目的:本研究项目涉及特定基因座的序列表征,旨在识别具有功能意义的 DNA 序列基序,以支持肌肉骨骼软组织损伤风险。申请征集和学术标准:我们邀请符合条件的候选人申请。成功的候选人必须在过去两年内获得分子遗传学、生物信息学、生理学、细胞生物学博士学位,并且不得担任任何永久专业职位(特别是学术职位)。候选人应具有分子遗传学、生物信息学、细胞生物学、生物统计学(特别是遗传关联研究)方面的经验,并在肌肉骨骼软组织损伤领域的同行评审期刊上发表过文章,并强烈建议提供研究生指导和教学的证据。该奖学金将在开普敦大学健康科学学院人类生物学系的“通过体育活动、生活方式和运动促进健康 (HPALS) 研究中心”内进行。该奖学金将重点应用下一代测序技术和生物信息学工具以及细胞生物学方法来识别和表征 DNA 功能基序,以支持肌肉骨骼软组织损伤风险。 奖励条件 欢迎申请一项博士后研究奖学金,该奖学金将于 2025 年开始,为期一年。成功的任职者将有望对涉及使用下一代测序数据、分子遗传学、生物信息学、细胞生物学和统计分析的跨学科项目做出重大贡献。我们将优先考虑在所有这些研究重点方面拥有经验的候选人,以及在肌肉骨骼软组织损伤风险分析方面有已发表研究成果的候选人。作为培训的一部分,任职者预计将对一个或多个合作机构进行研究访问。研究任务还包括在定期项目会议和研讨会上以及在进度报告中报告研究成果,以及准备科学论文以供发表。对参与本研究的研究生进行有限的共同监督将成为发展培训的一部分。研究生培训和/或教学经验将大有裨益。成功的在职人员必须遵守开普敦大学批准的博士后部门政策、程序和惯例。
在我们日常生活的许多食物中发现了食品行业的乳化剂,一种乳化剂,一种食品添加剂(面包屑面包,冰淇淋,奶油,奶油奶油,蔬菜奶油等)。其健康消费的影响已成为公共卫生的真正主题,因为它们在当前食品中的存在很重要。Benoit Chassaing,Inserm Research Research总监兼Microbiota-Host互动团队的负责人(Inserm/Inserm/ParisCité/CNRS),此前表明,这些添加剂可以促进慢性炎症性疾病和代谢性消失的发展,直接在我们的肠道杂物上进行作用。在一项新的研究中发表在报纸肠道上,他的团队并开发了一个人类的微生物群模型,该模型能够预测每个人对乳化剂的敏感性,这要归功于一个简单的粪便样本。此发现打开
1 1 ,KTH皇家技术学院,KTH皇家技术研究所,Albanova大学中心,SE-10691斯德哥尔摩,斯德哥尔摩,瑞典2号瑞普萨拉大学物理与天文学系,乌普萨拉大学,Box 516,SE-751,SE-751,SE-751 20 UPPSALA,SE-751 20 UPPSALA,SEWEN 3,SWEDEN 3 SWEDEN 4 PRYSIC和ELECTRICAL ELECTRICAR ENTICER ERMENER ERMENER ERMENER ERMERERING,SE-KALER UNICASION,SE-SE-392瑞典电子科学研究中心(SERC),KTH皇家技术学院,SE-10044斯德哥尔摩,瑞典5 Wallenberg 5 Wallenberg倡议可持续性材料科学科学(WISE),KTH皇家技术研究所,SE-10044 Stockholm,STECHOLM,SWEDEN 6 SWEDEN,SWEDEN 6,SWEDEN 6,科学与技术学院,SECRO,SE-REBRO UNICOCT,SE-701 82,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAIT,SWIRIAIT,sWIRIAIT,WISER,沃尔布罗,沃尔布罗,沃尔布罗。科学,乌普萨拉大学,框516,SE-751 20乌普萨拉,瑞典8应用数学和计算机科学系,数学和统计学院,1 ,KTH皇家技术学院,KTH皇家技术研究所,Albanova大学中心,SE-10691斯德哥尔摩,斯德哥尔摩,瑞典2号瑞普萨拉大学物理与天文学系,乌普萨拉大学,Box 516,SE-751,SE-751,SE-751 20 UPPSALA,SE-751 20 UPPSALA,SEWEN 3,SWEDEN 3 SWEDEN 4 PRYSIC和ELECTRICAL ELECTRICAR ENTICER ERMENER ERMENER ERMENER ERMERERING,SE-KALER