Berthet(一只真正的“孤独”老狼,我们一定离一起走过的 80 公里的路程不远了)、Ludovic Bultingaire、Thomas Dépret、Guillaume Fantino、Kristell Michel、Bertrand Morandi、Volodia Petropavlovsky、Dominique Reynaud、Samuel Segura 和 Vincent Wawrzyniak(因为你们铲了三铲土,而且照片证明你们有权让你们的名字出现!)和 Anaïs,我的另一半(你不常来,但你毫不犹豫地帮助我完成某些调查,而且不是在最容易的地点!谢谢你在隆冬时节的周末起床前往我的“黑暗、臭气熏天”的地点)。获取数据是一回事,分析数据又是另一回事。非常感谢 Lise Vaudor 提供的统计帮助和教学(好吧,我承认,R 很棒!)。
Berthet(“孤独”的神圣老狼,我们一定不会远离80公里的手臂覆盖在一起),Ludovic Bultingaire,Thomas Dépret,Guillaume Fantino,Kristell Michel,Bertrand Morandi,Volodia Petropavlovsky,Dominique Reynaud,Samuel Segura 和 Vincent Wawrzyniak(这很好,因为你拿了三把铲子,照片证明你有你的名字出现的权利!)还有我的另一半Anaïs(你不常来,但你毫不犹豫地奉献自己来帮助我完成某些调查,而且不是在最受欢迎的网站上)。谢谢你周末起床去我的“阴暗,不是很臭”的网站,在隆冬)。获取数据是一回事,分析数据又是另一回事。非常感谢 Lise Vaudor 的统计帮助和教学(好吧,我承认,R 很棒!)。
本出版物确实是协作努力的结果。首先,我要感谢塔拉·加内特(Tara Garnett)对手稿的五个先前版本的耐心,详细和智力上的反馈。也要感谢三位外部审稿人Souhil Harchaoui,Adrian Muller和Lena Schulte-uebbing,以及Ken Giller和Table员工Tamsin Blaxter,Hester van Hensbergen和Sophie Hockley,以在各个阶段获得详细的和建设性的反馈。感谢Lise Benoist对早期草案的评论,路易斯·拉萨莱塔(Luis Lassaletta)帮助创建了图4。最后但并非最不重要的一点是,感谢插图画家苏珊·弗洛丁(Susanne Flodin没有您的所有贡献,最终结果将几乎相同。
用于对狗微生物组进行宏基因组分析的数据库的开发:一种采用 KRAKEN2 和 BOWTIE2 的方法 PAULO SALLAROLA TAKAO;帕梅拉·苏萨·科里亚;胡利奥·弗朗茨·莫拉大卫·阿西奥莱·巴博萨; FABIANO BEZERRA MENEGIDIO 摘要 宏基因组分析在了解微生物群落及其环境影响方面发挥着至关重要的作用,在兽医学中对于宠物疾病的诊断、治疗和预防具有特殊意义。这项研究旨在为 Bowtie2 和 Kraken2 工具创建集成数据库,将狗和人类基因组整合成最新且易于访问的资源。随着技术的进步,微生物组的宏基因组分析已成为兽医日常工作中一种很有前途的工具,特别是考虑到兽医诊所中狗的普及率很高,仅在巴西就有大约 5810 万只狗,是家庭中第二大宠物,仅次于鸟类。然而,必要的生物信息学步骤(例如去除宿主基因组和人类污染物)需要大量时间和计算资源。为了克服这一挑战,我们为每种工具开发了特定的数据库,大大减少了分析时间并确保基因组的持续更新。虽然 Bowtie2 执行精确序列比对,但 Kraken2 使用较小的序列(k-mers)进行更快、更有效的分类学分类。数据库构建后,对犬类宏基因组文库进行了测试,结果显示比对率较高,且能有效去除与狗或人类相关的读段。尽管由于缺乏详细的文献而面临挑战,但创建的数据库被证明是可行且可重复的,为未来兽医宏基因组分析研究做出了重大贡献。关键词:家狼,宏基因组,Kraken2-build,Bowtie2-build,污染物。 1 引言 宏基因组分析是对宏基因组进行分类的过程(MARCHESI;RAVEL,2015),宏基因组是基因组学的衍生词,是研究生物体基因的学科。从字面上翻译,宏基因组学是“超越基因组的”,也就是说,在宏基因组学中我们不仅分析一个基因组,还分析样本中包含的所有基因组(GILBERT;DUPONT,2011)。这些基因组可以来自微生物,甚至可以是环境(样本)中的游离 DNA 片段、微生物结构元素的基因、病毒、噬菌体、毒素和其他所有具有遗传物质的东西(BERG 等人,2020 年;HANDELSMAN 等人,1998 年;MERRIAM-WEBSTER,2023 年;WHIPPS;LEWIS;COOKE,1988 年)。那么我们可以将宏基因组分析描述为对给定条件下的微生物基因组集合及其环境条件的分析
这些运动员以各种形式体验着“军事素养”,无论是在第 21 届国际军事比赛场地的房间里,还是在露营期间,学习射击突击步枪和近距离移动,甚至吞下战斗口粮作为午餐。 “我们发现了军队的日常生活以及他们特有的互助精神。如果没有其他人,我就不可能完成这些活动,”该部公务员、2017 年和 2019 年残疾铁人三项双料世界冠军埃莉斯·马克 (Élise Marc) 高兴地说道。“我们来这里是为了作为运动员代表军队。我们发现了相同的价值观:纪律、严谨和凝聚力。 “看到这么多运动员齐聚一堂,我感到非常高兴,”2020 年世界冠军山地自行车手、第 21 届 RIMa 赛事赞助人、士兵 Loana Lecomte 说道。
从左到右:Hydro-Québec 创新、设备和共享服务总裁兼詹姆斯湾能源公司总裁兼首席执行官 Réal Laporte;埃莉斯·普鲁克斯 (Élise Proulx),通讯、政府事务和土著关系副总裁;魁北克水电配送公司总裁 Eric Filion ;总裁兼首席执行官 Eric Martel; Simon Richard,企业战略和业务发展副总裁;魁北克水电公司首席运营官兼魁北克水电公司生产总裁 David Murray; Nathalie Dubois,人力资源副总裁; Marc Boucher,Hydro-Québec TransÉnergie 总裁; Pierre Gagnon,企业和法律事务执行副总裁兼首席治理官; Jean-Hugues Lafleur,执行副总裁兼首席财务和风险官。
作为替代方案,在搭便车发射进入太阳同步极地轨道的情况下,设计了具有此特性的轨道,其高度接近 600 公里(仪器要求),但本文不再介绍。对于脱轨分析,必须考虑卫星的平均面积,估计为 1,307 平方米。请注意,这是通过每个平面上的投影的算术平均值获得的下限,这将提供最坏情况的分析。基于上述考虑,在初步简化分析中,通过 NASA DAS v2.0 软件[2] 获得了卫星衰减曲线,如图 3 所示。可以看出,在最坏情况下,卫星将在任务使用寿命结束后 27 年后重新进入大气层,比国际标准建议的时间多了两年(这额外的两年应在项目后期考虑)。