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对发病机理和宿主相互作用的见解
效应蛋白在锈菌病原体与小麦宿主之间的相互作用中起着至关重要的作用。高通量“ OMICS”数据的可用性已经改变了该领域的游戏规则，可以识别和比较各种锈病和菌株的效应子。这项研究采用了高通量的“ OMICS”数据来探索多种锈菌真菌的共享效应方面，包括三种小麦锈菌，puccinia triticina，puccinia striiformis和puccinia graminis，以及puccinia sorghi（玉米锈）和梅拉姆普斯罗拉·洛里奇（Melampsora lurici-Poppoplar），这项研究采用了全面的生物信息学管道来预测每个锈病的候选效应蛋白（CSEP），评估其亚细胞定位，基于其序列相似性群集相似的效应子，并筛选其表达谱以评估病原体中潜在的作用。这项研究揭示了构成每个物种蛋白质组的4％的不同效应子，其定位预测表明宿主细胞内的靶向多样。效应子序列的聚类导致鉴定1,027个效应子部落和2,186个单线，而格拉米尼菌则表现出最高数量的单线，这表明进化加速和适应以逃避宿主防御。保护分析表明，在三种小麦锈菌中共享了30个共同的部落，其中许多人也发现了triticina和graminis之间。表达谱分析显示早期感染期间的差异表达，表明在发病机理中作用。这项研究强调了锈菌的分子多样性和适应性策略，为疾病管理提供了见解。关键字 - 比较分析 - 抗病性 - 效应蛋白 - 发病机理 - 植物病原体相互作用 - 锈菌 - 小麦简介
单价离子 - 氧化石墨烯相互作用是...
https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2023-dj4m0-v3 orcid：https：//orcid.org/0000-0000-0003-3278-5570不通过chemrxiv对内容进行不同行评审的内容。许可证：CC BY-NC-ND 4.0
健康与疾病中的微生物组相互作用14-16 ...
纵向上呼吸道微生物组的表征在鼻腔接种后，母亲对乳房对乳腺癌的接种后，怀孕期间乳酸乳酸乳腺菌的nasal接种：世界上首次围产期人类围产期人类挑战研究的结果
微生物相互作用从新的角度
大学，柯林斯堡，美国80521 *通讯作者：joshua.chan@colostate.edu摘要微生物是所有生态系统的重要组成部分，影响着物质流并塑造周围的环境。代谢建模一直是一种有用的工具，并为微生物群落代谢提供了极大的见解。但是，基于通量平衡分析（FBA）的当前方法通常无法预测导致长期生存和稳定性的代谢和调节策略，尤其是在异源社区中。在这里，我们引入了一种新颖的增强学习算法，动态FBA中的自我播放微生物，将微生物代谢视为一个决策过程，从而使单个微生物剂能够通过学习和适应新陈代谢策略来进化，以增强长期健身。该算法预测，在存在其他微生物的情况下，哪些微生物通量调节策略将在感兴趣的动态生态系统中稳定，对预定义策略的依赖最少。在本文中，我们介绍了几种情况，其中我们的算法在复制结果中的现有方法优于现有方法，我们探讨了这些预测的生物学意义。简介
微生物相互作用对根瘤菌健康的作用
根瘤菌是土壤细菌，可以与豆科植物建立氮固定共生。作为水平传播的共生体，根瘤菌的生命周期包括土壤中的自由生活阶段和植物相关的共生阶段。在整个生命周期中，根瘤菌暴露于与它们相互作用的无数其他微生物中，从而调节其拟合度和共生性能。在这篇综述中，我们描述了根茎与其他微生物之间相互作用的多样性，这些微生物在根际，结节开始和结节中可能发生。这些根瘤菌 - 微生物相互作用中的某些是间接的，并且发生某些微生物的存在以一种以根瘤菌的方式反馈的植物生理学的存在。我们进一步描述了这些相互作用如何对根瘤菌施加显着的选择性压力并修改其进化轨迹。对复杂的生物环境中根茎的生态进化动力学进行更广泛的研究可能会揭示出这种认真的共生相互作用的引人入胜的新方面，并为未来的农艺应用提供了关键的知识。
HLA-E相互作用可改善抗癌免疫力
