Hang Thi Thuy Gander-Bui, 1 , 2 Jo € elle Schl € afli, 1 Johanna Baumgartner, 1 , 2 Sabrina Walthert, 1 Vera Genitsch, 3 Geert van Geest, 4 Jose´ A. Galva´ n, 3 Carmen Cardozo, 3 Cristina Graham Martinez, 3 Mona Grans, 5 Sabine Muth, 5 Re´ my Bruggmann,4 Hans Christian Probst,5 Cem Gabay,6和Stefan Freigang 1,7, * 1, * 1伯恩伯恩伯恩伯恩大学组织医学与病理学研究所实验病理学,瑞士大学2研究生院2伯尔尼大学伯尔尼,伯尔尼,瑞士3012伯尔尼,3012瑞士4 Interfulty BioInformatics和瑞士生物信息学研究所,伯恩大学,3012,瑞士伯恩,瑞士5. 55131 MAINZ大学医学中心,德国55131 Mainz 6 6 6瑞士大学医院,瑞士大学医院,瑞士大学医院7号风湿病学司。 stefan.freigang@unibe.ch https://doi.org/10.1016/j.immuni.2023.06.023
癌症疗法的发展受到合适药物靶点的限制。可以根据合成致死率 (SL) 的概念来识别潜在的候选药物靶点,SL 指的是基因对,对于这些基因对来说,单独一个基因的畸变不会致命,但畸变同时发生则会对细胞造成致命影响。在这里,我们介绍了 SLIdR(R 中的合成致死率识别),这是一个用于从大规模扰动筛选中识别 SL 对的统计框架。即使样本量很小,SLIdR 也能成功预测 SL 对,同时最大限度地减少假阳性靶点的数量。我们将 SLIdR 应用于 Project DRIVE 数据,并找到已建立和潜在的泛癌症和癌症类型特异性 SL 对,这与文献和药物反应筛选数据的结果一致。我们通过实验验证了肝细胞癌中预测的两种 SL 相互作用(ARID1A-TEAD1 和 AXIN1-URI1),从而证实了 SLIdR 识别潜在药物靶点的能力。
摘要:植物混合杀伤力是指父母正常的现象,但是它们的杂种后代表现出异常发育甚至死亡,并且被归类为一种生殖隔离的杂种后形式。生殖隔离在物种形成和维持物种完整性中起着至关重要的作用,但也可能阻碍高质量种质资源的发展。克隆混合杀伤力基因并分析其功能有助于丰富我们对物种进化和形成机理的理解。本文在细胞,遗传和分子水平的植物杂交杀伤力方面的研究进展进行了全面概述,探讨了杂交致死性的分子机制,加深了我们对这种现象的理解,并为未来相关研究提供了一些参考。
Optimizing transcriptome-based synthetic lethality predictions to improve precision oncology in early-stage breast cancer: BC-SELECT Yewon Kim 1 , Matthew Nagy 2 , Rebecca Pollard 1 , *Padma Sheila Rajagopal 1,3 1 Cancer and Data Science Laboratory, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, MD 2 Boston Children's Hospital, Boston, MD 3 Women's恶性分支,癌症研究中心,国家癌症研究所,贝塞斯达,医学博士摘要单词计数:246个单词单词计数:3,649个单词参考文献:75参考图 /表计数:图:4表:2表:2补充图:2补充表:2补充表:3个补充表:3个通信作者:PADMA SHEILA RAJAGOPAL,MD MSC MSSC MSSC PORDICAIN 4B PRODENATIAN:10贝塞斯达,医学博士20892电子邮件:sheila.rajagopal@nih.gov电话:240-858-3169跑步标题:BC-SELECT:早期乳腺癌的治疗反应预测
蛋白质磷酸化过程是调节身体各种功能的关键,包括心脏泵血能力。该过程由一种称为蛋白激酶的酶控制,这种酶将磷酸基团添加到目标蛋白质上的特定氨基酸上。这种修饰会改变蛋白质的结构,导致其活性和与其他分子的相互作用发生变化。酶活性的破坏是心脏僵硬的关键原因。
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参考文献•凯利·RI,罗宾逊D,普芬伯格,例如施特劳斯·卡,莫顿DH。Amish致死性畸形:一种新的代谢疾病,具有严重的先天性小头畸形和2-酮戊二酸尿。Am J Med Genet。2002年11月1日; 112(4):318-26。 doi:10。 1002/ajmg.10529。 引用于PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12376931)•korf br。 神经遗传学的新内容? Amish小头畸形。 Eur J Paediatrneurol。 2003; 7(6):393-4。 doi:10.1016/j.ejpn.2003.09.005。 没有抽象可用。 引用PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14623217)•Lindhurst MJ,Fiermonte G,Song S S,Struys E,De Leonardis E,De Leonardis F,Schwartzberg pl,Schwartzberg pl,Chen a,Chen a,Chen a,Castegna a,castegna a,castegna a,verhebies n,bies bies bies bies bies beck b,Mathere ckk,Mathere ck,Mathereck,Mathereck。 敲除SLC25A19导致线粒体硫胺素吡啶磷酸盐耗竭,胚胎杀伤性,CNS畸形和贫血。 Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Oct24; 103(43):15927-32。 doi:10.1073/pnas.0607661103。 Epub 2006年10月11日。 引用PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17035501)或PubMed Central上的免费文章(https://www.ncbi.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmc/articles/pmc1595310/) Fiermonte G,Hilliard MS,Kocht,Kalikin LM,Makalowska I,Morton DH,Petty EM,Weber JL,Palmieri F,Kelleyri,Kelleyri,Schaffer AA,Biesecker LG。 