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生物技术（045）XII类（2024-25）
发酵完成后，有必要恢复所需的代谢物。最少，这将涉及将细胞与发酵肉汤分离。，但它也可能包括在有或没有细胞破坏的情况下纯化代谢产物的纯化；如果代谢物是细胞内的，则需要细胞破坏。此类操作称为下游处理。The steps involved in isolation of the desired microbial product are: (1) separation of cells from the fermented broth, (2) cell disruption if the product is intracellular or concentration of the broth if the product is extracellular (3) initial purification of the metabolite, (4) metabolite-specific purification in which the metabolite of interest is purified to a high degree, and (5) polishing of the metabolite （将其提高到98 -100％的纯度），在进一步浓缩并配制使用以供使用。
赤霉素抑制剂对芒果（Mangifera indica L.）品种 Irwin 花芽分化和代谢物动力学的潜在影响
全球气温上升导致温室内芒果 ( Mangifera indica L. ) 的种植面积扩大，尤其是在韩国南部。然而，芒果树过度的营养生长会阻碍生殖生长和果实生产，对温室种植构成挑战。花芽分化过程中赤霉素 (GA) 水平过高会阻碍这一过程，减少开花和结果。这项先导研究调查了已知的 GA 抑制剂多效唑 (PBZ) 和调环酸钙 (Pro-Ca) 对温室条件下生长的芒果树花芽分化和穗发育的影响。设立了两个处理组：PBZ 一次和两次（22.9% 悬浮浓缩液中 1,500 ppm）以及 Pro-Ca 一次和两次（20% 悬浮浓缩液中 500 ppm）。处理于 2022 年 7 月进行，在夏季修剪后枝条变硬后进行，恰逢花芽分化诱导期（2022 年 11 月中旬至 2023 年 1 月中旬）。在此期间，平均温度和平均相对湿度分别为 13.4°C 和 62%。通过七个阶段观察到生殖生长变化。PBZ 一次和两次处理最快达到第 2 阶段（花芽起始），其次是 Pro-Ca 一次和两次，以及对照组，均在四天内完成。值得注意的是，处理和对照之间的结果没有显著差异。关于穗特征，PBZ 两次产生的穗最长，而 Pro-Ca 两次产生的穗最短。然而，所有组的穗宽度保持相似。研究结果表明，PBZ 两次、Pro-Ca 一次和 Pro-Ca 两次处理可有效促进花芽分化并根据生长特性提高穗质量。此外，随后的 GC-MS 分析和热图分析发现，所有样品（包括对照组和处理组）中都存在八种关键代谢物，这些代谢物均与芒果开花反应有关。总体而言，GA 抑制剂在诱导花芽分化方面表现出良好的效果。
利用 CRISPR-Cas9 和体外组装的核糖核蛋白操纵全局调节器 mcrA 上调温曲霉中的次级代谢产物
摘要：丝状真菌基因组测序表明，大多数次级代谢物生物合成基因簇 (BGC) 在标准实验室条件下处于沉默状态。在这项研究中，我们在温氏曲霉中建立了一个体外 CRISPR-Cas9 系统。为了激活原本沉默的 BGC，我们删除了负转录调节因子 mcrA 。当菌株在马铃薯葡萄糖培养基 (PDA) 上培养时，mcrA (mcrA Δ) 的缺失导致总共产生 17 种 SM。在 15 种 SM 中，有 9 种已得到充分表征，包括大黄素 ( 1 )、大黄酸乙酯 ( 2 )、sulochrin ( 3 )、大黄酸乙酯二蒽酮 ( 4 )、14- O-脱甲基sulochrin ( 5 )、( 反式 / 顺式 )-大黄素二蒽酮 ( 6 和 7 ) 和 ( 反式 / 顺式 )-大黄素大黄酸乙酯二蒽酮 ( 8 和 9 )。经发现，这些化合物均由相同的聚酮合酶 (PKS) BGC 产生。随后，我们在 mcrA Δ 背景下针对该 PKS 簇进行了二次敲除。双敲除菌株的代谢物谱揭示了先前未在 mcrA Δ 亲本菌株中检测到的新代谢物。从双敲除菌株中纯化出另外两种 SM，并被鉴定为曲霉酸 B ( 16 ) 和一种结构相关但之前未鉴定的化合物 ( 17 )。这项工作首次提出了一种能够在 A.wentii 中进行靶向基因编辑的简便遗传系统。这项工作还说明了进行双敲除以消除主要代谢产物的实用性，从而能够发现更多的 SM。■ 简介
