美国政府最终用户:Oracle计划(包括任何操作系统,集成软件,任何已嵌入,安装或在交付的硬件上激活的程序,以及此类程序的修改)和Oracle计算机文档或美国政府最终用户提供或访问的其他Oracle数据是“商业计算机软件”,“商业计算机软件”,“商业计算机软件文档”,“商业计算机软件”,“商业计算机软件”,“有限的权利数据”或“有限的权利”适用于适用于适用的适用性,或者适用于适用性的适用性,并适用于适用于适用性。因此,使用,复制,重复,释放,显示,披露,修改,衍生作品的准备和/或适应i)Oracle程序(包括任何操作系统,集成软件,嵌入,安装或激活的任何程序,在此类程序中嵌入或激活的任何程序,对此类程序的限制和其他限制),III和/或III IS IS III和/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/ii ii III),IS或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或/或III III IS IIS)在适用的合同中。管理美国政府使用Oracle Cloud Services的条款由适用的此类服务的合同定义。没有其他权利授予美国政府。
细菌无处不在,能够在包括工业废水在内的各种环境中繁荣发展,这些环境通常会带来严峻的物理和化学条件。这些微生物产生各种细胞内和细胞外生物分子,可实现这种极端环境的适应,耐受性和利用。认识到对热稳定脂肪酶的工业需求不断增长,这项研究集中于从印度西孟加拉邦西孟加拉邦加尔各答的北24 Parganas的一家工厂收集的药物垫片中产生脂肪酶的细菌的隔离,表征和优化。十九个产生脂肪酶的细菌分离株,并使用Tributyrin琼脂(TBA)板筛选。通过具有20/80琼脂和甲基红色的杯子板法证实了细胞外脂肪性活性。通过形态学和生化测试对分离株进行表征。细胞外脂肪酶活性是在50 mM TRIS-HCL缓冲液中用二硝基苯基棕榈酸酯(PNPP)作为底物对分光光度计进行定量的,并在65°C孵育20分钟后在410 nm下测得的吸光度为20分钟,以评估可温度。产生了热不稳定脂肪酶,而8种则表现出热稳定脂肪酶活性。其中,三个分离株(MWS14,MWS6和MWS18)表现出高温脂肪酶的产生,其中MWS18是最有生产力的。结型和爆炸分析表明,这些分离株分别与肠球菌,芽孢杆菌和Serratia spe CIE共享99%的序列相似性。使用Kruskal-Wallis H检验的统计分析证实,在这三组分离株中,脂肪酶产生的显着差异。 该研究还可以预测,与革兰氏阳性分离株相比,革兰氏阴性细菌菌株中的脂肪酶产生潜力更大。 这些发现突出了药物废水作为热稳定脂肪酶产生细菌的来源的工业相关性。使用Kruskal-Wallis H检验的统计分析证实,在这三组分离株中,脂肪酶产生的显着差异。该研究还可以预测,与革兰氏阳性分离株相比,革兰氏阴性细菌菌株中的脂肪酶产生潜力更大。这些发现突出了药物废水作为热稳定脂肪酶产生细菌的来源的工业相关性。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可,未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者(此版本于 2020 年 7 月 30 日发布。;https://doi.org/10.1101/2020.07.30.229914 doi:bioRxiv preprint
研究人员仔细研究了与免疫反应有关的基因,发现有藻类的水母的基因表达活性与没有藻类的水母不同。这表明与藻类共生会改变水母的免疫系统,使它们更容易受到细菌的攻击。研究人员认为,有共生藻类的水母更容易因细菌感染而死亡,因为它们的免疫反应更强烈,炎症更严重,对细胞造成的损害更大。
施用生物固体可以提高土壤肥力和作物产量,但也伴随着重金属和抗生素引入的风险。在重金属污染环境下,利用丛枝菌根真菌 (AMF) 是一种有效的策略,可以增强土壤微生物群落稳定性和植物对重金属的耐受性,并减少抗生素抗性基因 (ARG) 的传播。本研究通过盆栽试验探究了接种 AMF 对土壤和植物重金属含量以及土壤微生物群落的影响。结果表明,接种 AMF 显著提高了植物生物量,并降低了土壤和植物重金属含量。虽然接种 AMF 不会改变细菌和真菌群落的组成,但在较高的生物固体浓度下,它增加了细菌的多样性。值得注意的是,接种 AMF 增强了微生物网络的复杂性,并增加了关键类群的丰度。此外,在接种 AMF 的土壤中,一些对重金属具有高抗性的有益微生物得到了富集。宏基因组分析显示,与未接种AMF的土壤相比,接种AMF的土壤中移动遗传元件(MGE)基因IS91减少,重金属抗性基因增加。MGE介导的耐药基因(ARG)扩散减少的可能性是本研究的主要发现之一。需要注意的是,本研究还检测到接种AMF的高生物固体改良土壤中少数耐药基因的富集。总体而言,接种AMF可能是一种有效的农业策略,可以减轻与生物固体、重金属和抗生素耐药性相关的环境风险,从而促进可持续的土壤管理和健康。