UNICASION,SE-SE-392瑞典电子科学研究中心(SERC),KTH皇家技术学院,SE-10044斯德哥尔摩,瑞典5 Wallenberg 5 Wallenberg倡议可持续性材料科学科学(WISE),KTH皇家技术研究所,SE-10044 Stockholm,STECHOLM,SWEDEN 6 SWEDEN,SWEDEN 6,SWEDEN 6,科学与技术学院,SECRO,SE-REBRO UNICOCT,SE-701 82,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAIT,SWIRIAIT,sWIRIAIT,WISER,沃尔布罗,沃尔布罗,沃尔布罗。科学,乌普萨拉大学,框516,SE-751 20乌普萨拉,瑞典8应用数学和计算机科学系,数学和统计学院,,KTH皇家技术学院,KTH皇家技术研究所,Albanova大学中心,SE-10691斯德哥尔摩,斯德哥尔摩,瑞典2号瑞普萨拉大学物理与天文学系,乌普萨拉大学,Box 516,SE-751,SE-751,SE-751 20 UPPSALA,SE-751 20 UPPSALA,SEWEN 3,SWEDEN 3 SWEDEN 4 PRYSIC和ELECTRICAL ELECTRICAR ENTICER ERMENER ERMENER ERMENER ERMERERING,SE-KALER UNICASION,SE-SE-392瑞典电子科学研究中心(SERC),KTH皇家技术学院,SE-10044斯德哥尔摩,瑞典5 Wallenberg 5 Wallenberg倡议可持续性材料科学科学(WISE),KTH皇家技术研究所,SE-10044 Stockholm,STECHOLM,SWEDEN 6 SWEDEN,SWEDEN 6,SWEDEN 6,科学与技术学院,SECRO,SE-REBRO UNICOCT,SE-701 82,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAIT,SWIRIAIT,sWIRIAIT,WISER,沃尔布罗,沃尔布罗,沃尔布罗。科学,乌普萨拉大学,框516,SE-751 20乌普萨拉,瑞典8应用数学和计算机科学系,数学和统计学院,,KTH皇家技术学院,KTH皇家技术研究所,Albanova大学中心,SE-10691斯德哥尔摩,斯德哥尔摩,瑞典2号瑞普萨拉大学物理与天文学系,乌普萨拉大学,Box 516,SE-751,SE-751,SE-751 20 UPPSALA,SE-751 20 UPPSALA,SEWEN 3,SWEDEN 3 SWEDEN 4 PRYSIC和ELECTRICAL ELECTRICAR ENTICER ERMENER ERMENER ERMENER ERMERERING,SE-KALER UNICASION,SE-SE-392瑞典电子科学研究中心(SERC),KTH皇家技术学院,SE-10044斯德哥尔摩,瑞典5 Wallenberg 5 Wallenberg倡议可持续性材料科学科学(WISE),KTH皇家技术研究所,SE-10044 Stockholm,STECHOLM,SWEDEN 6 SWEDEN,SWEDEN 6,SWEDEN 6,科学与技术学院,SECRO,SE-REBRO UNICOCT,SE-701 82,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAIT,SWIRIAIT,sWIRIAIT,WISER,沃尔布罗,沃尔布罗,沃尔布罗。科学,乌普萨拉大学,框516,SE-751 20乌普萨拉,瑞典8应用数学和计算机科学系,数学和统计学院,,KTH皇家技术学院,KTH皇家技术研究所,Albanova大学中心,SE-10691斯德哥尔摩,斯德哥尔摩,瑞典2号瑞普萨拉大学物理与天文学系,乌普萨拉大学,Box 516,SE-751,SE-751,SE-751 20 UPPSALA,SE-751 20 UPPSALA,SEWEN 3,SWEDEN 3 SWEDEN 4 PRYSIC和ELECTRICAL ELECTRICAR ENTICER ERMENER ERMENER ERMENER ERMERERING,SE-KALER UNICASION,SE-SE-392瑞典电子科学研究中心(SERC),KTH皇家技术学院,SE-10044斯德哥尔摩,瑞典5 Wallenberg 5 Wallenberg倡议可持续性材料科学科学(WISE),KTH皇家技术研究所,SE-10044 Stockholm,STECHOLM,SWEDEN 6 SWEDEN,SWEDEN 6,SWEDEN 6,科学与技术学院,SECRO,SE-REBRO UNICOCT,SE-701 82,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAIT,SWIRIAIT,sWIRIAIT,WISER,沃尔布罗,沃尔布罗,沃尔布罗。