shot弹枪宏基因组学和全身性靶向代谢组学突出显示吲哚-3-丙酸作为保护性肠道微生物代谢物，抗流感感染
摘要肠道轴在呼吸道感染期间至关重要，包括流感病毒（IAV）感染。在本研究中，我们使用了高分辨率的shot弹枪元基因组学和靶向代谢组学分析来表征小鼠肠道肠道微生物群的组成和元倾斜度中与流感相关的变化。我们观察到7天（d）7天的分类级变化，包括明显减少乳酸杆菌科和双歧杆菌科的成员，以及akkermansia muciniphila的丰度增加。在D14上，某些物种持续存在扰动。宏基因组数据的功能尺度分析揭示了几种代谢途径的短暂变化，尤其是导致短链脂肪酸（SCFA），多胺和色氨酸代谢物的瞬时变化。对血清的定量靶向代谢组学分析揭示了特定类别的肠道微生物群代谢产物的变化，包括SCFAS，三甲胺，多胺和含吲哚的色氨酸代谢物。在D7上观察到吲哚-3-丙酸（IPA）血液水平的明显降低。微生物群相关的代谢产物的变化与分类单元丰度和疾病标志物水平的变化相关。特别是，IPA与一些乳酸杆菌科和双歧杆菌科（limosilactobacillus reuteri，Animalis limosilactobacillus）正相关，并与细菌M7，病毒载量和炎症标志物呈负相关。在患病动物中补充IPA可减少病毒载量，并降低局部（肺）和全身炎症。用靶向IPA产生细菌的抗生素治疗感染前的抗生素，从而增强了病毒载量和肺部炎症，这是补充IPA抑制的作用。这种综合的宏基因组 - 代谢组分分析的结果强调了IPA是导致流感结果的重要因素和潜在的疾病严重性生物标志物。
鼻腔内给予 NEO100 后检测胶质母细胞瘤术后组织中的紫苏醇及其代谢物紫苏酸：illustra
鼻腔内给药的一般概念基于这样的前提：这种非侵入性给药途径至少可以部分采用直接从鼻腔到脑的运输，从而避免肝脏快速代谢药物，绕过血脑屏障 (BBB) 的药物排斥，并最大限度地减少需要用药物充斥整个体循环以将足够高的药物浓度输送到脑病变的需要。13,14 然而，目前仍不清楚 POH/NEO100 的鼻腔内给药途径是否确实能够实现其关键目标，即使药物能够到达其预期的脑内肿瘤目标。这种确认至关重要，因为它将为以下模型提供急需的支持：鼻腔内 NEO100 是一种可行、更安全且可能更好的治疗脑癌患者的方法。在以下报告中，我们介绍了一例复发性 IV 级 IDH 突变型胶质瘤患者的病例，该患者接受鼻内 NEO100 治疗超过 3 年，并取得了良好的效果，并且再次手术使我们能够在 NEO100 给药后获得肿瘤组织，从而能够在肿瘤内检测 POH 及其代谢物 PA。
利用 3D 压缩感知 SENSE 低秩 1H FID-MRSI 进行全脑高分辨率代谢物映射
图 2 顶部，3D FID-MRSI 重建代谢物体积，具有回顾性加速。完全采样采集（无加速）在 70 分钟内完成，加速因子对应于 k 空间欠采样并相应地减少采集时间（例如 3，24 分钟；6，12 分钟）。彩色图针对从 0 到第 95 个百分位数的每个代谢物范围单独缩放。底部，在所有加速因子下相对于未加速结果为每个代谢物图计算的归一化 RMSE 和 SSIM。显示了来自两个不同位置的样本光谱，它们随加速度（无、3、5）的变化很小。LCModel 拟合与拟合残差一起显示。左下方，整个大脑平均残差的 RMS 随加速度保持不变
https://doi.org/10.1038/s42003-025-07641-8通过饮用水中的微塑料激活肠道代谢物ACSL4/LPCAT3 3
环境污染物[A] pyrene（BAP）通常在环境中发现，微型塑料（MPS）充当BAP的主要载体中生物有机体的主要载体，从而增加了其体内的可用性。然而，尚未完全了解携带污染物的MP携带污染物的特定途径和机制。这项研究旨在研究小鼠肾损伤的途径和机制，以使MPS和BAP均为低浓度。聚苯乙烯（PS）和BAP肾脏中断脂质代谢的结合，导致一种称为铁毒性的细胞死亡形式。但是，在体外HK-2细胞中未观察到这种作用，表明细胞特异性反应。有趣的是，在HIEC-6细胞中，PS和BAP都直接诱导了铁凋亡。这些发现证实了暴露于PS和BAP的情况会破坏肾脏中的代谢稳态，从而导致肾脏功能障碍和细胞死亡。
回顾甘油酸及其水解代谢产物18β-甘露辛酸作为特定的配体，用于靶向纳米系统来治疗活
