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使用有针对性的下一代测序来检测药物 -
背景在2021年，有超过1000万人因结核病（TB）而患病，其中包括近50万人使用多药或耐利Fampicin的TB（MDR/RR-TB）（1）。已知只有三分之一的MDR/RR-TB患者已被诊断并接受治疗。易受利福平但对异尼氏二氮的抗性结核病患者的数量估计比RR-TB高两倍以上，并且在很大程度上未被发现和未经治疗（2）。在全球范围内，MDR/RR-TB中氟喹诺酮耐药性的患病率约为20％。最近，世界卫生组织（WHO）认可使用一种由Bedaquiline，Fipomanid，Linezolid和Moxifloxacin（BPALM）组成的全年全年6个月的新型治疗方法，包括患有MDR/RR-TB的患者，包括对氟尿固醇（前XDR-XDR-TB）的耐药性。新推荐的BPALM方案提供了更好的结果，明显缩短了治疗的持续时间，从而显着改善了MDR/RR-TB患者的生活质量（3）。一个新出现的关注点是Bedaquiline和lineZolid耐药性，因为这两种药物是较短的MDR/RR-TB方案的骨干，预计这些药物对于未来方案中耐药TB的治疗仍然至关重要。为了结束全球结核病的流行，我们必须大大扩展对药物抗药性测试的机会，包括构成推荐用于药物敏感和耐药性TB的最佳可用方案的药物。当前WRD仅检测对有限数量药物的耐药性，并且仅覆盖单个或几个抗性相关的基因区域。目前，没有谁推荐的快速诊断（WRD）可以在单个测试中检测到这两种治疗方案中对所有药物的耐药性来为治疗决策提供信息，也没有任何WRD检测到对新的和重复的药物的耐药性，例如bedaquiline，lineZolid，lineZolidzolid，delamanid和phitamanid和Pitermanid（4）。有针对性的下一代测序（NGS）技术伴侣使用下一代测序技术扩增所选基因，以通过一次测试来检测许多药物的抗性。此外，由于目标NG可以询问整个基因以识别与抗药性相关的特定突变，因此与现有WRD相比，有针对性的NG可以提供提高的精度。此外，新的基于NGS的新测试可以检测到当前未包含在任何其他分子测定中的新的和重新利用的药物的耐药性。基于NGS的靶向测试提供了巨大的潜力，可以提供与现代治疗方案相匹配的全面阻力检测。在2022年，他们委托了一系列有关已发表和未发表的针对性NGS产品的数据的系统评价，这些数据是商业开发用于结核病药物耐药性检测的。WHO TB诊断的评估过程已演变为一种侧重于评估结核病诊断产品而不是特定产品的机制。三种产品符合评估的纳入标准。系统评价包括有关诊断准确性，经济信息以及有关可行性，可接受性，公平性和最终用户价值观和偏好的定性证据的数据。For this guideline process, the class of targeted NGS products was defined as one that uses massively parallel sequencing to detect resistance to TB drugs, starting from a processed clinical sample and ending with an end-user report that relates detected Mycobacterium tuberculosis mutations to the presence (or absence) of drug resistance, based on the interpretation of a standard catalogue of mutations.根据可用数据，回顾了对以下药物的耐药性检测：利福平，异念珠菌，左氧氟沙星，莫西法沙星，乙拉托醇，乙酰胺，吡嗪酰胺，Bedaquiline，linezelquiline，linezolid，clofazimine，clofazimine，amikikacin和sttreptheptycin。谁于2023年5月2日至5日召集了一个指南开发小组（GDG），讨论了系统评价的发现并就此技术提出建议。
37革兰氏阳性的抗菌抗性...
