(未经同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2025 年 1 月 10 日发布。;https://doi.org/10.1101/2025.01.06.631520 doi:bioRxiv preprint
背景:这项研究旨在研究精神分裂症(SZ)发病机理中涉及的miRNA和上游调节转录因子。方法:使用基因表达综合数据集,基因本体论注释和基因和基因组百科全书(KEGG)途径富集分析的基因表达综合数据集,基因本体学注释和京都百科全书,研究了SZ患者中miRNA和基因的差异表达。进行实时定量聚合酶链反应实验,以验证来自20名SZ患者和20个健康对照组的外周血样本中调节基因的预测筛查。通过接收器操作特征(ROC)曲线分析评估了这些因素中这些因素的诊断潜力。结果:在SZ患者的外周血中,将58个miRNA鉴定为差异表达。miR-26b-5p在SZ患者中表现出明显降低。另外,差异表达了1422个mRNA,包括5个可能调节miR-26b-5p表达的转录因子。在其中,EGR1和STAT1在SZ患者中的表达水平明显较低。接收器的工作特性分析揭示了miR-26b-5p曲线下的面积为0.76,EGR1的0.74为0.74,STAT1的0.82为0.82,STAT1合并的STAT1 -MIR-MIR-26B-5P诊断为0.85。结论:与健康对照组相比,SZ患者外周血中miR-26b-5p,Egr1和STAT1的表达降低表明与SZ有很强的关联。这些分子代表潜在的诊断生物标志物,联合标记STAT1 -MIR-26B-5P可能提供增强的诊断精度。
肾上腺皮质癌(ACC)是一种罕见且侵略性的恶性肿瘤,其特征是诊断挑战,高复发率和预后不良。这项研究探讨了miRNA加工基因在ACC中的作用及其作为诊断和预后生物标志物的潜在作用。我们分析了使用癌症基因组图(TCGA)和基因型 - 型 - 型 - 基因组表达(GTEX)项目的mRNA-SEQ数据,分析了miRNA机械组件(Drosha,DGCR8,XPO5,RAN,DICER,DICER,TARBP2和AGO2)的mRNA表达水平。此外,在科林医学研究所的肿瘤库的组织样品中量化了蛋白质水平。我们的结果表明,与正常的肾上腺皮质和良性肾上腺腺瘤相比,AGO2在所有miRNA加工成分中均表现出明显的过表达(P <0.001)。kaplan – Meier生存分析表明,ACC患者的总体生存率明显较差(HR:7.07,p <0.001)。在TCGA的32种癌症类型中,AGO2的预后意义在ACC中最为突出。这项研究是第一个在ACC中报道AGO2作为诊断和预后生物标志物的潜力,强调了其在ACC发病机理和潜在应用中作为无创液体活检生物标志物的重要性。
摘要背景和目的:心脏功能缺陷会导致心脏中细胞外基质蛋白的过度积聚。本研究旨在使用机器学习算法研究和分析与心脏纤维化有关的 miRNA。方法:从公共来源和相关临床数据库收集与健康个体和心脏纤维化患者中 miRNA 表达相关的数据集。我们选择了 50 人作为研究对象,其中包括 25 名健康对照者和 25 名心脏纤维化患者。采用不同的机器学习算法,包括支持向量机、随机森林和人工神经网络来分析、分类和预测 miRNA 表达变化在心脏纤维化中的作用。通过留一交叉验证和独立数据集对机器学习模型的验证有效地支持了结果的稳健性。报告的准确性、敏感性和特异性指标令人印象深刻。结果:两组间共发现 78 个 miRNA 存在差异表达(调整 P < 0.05),与对照组相比,心脏纤维化组有 47 个 miRNA 上调,31 个 miRNA 下调。比较每种方法选出的前 10 个 miRNA,并确定一组一致的 5 个 miRNA(miR-21-5p、miR-29a-3p、miR-29c-3p、miR-30b-5p 和 miR-133a-3p)作为区分心脏纤维化和对照样本最具参考价值的特征。