1实验室研发制药和化妆品，帕尔街联邦大学，奥古斯托·科里亚（Street Augusto Correa）01，BeléM66075-110，巴西； lastecanella@ufpa.br（L.A.S.）; antoniopaulo.ribeirobitencourt@unipr.it（A.P.R.B.）; carrera@ufpa.br（J.O.C.S.J.）2帕尔马大学帕尔科地区的食品与药物系德莱·斯科兹27/A，43124意大利帕尔马； gustavo.vaz@unipr.it（g.r.v.）; eride.quarta@studenti.unipr.it（e.q。）3纳米技术实验室适用于健康科学研究生课程的纳米技术实验室，里约热内卢联邦大学，AV。意大利，第8公里，里奥格兰德96210-900，巴西4食品和药物系，Plumestars SRL，C/O parco scienze 27/a，43124，43124，意大利帕尔马43124，意大利帕尔马5信件：Alessandra.rossi@unipr.it;电话。： +39-0521-905084†这些作者对这项工作也同样贡献。
1,25（OH）2-3- EPI-VITAMIN D3，一种天然的维生素D3的生理代谢物：其合成，生物学活性和晶体结构，其受体
从位置B更改为其非对映异构体a。尚未确定负责C3-二聚化的酶为当前日期。它也由Reddy等人提出。该途径可用于通过C-24氧化抗活化的代谢产物[18]在胆汁酸代谢中表征良好的现象，在胆汁酸代谢中，该反应被胆汁酸羟基甾体脱氢酶催化[27]。该途径在类固醇激素（如雄激素）的激活和/或灭活中也起着主要作用[28]。尽管结合亲和力低于钙三醇，但1 A，25（OH）2 -3- EPI-D 3仅在产生的特定组织中才具有显着的生物学活性[29]。1 A，25（OH）2 -3-EPI-D 3化合物的转录响应在不同组织中的不同VDR-指导基因的不同。例如，它显示骨钙素基因和较低的HL60分化[30]的激活较低，但在1 A，25（OH）2 D 3具有抑制角质形成细胞的细胞增殖[19]和抑制甲状腺功能旁分泌的甲状旁腺副细胞[25]时，几乎具有等值的活性。这些与其低钙化活性相关的体外特性[31,32]为该化合物分配了潜在的治疗兴趣。要进一步揭露1 A，25（OH）2 -3-EPI-D 3 /HVDR-LBD综合的结构机制和结构 - 活性关系，我们描述了一种更有效的合成途径，以合成1 A，25（OH）2 -3-EPI-D 3，其中一些具有其体外生物学和与HVDR的体外生物学和晶体结构的合成。
纤维肌痛患者的抗卫星胶质细胞 IgG 抗体与症状严重程度以及丘脑和前扣带皮层中的代谢物浓度有关
最近的转化研究表明，纤维肌痛可能是一种自身免疫性疾病，其致病机制由外周疼痛诱发作用介导，即免疫球蛋白 G (IgG) 抗体与背根神经节中的卫星胶质细胞 (SGC) 结合。对假定的自身免疫的首次临床评估表明，与健康对照组相比，纤维肌痛患者 (FMS) 的抗 SGC 抗体 (称为抗 SGC IgG) 水平升高，并且抗 SGC IgG 与更严重的疾病状态相关。本研究的总体目标是确定抗 SGC IgG 在驱动疼痛方面的作用是否完全通过外周机制（如迄今为止间接显示的那样），还是也可以归因于中枢机制。为此，我们希望首先在更大的 FMS 队列中确认抗 SGC IgG 与疼痛相关临床指标之间的关系。其次，我们探索了这些自身抗体与 FMS 中的脑代谢物浓度（通过磁共振波谱分析 (MRS) 评估）和压力诱发的大脑疼痛处理（通过功能性磁共振成像 (fMRI) 评估）之间的关联。在 FMS 的丘脑和前扣带皮层 (rACC) 中进行了质子 MRS，并评估了各种代谢物的浓度。在 fMRI 期间，FMS 接收与低和高疼痛强度相对应的单独校准的疼痛压力刺激。我们的结果证实了抗 SGC IgG 与评估病情严重程度的临床指标之间存在正相关性。此外，与抗 SGC IgG 水平低的 FMS 相比，抗 SGC IgG 水平高的 FMS 疼痛强度更高，疾病状态更差。此外，抗 SGC IgG 水平与丘脑和 rACC 中的代谢物（如鲨肌醇）以及丘脑中的总胆碱和大分子 12 呈负相关，因此将抗 SGC IgG 水平与 FMS 脑中代谢物的浓度联系起来。然而，FMS 中的抗 SGC IgG 水平与对压痛的敏感性或大脑对诱发压痛的处理无关。总之，我们的结果表明，抗 SGC IgG 可能与自发性、非诱发性疼痛具有临床相关性。我们当前和以前的转化和临床发现可以为在 FMS 中尝试新的抗体相关治疗提供依据。