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“DNA不会说谎”：研究揭示北美纯种马的遗传多样性
“这项研究的动机是量化纯种马的遗传变异和近亲繁殖程度，”马丁-加顿 CAFE 的马克斯韦尔 H. 格鲁克马研究中心教授、这项研究的主要作者欧内斯特·贝利说。“通过识别趋势，我们为饲养者提供了必要的数据，使他们能够做出明智的选择，保护品种的健康和性能。”
GWAS信息的数据整合和非编码CRISPRI筛选骨矿物质密度的遗传病因
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于12月29日，2024年。 https://doi.org/10.1101/2024.03.19.585778 doi：Biorxiv Preprint
Patina Maldives用
一种启发沉浸式体验的私人庇护所，Patina Maldives是一个超越的旅程，进入了深层文化特征的目的地，通过独创性，发现和团结将有意识的旅行者联系起来。关于Patina Hotels＆Resorts Patina Hotels＆Resorts是Capella Hotel Group的变革性奢侈品牌。先开创豪华酒店的新视角，帕特纳是目的地的目的地，强调了将志趣相投的人聚集在一起并与自己和周围环境建立有意义的联系的能量和共同的激情。Patina体现了一个不断发展的旅程，将时刻转变为像Patina效果一样的客人的持久标记。遵循Patina Maldives，Fari群岛，Patina Osaka将是该品牌的第一个Urban Hotel，这是该品牌的第一个Urban Hotel，创造性的视野开放的思想和烙印生活...无限烙印！
算法照亮第1部分的基础知识Tim Roughgarden PDF
本文介绍了由蒂姆·鲁德加登（Tim Roughgarden）在内的作者撰写的与算法游戏理论相关的各种研究论文和书籍的出版历史。出版物涵盖了诸如机理设计，拍卖和路由游戏之类的主题。此外，它还提到了一本书，题为《蒂姆·鲁德加登（Tim Roughgarden）所阐明的算法》，该书是具有基本编程知识的读者的算法介绍。它首先要探索Huffman的编码技术，以提高数据压缩效率。然后，该课程使用Prim和Kruskal的算法以及其他方法（如Union-Find）来研究最小跨越树。此外，它涉及序列对齐，最佳的二进制搜索树，最短边缘长度的最短路径以及几个NP硬问题问题，例如Knapsack问题，影响最大化和旅行推销员问题（TSP）。在整个课程中，还着重于解决复杂的计算问题的算法策略，包括证明NP硬度。**本地搜索原则**讨论了旅行推销员问题（TSP）的Bellman-Karp-Karp动态编程算法。此外，涵盖了用于查找长路径和混合整数编程（MIP）求解器的Alon-Yuster-Yuster-Zwick颜色编码算法。**特定问题算法与魔术盒**令人满意的（SAT）求解器和还重新审视的减少。证明了3个SAT，哈密顿路径，TSP，子集和集合等问题的NP完整性。NP完整性，并探讨了其对解决问题的影响。The main topics are divided into sections: * Section 2: Notation and additional examples + Divide-and-conquer paradigm + Counting inversions in O(n log n) time + Strassen's matrix multiplication algorithm + Closest pair algorithms * Section 3: Master method + Motivation + Formal statement + Examples + Proof of the master method * Section 4: QuickSort + Overview + Partitioning around a pivot element + Choosing a good pivot + Analysis (part 1, part 2, and part 3) + Sorting requires Omega(n log n) comparisons * Section 5: Randomized linear-time selection + Algorithm + Analysis + Deterministic linear-time selection algorithm + Deterministic linear-time selection analysis (part 1 and part 2) * Section 6: Proofs by induction and the correctness of