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引用：Franz K，MarkóL，MählerA等。性激素 - 依赖性宿主 - 微生物组相互作用和心血管风险（XCVD）：朗特的设计
摘要引言心血管疾病（CVD）在男女中的表现不同，受宿主微生物组相互作用的影响。性激素在CVD结局和肠道微生物组中的作用在修饰这些作用中的作用很少。XCVD研究通过观察接受性别表明激素治疗（GAHT）的跨性别参与者（GAHT）来研究性激素对CVD风险标志物的肠道微生物组介导，预计将外推到Sisgender群体。方法并分析了这项观察性的纵向队列研究，包括基线，1年和2年的随访，跨性别参与者开始GAHT。它涉及全面的表型和微生物组基因分型，并整合了高维数据的计算分析。微生物多样性将通过肠道样品的16S rRNA和shot弹枪元基因组测序来评估肠道，皮肤和口服样品。血液测量将包括性激素，CVD风险标记，心脏代谢参数，细胞因子和免疫细胞计数。头发样品将分析用于皮质醇。参与者将完成有关体育活动，心理健康，压力，生活质量，疲劳，睡眠，疼痛和性别烦躁不安的在线问卷，跟踪药物使用和饮食以控制混杂因素。统计分析将将现象，生活方式和多摩尼克数据整合到建模健康效应，测试CVD风险的肠道微生物组介导，因为内分泌环境在顺格西格男性对女性的典型情况与反之亦然。伦理和传播研究遵守良好的临床实践和赫尔辛基的宣言。该协议得到了慈善道德委员会（EA1/339/21）的批准。将获得已签署的知情同意书。结果将在经过同行评审的期刊和会议上发布，并作为参与者，社区团体和公众的可访问摘要共享，参与者能够在公众和患者参与审查以获取可访问性之后安全地查看其数据。试验注册编号XCVD研究在临床检查中进行了注册。Gov（NCT05334888）为“性别差异宿主 - 微生物组CVD风险 - 一种纵向同类群体（XCVD）”，于2022年4月4日。数据集链接
等离子表面相互作用：对（航天器）表面的影响
抽象的月亮 - 阿波罗计划期间通过轨道和表面实验观察到血浆相互作用。光子和带电的颗粒为月球表面充电，并形成薄的debye-比例等离子鞘，在日光下和阴影半球上方。此外，电子的平均热速度，导致Debye鞘在航天器周围形成。光电子和等离子体鞘直接在表面上吸收的灰尘谷物，这些粉尘呈凸起，随后充电的尘埃流动呈负电荷，并与降落的航天器的正面表面接触。作为电荷载体，灰尘颗粒被吸引或排斥在带电的航天器上。环境等离子体和高次级排放的低密度也有助于横杆上的表面充电速率高。电荷在航天器和航天器组件上的积累是由航天器与空间等离子体，能量粒子流和太阳光子相互作用而产生的，该太阳光子通常由游离电子和光子驱动。据报道，归因于航天器充电的各种效果是导致许多操作异常的原因，包括操作异常组件故障，伪造命令，物理航天器表面损伤以及航天器表面材料热和电特性的降解。等离子体的研究 - 表面相互作用显示出有希望的结果，用于开发新型的粉尘缓解航天器充电安全管理的策略。关键字：等离子表面相互作用，等离子鞘，（航天器）表面充电本文旨在调查减轻月球尘埃作为等离子表面相互作用的载体的策略，从而导致航天器充电。
微生物相互作用对多孔介质中地下氢存储的影响：对实验，数值和现场研究的全面综述
在可再生能源的快速发展中，能源供应的间歇性和不稳定构成了严重的挑战，并对能源存储系统施加了更高的要求。在各种储能技术中，功率到水的耦合方法（H 2）和地下H 2存储（UHS）提供了诸如扩展存储持续时间和大规模容量之类的优点，这使它对未来的发展非常有希望。然而，在UHS期间，特别是在多孔培养基中，微生物代谢过程，例如甲烷生成，乙酰发生和硫酸盐还原可能导致H 2征服和副产物的产生。这些微生物活动可能会对UHS的效率和安全性产生积极和负面影响。因此，本文对多孔培养基中UHS中微生物相互作用的实验，数值和领域进行了全面综述，旨在捕获研究进度并阐明微生物效应。首先概述了UHS的主要类型和关键的微生物代谢过程。随后，本文介绍了用于研究气体岩石岩石相互作用和界面培养物，数值研究中使用的模型和模拟器的实验方法，以及实施了内部试验的程序。此外，它分析和讨论了微生物相互作用及其对多孔媒体中UHS的积极和负面影响，重点是H 2消耗，H 2流和存储安全性。©2024作者。Elsevier B.V.的发布服务代表KEAI Communications Co. Ltd.根据这些见解，网站选择的建议，工程操作以及对UHS的现场监控以及潜在的未来研究方向。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/ 4.0/）下的开放访问文章。