科学,乌普萨拉大学,框516,SE-751 20乌普萨拉,瑞典8应用数学和计算机科学系,数学和统计学院,,KTH皇家技术学院,KTH皇家技术研究所,Albanova大学中心,SE-10691斯德哥尔摩,斯德哥尔摩,瑞典2号瑞普萨拉大学物理与天文学系,乌普萨拉大学,Box 516,SE-751,SE-751,SE-751 20 UPPSALA,SE-751 20 UPPSALA,SEWEN 3,SWEDEN 3 SWEDEN 4 PRYSIC和ELECTRICAL ELECTRICAR ENTICER ERMENER ERMENER ERMENER ERMERERING,SE-KALER UNICASION,SE-SE-392瑞典电子科学研究中心(SERC),KTH皇家技术学院,SE-10044斯德哥尔摩,瑞典5 Wallenberg 5 Wallenberg倡议可持续性材料科学科学(WISE),KTH皇家技术研究所,SE-10044 Stockholm,STECHOLM,SWEDEN 6 SWEDEN,SWEDEN 6,SWEDEN 6,科学与技术学院,SECRO,SE-REBRO UNICOCT,SE-701 82,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAT,SWIRIAIT,SWIRIAIT,sWIRIAIT,WISER,沃尔布罗,沃尔布罗,沃尔布罗。科学,乌普萨拉大学,框516,SE-751 20乌普萨拉,瑞典8应用数学和计算机科学系,数学和统计学院,
工作与安全。您对工作和连接眼镜的研究的背景和目的是什么?AurélienLux。 在研究的起源上,这是一个与玻璃或互联头盔公司使用的风险相关的风险的问题。 的确,这些失望越来越多地使用了 - 尤其是在维护部门,但也在生产中 - 没有潜在风险是真实的问题。 首先,我们想知道使用这些位移设备的使用的影响,尤其是单层瀑布的风险,占工作中事故的11%。 为此,我们进行了一项实验室研究,在此期间,我们要求80名18至50岁的参与者遵循一条直线和另一条蜿蜒的途径。 第一次旅行是没有眼镜的,以便有参考课程。 然后他们重新开始,但是这次配备了一场连接的灾难,通过该灾难,练习是不同的。 一些练习很容易,例如计算显示的符号数量;当分析齿轮旋转方向时,其他更困难的是需要更多的关注。AurélienLux。在研究的起源上,这是一个与玻璃或互联头盔公司使用的风险相关的风险的问题。的确,这些失望越来越多地使用了 - 尤其是在维护部门,但也在生产中 - 没有潜在风险是真实的问题。首先,我们想知道使用这些位移设备的使用的影响,尤其是单层瀑布的风险,占工作中事故的11%。为此,我们进行了一项实验室研究,在此期间,我们要求80名18至50岁的参与者遵循一条直线和另一条蜿蜒的途径。第一次旅行是没有眼镜的,以便有参考课程。然后他们重新开始,但是这次配备了一场连接的灾难,通过该灾难,练习是不同的。一些练习很容易,例如计算显示的符号数量;当分析齿轮旋转方向时,其他更困难的是需要更多的关注。
非港口操作(排除起诉措施): - Peiner Cranes€732.04 366.02€457.52€549.03€ -Sennebogen Cranes€554.62€554.62€277.31€277.31€346.63 549.03 -Liebherr Liebher LHM 180 732.04€366.02€457.52€457.52€549.03 -Liebherr Crane€954,552.86€276.43€276.43€345.53