QuickSort The rest of the text is about graph theory, including: * Graphs: basics and representations * Graph search overview * Breadth-first search (BFS) and shortest paths * BFS and undirected connected components * Depth-first search (DFS) * Topological sort * Computing strongly connected components * The structure of the web * Shortest paths and Dijkstra's algorithm The final sections cover data structures, including: * Heaps: operations, applications, and implementation details * Balanced search树：操作，应用和实施详细信息 *搜索树：旋转 *哈希表：操作，应用和实施细节 * Bloom过滤器：基础知识和启发式分析本课程涵盖了图理论和算法设计中的一系列基本主题。**决策，搜索和优化** P！= NP猜想和指数时间假设。还描述了下降时钟拍卖的实施和最终结果。**无线频谱重新调整**涵盖了回购许可证和可行性检查的贪婪启发式方法。**算法设计现场指南**本书以结尾结束，包括视频，奖励幻灯片，讨论论坛，勘误表，测试用例和编程项目的数据集。**编程问题**提出了两个问题：Karatsuba乘法和计数反转。提供了理智检查和测试用例，以及针对反转问题的挑战数据集。此外，还探索了QuickSort算法，并提出了测试用例和挑战。涉及QuickSort的挑战问题，其中100个元素的数组需要使用不同的枢轴策略进行排序：始终将第一个元素，最后一个元素或中位数用作枢轴。应计算每个策略的预期比较数。此外，还存在与线性时间选择算法，强烈连接组件和Dijkstra算法有关的测试用例和挑战。（注意：我以原始语言保留了文本。）期待讨论从顶点1到顶点7、37、59、82、99、115、133、165、188和197的最短路径距离。此外，我们将研究编程问题，例如中间维护问题，2-SUM，贪婪的调度，霍夫曼代码，最小跨越树木和加权独立集。这些测试用例涉及求解KTH中位数，在数组中找到目标值，安排重量和长度的作业，构造最佳前缀无代码，并确定最小跨越树的成本。给定文章文本此处文章讨论了各种编程问题，包括与图形相关的问题，例如路径图的最大重量独立集和旅行推销员问题。它还涉及序列对齐，最佳的二进制搜索树以及最短的路径。这些问题的挑战具有不同的复杂性水平，需要创造性的解决方案才能有效地计算最佳结果。给定文本描述了与图理论和计算复杂性有关的不同问题实例，包括针对各种算法的测试用例和挑战数据集，例如旅行推销员问题（TSP）和通过SAT求解器的图形着色。它还提供了指向外部资源的链接，并参考了一本名为“算法照明”的书，以进行进一步研究。文本包括最佳旅行成本的描述，基于欧几里得距离的边缘成本以及有关这些实例的文件格式的详细信息。由Tim Roughgarden照亮的算法是一部开创性的书籍系列，以引人入胜且易于访问的方式提出了算法的核心思想。它受到了玛丽·沃特（Mary Wootters），阿夫拉汉姆·莱夫（Avraham Leff）和丹尼尔·辛加罗（Daniel Zingaro）等专家的高度赞扬，他们欣赏其独特的教学算法方法。这本书的奇异能力将算法设计与教学设计混合在一起，使其与其他教科书区分开来。Roughgarden对算法和学习的热情使材料与学生相关且令人愉悦。这本书是由Coursera和EDX上的在线课程启发的DIY系列的一部分，其中有四卷可用，包括精装综合版。该系列为学习者提供了足够的机会，可以检查他们的理解，研究示例并在上下文中查看算法，从而使其成为那些起步者的绝佳资源。可以通过各种渠道订购，包括书店，亚马逊和出版商的网站。这本书已被翻译成几种语言，使其在全球读者可以使用。
脆性星基因组照亮了动物附属再生的遗传基础
几乎所有现存的动物谱系中的物种都能够再生身体部位。但是，尚不清楚控制再生的基因表达程序是否在进化上保守。脆性恒星是一类具有出色再生能力的棘皮动物类，但是有限的基因组资源阻碍了对该组再生遗传基础的研究。在这里，我们报告了脆性恒星Amphiura Filiformis的染色体规模的基因组组件。我们表明，脆性星基因组是到目前为止测序的棘皮动物中最重新排列的，其重新组织的HOX群集让人联想到海胆中观察到的重排。此外，我们在脆性恒星成人手臂再生过程中对基因表达进行了广泛的分析，并确定了控制伤口愈合，增殖和分化的基因表达的顺序波。我们与其他无脊椎动物和脊椎动物模型进行了比较转录组分析，以进行附加物再生，并发现了数百个具有保守表达动力学的基因，尤其是在再生的增殖阶段。我们的发现强调了棘皮动物检测脊椎动物和经典无脊椎动物再生模型系统之间的远程表达保护的关键重要性。