所有菌株30（100％）耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）均对青霉素，头孢辛蛋白和头孢曲松酮具有抵抗力。Highest resistance was observed towards gentamicin 19 (63%), followed by moxifloxacin 12 (40%), levofloxacin, ciprofloxacin 11 (36%), erythromycin 9 (30%), clindamycin 6 (20%), tetracycline 5 (17%), fosfomycin 2 (6%), rifampicin, fusidic acid 1 （3％）。在18（60％），19（64％）中检测到对左氧氟沙星和环丙沙星的中间敏感性。所有菌株均对万古霉素，teicoplanin，linezolid，tigecycline敏感。表1。表1。金黄色葡萄球菌的抗生素抗性模式。
中国儿童侵袭性肺炎球菌疾病靶向治疗抗生素处方的多中心回顾性研究
摘要 背景：肺炎链球菌是引起儿童细菌性脑膜炎、败血症和肺炎的主要原因，抗生素选择不当会对个人和社区产生严重的不良后果。本文以肺炎链球菌对青霉素/头孢噻肟的敏感性为研究对象，评估了我国侵袭性肺炎球菌疾病（IPD）儿童针对性抗生素治疗的适宜性。方法：在中国13个省的14所医院进行多中心回顾性研究，收集2012年1月至2017年12月IPD病例的抗生素处方、临床特征和耐药模式，评估针对性抗生素治疗的适当性。结果：共收集IPD病例806例。 492 例非脑膜炎病例中肺炎链球菌对青霉素和头孢噻肟的不敏感率分别为 40.9% 和 20.7% ，314 例脑膜炎病例中肺炎链球菌对青霉素和头孢噻肟的不敏感率分别为 73.2% 和 43.0% 。针对性治疗中，非脑膜炎病例使用卡巴培南类药物的比例为 21.3%，脑膜炎病例为 42.0% 。针对性治疗中，390 例分离株对头孢噻肟敏感的非脑膜炎病例中，使用万古霉素和利奈唑胺的比例分别为 17.9% 和 8.7% 。针对性治疗中，179 例分离株对头孢噻肟敏感的脑膜炎病例中，使用万古霉素和利奈唑胺的比例分别为 55.3% 和 15.6% 。总体而言，806 例 IPD 病例中 361 例（44.8%）存在不适当的靶向治疗，其中卡巴培南类药物使用不适当 232 例（28.8%），万古霉素使用不适当 169 例（21.0%），利奈唑胺使用不适当 62 例（7.7%）。
供应链和库存控制
1。Aztreonam 2。Carumonam 3。Colistine（East）4。ceftaroline 5。Cefideroccol 6。ceftobrole 7。头孢张 + avimbatam 8。ceftolose + tasobaccam 9。教练10。dalbavancin 11。dalfopistin + quinupistine 12。eravacycline 13。磷酸霉素 imipenem + cilsatin +降级15。线性16。 米诺科17。 祈祷18）多粘蛋白B（注射）18。 tedizolid 19。 daptomycin 20。 faropenem 21。 iCaimer 22。叶23。 MeropeNem + Vaborbabetam 24。 omadacycle 25。 plasomicin 26。 b（东）27。 Televancin 28。磷酸霉素imipenem + cilsatin +降级15。线性16。米诺科17。祈祷18）多粘蛋白B（注射）18。tedizolid 19。daptomycin 20。faropenem 21。iCaimer 22。叶23。MeropeNem + Vaborbabetam 24。omadacycle 25。plasomicin 26。b（东）27。Televancin 28。
阐明石墨烯量子点对结核分枝杆菌感染的潜力
基于碳的纳米材料（CNM）治疗，尤其是石墨烯 - 氧化物（GO）已经显示出对分枝杆菌的有希望的活性（De Maio等，2019）。即使GO没有显示直接的杀菌活性，它也能够将分枝杆菌置于网中，从而干扰正常的巨噬细胞感染（De Maio等，2019）。此外，由于活性氧（ROS）产生的增加，二线抗TB药物LineZolid的共同给药导致了协同的抗MTB效应（De Maio等人，2020年）。然而，GO板与异念珠菌或amikacin的相互作用干扰并阻碍了抗生素活性（De Maio等，2020）。此外，当基于外周血单核细胞的MTB感染模型中使用GO时，我们观察到控制分枝杆菌复制的失败，这在很大程度上是由于抗单核细胞和CD4 T细胞的毒性（Salustri et al。，2023）。
转录因子FOXM1在糖尿病及其...
