遗传性视网膜营养不良 [IRD] 是导致严重视力丧失的常见原因,这种视力丧失是由致病性基因变异引起的。眼睛是测试遗传性疾病临床转化方法的理想靶器官。4 年前,第一种治疗常染色体隐性 IRD、RPE65 连锁莱伯先天性黑蒙(2 型)的基因补充疗法获得批准,证明了这一点。然而,并非所有疾病都适合使用基因补充疗法治疗,这凸显了需要采用替代策略来克服这种补充治疗方式的局限性。随着 CRISPR-Cas9 平台的发现,基因编辑越来越受到关注。与以前的基因编辑技术相比,CRISPR-Cas9 具有多种优势,因为它可以以高效、特定和可修改的方式促进靶向基因编辑。CRISPR-Cas9 研究的进展意味着基因编辑是治疗 IRD 的可行策略。本综述将重点介绍 CRISPR-Cas9 的背景,并强调使用 CRISPR-Cas9 进行基因编辑与传统基因补充疗法之间的差异。此外,我们将回顾导致首次 CRISPR-Cas9 试验的研究,该试验用于治疗 CEP290 相关的莱伯先天性黑蒙症(10 型),并概述 CRISPR-Cas9 技术在治疗 IRD 方面的未来方向。
1 UMR 5554 ISEM(IRD,UM,CNRS,EPHE),UNIV MONZONLIER,PACA EUGENE BATAILON,34095 MONTPELLIER CEDEX 5,法国2,Museum 2 Museum Naturkunde,Leibniz Institute for Evolution and Biovive Science Institute for Invelosity and Bioviverity Science,Invalidstr。 div>43,10115德国柏林3 CEFE,CEFE,UNIV MONTPELLIER,CNRS,EPHE-PPSL大学,IRD,IRD,CNRS校园1919 De Mende,34293 Montpellier Cedex Cedex 5 France 5 France 4次生生态实验室,沿海研究,海洋研究部沿海地区,海洋研究部。 Chile, Santiago, Casilla 114-D, Santiago, Chile 5 Institute of Environmental and Evolutionary Sciences (ICAEV), Universidad Austral de Chile, Valdivia, Chile 6 Ictioplankton Laboratory (Labiti), Institute of Biologist, Faculty of Sciences, University of Valparas of Valparaso, Chile 8 Millennium nucleus for Ecology and Conservation of Temperate中间礁生态系统(Nutme)
抽象目的基因组测序(GS)有望减少罕见疾病遗传学的诊断差距。我们旨在评估基于基因组分析的可扩展框架“超越外显子”的遗传性视网膜变性患者(IRD)或遗传性神经病变(ION)。方法在常规诊断中使用IRD/ION的1000个探针上进行无PCR的短读GS。互补的全血RNA测序(RNA-Seq)是在74例患者中进行的。为结构变体(SV)调用和组合RNA/DNA变异解释优化了开源生物信息学分析管道。结果在57.4%的病例中确定了明确的遗传诊断。对于另外16.7%,在已知的IRD/离子基因中鉴定出了不确定意义的变异,而潜在的遗传原因在25.9%中仍未解决。svs或非编码基因组区域的变化占观察到的变体的12.7%。RNA-seq研究支持了两个不清楚的变体的分类。结论GS在临床实践中是可行的,并可靠地识别了很大一部分个体中的因果变异。gs将诊断产率扩展到罕见的非编码变体,并可以精确确定SV。RNA-Seq的附加诊断值受到血液中主要IRD疾病基因的低表达水平的限制。
1学校或公共卫生,大学,布鲁塞尔,布鲁塞尔,比利时2全球健康主题,大学或英国铅,英国3毛血管ICU,St-luc大学,大学阳光大学,大学天主教大学,卢万,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔。 Kinshasa乡村官员,德意志Slellish Fur International类似的样本,Kinhashasa,Democtation Republic或Cong 5系或重症监护医学,St-St-Luc大学,Catholique the Louvain,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,6次复位。名誉,EM教授。 viology&viral免疫学,大学已故,比利时7 CEPED,可持续发展研究所(IRD),IRD宇宙研究所,ERL IRD INSERM SERY,和平8,Arendir Mountin Voying Inc,CA,美国;前比利时部或国防部的Vub(布鲁塞尔)和Kuleuven教授1学校或公共卫生,大学,布鲁塞尔,布鲁塞尔,比利时2全球健康主题,大学或英国铅,英国3毛血管ICU,St-luc大学,大学阳光大学,大学天主教大学,卢万,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔。 