调节DNA的单细胞映射：蛋白质相互作用
由染色质结合因子（包括转录因子（TFS）和染色质重塑剂）策划的调节控制是负责维持细胞身份，执行细胞功能并响应环境刺激的基因表达程序的基础。这些DNA：蛋白质相互作用是通过表观遗传特征1引导的，例如组蛋白修饰和DNA甲基化（DNAME），它们建立染色质景观，调节特定因子的结合，从而根据细胞的需求雕刻功能基因组。重要的是，表观遗传失调与疾病，癌症和衰老的细胞功能障碍有关，在该疾病，癌和衰老中，异常染色质景观会改变TFS 2的结合景观，从而改变了细胞3的正常生物学过程。因此，了解TF跨不同
遗传相互作用会影响酒精使用障碍
酒精使用障碍（AUD）已知具有重要的遗传成分，但其遗传力与全基因组关联研究的发现之间仍然存在很大的差距。有助于这一差距的一个潜在因素可能是遗传相互作用，或者是遗传相互作用，这在AUD的背景下在很大程度上没有探索。这项研究的目的是调查上毒在美国印第安人的易感性和严重性中的作用，美国印第安人在美国所有族裔中表现出最高的AUD率，我们首先确定了先前与酒精依赖性和AUD相关的基因，然后通过生物学网络扩展了该基因，最终构成了3,736 Genes and Congulation elements and Interialts。最终基因集被映射到742个人的美洲印第安人队列中的476K变体。，我们对变体集进行了成对的遗传相互作用关联分析，然后进行了双集群程序，将相互作用的SNP对分组为相互作用的间隔。总共确定了114对基因相互作用对，并确定调节元素与AUD严重程度显着相关。这些基因富含免疫系统，细胞粘附，神经元和疾病途径。他们的表情在中脑GABA能神经元中特别丰富。我们的研究代表了任何人群中AUD的首次大规模遗传相互作用研究。我们的发现表明，上毒可能有助于AUD的发展和发展。
使用鼠标ICM胚胎
使用小鼠ICM胚胎Beatrice F. Tan 1，Olivier J.M.Schäffers1,2，Sarra Merzouk 1，Eric M. Bindels 3，Danny Huylebroeck 4，Joost Gribnau 1,4，CathérineDupont1，†， * 1 1 1 1， * 1 1， * 1，荷兰鹿特丹，伊拉斯mus大学医学中心，伊拉斯特大学医学中心。2荷兰鹿特丹伊拉斯mus大学医学中心妇产科和胎儿医学系。3荷兰鹿特丹伊拉斯mus大学医学中心血液学系。4荷兰鹿特丹伊拉斯mus大学医学中心的细胞生物学系。†最后一位作者。*通讯作者：c.dupont@erasmusmc.nl。抽象的基于干细胞的胚胎模型是研究早期胚胎发生的有希望的替代方法。我们介绍了两个不同的模型，以复制小鼠胚胎发育过程中胚胎内胚层和epiblast之间的动力学。诱导性GATA6（I GATA6）胚胎体（EB），仅源自I GATA6胚胎干细胞（ES）细胞，对于对原始内胚层的位置依赖性发展进行建模非常有价值。内部细胞质量（ICM）胚胎，相反，通过汇总“野生型”和i GATA6 ES细胞形成，准确，以可比的PACE模拟在E7.5到E7.5的体内发育中的相当PACE模拟。值得注意的是，ICM胚胎模型细胞分类，并通过玫瑰花结状阶段，将层级从幼稚到启动多能的过渡。此外，在该模型中缺乏胚胎外胚层样细胞，将表皮和内脏内胚层引导到前发育的命运。因此，I GATA6 EB和ICM胚胎是在小鼠早期胚胎发育过程中对细胞命运决策的理解的强大工具。引言小鼠的植入前发育标志着两个细胞命运决策，每种都会导致谱系隔离[1]。在胚泡中，第一个隔离发生在胚胎第3-3.5（e3-e3.5）的情况下，并形成了滋养型剂（TE）和内部细胞质量（ICM）。随后在ICM中随后发生了第二个隔离，并形成了原始内胚层（PRE，低纤维细胞）和层细胞。在第二个决策中运行的机制涉及位置效应，细胞分选和凋亡。随着发育的进展，PRE不仅形成顶叶内胚层，还会产生内脏内胚层（VE），当后者从幼稚到启动的多能状态过渡时，围绕着层状的内胚层（VE）。pre/ve与层细胞之间的细胞间通信以及对其的相互解释调节了这两个谱系中每一个的发展。然而，沿子宫中小鼠小鼠胚胎的差可及性，了解胚胎发生的这些阶段的参与者和基因调节网络的变化受到了复杂，重叠和冗余的分子机制的阻碍。基于干细胞的胚胎模型已成为研究哺乳动物胚胎早期发育的有吸引力的替代方法，但并非没有局限性。类囊体的发育潜力较差，因为它们的PRE（E3.5-E4）的形成仍然很困难，并且取决于各种培养添加剂[2，11]。小鼠整合性胚胎模型，例如胚胎[2-4]和ETX胚胎[5-10]，它们分别模拟了植入前和植入后发育，无法准确复制E3-E5.5之间的体内发育阶段。ETX胚胎在发育的特定阶段仍处于装配模式，因此对于从E5.5开始建模和研究胚胎发生最有用。此外，在这两个综合胚胎模型中达到高效率都构成了重要的
