生态与生物多样性系,生命科学学院,安德烈斯·贝洛大学,圣地亚哥,智利B生物多样性研究所,动物健康与比较医学,格拉斯哥大学医学兽医和生命科学学院Iologie,蒙彼利埃,法国和Mivegec的Iologie,IRD,CNRS,CNRS,MONTPELLIER,法国蒙彼利埃大学,劳动力Mixte International,Drisa,IRD,IRD用于细菌耐药性合作研究的千年核,Microb-R,Santiago,智利和实验室服务HôpitaldelaMère等人,N'djaména,N'djaména,Chad J A,Lima,Lima,Peru K MRC,秘鲁K MRC - 格拉斯哥大学病毒研究中心,英国格拉斯哥大学,格拉斯哥大学,英国,格拉斯哥大学
牲畜的遗传工程(GE)最初是主要使用核对核微注射到Zygotes(1985-1996)的。由于较低的整合效率,由于随机整合而导致的异常转基因表达以及在转基因创始动物中存在遗传镶嵌物,因此该技术的应用受到限制。尽管为国内物种建立了胚胎干细胞(ESC)的巨大努力,但牲畜不存在ESC GE技术。体细胞核转移(SCNT)的发展绕过了牲畜ESC的需求,并通过提供第一个基于细胞的基于细胞的遗传操作的平台来彻底改变牲畜转基因领域。自多莉(Dolly)诞生以来近二十年(1996 - 2013年),SCNT是产生敲除和敲除牲畜的唯一方法。新一代基因编辑技术的CRISPRS/CAS9系统的到来使我们能够轻松有效地引入精确的基因组修饰。这种技术进步加速了SCNT的GE牲畜的产生,并恢复了合子微观渗透,作为重要的GE方法。SCNT技术的主要优点是能够在动物产生之前体外确认所需的遗传修饰。还可以测试编辑的细胞的潜在脱靶突变。此外,这种方法消除了合子微观渗透后经常观察到的遗传镶嵌的风险。复制(2021)162 F11 – F22尽管效率低,但SCNT还是世界上许多实验室的完善程序,并将继续在GE牲畜领域发挥重要作用。
基因编辑技术允许用户在体内(活体)改变生物体的 DNA。与以前的技术相比,基因编辑领域的进步使其更加精确、高效、灵活和便宜。这引起了人们对基因编辑及其治理的兴趣,包括畜牧业应用。尽管牲畜基因编辑有望带来好处,但它也引发了技术、伦理和社会问题,以及(彻底)转变的前景。由于该技术仍有待开发成可销售的产品,因此设计、愿景或我们所说的“社会技术想象”塑造了基因编辑技术,并代表了社会学研究的重要领域。在本文中,基于对荷兰育种公司代表和农业科学家的采访分析,我们分析了支撑他们想象的假设、价值观和承诺。这些想象很重要,因为它们的协商将有助于构建技术的发展方式以及它随后将如何改变牲畜和人与动物的关系。在我们的分析中,我们分析了访谈数据中的话语实践,提炼出三种社会技术想象,这些想象塑造并支撑了受访者讨论牲畜基因编辑的方式。通过阐述社会技术想象概念,使其更适合牲畜基因编辑的新兴动态,我们展示了如何“就地”和“物质实践”来研究想象。尽管每种想象都将牲畜基因编辑视为可取和有益的,但它们在构建行业、研究人员、政府和消费者/公民关系方面却具有不同的影响。最后,我们讨论了社会技术想象对牲畜基因编辑的重要性及其原因,以及它们对治理和研究的影响。
控制高粱地野猪的收益可高达每公顷 33 美元(图 6)。控制方法之间的结果差异主要归结于有效性。最有效的控制方法,诱饵和空中射击产生了最高的效果,其次是诱捕,最后是地面射击。在高粱地中,诱捕的可能性为 4%,地面射击的可能性为 68%,导致每公顷净损失——表明控制的野猪比例较低,不超过控制成本。