Kinshasa乡村官员,德意志Slellish Fur International类似的样本,Kinhashasa,Democtation Republic或Cong 5系或重症监护医学,St-St-Luc大学,Catholique the Louvain,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,布鲁塞尔,6次复位。名誉,EM教授。viology&viral免疫学,大学已故,比利时7 CEPED,可持续发展研究所(IRD),IRD宇宙研究所,ERL IRD INSERM SERY,和平8,Arendir Mountin Voying Inc,CA,美国;前比利时部或国防部的Vub(布鲁塞尔)和Kuleuven教授
遗传性视网膜疾病 (IRD) 是一种慢性遗传性疾病,会导致视网膜逐渐退化。疾病病因源于遗传或新生基因突变,大多数 IRD 是由点突变引起的。鉴于 IRD 数量众多,迄今为止,已在约 280 个基因中发现了导致这些营养不良的突变。然而,目前只有一种 FDA 批准的基因增强疗法 Luxturna (voretigene neparvovec-rzyl) 可用于 RPE65 介导的视网膜色素变性 (RP) 患者。虽然其他基因的临床试验正在进行中,但这些技术通常涉及基因增强而不是基因组手术。虽然基因增强疗法将健康的 DNA 副本传递给视网膜细胞,但基因组手术使用基于成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 的技术来纠正内源性基因组序列中的特定基因突变。一种称为 prime editing (PE) 的新技术应用了基于 CRISPR 的技术,该技术有可能纠正所有 12 种可能的转换和颠换突变以及小插入和缺失。EDIT-101 是一种基于 CRISPR 的疗法,目前正在临床试验中,它使用双链断裂和非同源末端连接来消除 CEP290 基因中的 IVS26 突变。最好是,PE 不会导致双链断裂,也不需要任何供体 DNA 修复模板,这突显了其无与伦比的效率。相反,PE 使用逆转录酶和 Cas9 切口酶来修复基因组中的突变。虽然这项技术仍在发展中,还有几个挑战尚待解决,但它为 IRD 治疗的未来带来了希望。
作者:克拉拉菜单1,Laure Pecquerie 2,Cedric Bacher 3,Mathieu Doray 4,Tarek Hattab 5,5 Jeroen van der Kooij 6,Martin Huret 1 1 1 1解(生态系统动力学和可持续性) 6539 CNRS/UBO/IRD/IFREMER,LEMAR-IUEM,PLOUZANé,法国,10 3 Ifremer,Dyneco,dyneco,f-29280,法国Plouzané,法国4解码(生态系统动力学和可持续性)法国Sète的Ifremer和Ird 6环境,渔业和水产养殖科学中心,Lowestoft,英国,英国15通讯作者:Clara菜单,clara.menu@ifremer.fr,Ifremer Center Bretagne LBH,29280Plouzané20
摘要。不规则指数本质上是拓扑指数。它们对于确定非规范图的分子结构的定量形态非常有帮助。定量结构 - 特性关系(QSPR)和定量结构 - 活性关系(QSAR)都在很大程度上取决于图中异常的计算。它由几种化学和物理特征组成,包括抗性,焓,熵,毒性,熔融和沸点以及熵。本文研究了不同不规则性指数在碳纳米酮分子网络中识别不规则度测量(IMS)CNC T(M)的应用,t = 4、5和T。我们使用了不同的不规则指标,例如IRDIF(ξt),AL(ξt),IRL(ξt),IRLU(ξt),IRLF(ξT),IRF(ξT),IRLA(ξT),IRLA(ξt),IRD 1(IRD 1(IRD 1(ξt),IRA(ξt),IRA(IRA(IRA),IRA(IRA(IRA),IRGA(IRGA(IRGA),IRGA(IRGA(IRGA)),IRB(IRB),IRB(ξT)在CNC 4(M),CNC 5(M)和CNC T(M)中的不规则性比较图形测量也已被阐明并提出。我们有兴趣创建新的公式,以便使用上述指数更好地了解碳纳米酮中的不规则度量。
通过cerkl基因突变看到的引起视网膜营养不良的北印度人口班萨尔*(1,2,3),debojyoti chakraborty(1)(1)(1)CSIR-基因组学和综合生物学研究所,德里,(2)景点研究,fortis Indiperies,fortis Indies Indive Isporties Indive Isporties Indive Indive Indive Indive Isporties Indive Indiperies,Instriped Isporties Indive Isporties Indive Isporties Indive Isporties Indive Isportion*临床特征,CERKL基因突变的基因型表型相关性,这是我们在印度北部的同类中看到的遗传性视网膜营养不良(IRD)患者的最常见基因突变之一。 