mfour

NMR结构，一种新型的蛋白质金属蛋白酶抑制剂：对作用机理的见解

emfourin（M4IN）是一种蛋白质的金属蛋白酶抑制剂，该蛋白质抑制剂最近在细菌粒细菌proteamaculans和具有未知作用机理的新型蛋白质蛋白酶抑制剂家族的原型中发现。热蛋白家族的蛋白蛋白样性（PLP）是粉状林样抑制剂在细菌中普遍存在的自然靶标，在古细菌中已知。可用的数据表明PLP参与细菌间相互作用以及与其他生物体的细菌相互作用，并且可能在发病机理中。可以说，emfourin样抑制剂可以通过控制PLP活性来调节细菌发病机理。在这里，我们使用溶液NMR光谱确定了M4IN的3D结构。获得的结构与已知蛋白质结构没有明显的相似性。该结构用于对M4IN - 酶复合物进行建模，并通过小角度X射线散射对复合模型进行了验证。基于模型分析，我们提出了一种抑制剂的分子机制，该机制由位置定向的诱变确认。我们表明，两个在空间上的近距离环路区域对于抑制剂 - 蛋白酶相互作用至关重要。一个区域内天冬氨酸与酶的催化Zn 2+形成酶的配位键，而第二区则携带疏水氨基酸与蛋白酶底物结合位点相互作用。这样的主动位点结构对应于非规范抑制机制。这是Thermolysin家族菌蛋白蛋白质抑制剂的第一个证明，这是依赖于选择性侵害细菌病原体属于该家族的重要因素的抗病剂的新基础的新基础。