抗菌药物耐药性 (AMR) 已成为当今对公共卫生的最大威胁之一。抗菌药物被广泛使用,尤其是在畜牧业中,它们还被用作生长促进剂和预防目的。一些国家已经开始限制抗菌药物的使用,但在许多地方,特别是在中低收入国家 (LMIC),抗菌药物市场监管不力,人们对抗菌药物滥用的负面影响的了解有限。抗菌药物通常在柜台出售,无需处方,价格低廉,广泛应用于所有类型的动物生产。在柬埔寨,这种情况导致各种耐药细菌的流行率很高,对人和动物的健康构成风险。另一个需要解决的问题是伪造和不合格 (FS) 抗菌药物的出现,导致治疗剂量不足,导致治疗失败和抗菌药物耐药性的进一步发展。为了控制抗菌药物耐药性的出现,绘制抗菌药物网络图谱很重要,以便确定重要的利益相关者和合适的干预点。本研究采访了销售家畜(即猪和家禽)抗菌药物的药店零售商。目的是获取有关零售商抗菌药物和抗菌药物耐药性的知识,并评估他们在多大程度上参与了动物治疗的选择。还购买了抗菌药物样品并用质谱法进行分析,以验证活性药物成分 (API) 的含量。结果表明,零售商积极参与选择使用哪种抗菌药物,并且对抗菌药物和抗菌药物耐药性的一般了解程度较低。多种抗菌药物用于治疗家禽和猪,其中阿莫西林和恩诺沙星最常被列为最畅销的抗菌药物。世界卫生组织 (WHO) 将所使用的许多物质归类为对人类医学至关重要的抗菌药物,产品通常含有至少两种不同的物质。这扩大了产品的治疗范围,可以根据世卫组织目前的建议使用窄谱抗菌药物,并尽可能避免在牲畜身上使用至关重要的抗菌药物。通过减少和改变抗菌药物的使用来减缓柬埔寨抗菌药物耐药性发展的可能干预措施包括教育以及强力执行更严格的立法。这项调查表明,动物药店的零售商可能是提高抗菌药物耐药性意识的合适目标群体,因为他们似乎是抗菌网络中有影响力的参与者。然而,需要更多的研究来评估不同干预措施的成本效益,特别是在中低收入国家,以便设计出适合当地情况的措施。
摘要背景:合适的测序策略与填补方法的结合对于从牲畜种群中收集用于研究和育种的大型全基因组序列数据集至关重要。在本文中,我们描述并验证了测序策略与填补方法混合剥离在真实动物育种环境中的结合。方法:我们使用了四个不同规模的猪种群的数据(18,349 到 107,815 头猪),这些猪种群的基因分型广泛,全基因组标记密度在 15,000 到 75,000 个之间。每个种群中大约有 2% 的个体进行了测序(大多数为 1 × 或 2 ×,每个种群有 37–92 个个体,总计 284 个,为 15–30 × )。我们使用混合剥离技术填补了全基因组序列数据。我们使用留一法设计,通过删除覆盖率高的 284 个个体的序列数据来评估填补准确性。我们模拟了模仿真实人群中使用的测序策略的数据,以使用回归树量化影响个体和变异插补准确性的因素。结果:四个人群中大多数个体的插补准确性都很高(个体剂量相关性中位数:0.97)。由于缺乏自身和祖先的标记阵列数据,每个人群最早几代个体的插补准确性低于其他人群。决定个体插补准确性的主要因素是基因分型状态、直系祖先的标记阵列数据的可用性以及与其他人群的关联程度,但亲属的测序覆盖率没有影响。决定变异插补准确性的主要因素是次要等位基因频率和每个变异位点具有测序覆盖的个体数量。通过实证观察验证了结果。结论:我们证明,将适当的测序策略与混合剥离相结合是一种强大的策略,可以在大型谱系群体中生成高精度的全基因组序列数据,其中只有一小部分个体(2%)进行了测序,而且大部分覆盖率较低。这是成功实施全基因组序列数据进行基因组预测和精细定位因果变异的关键步骤。