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具有生成深度学习
遵循序列和结构旋转，预测实施生物学功能的蛋白质的动力学机制仍然是一个杰出的科学挑战。几种实验技术和分子动力学（MD）模拟原则上可以确定构象状态，结合构型及其概率，但吞吐量较低。在这里，我们开发了一种生物分子模拟器（BioEmu），这是一种生成深度学习系统，可以在单个图形处理单元上每小时从蛋白质结构集合中生成数千个独立的独立样品。通过利用新颖的培训方法和蛋白质结构的大量数据，超过200毫秒的MD模拟以及实验蛋白质稳定性，BioeMu的蛋白质集合代表了一系列具有挑战性且实际相关的指标的平衡。在定性上，生物EMU采样了许多与功能相关的构象变化，范围从隐性口袋的形成，到特定蛋白质区域的展开，到大型域的后方范围。定量地，生物EMU对蛋白质构象与1 kcal/mol左右的相对自由能误差进行了构象构象，以验证了毫秒timesscale MD模拟和实验测量的蛋白稳定性。通过同时模拟结构集合和热力学特性，生物EMU揭示了机械洞察力，例如突变体折叠不稳定的原因，并可以有效地提供实验性检验的假设。
使用土著酵母乳酸启动器联盟开发发酵麦面粉
这项研究旨在使用从Dahi（一种流行的印度发酵乳制品）中分离出的天然酵母乳酸启动联盟来开发发酵的小麦粉（FWF）。酵母菌和乳酸细菌（LAB）从当地家用达希样品中分离出来，以评估其牛奶发酵潜力。分子方法用于鉴定实验室分离株，而使用碳水化合物发酵型鉴定酵母菌株。用实验室分离乳杆菌和酵母分离型念珠菌球形乳杆菌制备达希样品，它们的组合显示出优质的感觉得分。使用实验室，酵母及其组合制备FWF，并对基于FWF的汤进行感觉评估。与市售的小麦粉/atta相比，制备的FWF含量较低（6％），碳水化合物（71.14％）和热量值（345.4 kcal）含量。微生物分析表明，大肠菌群，大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的不存在，表明卫生制剂并抑制了变质和致病性细菌。FWF的低水分含量和酸性pH（4.4）有助于其存储稳定性。总而言之，使用DAHI的本机实验室生产的发酵小麦粉是一种具有成本效益，储存稳定的功能性食品，具有实用有益的微生物，适合促进肠道健康。
鉴定托鲁巴姆中作为 AKT1 调节剂对抗乳腺癌的新型生物活性植物化学物质：一种计算机模拟方法
摘要：Solanum torvum L. 是一种常见于印度次大陆的野生药用植物。AKT1 是抗乳腺癌的极佳抗癌靶点，因为抑制 AKT1 会降低细胞侵袭和运动能力，尽管 AKT1 激活可能会促进细胞生长。在本研究中，S. torvum 中的十种生物活性植物化学物质与乳腺癌相关靶蛋白 AKT1 对接，并与已知药物他莫昔芬进行比较。在十种生物活性化合物中，三种植物化学物质，螺甾烷-3,6-二酮、绿原酸和 β-谷甾醇-d-葡萄糖苷，与标准他莫昔芬相比表现出更高的结合能力，对接得分分别为 -17.4、-12.2 和 -11.5 Kcal/mol。这些热门生物活性化合物的结构稳定性和反应性基于前沿分子轨道进行了进一步研究，电子光谱通过密度泛函理论在 B3LYP/6-311 G 水平上揭示了激发态。观察到的电子跃迁为 π→π* 和 → *。根据吸收、分布、代谢、排泄、毒性和生理化学参数评估了热门生物活性化合物的药物相似性特征。这项计算机研究将促进 S. torvum 在常规治疗中的应用，并启动体外模型以开发治疗乳腺癌的新药。
生物质发电厂的潜在发展
在PONU转移地区开发生物质发电厂（PLTBM）的潜力，以支持边境国家战略区（PKSN）的发展。到2025年底之前，可再生能源的目标（EBT）为23％，而在2023年，EBT能量混合物仍为13.09％。本研究旨在分析PONU转移区域中开发PLTBM的潜力，以实现EBT目标作为发电厂。通过EBT提供电力是满足处境不利，最外向和偏远地区（3T）的电力需求的解决方案，例如位于Kefamenanu PKSN边界的PONU透射区。EBT的替代来源来自地热，水力发电，太阳能，风，生物量和废物。在通过生物量实现的角度来看，移民获得了大约2公顷的院子土地和商业土地的权利，可以用合适的生物质种植。该研究的结果在PONU中获得了几种替代生物量植物，即竹，Gamal，Gewang，Lontar和Thorn Trees。Gamal非常适合PLTBM的原材料，因为社区熟悉它，并且可以在PONU中很容易生长，PONU的降雨量最小，而Gamal Firewood的热量价值为4,900 kcal/kg。现有面积约为5,222公顷，可用于1 MW