结果显示,与对照组相比,心脏纤维化患者的 miR-21-5p、miR-29a-3p 和 miR-29c-3p 表达增加。相反,与患者相比,正常受试者中 miR-30b-5p 和 miR-133a-3p 的表达增加。发现具有径向基函数核的 SVM 算法是性能最佳的模型,其准确率为 92%,灵敏度为 88%,特异性为 96%,受试者工作特征曲线下面积 (AUC-ROC) 为 0.95。结论:总体而言,对患者体内 miRNA 的评估可作为监测患者和应用治疗策略的生物标志物。关键词:miRNA、心脏纤维化、机器学习、网络分析、生物标志物资金:无*本作品已根据 CC BY-NC-SA 许可发表。版权所有 © 作者引用本文为:Amin A、Rashki Ghalehnoo S、Mohajerian A、Samadi P、Torabahmadi A、Ahadi S、Hasanvand A、Nikdoust F。评估与心脏纤维化有关的 miRNA:基于机器学习的方法。伊朗红新月会医学杂志。2024,54.1-10。
基于微小 RNA (miRNA) 的疗法对癌症治疗大有希望,但表达多变性、脱靶效应和临床效果有限等挑战已导致许多临床试验退出。本综述通过研究 miR-21、miR-34 和 miR-155 探讨了基于 miRNA 的疗法所面临的挫折,强调了它们的功能复杂性、脱靶效应以及有效提供这些疗法的挑战。此外,它还强调了为克服这些挑战而在递送方法、联合疗法和个性化治疗方法方面取得的最新进展。本综述强调了涉及 miRNA 的复杂分子网络,特别是它们与其他非编码 RNA(例如长链非编码 RNA (lncRNA) 和环状 RNA (circRNA))的相互作用,强调了 miRNA 在癌症生物学和治疗策略中的关键作用。通过解决这些障碍,本综述旨在引导未来的研究利用 miRNA 疗法的潜力有效靶向癌症途径,增强抗肿瘤反应,并最终改善精准癌症治疗的患者预后。
约为15–20%。与激素受体和HER2阳性BC相比,TNBC具有高度侵入性的临床过程,具有较早的发作年龄,更明显的转移性潜力,较差的临床预后,更高的复发率和较低的存活率(1,2)。传统的TNBC治疗主要包括辅助治疗,外科治疗和放射疗法。辅助治疗是癌症治疗的关键策略,可以避免转移的风险以及伴有快速进展和肿瘤复发的风险。但是,化学抗性是癌症辅助治疗的主要问题,在转移性癌症治疗中的失败率高达90%(3)。此外,由于其特殊的分子表型,TNBC对内分泌治疗或分子靶向疗法不敏感。因此,全身化疗仍然是治疗的主要手段,但是常规的术后辅助放疗和化学疗法的疗效较差,残留转移最终会导致肿瘤复发和更多副作用(4)。但是,没有针对TNBC的靶向治疗策略。全身化疗仍然是治疗的主要方法,化学疗法的治疗作用通常会持续很短的时间,从而导致TNBC的治疗是临床挑战(4)。因此,开发更有效的治疗策略对于TNBC的治疗具有重要意义。越来越多的证据表明炎症有助于肿瘤的发生。炎症细胞可以促进肿瘤形成,释放生存因子,促进血管生成和淋巴管生成,刺激DNA损伤,重塑细胞外基质以促进侵袭,涂上肿瘤细胞,提供通过淋巴管和毛细管传播细胞的受体,并避免宿主防御机制(5)。Toll样受体4(TLR4)是免疫细胞表面上的必需受体之一,通常在肿瘤细胞中表达,并参与BC的进展,侵袭和耐药性(6,7)。TLR4在接收肿瘤抗原信息后激活髓样分化因子88(MYD88),促进核因子κB(NF-κB)的核转移,并激活基因转录,诱导炎性细胞因子的产生并引起炎症反应(8,9)。根据研究报告,NF-κB途径可能是TNBC进展的关键调节剂(10),可以通过促进包括细胞因子,趋化因子,趋化因子,细胞粘附分子和
子宫接受性对于胚胎植入和成功怀孕至关重要。由于子宫接受性受损而导致的植入失败是导致不孕的重要原因,但目前尚无检测方法可以识别子宫内膜引起的不孕症。在这项研究中,我们证明了在接受期,不孕女性的子宫上皮中 microRNA - 124 - 3p 异常升高。我们开发了两种模型:一种基因诱导的子宫上皮特异性 microRNA - 124 - 3p 过表达小鼠模型和一种三维人类胚胎滋养外胚层 - 子宫内膜细胞共培养模型。利用这些模型,我们发现小鼠和人类中升高的 microRNA - 124 - 3p 会破坏子宫内膜上皮细胞的粘附和极性,从而阻止子宫上皮过渡到接受状态。这项研究将 microRNA - 124 - 3p 确定为子宫内膜引起的不孕症的诊断和治疗靶点。