g e o p h ys i c s火山弧形刚度变化通过2011年tohoku-oki M9
岩石强度长期以来一直与岩石圈变形和地震性联系在一起。然而，缺少对相关弹性异质性的独立约束，但可以为固体地球动力学提供关键信息。使用Coseismic全球导航卫星系统（GNSS）数据，用于日本的2011 M9 Tohoku-Oki地震，我们应用一种反向方法来同时推断弹性结构和断层滑移。我们在火山弧下方和壁式楔形区域的部分熔体生成区域内发现，被推断为位于〜100 km的平板深度。我们还确定了更接近较接近的抗震动性地震性模式的低含量材料，这可能与增生性楔形结构相关。以及传统的地震和电磁方法，我们的方法开辟了多物理倒置的途径。那些可能会推动地震和火山的潜力，尤其是一旦扩展到INSAR类型的约束，可能会导致对跨尺度的短暂岩石圈变形的更好理解。
litomosoides sigmodontis的基因组照亮了丝状线虫中Y染色体的起源
异态性别染色体起源于一对获得性别确定基因座的自动染色体，随后停止重组，导致性别受限的染色体变性。大多数线虫物种缺乏异态性别染色体，并使用X染色体计数机制来确定性别，其中一个或多个X染色体（XX/X0）的雄性为半合子。一些丝状线虫物种，包括人类的重要寄生虫，具有异晶XX/ XY核型。已经假定性别是由这些特殊的Y连锁基因座确定的。然而，核型分析表明，丝状Y染色体源自参与X型体融合事件的常染色体的未连接同源物。在这里，我们生成了一个染色体水平的参考基因组，用于litomosoides sigmodontis，这是一种具有祖先丝状核型和性别确定机制（xx/x0）的丝状线虫。通过将组装的染色体映射到透性线虫祖先连锁（或Nigon）元素中，我们推断出，祖先的丝状X染色体是Nigonx（祖先X-inked Element）和Nigond（Ancestryally Autoso-autoso-mal）之间融合的产物。在带有XY系统的两个丝状谱系中，已经有两个独立的X-Auto-一些涉及不同常染色体黑色NIGON元素的染色体融合事件。在这两个谱系中，Neo-X和Neo-Y染色体共享的区域都在X的祖先常染色体部分内，证实了丝状Y染色体是源自自动体的未使用的同源物。XY丝状线虫中的性别确定可能会继续通过祖先的X染色体计数机制进行操作，而不是通过y连接的性别决定的基因座进行。
首届核医学人工智能与信息学国际网络研讨会：“人工智能照亮核医学美好未来”
人工智能 (AI) 和信息学在医疗保健领域，尤其是在医学成像领域，正在迅速获得临床应用，目前 FDA 批准的 76% 的 AI 医疗设备在放射学领域运行 [ 1 ]。在放射学领域，由于检查数量和专业人员的参与，AI 的重要性还体现在科学文献中不断增加的论文数量以及会议和学会中提供的相关认证教学课程。然而，在核医学领域，在 AI 应用的开发、验证和采用方面仍有许多工作要做。此外，信息学转化为专用软件包 (EPD 和 PACS) 的作用值得进一步关注挑战和机遇。正电子发射断层扫描 (PET)、单光子发射计算机断层扫描 (SPECT) 及其配套的计算机断层扫描 (CT) 或磁共振成像 (MRI) 硬件和软件的不断改进，提高了诊断
空间和单细胞转录组学照亮了蝙蝠免疫和屏障组织进化
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2023年11月2日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.10.30.564705 doi：Biorxiv Preprint
并行基因簇编辑照明环氧基酮蛋白酶体抑制剂生物合成的机制
DNA测序技术和生物毒素格式的进步揭示了微生物在医学和农业中产生具有不同用途的结构复杂的特殊代谢物的巨大潜力。然而，这些分子通常会重新检查结构修饰以优化它们以供应用，这可能是使用合成化学很难的。生物工程提供了一种互补的结构修饰方法，但通常会因遗传性棘手性而受到影响，并且需要对生物合成基因功能的理解。异源宿主中专门的代谢产物生物合成基因簇（BGC）可以解决这些问题。然而，当前的BGC克隆和操作方法是不具体的，缺乏实现的，并且可能非常昂贵。在这里，我们报告了一个基于酵母的平台，该平台利用了与转换相关的重组（TAR）进行高效率捕获和对BGC的并行操作。作为概念证明，我们克隆，杂酚表达和遗传分析了与结构相关的非核糖体肽epone-epone-epone- mycin和tmc-86a的BGC，阐明了这些重要蛋白质的生物合成中的模棱两可。我们的结果表明，epone- mycin BGC还指导TMC-86A的产生，并揭示了启动这两种代谢产物组装的对比机制。此外，我们的