1。神经病学系,加州大学洛杉矶分校,洛杉矶,加利福尼亚2。基因组健康研究所,伊坎医学院位于纽约,纽约州西奈山3. 分子,细胞和发育生物学系,加州大学洛杉矶分校;洛杉矶,加利福尼亚4。 化学,生命科学和环境可持续性系,意大利帕尔马大学5。 澳大利亚布里斯班昆士兰州大学分子生物学研究所6。 心血管研究所,加州大学旧金山UCSF 7。 系统和合成生物学,基因组调节中心,西班牙巴塞罗那8。 内科学系III,维也纳医科大学风湿病学系,奥地利,奥地利9。 马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌症研究所医学肿瘤学系10. 计算和系统生物学跨部门计划,加州大学洛杉矶分校,加利福尼亚州洛杉矶11。 澳大利亚生物工程和纳米技术学院,澳大利亚布里斯班昆士兰州大学12。 皇家布里斯班和妇女医院神经病学系,澳大利亚昆士兰州布里斯班, 生物医学科学学院,澳大利亚布里斯班昆士兰州大学医学院 昆士兰州脑研究所,昆士兰州昆士兰州,布里斯班,澳大利亚15。 Mater公立医院,澳大利亚布里斯班16。 神经病学系,加州大学旧金山,加州大学,加利福尼亚州17。 加利福尼亚大学洛杉矶分校的人类遗传学系,加利福尼亚州洛杉矶基因组健康研究所,伊坎医学院位于纽约,纽约州西奈山3.分子,细胞和发育生物学系,加州大学洛杉矶分校;洛杉矶,加利福尼亚4。化学,生命科学和环境可持续性系,意大利帕尔马大学5。澳大利亚布里斯班昆士兰州大学分子生物学研究所6。心血管研究所,加州大学旧金山UCSF 7。 系统和合成生物学,基因组调节中心,西班牙巴塞罗那8。 内科学系III,维也纳医科大学风湿病学系,奥地利,奥地利9。 马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌症研究所医学肿瘤学系10. 计算和系统生物学跨部门计划,加州大学洛杉矶分校,加利福尼亚州洛杉矶11。 澳大利亚生物工程和纳米技术学院,澳大利亚布里斯班昆士兰州大学12。 皇家布里斯班和妇女医院神经病学系,澳大利亚昆士兰州布里斯班, 生物医学科学学院,澳大利亚布里斯班昆士兰州大学医学院 昆士兰州脑研究所,昆士兰州昆士兰州,布里斯班,澳大利亚15。 Mater公立医院,澳大利亚布里斯班16。 神经病学系,加州大学旧金山,加州大学,加利福尼亚州17。 加利福尼亚大学洛杉矶分校的人类遗传学系,加利福尼亚州洛杉矶心血管研究所,加州大学旧金山UCSF 7。系统和合成生物学,基因组调节中心,西班牙巴塞罗那8。内科学系III,维也纳医科大学风湿病学系,奥地利,奥地利9。马萨诸塞州波士顿的达纳 - 法伯癌症研究所医学肿瘤学系10.计算和系统生物学跨部门计划,加州大学洛杉矶分校,加利福尼亚州洛杉矶11。澳大利亚生物工程和纳米技术学院,澳大利亚布里斯班昆士兰州大学12。皇家布里斯班和妇女医院神经病学系,澳大利亚昆士兰州布里斯班,生物医学科学学院,澳大利亚布里斯班昆士兰州大学医学院昆士兰州脑研究所,昆士兰州昆士兰州,布里斯班,澳大利亚15。Mater公立医院,澳大利亚布里斯班16。神经病学系,加州大学旧金山,加州大学,加利福尼亚州17。加利福尼亚大学洛杉矶分校的人类遗传学系,加利福尼亚州洛杉矶
。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。它是制作
摘要越来越多地通过探索表观遗传机制,尤其是DNA甲基化来阐明阿尔茨海默氏病发病机理的复杂性。本综述全面调查了最新以人为中心的研究,这些研究研究了整个基因组DNA甲基化在阿尔茨海默氏病神经病理学中。对各种大脑区域的检查揭示了与Braak阶段和阿尔茨海默氏病进展相关的独特DNA甲基化模式。内嗅皮层由于其早期的组织学改变以及随后对海马等下游区域的影响而成为焦点。值得注意的是,在内嗅皮层中复杂地鉴定出与神经纤维缠结形成有关的Ank1高甲基化。此外,颞中回和前额叶皮层显示出对Hoxa3,Rhbdf2和MCF2L等基因的显着高甲基化,这可能会影响神经炎症过程。BIN1在晚期阿尔茨海默氏病中的复杂作用与改变的甲基化模式相关。尽管在研究之间存在差异,但这些发现突出了表观遗传修饰与阿尔茨海默氏病病理学之间的复杂相互作用。未来的研究工作应解决方法论上的差异,结合多样的人群,并考虑环境因素,以揭示阿尔茨海默氏病进展的细微表观遗传景观。关键词:阿尔茨海默氏病; ank1; bin1; DNA甲基化;全基因组的关联研究; Hoxa3; MCF2L; RHBDF2