抑制性受体NKG2A与CD94形成异二聚体，由〜50％的外周血NK细胞表达，并在NK细胞扩张后进一步上调[1]。此外，NKG2A是CD8+ T细胞上的晚期免疫检查点，在反复的抗原刺激和分裂后，它上调了[2]。NKG2A在耗尽的CAR T细胞上还发现了27天的T细胞输注[3]和CD8+肿瘤浸润T细胞[4-6]。有趣的是，NKG2A具有有效的抗肿瘤活性[7]。NKG2A通过其配体HLA-E的参与导致磷酸酶的募集和激活，这些磷酸酶抑制了NK细胞和T细胞激活[8]。 与健康组织相比，在多种癌症中高度表达了 HLA-E [4，9]，并且已证明通过HLA-E逃避NK和CD8+ T细胞免疫[10]。 两项在癌细胞中采用CRISPR筛查的研究确定HLA-E是NK细胞的关键负调节剂：癌细胞相互作用[11，12]。 根据此，IFNγ信号传导与STAT1激活增加和HLA-E表达增强引起的NK细胞电阻有关[11]。 这在HLA-E的鼠同源物QA-1B也很明显，QA-1B的鼠同源物在所有测试的细胞类型上被炎症信号上调[13]。NKG2A通过其配体HLA-E的参与导致磷酸酶的募集和激活，这些磷酸酶抑制了NK细胞和T细胞激活[8]。HLA-E [4，9]，并且已证明通过HLA-E逃避NK和CD8+ T细胞免疫[10]。两项在癌细胞中采用CRISPR筛查的研究确定HLA-E是NK细胞的关键负调节剂：癌细胞相互作用[11，12]。根据此，IFNγ信号传导与STAT1激活增加和HLA-E表达增强引起的NK细胞电阻有关[11]。这在HLA-E的鼠同源物QA-1B也很明显，QA-1B的鼠同源物在所有测试的细胞类型上被炎症信号上调[13]。
吞吐技术研究宿主 - 病原体相互作用
几年，人们对在实验中过度使用动物的使用越来越多，尤其是出于道德原因，这导致了搜索可靠的替代模型，例如体外，ex vivo，以及可以在科学研究中使用的硅方法，可作为动物模型替代或替代动物模型的辅助方法（4）。真核细胞培养是许多生物医学应用的动物模型的有趣替代方法，但是这些方法受到限制，因为它们通常涉及单层中的细胞系，但未能模仿重要的组织功能。为了改善这些模型，可以在三维培养物（3D）中生长细胞系，从而发展一些典型的组织结构，例如在肠道细胞的情况下，紧密连接蛋白的表达和粘蛋白的产生（3，5，6）。此外，如表1所述，可以在3D培养物中种植不同类型的细胞系，但是必须考虑它们的优点和缺点，以便为每个应用程序提供最佳的模型选择。三维细胞培养已应用于发育，细胞和癌症生物学以及宿主 - 细菌相互作用的研究，因为它模拟了体内发生的重要特征，包括在体外系统中的细胞细胞和细胞外基质相互作用（6，10，11）。这样的3D培养物代表了单一培养实验和用于研究传染病的动物模型之间的中间立场，尤其是与高通量技术结合使用。鉴于高通量技术的可及性和可负担性的增加（例如，）鉴于高通量技术的可及性和可负担性的增加（例如，这种组合有助于确定宿主特异性免疫反应和病原体相互作用，从而导致对感染的发病机理和治疗的新见解（12-14）。转录组学，蛋白质组学和代谢组学）有很大的机会来测量模型系统中3D培养物的响应，无论是在真核组织侧还是在细菌相互作用的侧面
固体中磁相互作用的定量理论
在本报告中，我们回顾了磁性材料间原子间交换的明确计算方法。这涉及通常称为海森堡交换，dzyaloshinskii-moriya相互作用和各向异性对称交换的交换机制。详细介绍了电子结构的微观理论（例如密度功能理论或动态均值理论）和原子间交换之间的联系。提取涉及数千原子的有效自旋哈密顿量的信息的不同方面，考虑到明显较少的原子（1-50），从电子结构计算中提取了数千个原子。提出了大量材料交换相互作用的示例，其中涉及3D时期的重元素，过渡金属之间的合金，助母子化合物，多层系统以及底物上的叠加剂和叠加剂，过渡金属氧化物，4F元素，4F元素，磁性
有关实施植物 - 微生物互动的第四次研讨会...
研讨会是由Eucarpia工作组组织的，该小组在有机和低投入农业的植物 - 微生物相互作用方面组织，并将继续讨论实施其在植物育种方面不断增长的知识的潜力和局限性。以前的研讨会输出是在一篇有关新兴研究重点的观点文章中合成的（Hohmann等人。2020，FEMS micr ecol）。