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云，空气中微生物的绿洲 - 元基因组学/ metatranscriptomics分析云和清晰的大气情况 div
细菌细胞和真菌孢子可以在大气中雾化并悬浮几天，暴露于水的限制，氧化和缺乏营养素。使用比较宏基因组学/metatranscriptomics，我们表明云与20种空气中微生物（包括真菌孢子发芽）的20种代谢功能的激活相关。整个现象反映了通过雨水重新吹干土壤中微生物活性的快速恢复，称为“桦木效应”。云滴中的营养资源不足会导致饥荒，使细胞结构可以减轻。云中微生物的代谢活性恢复可能有利于沉积后的表面侵袭，但在云蒸发后也可能有25次妥协进一步的生存。在任何情况下，云都显示为浮动生物活性水生系统。
激发途径的纳米级成像
在植物根部的微生物定植期间，特异性微生物激活的过程的识别受到元文字组学的技术约束的阻碍。这些包括缺乏参考基因组，数据集中宿主或微生物rRNA序列的高度表示，或难以实验验证基因功能。在这里，我们将无菌丝的丁香虫thaliana重新定殖，具有合成但代表性的根微生物群，可释放106个基因组序列的细菌和真菌分离株。我们使用了多个王国rRNA耗竭，深度RNA测序和读取参考微生物基因组来分析丰富的殖民者的植物元转录组。我们确定了在土壤界面差异调节的3,000多个微生物基因。翻译和能量生产过程在植物中持续激活，它们的诱导与细菌菌株在根中的丰度相关。最后，我们使用靶向诱变表明，在丰富的细菌菌株之一（一种可遗传可触及的杜鹃杆菌）中，需要多种细菌持续诱导的几个基因。我们的结果表明，菌群成员激活应变特异性过程，但也可以激活植物根的常见基因集。
云，空气中微生物的绿洲 - 元基因组学/ metatranscriptomics分析云和清晰的大气情况 div
细菌细胞和真菌孢子可以在大气中雾化并悬浮几天，暴露于水的限制，氧化和缺乏营养素。使用比较宏基因组学/metatranscriptomics，我们表明云与20种空气中微生物（包括真菌孢子发芽）的20种代谢功能的激活相关。整个现象反映了通过雨水重新吹干土壤中微生物活性的快速恢复，称为“桦木效应”。云滴中的营养资源不足会导致饥荒，使细胞结构可以减轻。云中微生物的代谢活性恢复可能有利于沉积后的表面侵袭，但在云蒸发后也可能有25次妥协进一步的生存。在任何情况下，云都显示为浮动生物活性水生系统。
使用基因组中的元文章
摘要通过在营养较差的环境中提供和回收必需营养物质，海绵微生物组基础宿主功能。基因组数据表明，碳水化合物降解，碳固定，氮代谢，硫代谢和补充B-维生素是中央微生物功能。然而，很少探索海绵共生途径的基因组潜力的验证。为了评估宏基因组预测，我们测序了三个常见的珊瑚礁海绵的宏基因组和元文字：ircinia ramosa，ircinia ramosa，ircinia microconulosa和phyllospongia foliascens。多种碳水化合物活性酶通过猪杆菌，细菌和氰基菌群共生菌表达，这表明这些谱系在吸收溶解的有机物中具有核心作用。在所有海绵中都观察到了碳固定和多硫化合物转化的整个途径的表达。厌氧氮代谢（反硝化和硝酸盐还原）的基因表达比有氧代谢（硝酸盐）更常见，其中只有I. ramosa微生物组表达了硝化途径。最后，虽然B-VITAMIN的生物合成途径的表达很常见，但其他转运蛋白基因的表达受到了限制。总的来说，我们强调了元基因组和