hal是一个多学科的开放访问档案,用于存款和传播科学研究文件,无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
“更突出的是,我们确定的一半以上的DNA部位具有保护作用,这意味着它们与抑郁症状减轻有关,” Lussier说。“这一结果挑战了传统观点,即逆境引起的生物变化纯粹是有害的。相反,我们的发现表明DNA甲基化也可能是一种弹性的机制,可以帮助某些人更好地应对逆境。”
结果:对大约200万个地点进行了映射和量化,其中大多数位于基因区域(68.8%),在3'UTRS,外显子和2-KB海岸线的CPG群岛中观察到每个位点的5hmc水平升高。IPSC和NSC细胞系之间归一化5HMC计数的配对t检验揭示了NSC中的全球羟基甲基化,并富集了与质膜相关的基因中差异羟基甲基化位点(FDR = 9.1×10-12)和AXON GUIDENCE(FRASESERS和AXON GUIDERES)(FROCESERS)(FROCERS)(FROCERS)(FRASESERS)(FRASESERS),以及其他= 2.1-11×6×6×6×6×6×6×6×6。对于KCNK9基因的转录因子结合位点观察到了最显着的差异(p = 8.8×10-6),编码涉及神经元活性和迁移的钾通道蛋白。蛋白质 - 蛋白质交流(PPI)网络在由具有高度分化的5HMC位点的基因编码的蛋白质之间显示出显着的连通性(P = 3.2×10-10),其中涉及轴突引导和离子跨膜转运的基因,形成了不同的子群体。比较BD病例和未受影响的兄弟姐妹的NSC揭示了分化的其他模式
hal是一个多学科的开放访问档案,用于存款和传播科学研究文件,无论它们是否已发表。这些文件可能来自法国或国外的教学和研究机构,也可能来自公共或私人研究中心。
多能视网膜祖细胞的视网膜细胞命运决定受染色质结构和基因表达的动态变化控制。DNA 胞嘧啶甲基化 (5mC) 受到积极调控,以正确控制基因表达和染色质结构。许多基因在视网膜发育过程中表现出活性 DNA 去甲基化;这个过程需要将 5mC 氧化为 5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC),并由十-十一易位甲基胞嘧啶双加氧酶 (TET) 酶控制。使用一系列等位基因条件性 TET 酶突变体,我们确定 DNA 去甲基化是 NRL 和 NR2E3 表达上游所必需的,以建立视杆细胞命运。使用组织学、行为学、转录组学和碱基对分辨率 DNA 甲基化分析,我们确定抑制活性 DNA 去甲基化会导致整体变化
抽象DNA甲基化是一种表观遗传标记,在真核生物的遗传调节中起重要作用。在解剖调节DNA甲基化的分子途径方面已取得了重大进展。然而,关于进化时间的DNA甲基化变化知之甚少。在这里,我们介绍了丝状蛋白酶神经孢子物种中DNA甲基化和可转座元素(TE)含量变化的研究。,我们以单基碱分辨率生成了全基因组DNA甲基化数据,以及基因组TE含量和基因表达数据,分别代表了五种密切相关的神经孢子物质的10个个体。我们发现甲基化水平较低(范围从1.3%到2.5%),并且以物种特异性的方式在基因组中有所不同。此外,我们发现,超过400 bp的TE是通过DNA甲基化靶向的,在所有基因组中,高甲基化与低GC相关,证实了这组真菌中DNA甲基化与重复诱导点(RIP)突变之间的保守联系。TE含量和DNA甲基化模式均显示出系统发育信号,而Te载荷最高的物种(N. crassa)也表现出每TE的最高甲基化水平。我们的结果表明,DNA甲基化是一种可进化的性状,表明神经孢子的基因组是由TES和宿主防御之间的进化武器塑造的。
Todd M. Everson Baker 14,Nora Farm-Midenez 15:16,17,Barbara Heude 18,Patrice Perron 19,Alsa-Assiah 8:9,玛格丽特21,玛格丽特21,Cargasíñiguez4,22,23,4,22,23 5,38,无玛丽6,37.38和玛丽安娜Todd M. Everson Baker 14,Nora Farm-Midenez 15:16,17,Barbara Heude 18,Patrice Perron 19,Alsa-Assiah 8:9,玛格丽特21,玛格丽特21,Cargasíñiguez4,22,23,4,22,23 5,38,无玛丽6,37.38和玛丽安娜