Icacina 物种：选定的多靶点分子对接
摘要：利用计算机模拟评估了 Icacinol、Icacenone 和 Icaceine 对金黄色葡萄球菌的活性。使用 SwissDock 将化合物与六种蛋白质 2ZCO、1JIJ、1TVF、1N67、3TTZ 和 4H8E 对接。将结果与头孢他啶、庆大霉素、环丙沙星和亚胺培南对相同蛋白质的结果进行比较。使用 SwissADME 评估具有最佳结合亲和力的化合物的药物相似性。Icaceine (-7.45 kJ/mol) 对 1TVF 的结合亲和力与环丙沙星 (-7.44 kJ/mol) 和亚胺培南 (-7.58 kJ/mol) 相当。Icacinol (-7.68 kJ/mol) 对 3TTZ 的结合亲和力与环丙沙星 (-7.94 kcal/mol) 相当。伊卡西诺 (-7.46 kJ/mol) 对 1N67 的结合能与亚胺培南 (7.29 kJ/mol) 和环丙沙星 (-7.40 kJ/mol) 相当。伊卡西诺和伊卡西酮的结合能分别为 -6.40 kJ/mol 和 -6.75 kJ/mol，对 2ZCO 的亲和力与环丙沙星 (-6.49 kJ/mol) 相当。伊卡西诺 (-6.44 kJ/mol) 和伊卡西酮 (-6.80 kJ/mol) 对 4H8E 的结合能与环丙沙星 (-6.85 kJ/mol) 相当，而伊卡西诺 (-7.55 kJ/mol) 对环丙沙星 (-8.08 kJ/mol) 的结合能与环丙沙星 (-8.08 kJ/mol) 相当。伊卡西诺和伊卡西酮满足 Lipinski 的药物相似性条件。这两种化合物都显示出作为治疗金黄色葡萄球菌引起疾病的抗菌剂的前景。
英国政府的目标是到 2035 年利用太阳能发电 70 吉瓦。迅速实现这一目标将是实现目标的重要组成部分
1 根据规划，我们假设这三个太阳能发电场将占用 35 公顷 2 级农业用地、292 公顷 3a 级土地、1,339 公顷 3b 级土地和 411 公顷 4 级土地（参见：Gate Burton、Mallard Pass 和 Sunnica）。这些计划表明，农业生产力最高的 1 级土地不受影响。我们假设 2 级和 3a 级土地是可耕地（英格兰的可耕地面积大约等于英格兰 1、2 和 3a 级土地的面积），动物在 3b 级和 4 级土地上放牧。因此，我们根据国家粮食战略的分析估算了这些地区的产量损失百分比，即英国 84% 的卡路里产量来自 37% 的可耕地，16% 的卡路里产量来自 63% 的放牧农田。根据英国每人每天的卡路里供应量估计为 3.344 千卡，其中 49% 的卡路里是在国内生产的，我们计算出这三个太阳能发电场将损失多少卡路里。相比之下，使用标准的能量密度估计值，2024 年小麦产量与 2023 年相比减少了 27%，这比三个太阳能发电场造成的粮食损失高出 5,761 倍。
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具有轴手性和对称性的双苯并[rst]五芬……
探索由两个多环芳烃 (PAH) 单元组成的新型联芳烃是进一步开发具有独特性能的有机材料的重要策略。在本研究中，采用一种高效、通用的方法合成了具有两个苯并[rst]五芬 (BPP) 单元的 5,5′-联苯并[rst]五芬 (BBPP)，并通过 X 射线晶体学明确阐明了其结构。BBPP 表现出轴手性，通过手性高效液相色谱法拆分 (M)- 和 (P)-对映体，并通过圆二色光谱法进行研究。根据密度泛函理论计算，这些对映体具有相对较高的异构化能垒，为 43.6 kcal mol − 1。单体 BPP 和二聚体 BBPP 用紫外可见吸收和荧光光谱、循环伏安法和飞秒瞬态吸收光谱进行表征。结果表明，BPP 和 BBPP 均从形式上暗的 S 1 电子态发出荧光，这是通过借用相邻的亮 S 2 态的 Herzberg-Teller 强度实现的。虽然 BPP 表现出相对较低的光致发光量子产率 (PLQY)，但由于借用了更大的 S 2 强度，BBPP 表现出显著增强的 PLQY。此外，在不同极性溶剂中进行的光谱研究表明 BBPP 中存在对称性破坏电荷转移。这表明通过适当的分子设计，此类 𝝅 延伸的联芳烃具有很高的单重态裂变潜力。
红色伯特利叶（Piper Crocatum）的潜力为...