与发病机理相关1(NPR1)的非XPRessor对于通过信号分子水杨酸(SA)激活植物免疫系统至关重要,这会触发拟南芥的全身性获得性(SAR)。在这项研究中,已经在Cacao的基因组中鉴定出了三个与NPR1相关的假定基因,即TCNPR1,TCNPR2和TCNPR3,这表明这三个基因实体之间的功能多样化表明。系统发育分析表明,TCNPR1和TCNPR2与它们的拟南芥直系同源物NPR1和NPR2一起分支,表明这些基因在不同物种的SA信号传导途径中保持了保守的作用。相比之下,TCNPR3存在于单独的进化枝中,表明了独特的功能作用和进化差异。对这些TCNPR的生理化学特性的比较分析显示出不同的亚细胞定位,因为TCNPR1在细胞质中持续存在,而TCNPR3在细胞核中发现,与其在SA信号传导和转录性调节中的作用保持一致。此外,我们确定了针对TCNPR3的microRNA,这表明P. Megakarya可能会利用转录调节网络绕过植物防御激活。通过RNA干扰介导的基因沉默对TCNPR基因的瞬时过表达或抑制可能足以研究对其他分子的产生的影响,例如SA,某些PR蛋白表达以及对巨疟原虫的抗性。由TCNPRS编码的蛋白质与P. megakarya的细胞蛋白质之间的相互作用将提供有关Patho Gen是否操纵宿主防御的洞察力。最后,P。Megakarya响应感染TCNPR基因的表达提供了有关防御反应过程中时间和空间激活的有价值的信息。
抽象背景:羊毛和生长特征的遗传改善是绵羊行业的主要目标,但其潜在的遗传建筑仍然难以捉摸。To improve our understanding of these mechanisms, we conducted a weighted single-step genome-wide association study (WssGWAS) and then integrated the results with large-scale transcriptome data for five wool traits and one growth trait in Merino sheep: mean fibre diameter (MFD), coefficient of variation of the fibre diameter (CVFD), crimp number (CN), mean staple length (MSL),油腻的羊毛重量(GFW)和活体重(LW)。结果:我们的数据集包括7135个具有表型数据的人,其中1217个具有高密度(HD)基因型数据(n = 372,534)。这些动物的707种基因型是从Illumina Ovine单核苷酸多态性(SNP)54 Beadchip归为HD阵列的。这些特征的遗传力范围从0.05(CVFD)到0.36(MFD),并且特征遗传相关性之间的遗传性范围为-0.44(CNvs。lw)至0.77(GFW与LW)。通过从500个样品中使用RNA-seq数据进行整体化(代表16只动物的87种组织类型),我们检测到与六个特征相关的组织,例如肝,肌肉和胃肠道(GI)是LW的最相关组织,白细胞和巨噬细胞是CN的最相关细胞。对于六个性状,鉴定出54个定量性状基因座(QTL),涵盖了21个卵巢常染色体上的81个候选基因。多个候选基因显示出强大的组织特异性表达,例如通过进行全现象关联研究(PHEWAS)bnc1(与MFD)和CHRNB1(LW)分别在皮肤和肌肉中特别表达。
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检测DNA甲基化的常见方法使用硫酸盐或酶将未甲基化的C转换为在测序数据中读取为T。这导致核苷酸多样性低的文库很难对齐。亚硫酸盐治疗损害DNA的恶劣条件,在基因组数据中留下了很大的差距。Illumina 5基本化学直接以简单的单步直接将5MC转换为t,该步骤非启示DNA并保留了库复杂性。
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