摘要:自发现第一个微小RNA(miRNA,miR)以来,人们对miRNA生物学的理解已大大扩展。miRNA参与并被描述为癌症主要特征的主要调节器,包括细胞分化、增殖、存活、细胞周期、侵袭和转移。实验数据表明,可以通过靶向miRNA表达来改变癌症表型,并且由于miRNA充当肿瘤抑制因子或致癌基因(oncomiR),它们已成为有吸引力的工具,更重要的是,成为癌症治疗药物开发的新靶点。通过使用miRNA模拟物或靶向miRNA的分子(即小分子抑制剂,如抗miRS),这些疗法在临床前环境中显示出良好的前景。一些以miRNA为靶向的疗法已扩展到临床开发,例如用于治疗癌症的miRNA-34模拟物。在这里,我们讨论了 miRNA 和其他非编码 RNA 在肿瘤发生和抗药性中的作用,并总结了一些最近成功的系统性递送方法以及 miRNA 作为抗癌药物开发靶标的最新进展。此外,我们还全面概述了临床试验中的模拟物和抑制剂,最后列出了基于 miRNA 的临床试验。
5 Van Zundert B. Neurosci Lett 2017; 636:32-9; 6 Bravo-Hernandez M. Nat Med 2020; 26:118–30。 缩写:ALS:肌萎缩性侧硬化;方差分析:方差分析; ATXN2:ataxin-2; BP:基对; FTD:额颞痴呆; IGV:综合基因组学观众; mRNA:Messenger RNA; mirna:microRNA; PBS:磷酸盐缓冲盐水; NT:核苷酸; NS:不重要; SD:标准偏差; SOD1:超氧化物歧化酶1; WT:野生类型的致谢和披露:这项研究由Aviadobio Ltd. CA,RE,AU,AG,AG,DO,LO,LO,ZW,YB,AA,AA,PH,SC,PC,PC,CM,RJ,JI,JI,JI和CS是Aviadobio Ltd.的员工和股东Aviadobio Ltd.是Aviadobio Ltd.的雇员。 根据国际医学杂志编辑委员会(ICMJE)的建议,作者符合作者身份标准。 医学写作和社论支持由英国Costello Medical的David Morgan和Oliver Palmer,BSC(荣誉),并由Aviadobio Ltd. RJ资助。 CA已从伦敦大学学院和惠康信托基金会获得赠款/合同。5 Van Zundert B. Neurosci Lett 2017; 636:32-9; 6 Bravo-Hernandez M. Nat Med 2020; 26:118–30。缩写:ALS:肌萎缩性侧硬化;方差分析:方差分析; ATXN2:ataxin-2; BP:基对; FTD:额颞痴呆; IGV:综合基因组学观众; mRNA:Messenger RNA; mirna:microRNA; PBS:磷酸盐缓冲盐水; NT:核苷酸; NS:不重要; SD:标准偏差; SOD1:超氧化物歧化酶1; WT:野生类型的致谢和披露:这项研究由Aviadobio Ltd. CA,RE,AU,AG,AG,DO,LO,LO,ZW,YB,AA,AA,PH,SC,PC,PC,CM,RJ,JI,JI,JI和CS是Aviadobio Ltd.的员工和股东Aviadobio Ltd.是Aviadobio Ltd.的雇员。根据国际医学杂志编辑委员会(ICMJE)的建议,作者符合作者身份标准。医学写作和社论支持由英国Costello Medical的David Morgan和Oliver Palmer,BSC(荣誉),并由Aviadobio Ltd. RJ资助。CA已从伦敦大学学院和惠康信托基金会获得赠款/合同。