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预扭转以改善基因组修饰和 miRNA 靶向
作为新的治疗方式，需要精确靶向 DNA 和 RNA 序列的调控工具。PNA（图 1 A、B）[ 1 ] 最初由 Nielsen 等人于 1991 年开发，在靶向疾病相关 DNA 和 RNA 序列方面显示出巨大潜力。PNA 可以与天然 DNA/RNA 序列配对，形成 PNA-DNA 和 PNA-RNA 双链。与具有三个或四个手性中心的 DNA/RNA 糖环部分相比，典型的 PNA 没有环结构或手性中心。相对灵活且电中性的骨架使 PNA 有利于通过 Watson-Crick 碱基配对识别具有平行和反向平行链取向的 DNA/RNA 序列，并具有增强的结合亲和力。此外，PNA 通过三链结构形成识别 DNA 和 RNA 序列（例如，PNA • DNA-PNA、PNA • RNA-PNA、PNA • RNA-RNA 和 PNA • DNA-DNA 三链；此处 - 和 • 分别表示 Watson-Crick 和 Hoogsteen 对）。通常，PNA 与蛋白质没有显著结合，因此无免疫原性，并且对蛋白酶和核酸酶具有抗性。
miR-15b-5p对心脏代谢的编程，这是一种在缺血 - 重新灌注损伤之后在心脏外囊泡中释放的miRNA
目的：我们研究了miRNA在母体肥胖症中的潜在参与心血管疾病CVD的发展。方法：在赫尔辛基出生队列（具有已知母体体重指数）的个体中测量血清miRNA，并使用小鼠模型来确定孕妇在怀孕期间孕产妇肥胖的致病作用，而再灌注 - 再生灌注对Offspring Cardiac miRNA的表达和释放。结果：MiR-15b-5p水平在BMI较高的母亲和肥胖大坝出生的成年小鼠心脏的雄性血清中升高。在灌注小鼠心脏的前体内模型中，我们证明了心脏组织释放miR-15b-5p，并且一些释放的miR-15b-5p包含在小细胞外囊泡（EV）中。我们还证明，缺血/再灌注后暴露于孕产妇肥胖的心脏释放更高。miR-15b-5p在体外的过表达导致线粒体膜的稳定性丧失，并抑制心肌细胞中脂肪酸氧化。结论：这些发现表明，暴露于子宫内代谢环境后心脏代谢的失调中，miR-15-b可以发挥机械作用，并且在缺血性损害后其在心脏电动汽车中释放可能是导致编织心脏和外围性心脏之间的中间通信的新因素。2024由Elsevier GmbH出版。这是CC BY-NC-ND许可证（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）下的开放访问文章。
miRNA在儿童心血管疾病中的作用 -
摘要：患有心血管疾病（CVD）的儿童数量在全球范围内增加。因此，迫切需要更好地了解与CVD的发病机理有关的遗传因素和分子机制，以制定未来的新预防和治疗策略。microRNA（miRNA）构成一类小的非编码RNA片段，长度为17至25个核苷酸，在调节基因表达中起着至关重要的作用，控制了细胞寿命的丰富性，例如增殖，分化和凋亡等生物学方面，从而影响了免疫反应，从而影响了免疫反应，会影响免疫反应，会影响免疫的生长，衰减，衰老。近年来，miRNA作为诊断标记的概念允许健康个体歧视和受CVD影响的人的歧视，进入了学术辩论的范围。在这篇综述中，我们旨在系统化有关儿童心律不齐，心肌病，心肌炎和先天性心脏病相关的有关miRNA的可用信息。我们专注于受那些miRNA影响的靶向基因和代谢途径，最后试图确定miRNA作为CVD的新生物标志物的未来。
通过通路富集分析和中心基因-miRNA 网络揭示多囊卵巢综合征 (PCOS) 中的关键生物标志物和治疗药物
背景：多囊卵巢综合征 (PCOS) 影响着全球育龄妇女，发病率为 5% - 26%。越来越多的证据表明，微小 RNA (miRNA) 在 PCOS 的颗粒细胞 (GC) 病理生理中发挥着重要作用。目的：本研究的目的是通过分析三个不同的微阵列数据集，确定枢纽基因-miRNA 网络中差异表达最显著的 miRNA (DE-miRNA) 及其相应的靶标，并识别新的 DE-miRNA。此外，还使用生物信息学方法进行了功能富集分析。最后，研究了排名前 5 位的枢纽基因与药物之间的相互作用。方法：使用生物信息学方法，分析了基因表达总集 (GEO) 中的三个 GC 谱，即基因表达总集系列 (GSE)-34526、GSE114419 和 GSE137684。使用 multiMiR R 包预测排名靠前的 DE-miRNA 的靶标，并且仅检索具有验证结果的 miRNA。将“DE-miRNA 预测结果”和“现有组织 DE-mRNA”之间共同的基因指定为差异表达基因 (DEG)。对 DEG 实施了基因本体 (GO) 和通路富集分析。为了识别枢纽基因和枢纽 DE-miRNA，使用 Cytoscape 软件构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络和 miRNA-mRNA 相互作用网络。利用药物-基因相互作用数据库 (DGIdb) 数据库来识别排名靠前的枢纽基因与药物之间的相互作用。结果：从 GSE114419 和 GSE34526 微阵列数据集中检索到的前 20 个 DE-miRNA 中，只有 13 个通过 multiMiR 预测方法具有“验证结果”。在研究的 13 个 DE-miRNA 中，只有 5 个，即 hsa-miR-8085 、 hsa-miR-548w 、 hsa-miR-612 、 hsa-miR-1470 和 hsa-miR-644a，与我们研究中的枢纽基因-miRNA 网络中的 10 个枢纽基因表现出相互作用。除 hsa-miR-612 外，其他 4 个 DE-miRNA，包括 hsa-miR-8085 、 hsa-miR-548w 、 hsa-miR-1470 和 hsa-miR-644a ，都是新发现的，之前尚未在 PCOS 发病机制中报道过。此外，GO 和通路富集分析将京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 中的“致病性大肠杆菌感染”和 FunRich 中的“调节 Rac1 活性”确定为主要通路。药物中心基因相互作用网络确定 ACTB 、 JUN 、 PTEN 、 KRAS 和 MAPK1 是使用治疗药物治疗 PCOS 的潜在靶点。结论：本研究结果可能有助于研究人员发现 PCOS 治疗中的新生物标志物和潜在治疗药物靶点。
