的意外成像发现）。1 - 5 在我们的儿科神经放射学实践中，我们经常在因各种适应症进行的脑部检查中发现丘脑内的非特异性病变。虽然其中一些偶然发现可能具有直接的临床意义，但大多数意义尚不明确，可能会引起临床医生的困惑以及患者及其家属的担忧。6 此外，对这些发现的后续评估可能会导致一系列额外的成像和测试，
将全基因组的 CNV 整合到 QTL 和高置信度 GWAScore 区域中，可确定绵羊经济性状的候选位置
拷贝数变异（CNV）是遗传变异的重要来源，它通过多种机制影响多种经济性状。此外，基因组扫描可以识别许多影响经济性状的数量性状位点（QTL），而全基因组关联研究（GWAS）可以定位与表型变异相关的遗传变异。在本研究中，我们开发了一种称为 GWAScore 的方法，该方法收集 GWAS 汇总数据以识别潜在候选基因，并将 CNV 整合到 QTL 和高置信度 GWAScore 区域以检测影响绵羊生长性状的关键 CNV 标记。我们得到了 197 个与候选 CNV 重叠的候选基因。一些关键基因（MYLK3、TTC29、HERC6、ABCG2、RUNX1 等）显示出比其他候选基因显著更高的 GWAScore 峰值。在本研究中，我们开发了 GWAScore 方法来挖掘候选基因作为绵羊分子育种标记的潜在价值。
青霉素结合蛋白5/6充当铜绿假单胞菌的诱饵靶标，可通过全细胞受体结合和定量系统药理学识别
摘要B -LACTAM抗生素已成功使用了数十年来与易感假单胞菌的铜绿假单胞菌作斗争，该抗生素具有众所周知的渗透外膜（OM）的臭名昭著。然而，对于完整细菌中B- lactams和B-乳糖酰酶抑制剂的青霉素结合蛋白（PBP）的目标位点渗透和共价结合缺乏数据。我们旨在确定完整和裂解细胞中PBP结合的时间过程，并估计目标位点penetra和PBP访问铜绿假单胞菌PAO1中的15种化合物。所有B-乳酰胺（在2 MIC处）在裂解细菌中有相当大的pbps 1至4。然而，完整细菌中的PBP结合大大减弱，但对于快速穿透B-乳酰胺而言，PBP结合的速度很慢。imipenem产生1.5 6 0.11 log 10在1H时杀死，而其他所有药物的杀戮为0.5 log 10。相对于imipenem，净插入率和PBP访问的速率为；多甲苯和美洲膜烯的慢2倍，阿维巴氏菌的7.6倍，头孢嗪速14倍，头孢菌素为45倍，硫酸盐为50倍，Ertapenem为72倍，; 249-用于哌拉西林和aztreonam的折叠，tazobactam的358倍； 547倍碳苯甲林和提卡林蛋白，头孢辛蛋白的1,019倍。在2 MIC时，PBP5/6结合的程度高度相关（r 2 = 0.96）与净插入率和PBP访问的速率，这表明PBP5/6的净率是诱饵靶标的，应通过缓慢穿透，未来的B -LACTACTAMS来避免。对完整和裂解的铜绿假单胞菌中PBP结合的时间过程的第一次全面评估解释了为什么只有imipenem迅速杀死。完整细菌中发达的新型共价结合分析构成了所有表达的恢复机制。
使用靶向单细胞 RNA 测序定制面板鉴定出使用全转录组扩增未发现的重要基因，作为具有生物学意义的基因
特征选择、层次聚类和差异表达分析确定了细胞类型标记基因。将其他感兴趣的目标与细胞类型标记列表相结合，得到总共 500 个基因。BD WTA-to- poly( A ) 流程选择了基因列表的主要转录本变体，并创建了终止于 poly( A ) 位点的转录本最后 1,000 个碱基的 FASTA 文件。FASTA 文件输入到 BD Genomics Resource 上的引物设计工具中。引物设计流程通过评估各种因素（例如熔化温度、扩增子长度、引物兼容性和目标特异性）输出一组引物。由此产生的定制 500 基因面板包含细胞类型标记和与肾脏生理学和器官重塑有关的感兴趣的基因的组合。
使用基于标记扩增子的 NGS 检测方法通过液体活检基因组分析确定具有可操作突变的致癌成瘾晚期 NSCLC 患者的预后