图2:ESM2预测结构化和无序残基的适应性景观。(a)呈现了人类HP1α蛋白(Uniprot ID:P45973)中氨基酸的ESM2评分,残基的PLDDT得分低于70,以蓝色突出显示,以表示缺乏确定结构的区域。(b)在结构秩序不同程度的三个区域的健身景观的详细观点。在左侧,人类HP1α蛋白的Alphafold2预测的结构以卡通表示显示,其颜色为PLDDT分数。三个特定区域,代表柔性无序(残基75-85),保守无序(残基87-92)和折叠(残基120-130)段,分别用蓝色,橙色和红色突出显示,使用球形粘贴样式。右侧的面板描绘了每个区域中每个区域的ESM2 LLR预测。(c,d)PLDDT和ESM2分布分布的直方图(C)和无序(D)残基。轮廓线表示计算为 - log P(PLDDT,ESM2)的自由能水平,其中P是基于其PLDDT和ESM2分数的残基的概率密度。轮廓以0.5个单位间隔间隔,以区分不同密度的区域。
抽象细菌DNA甲基化参与了各种细胞功能,从基因表达的调节,DNA修复和限制性化系统来防御病毒和其他异物DNA。甲基分析确定细菌染色体中甲基化的位点,揭示了可能由天然限制酶靶向的基序。因此,对这些基序的识别对于使生物体具有遗传诱因至关重要,其中模仿大肠杆菌中的甲基甲基模式允许保护质粒DNA免受目标生物体的限制,因此可以极大地提高转化效率。 牛津纳米孔技术(ONT)测序可以在测序过程中检测甲基化的碱基,但是需要软件来识别数据中相应的甲基化基序。 在这里,我们开发了Mijamp(Mijamp只是一个甲基床解析器),该软件包是为了从ONT的Modkit的输出或甲基床格式中的其他数据中发现甲基化基序而开发的软件包。 Mijamp采用了人为驱动的改进策略,从经验上验证了针对全基因组甲基化数据的所有基序,从而消除了错误,未解释或过度解释的基序。 Mijamp还可以在特定的,用户定义的主题上报告甲基化数据。 使用Mijamp,我们确定了对照菌株(野生型大肠杆菌)和picosynecococcus sp中的甲基化基序。 菌株PCC7002,为改善该生物体转化的基础奠定了基础。 Mijamp可从https://code.ornl.gov/alexander-public/mijamp/获得。对这些基序的识别对于使生物体具有遗传诱因至关重要,其中模仿大肠杆菌中的甲基甲基模式允许保护质粒DNA免受目标生物体的限制,因此可以极大地提高转化效率。牛津纳米孔技术(ONT)测序可以在测序过程中检测甲基化的碱基,但是需要软件来识别数据中相应的甲基化基序。在这里,我们开发了Mijamp(Mijamp只是一个甲基床解析器),该软件包是为了从ONT的Modkit的输出或甲基床格式中的其他数据中发现甲基化基序而开发的软件包。Mijamp采用了人为驱动的改进策略,从经验上验证了针对全基因组甲基化数据的所有基序,从而消除了错误,未解释或过度解释的基序。Mijamp还可以在特定的,用户定义的主题上报告甲基化数据。使用Mijamp,我们确定了对照菌株(野生型大肠杆菌)和picosynecococcus sp中的甲基化基序。菌株PCC7002,为改善该生物体转化的基础奠定了基础。Mijamp可从https://code.ornl.gov/alexander-public/mijamp/获得。
抽象细菌DNA甲基化参与了各种细胞功能,从基因表达的调节,DNA修复和限制性化系统来防御病毒和其他异物DNA。甲基分析确定细菌染色体中甲基化的位点,揭示了可能由天然限制酶靶向的基序。因此,对这些基序的识别对于使生物体具有遗传诱因至关重要,其中模仿大肠杆菌中的甲基甲基模式允许保护质粒DNA免受目标生物体的限制,因此可以极大地提高转化效率。 牛津纳米孔技术(ONT)测序可以在测序过程中检测甲基化的碱基,但是需要软件来识别数据中相应的甲基化基序。 在这里,我们开发了Mijamp(Mijamp只是一个甲基床解析器),该软件包是为了从ONT的Modkit的输出或甲基床格式中的其他数据中发现甲基化基序而开发的软件包。 Mijamp采用了人为驱动的改进策略,从经验上验证了针对全基因组甲基化数据的所有基序,从而消除了错误,未解释或过度解释的基序。 Mijamp还可以在特定的,用户定义的主题上报告甲基化数据。 使用Mijamp,我们确定了对照菌株(野生型大肠杆菌)和picosynecococcus sp中的甲基化基序。 菌株PCC7002,为改善该生物体转化的基础奠定了基础。 Mijamp可从https://code.ornl.gov/5g6/mijamp/获得。对这些基序的识别对于使生物体具有遗传诱因至关重要,其中模仿大肠杆菌中的甲基甲基模式允许保护质粒DNA免受目标生物体的限制,因此可以极大地提高转化效率。