材料和方法:研究包括临床诊断患有IRD的患者。 患者进行了超广阔的菲尔德(UWF)眼底照片,眼底自动荧光(FAF),光学相干断层扫描(OCT)。 完成了谱系图表。 下一代测序(NGS)进行遗传测试,分析了临床外显子组。 结果:我们报告了35例选择接受遗传测序的35例CERKL基因突变患者的眼科和遗传发现(在我们的62名22名IRD患者中)。 年龄从17至45岁(中位数25岁)不等。 视觉范围从logmar 0.18到1.8。 OCT显示出103至268微米的中央黄斑厚度(CMT)。 多数患者的眼底表现出黄斑色素的变化,其萎缩,消除或有限的周围视网膜色素变化;轻度的视盘苍白和最小的血管衰减。 在黄斑处的斑点低荧光是最常见的发现,视网膜周围的低自露倍率最小。通过cerkl基因突变看到的引起视网膜营养不良的北印度人口班萨尔*(1,2,3),debojyoti chakraborty(1)(1)(1)CSIR-基因组学和综合生物学研究所,德里,(2)景点研究,fortis Indiperies,fortis Indies Indive Isporties Indive Isporties Indive Indive Indive Indive Isporties Indive Indiperies,Instriped Isporties Indive Isporties Indive Isporties Indive Isporties Indive Isportion*临床特征,CERKL基因突变的基因型表型相关性,这是我们在印度北部的同类中看到的遗传性视网膜营养不良(IRD)患者的最常见基因突变之一。材料和方法:研究包括临床诊断患有IRD的患者。患者进行了超广阔的菲尔德(UWF)眼底照片,眼底自动荧光(FAF),光学相干断层扫描(OCT)。完成了谱系图表。遗传测试,分析了临床外显子组。结果:我们报告了35例选择接受遗传测序的35例CERKL基因突变患者的眼科和遗传发现(在我们的62名22名IRD患者中)。年龄从17至45岁(中位数25岁)不等。视觉范围从logmar 0.18到1.8。OCT显示出103至268微米的中央黄斑厚度(CMT)。多数患者的眼底表现出黄斑色素的变化,其萎缩,消除或有限的周围视网膜色素变化;轻度的视盘苍白和最小的血管衰减。在黄斑处的斑点低荧光是最常见的发现,视网膜周围的低自露倍率最小。所有患者的遗传测序均显示出相同的突变,在CERKL基因的外显子7(CHR2:G.181548785_181548786DEL)中是2个碱基对缺失。偶然,所有患有CERKL基因突变的患者均来自一个族裔群落,提示创始人突变效应。结论:CERKL基因结果中的突变是印度北部IRD的最常见原因之一。受影响的患者显示出明确的早期黄斑受累。这项研究报告了在印度北部一个大种族社区中Cerkl基因中的创始人突变效应的存在。关键词:创始人突变,CERKL基因突变,基因型表型相关,遗传性视网膜营养不良(IRD),色素性视网膜炎(RP)
遗传性视网膜营养不良(IRD)以及遗传复杂的视网膜表型代表了异体的眼部疾病群,这都是由于其表型和基因型特征。因此,临床特征的重叠通常会复杂甚至会阻碍其正确的临床诊断。解密视网膜疾病的分子基础不仅有助于其疾病分类,而且还有助于我们理解不同的分子病理学如何具有共同的病理机理。尤其是与有助于细胞完整性的两个关键过程的失调有关,即细胞外基质(ECM)稳态和膨胀。在Bruch膜的ECM中的病理变化都在单基因IRD中进行了描述,例如Sorsby fordus营养不良(SFD)和Doyne Honeycomb视网膜营养不良(DHRD),以及遗传上与年龄相关的黄斑变性(AMD)ORIABETIC DENENERATION(AMD)ORIABETIC VENINOPETY(DR)。此外,补体系统功能障碍和扭曲的免疫调节也可能代表某些IRD与复杂的视网膜变性之间的共同联系。通过强调分子病理中的这种重叠,该评论的目的是阐明健康视网膜中的炎症过程和ECM稳态如何联系在一起,以及它们的相互作用如何在衰老和疾病中受到干扰。
1个组织和水生生态系统的统一生物学(UMR 8067 BOREA),CAEN-NORMANDIE大学,Muséum自然历史,索邦大学,CNRS,IRD,IRD,Antilles,Antilles,Esplanade de la la Paix,14032 Caen,法国,法国; cottilde.berthelin@unicaen.fr(C.B.); melanie.lepoittevin@unicaen.fr(M.L。)2法国海洋运营研究所(IFREMER)的实验室框架资源,法国大街,dugénéralde ral de Gaulle,14520年,法国法国贝辛·赫珀港; laurent.dubroca@ifremer.fr(L.D.)3服务单位Platon,Virtual'His,联邦结构4207“ Normandie Oncologie”,诺曼底大学Unicaen,法国14000 CAEN; nicolas.elie@unicaen.fr *通信:carine.sauger@gmail.com(C.S.); kristell.kellner@unicaen.fr(K.K.)†12月。