突变的脱氧核苷酸载体与象征小头畸形有关。 nat Genet。 2002年9月; 32(1):175-9。 doi:10.1038/ng948。 Epub 2002 8月19日。 引用于PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12185364)2002年11月1日; 112(4):318-26。 doi:10。1002/ajmg.10529。引用于PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12376931)•korf br。神经遗传学的新内容?Amish小头畸形。Eur J Paediatrneurol。2003; 7(6):393-4。 doi:10.1016/j.ejpn.2003.09.005。没有抽象可用。引用PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14623217)•Lindhurst MJ,Fiermonte G,Song S S,Struys E,De Leonardis E,De Leonardis F,Schwartzberg pl,Schwartzberg pl,Chen a,Chen a,Chen a,Castegna a,castegna a,castegna a,verhebies n,bies bies bies bies bies beck b,Mathere ckk,Mathere ck,Mathereck,Mathereck。敲除SLC25A19导致线粒体硫胺素吡啶磷酸盐耗竭,胚胎杀伤性,CNS畸形和贫血。Proc Natl Acad Sci U S A.2006 Oct24; 103(43):15927-32。 doi:10.1073/pnas.0607661103。 Epub 2006年10月11日。 引用PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17035501)或PubMed Central上的免费文章(https://www.ncbi.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmc/articles/pmc1595310/) Fiermonte G,Hilliard MS,Kocht,Kalikin LM,Makalowska I,Morton DH,Petty EM,Weber JL,Palmieri F,Kelleyri,Kelleyri,Schaffer AA,Biesecker LG。 突变的脱氧核苷酸载体与象征小头畸形有关。 nat Genet。 2002年9月; 32(1):175-9。 doi:10.1038/ng948。 Epub 2002 8月19日。 引用于PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12185364)2006 Oct24; 103(43):15927-32。 doi:10.1073/pnas.0607661103。Epub 2006年10月11日。引用PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17035501)或PubMed Central上的免费文章(https://www.ncbi.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmc/articles/pmc1595310/) Fiermonte G,Hilliard MS,Kocht,Kalikin LM,Makalowska I,Morton DH,Petty EM,Weber JL,Palmieri F,Kelleyri,Kelleyri,Schaffer AA,Biesecker LG。突变的脱氧核苷酸载体与象征小头畸形有关。nat Genet。2002年9月; 32(1):175-9。 doi:10.1038/ng948。Epub 2002 8月19日。引用于PubMed(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12185364)
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供(未经同行评审认证),作者/资助者已授予 bioRxiv 许可,可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2024 年 10 月 25 日发布了此版本。;https://doi.org/10.1101/2024.10.25.620277 doi:bioRxiv 预印本
Jean Ching-Yi Tien, 1,2 Jie Luo, 1,2,14 Yu Chang, 1,2,14 Yuping Zhang, 1,2,14 Yunhui Cheng, 1,2,14 Xiaoju Wang, 1,2 Jianzhang Yang, 3,4 Rahul Mannan, 1,2 Somnath Mahapatra, 1,2 Palak Shah, 1,2 Xiao-Ming Wang, 1,2 Abigail J. Todd, 1,2 Sanjana Eyunni, 1,2 Caleb Cheng, 1 Ryan J. Rebernick, 1,2 Lanbo Xiao, 1,2 Yi Bao, 1,2 James Neiswender, 5 Rachel Brough, 5 Stephen J. Pettitt, 5 Xuhong Cao, 1,2 Stephanie J.), arul@med.umich.edu (A.M.C.)https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101758
在这次上诉之后,2023年12月22日,联合国大会通过了“致命自治武器系统”第78/241号决议,有152个州投票支持该决议。2这是联合国大会自主武器系统的第一个决议。最初是由奥地利在联合国大会第一委员会引入的,由43个共同赞助国家组成的跨区域群体“强调国际社会的迫切需要应对国际社会的迫切需求,以应对自主武器系统提出的挑战和关注点,并要求秘书对成员国的观点和范围的挑战,以挑战属于杀死的武器,并在范围内提出挑战,并在范围内提出挑战。人道主义,法律,安全,技术,技术和道德观点以及人类在使用武力中的作用,并提交一份实质性报告,反映了包含这些观点的附件,并在其第七十九会议上向大会进行了全部观点,以进一步讨论成员国。”3这个历史性决议还创建了一个特定的议程项目,标题为“致命的自主武器系统”。