摘要：Lelliottia羊膜是一种革兰氏阴性的辅助厌氧芽孢杆菌，后来又从食物（洋葱，奶油，未经糊糊的牛奶和西班牙猪香肠）中鉴定出来，在某些情况下，在某些情况下会引起人类的感染，尤其是在人类中，尤其是在免疫成分的患者中。文献中很少有人类感染的病例，例如内脑炎，尿路感染，肾盂脾气病和败血症。我们描述了一个住在城市环境中的69岁高加索男性患者的情况拭子（2023年5月25日）在罗马尼亚县临床紧急医院的临床急诊医院被送往传染病诊所后。入院时，进行了肺计算机断层扫描（CT）扫描，该扫描的严重程度得分为25分。在疾病的第二周中，患者进行了闻症，从中进行了细菌学检查，并确定了pseudomonas putida和Lelliottia amnigena。在第三次收获痰液样品期间，将P. p. p. p. p. p. p. p. p. p. p. a amnigena（两种低毒力菌株均具有对抗生素的敏感性。在接受放线菌病，慢性阻塞性肺部疾病和支气管扩张的先前肺部手术的免疫抑制患者的背景下，所有这些疾病都有利于生物膜形成。在抗病毒治疗，皮质疗法，抗生素治疗（在缺乏鉴定病因学的情况下，最初与linezolid和lineZolid相关的杂苯甲和ceftazimime-avibactam），voriconazole，voriconazole，salbutamol intaration contriation contriation contriation CONTRATION CORTAINTIAN CONTIAN CORTAINS INHALALALALALALALALALALALALALALALALALALASES，在抗病毒治疗，皮质疗法，抗生素治疗（在缺乏识别病因学的情况下，最初是Meropenem）施用的进化，并将要求，出院后，患者在家中继续进行氧气治疗，流量为5 l/分钟。L. amnigena仍然是一种很少在人类病理学中孤立的病原体，但我们应该更加关注，尤其是在免疫抑制的患者中，在这种患者中，它可以造成极为严重的临床状况。
与抗药性扩大的结核病临床管理的最佳实践
出于本野外指南的目的，我们将“扩展的耐药性”定义为结核分枝杆菌的菌株，对利福平抗性，至少另一种以下药物：bedaquiline，bedaquiline，linezolid，clofazimine，delamanid和/或pitimanid。此定义包括XDR-TB，即具有对利福平，氟喹诺酮类和至少一个或多个A组的TB。然而，它还包含其他抗性模式，例如，TB具有对利福平和贝达奎林的抗性以及对氟喹诺酮类的敏感性。世界卫生组织（WHO）将结核分枝杆菌的菌株抗抗利福平和氟喹诺酮抗性和氟喹诺酮的抗性被定义为“耐药前耐药（前XDR）”结核病（WHO），如果在本指南中也将在本指南中考虑对上述药物的其他耐药性。但是，由于WHO提供了有关XDR-TB的管理指南，因此我们不会在本指南中关注这些菌株。
杭州圣庭医疗科技有限公司TBSeq测试
杭州盛廷医疗科技有限公司拥有一款基于靶向二代测序（NGS）的试剂盒，用于同时识别分枝杆菌种类并预测结核分枝杆菌复合群（MTBC）菌株的耐药性。该试剂盒 TBseq® 可直接应用于痰液、支气管肺泡灌洗液、胸腔积液或分枝杆菌阳性培养物等临床标本。它依赖于引物多重扩增混合物的深度测序，针对与一线和二线抗结核（抗 TB）药物（利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、对氨基水杨酸、环丝氨酸、乙硫异烟胺/丙硫异烟胺、贝达喹啉、氯法齐明和利奈唑胺）耐药相关的 21 种主要 MTBC 基因。分枝杆菌种属鉴定是通过针对 16S 和 hsp65 基因区域进行的。
信息表：GenoScreen Deeplex Myc-TB 测试
GenoScreen 拥有基于新一代测序 (NGS) 的试剂盒，可同时识别分枝杆菌种类、进行基因分型并预测结核分枝杆菌复合群 (MTBC) 菌株的耐药性；该试剂盒 (Deeplex® Myc-TB) 可直接用于临床样本 (1) 。该检测依赖于单个 24 重扩增子混合物的深度测序，针对与一线和二线抗结核药物（利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、阿米卡星、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、乙硫异烟胺、贝达喹啉、氯法齐明和利奈唑胺）耐药性相关的 18 个主要 MTBC 基因区域。 hsp65 基因是分枝杆菌种属识别的靶标，而 spoligotyping 靶标（CRISPR/直接重复 [DR] 基因座）和耐药相关靶标中的系统发育单核苷酸多态性 (SNP) 用于 MTBC 菌株基因分型。
Deeplex Myc-TB 技术说明
Deeplex® Myc-TB 检测依赖于与对一线和二线药物耐药性相关的 18 个主要 MTBC 基因靶点的深度测序（图 3）。根据在这些基因座中观察到的突变的存在或不存在以及对参考数据库*****的查询，预测样本中的 MTBC 菌株对每种抗生素敏感或耐药，或具有尚未表征的突变（图 1）。可以轻松查看单个靶点位置和突变及其序列覆盖深度。可通过超链接访问描述突变与耐药性关联的参考文献信息。总体而言，该检测可以预测对 15 种抗结核药物/药物类别的耐药性，包括最近推出的化合物，如贝达喹啉和利奈唑胺，使其成为迄今为止最详尽的可直接应用于样本的基因型检测。