人工智能有何新奇之处？从社交代理视角看人机交互
在本文中，我们认为，研究社会互动和发展联合行动中的“自主感”有助于确定要在人工智能系统中实施的相关解释的内容，以使其“可解释”。自动化系统以及更广泛的人工智能 (AI) 被引入到许多领域，深刻地改变了人类活动的性质，以及主体对自己的行为及其后果的主观体验——这种体验通常被称为自主感。我们建议研究支持自动化对个人自主感影响的实证证据，从而研究其对操作员绩效、系统可解释性和可接受性等多种指标的影响。由于人工智能的一些关键特性，它在人工智能领域占有特殊地位。我们认为，这种地位促使我们从人与人关系的角度重新审视人与人工智能的互动。我们研究人类社会互动中的联合行动，以推断在社会背景下发展可靠的代理意识需要哪些关键特征，并提出这种框架可以帮助定义什么是好的解释。最后，我们提出了改善人机交互的可能方向，特别是恢复人类操作员的代理意识，提高他们对人工智能代理所做决策的信心，并提高此类代理的可接受性。
使用 DiMeLo-seq 绘制蛋白质-DNA 相互作用
我们最近开发了定向甲基化和长读测序 (DiMeLo-seq)，以绘制全基因组范围内的蛋白质-DNA 相互作用。DiMeLo-seq 能够绘制单个 DNA 分子上的多个相互作用位点，在内源性 DNA 甲基化的背景下分析蛋白质结合，识别单倍型特异性蛋白质-DNA 相互作用，并绘制难以用短读方法研究的基因组重复区域中的蛋白质-DNA 相互作用。使用 DiMeLo-seq，通过使用蛋白质 A 将 Hia5 甲基转移酶束缚到抗体上，对目标蛋白质附近的腺嘌呤进行原位甲基化。然后通过使用长读单分子 DNA 测序平台（如纳米孔测序）直接读取腺嘌呤甲基化来检测蛋白质-DNA 相互作用。在这里，我们提供了执行 DiMeLo-seq 的详细协议和实用指南。该协议可以在新鲜、轻度固定或冷冻细胞的细胞核上运行。该方案需要 1-2 天进行原位靶向甲基化，1-5 天进行文库制备（取决于所需片段长度），1-3 天进行纳米孔测序（取决于所需测序深度）。该方案需要基本
从合成社区到合成生态系统：探索植物 - 微生物 - 环境相互作用的因果关系
植物微生物群研究领域已迅速从旨在获得对微生物群组成的描述性理解的努力转变为重点是获取对微生物群功能和装配规则的机械见解。这一进化是由我们建立综合成本构成的植物相关的微生物和toreconstructMeaningfulmicrobial合成群落（Syncoms）的能力所驱动的。我们认为，这种强大的解构 - 重建策略可用于重建日益复杂的合成生态系统（Synecos），并机械地理解高级生物组织。从简单到更高级，完全易处理和可编程的gnotobiotic合成生物的过渡正在进行中，并旨在通过工程来合理地简化自然生态系统。这种重构生态方法代表了弥合生态生物学和功能生物学之间差距以及揭开植物的差距的尚未开发的策略 - 微生物群 - 调节生态系统健康，组装和功能的环境机制。
水稻现象选择的表现：种群大小和基因型 - 环境相互作用对预测能力的影响
现象预测（PP）是一种利用近红外光谱（NIRS）数据的新方法，为育种应用提供了基因组预测（GP）的替代方法。在PP中，高光谱关系矩阵取代了基因组关系矩阵，可能会导致添加剂和非加性遗传效应。与GP相比，PP具有成本和吞吐量的优势，但影响其准确性的因素尚不清楚，需要定义。本研究研究了各种因素的影响，即训练人群的规模，多种环境信息整合以及基因型X环境（GXE）效应对PP的影响与GP相比。我们评估了在四种不同环境中种植的水稻多样性面板中的几种农艺上重要特征（开花，植物高度，收获指数，千粒体重和谷物氮含量）的预测准确性。培训人群规模和GXE效应包容对PP准确性的影响最小。影响PP准确性的关键因素是包括的环境数量。使用来自单个环境的数据，GP通常超出执行的PP。但是，使用来自多个环境的数据，使用基因型随机效应和每个环境的关系矩阵，PP获得了与GP的可比精度。与使用单个信息源相比，将PP和GP信息组合在一起（例如，GP，PP的平均预测能力以及GP和合并的GP和PP的平均预测能力分别为0.44、0.42和0.44）。我们的发现表明，当所有基因型至少具有一个NIRS测量值时，PP可以与GP一样准确，这可能为水稻育种计划提供重要优势，降低育种周期并降低计划成本。