基于循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的分子分析正在通过多基因下一代测序 (NGS) 面板在晚期癌症患者的临床实践中迅速获得关注。然而，临床结果仍然描述不详，需要通过对血浆 ctDNA 中检测到基因组改变的患者进行个性化治疗来进一步验证。在这里，我们描述了通过 ctDNA 液体活检检测 InVisionFirst ® -Lung 在血浆中发现可操作改变的致癌成瘾晚期 NSCLC 患者的结果、3 个月时的疾病控制率 (DCR) 和无进展生存期 (PFS)。对 81 名晚期 NSCLC 患者进行了汇总回顾性分析，这些患者具有预测对目前 FDA 批准药物有反应的所有类型的改变：致敏常见 EGFR 突变（78%，n = 63）和 T790M（73%，46/63）、ALK / ROS1 基因融合（17%，n = 14）和 BRAF V600E 突变（5%，n = 4）。所有患者均通过先前的组织基因组分析确认了液体活检中检测到的可操作驱动改变，并且所有患者都接受了个性化治疗。在接受匹配靶向治疗的 82 名患者中，10% 为一线患者，41% 为二线患者，49% 为二线以上患者。 73% (46/63) 的患者在 TKI 复发时被检测到获得性 T790M，所有潜在患者 (34/46) 均根据 ctDNA 结果开始奥希替尼治疗。81 名可评估患者的 3 个月 DCR 为 86%。中位 PFS 为 14.8 个月 (12.1-22.9 个月)。基线 ctDNA 等位基因驱动基因分数与个性化治疗的反应率无关 (p = 0.29)。ctDNA 分子分析是一种准确可靠的工具，可用于检测晚期 NSCLC 患者中临床相关的分子改变。靶向治疗的临床结果支持将基于扩增子的 NGS ctDNA 分析液体活检用于晚期 NSCLC 患者的一线和复发检测。
肺腺癌的病例具有新型CD74 -ROS1融合变体，该变体通过全面的基因组分析鉴定，对克里唑替尼和Entrectectinib做出了反应
一名38岁的女性从未吸烟，在胸部X射线上呈现心脏轮廓扩大，胸部计算机断层扫描（CT）扫描显示左上叶下叶段中有一个小的肺结节，双侧的双侧淋巴结肿大，介质淋巴结和大量的经percardial percardial effusion（图1）。经过支气管肿瘤活检和其他检查显示临床IVA（T1AN3M1A）肺部肺癌。EGFR突变和ALK易位。通过顺铂（pemetrexed和bevacizumab）的五个一线化学疗法进行了部分反应，开始使用pemetrexed和bevacizumab的维持化学疗法。在维护治疗的两个周期后获得了完全反应。第一次诊断四年后，当完成43个维持化疗的周期时，胸部CT扫描在主要病变处显示出很小的阴影（图1（b））。挽救部分叶切除术，并在切除的标本中确认可行的癌细胞。ROS1融合转录本未通过使用Oncoguide®AmoyDX®试剂盒从样品中检测到。他们也对BRAF突变进行了负面影响。手术九个月后，她的肺癌复发了双侧纵隔和肺淋巴结淋巴结，多种骨转移和多个脑转移（图1（c））。几种有症状的脑转移是
pan-cancer分析显示，在肿瘤发育期间，双价启动子的H3K4ME1在二价启动子上DNA高甲基化，并确定了DNA甲基化在组蛋白修饰方面的调节作用
©作者2023。Open Access本文是根据Creative Commons Attribution 4.0 International许可获得许可的，该许可允许以任何媒介或格式使用，共享，适应，分发和复制，只要您对原始作者和来源提供适当的信誉，请提供与创意共享许可证的链接，并指出是否进行了更改。本文中的图像或其他第三方材料包含在文章的创意共享许可中，除非在信用额度中另有说明。如果本文的创意共享许可中未包含材料，并且您的预期用途不受法定法规的允许或超过允许的用途，则您需要直接从版权所有者那里获得许可。要查看此许可证的副本，请访问http：//创建ivecommons。org/licen ses/by/4。0/。Creative Commons公共领域奉献豁免（http：//创建ivecommons。Org/publi cdoma in/Zero/1。0/1。0/）适用于本文中提供的数据，除非在数据信用额度中另有说明。