牛津纳米孔技术(ONT)测序可以在测序过程中检测甲基化的碱基,但是需要软件来识别数据中相应的甲基化基序。在这里,我们开发了Mijamp(Mijamp只是一个甲基床解析器),该软件包是为了从ONT的Modkit的输出或甲基床格式中的其他数据中发现甲基化基序而开发的软件包。Mijamp采用了人为驱动的改进策略,从经验上验证了针对全基因组甲基化数据的所有基序,从而消除了错误,未解释或过度解释的基序。Mijamp还可以在特定的,用户定义的主题上报告甲基化数据。使用Mijamp,我们确定了对照菌株(野生型大肠杆菌)和picosynecococcus sp中的甲基化基序。菌株PCC7002,为改善该生物体转化的基础奠定了基础。Mijamp可从https://code.ornl.gov/5g6/mijamp/获得。
C-610 B5L ZLCO 其他 PCE 43.05 50.90 43.05 50.90 48.85 56.70 48.85 56.70 C-615 B5L ZLCO 其他 PCE 34.72 41.05 34.72 41.05 39.39 45.72 39.39 45.72 C-620 B5L ZLCO 其他 PCE 82.34 97.35 82.34 97.35 93.43 108.44 93.43 108.44 C-630 B5L ZLCO HMOY PCE 65.82 77.82 65.82 77.82 74.68 86.68 74.68 86.68 C-632 B5L ZLCO 其他 PCE 118.10 139.63 118.10 139.63 134.00 155.53 134.00 155.53 C-634 B5L ZLCO 其他 PCE 28.25 33.40 28.25 33.40 32.05 37.20 32.05 37.20 C-634 GA650ML ZLCO 其他 PCE 6.98 8.25 6.98 8.25 7.92 9.19 7.92 9.19 G-353 CG400G ZGRA 其他 PCE 13.37 15.81 13.37 15.81 15.17 17.61 15.17 17.61 G-354 CG400G ZGRA 其他 PCE 12.51 14.79 12.51 14.79 14.19 16.47 14.19 16.47 G-355 CG400G ZGRA 其他 PCE 4.57 5.40 4.57 5.40 5.19 6.02 5.19 6.02 G-359 CG400G ZGRA 其他 PCE 5.42 6.41 5.42 6.41 6.15 7.14 6.15 7.14 G-361 CG400G ZGRA 其他 PCE 11.44 13.53 11.44 13.53 12.98 15.07 12.98 15.07 G-363 B500GR ZGRA 其他 PCE 39.45 46.64 39.45 46.64 44.76 51.95 44.76 51.95 G-366 CG400G ZGRA 其他 PCE 10.08 11.92 10.08 11.92 11.44 13.28 11.44 13.28 G-382 CG400G ZGRA 其他 PCE 6.33 7.48 6.33 7.48 7.18 8.33 7.18 8.33 G-392 CG400G ZGRA 其他 PCE 32.19 38.06 32.19 38.06 36.52 42.39 36.52 42.39 G-395 CG400G ZGRA 其他 PCE 9.57 11.31 9.57 11.31 10.86 12.60 10.86 12.60 G-395 T35LB ZGRA HMOY PCE 275.99 326.31 275.99 326.31 313.15 363.47 313.15 363.47 G-414 CG400G ZGRA 其他 PCE 2.41 2.85 2.41 2.85 2.73 3.17 2.73 3.17 G-414 F180KG ZGRA 其他 PCE 842.34 995.91 842.34 995.91 955.75 1109.32 955.75 1109.32 G-414 F50KG ZGRA 其他 PCE 147.51 174.40 147.51 174.40 167.37 194.26 167.37 194.26 G-460 B5KG ZGRA 其他 PCE 27.56 