抽象的黑绿色是一种色素沉着障碍，是由黑色素合成过多的面部或颈部周围的棕色斑块形式引起的。黄色素可能会影响所有种族群体，尤其是紫外线辐射高的地区。通常用于预防色素沉着的物质是曲酸，硫酸和汞，但如果连续使用，这些物质是致癌的。红色槟榔（Piper Crocatum）具有活性化合物，可作为抗氧化剂，例如类黄酮和苯酚。本研究旨在确定红槟榔叶的活性化合物对酪氨酸酶抑制的潜力。这项研究是在硅和体外方法中进行的。所使用的受体是酪氨酸酶，酪氨酸酶，具有PDB代码5M8O，Tropolone作为天然配体和Kojic Acid作为比较配体。总共将34种来自LC-MS的红槟榔叶和GC-MS分析的活性化合物用作测试配体。使用Autodock Vina和Autodock工具进行分子对接，并使用Ligplot +和Pymol进行了可视化。体外酪氨酸酶抑制使用酪氨酸酶活性测定试剂盒AB252899和曲酸作为阳性对照。儿茶素化合物具有最小的结合自由能（ΔG），即-6.7 kcal/mol，抑制作用的动力学为12.12M。体外测试结果，水分分数具有最大的酪氨酸酶抑制活性84.84％，而Kojic Acid的活性为82.47％。关键字：hiperpigmentation，elasm，分子对接，吹笛者鳄鱼酶，酪氨酸酶
基于配体的针对细菌转录的新型抗金黄色葡萄球菌抗菌药物设计
摘要：金黄色葡萄球菌是一种常见的人类共生病原体，可引起多种传染病。由于抗生素耐药性的产生，病原体对越来越多的抗生素产生耐药性，从而产生了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 (MRSA) 甚至耐多药金黄色葡萄球菌 (MDRSA)，即“超级细菌”。这种情况凸显了对新型抗菌药物的迫切需求。细菌转录负责细菌 RNA 的合成，是开发抗菌药物的有效但未充分利用的靶点。之前，我们报道了一类新型抗菌药物，称为 nusbiarylins，它通过中断两种转录因子 NusB 和 NusE 之间的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 来抑制细菌转录。在这项工作中，我们根据 nusbiarylins 的化学结构及其对金黄色葡萄球菌的活性开发了一种基于配体的工作流程。整合了基于配体的模型（包括药效团模型、3D QSAR、AutoQSAR 和 ADME/T 计算），并用于以下 ChemDiv PPI 数据库的虚拟筛选。结果，四种化合物（包括 J098-0498、1067-0401、M013-0558 和 F186-026）被鉴定为针对金黄色葡萄球菌的潜在抗菌剂，预测的 pMIC 值范围为 3.8 至 4.2。对接研究表明这些分子与 NusB 紧密结合，结合自由能范围为 -58 至 -66 kcal/mol。
生物能量学
4-下列哪一项关于生化反应中自由能变化（ΔG）的陈述是正确的？A. 如果ΔG为负，则反应会自发进行，同时损失自由能。B. 在放能反应中，ΔG为正。C. 当反应物浓度为 1.0 mol/L 且 pH 值为 7.0 时，标准自由能变化表示为ΔG0 D. 在吸能反应中，ΔG为负。5-如果反应的 ΔG 为零：A. 反应实际上会完成并且基本上是不可逆的。B. 该反应是吸能的。C. 该反应是放能的。D. 只有在可以获得自由能的情况下，反应才会进行。E. 系统处于平衡状态，没有发生净变化。 6-ΔG0' 定义为以下情况下的标准自由能电荷：A. 反应物的浓度为 1.0 mol/LB 反应物的浓度为 1.0 mol/L，pH 值为 7.0。C. 反应物的浓度为 1.0 mmol/L，pH 值为 7.0。D. 反应物的浓度为 1.0 μmol/LE 反应物的浓度为 1.0 mol/L，pH 值为 7.4。7-如果 ΔG ⁰ = -10 kcal/mole，则意味着：A) 该反应是非自发的 B) 该反应可与吸能反应相结合 C) 该反应速度较慢 D) 该反应可能是水解反应 E) B+D