32.58 27.56 32.58 31.27 36.29 31.27 36.29 G-460 CG400G ZGRA 其他 PCE 5.70 6.74 5.70 6.74 6.47 7.51 6.47 7.51 H-515 B5L ZLHY 其他 PCE 25.86 30.57 25.86 30.57 29.34 34.05 29.34 34.05 H-537 B5L ZLHY 其他 PCE 40.10 47.41 40.10 47.41 45.50 52.81 45.50 52.81 H-542 B1L ZLHY 其他 PCE 4.19 4.95 4.19 4.95 4.75 5.51 4.75 5.51 H-548 B5L ZLHY 其他 PCE 29.72 35.14 29.72 35.14 33.72 39.14 33.72 39.14 H-548 F208L ZLHY 其他 PCE 867.34 1025.47 867.34 1025.47 984.12 1142.25 984.12 1142.25 H-573 F208L ZLHY 其他 PCE 746.07 882.09 746.07 882.09 846.52 982.54 846.52 982.54 H-573 T20L ZLHY 其他 PCE 103.60 122.49 103.60 122.49 117.55 136.44 117.55 136.44 H-575 T20L ZLHY 其他 PCE 133.21 157.50 133.21 157.50 151.15 175.44 151.15 175.44 H-579 F205L ZLHY 其他 PCE 971.23 1148.30 971.23 1148.30 1102.00 1279.07 1102.00 1279.07 H-579 T20L ZLHY 其他 PCE 90.34 106.81 90.34 106.81 102.50 118.97 102.50 118.97 H-580 F208L ZLHY 其他 PCE 4604.12 5443.52 4604.12 5443.52 5224.02 6063.42 5224.02 6063.42 O-1177 B1L 追 HMOY PCE 8.18 9.67 8.18 9.67 9.28 10.77 9.28 10.77 O-1177 T20L 追 HMOY PCE 214.68 253.82 214.68 253.82 243.58 282.72 243.58 282.72 O-1179 B5L 追 HMOY PCE 15.94 18.85 15.94 18.85 18.09 21.00 18.09 21.00 O-1179 F208L 追HMOY PCE 670.71 792.99 670.71 792.99 761.01 883.29 761.01 883.29 O-1179 T20L 追HMOY PCE 60.29 71.28 60.29 71.28 68.41 79.40 68.41 79,40 O-133 B5L ZHUI HMOY PCE 30.31 35.84 30.31 35.84 34.39 39.92 34.39 39.92
从基因组的非编码区域通过突变依次出现。除其他外,此类突变分析转录并创建一个新的开放阅读框(ORF)。尽管ORF出现的机制有充分的文献证明,但对实现新转录事件的机制知之甚少。然而,在许多物种中,已经报道了基因组所有区域的缺乏和非常突出的转录之间的连续体。在这项研究中,我们使用新组装的基因组和七个果蝇的近交系列的转录组和转录组搜索了从头转录本,该基因组和一个来自六个欧洲和一个非洲人口的近交系列。此设置使我们能够检测Sam ple特定的从头转录本,并将其与其他样品中的同源非转录区以及遗传和基因间控制序列进行比较。我们研究了与转换元件(TES)的关联,并富集了从头开始出现的转录本上游的转录因子基序,并将其与调节元素进行了比较。我们发现,从头的成绩单与TES重叠的频率比偶然性的频率更高。新转录本的出现cor与高鸟嘌呤 - 环蛋白含量和TE表达的区域有关。此外,从头转录本的上游区域高度丰富了调节基序。这种基序在与TES(尤其是DNA TES)重叠的新转录物中更丰富,并且比上游的“非转录同源物”更保守上游。总体而言,我们的研究表明,TE插入对于转录本的出现很重要,部分是通过引入DNA te家族的新调节图案。