液体活检评估循环肿瘤 DNA、miRNA……
简介：液体活检是一种非侵入性方法，通过分析血液或其他体液中的癌症生物标志物来检测癌症并监测治疗反应。脑膜瘤是最常见的原发性中枢神经系统肿瘤，生物标志物在其诊断、预后和治疗监测中起着至关重要的作用。世界卫生组织 (WHO) 根据肿瘤等级和基因的分子改变对脑膜瘤进行分类，例如 NF2、AKT1、TRAF7、SMO、PIK3CA、KLF4、SMARCE1、BAP1、H3K27me3、TERT 启动子和 CDKN2A/B。液体活检，特别是游离 DNA (cfDNA) 分析，已显示出监测脑膜瘤的潜力，因为它可以检测血液中的 ctDNA 释放，不受血脑屏障的影响。还发现，microRNA (miRNA) 在各种癌症（包括脑膜瘤）中失调，具有作为诊断生物标记物的潜力。此外，研究肿瘤微环境中的细胞因子可能有助于建立脑膜瘤的预后或诊断组。
标题：人心力衰竭会改变线粒体和纤维3D结构触发代谢1偏移2
。CC-BY-NC 4.0国际许可证的永久性。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2023年12月16日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2023.12.16.571081 doi：Biorxiv Preprint
在DNA复制期间从模板切换中产生从头miRNA
即使对于具有极为约束的设计的microRNA（miRNA）基因，生成新基因和遗传信息的机制也是鲜为人知的。所有miRNA主要转录物都需要折叠成干循环结构，以产生与结合和拒绝其mRNA靶标结合和倒置的短基因产物（约22 nt）。虽然大量的miRNA基因是古老且高度保守的，但已证明编码完全新颖的miRNA基因的短次级结构以谱系特异性的方式出现。模板切换是一种与DNA复制相关的突变机制，可以在单个事件中引入复杂的变化并为整个发夹结构生成完美的基础配对。在这里我们表明，模板开关突变（TSM）参与了灵长类动物谱系中6,000多个合适的发夹结构的出现，以产生至少18个新的人类miRNA基因，即自从灵长类动物起源以来就已经出现的miRNA的26％。虽然该机制似乎是随机的，但TSM生成的miRNA富含内含子，可以用其宿主基因表达它们。TSM事件的高频提供了进化的原材料。比从从头创建基因创建的其他机制快的速度要快，TSM生成的miRNA可以使遗传信息的近乎静止状态和快速适应不断变化的环境。
circrna-miRNA-mRNA在缺血性心力衰竭患者中失控的网络
1分子心脏病学实验室，IRCCS POLICLINICO SAN DONATO，SAN DONATO MILANESE，20097年意大利米兰； alisia.made@grupposandonato.it（a.m.）; alessia.bibi@grupposandonato.it（a.b.）; santiagonicolas.piella@grupposandonato.it（s.n.p。）; roman.tikhomirov@manchester.ac.uk（R.T.）; Christine.voellenkle@grupposandonato.it（C.V.）; simona.greco@grupposandonato.it（S.G.）2米兰大学生物科学系，20122年米兰，意大利米兰3号奥米奇科学中心COSR，生物信息学实验室，圣拉法尔科学研究所，20132年意大利米兰； garciamanteiga.josemanuel@hsr.it（J.M.G.-M。）; tascini.anna@hsr.it（a.s.t.）4 Universit - Vita-Salute San Raffaele，20132年，米兰，意大利5实验室，ISTITUTI CLINICI SCIENSICI MAUGEI MAUGERI IRCCS，意大利27100 Pavia，意大利； carlo.gaetano@icsmaugeri.it 6心脏病学研究所心力衰竭和移植学系，波兰华沙04-628； przemyslaw.leszek@ikard.pl 7成人心脏外科部，IRCCS Policlinico San Donato，San Donato Milanese，20097年意大利米兰； serenella.castelvecchio@grupposandonato.it（s.c。）; lorenzo.menicanti@grupposandonato.it（l.m.）*信件：fabio.martelli@grupposandonato.it
miRNA-369-3p靶向TCF4调控结肠癌细胞恶性生物学行为的体外研究
结直肠癌(colorectal carcinoma, CRC)是常见的胃肠道恶性肿瘤, 是癌症死亡的第四大原因(1)。近10年来, 尽管在诊断和治疗上取得了很大的进步, 但结肠癌患者的5年生存率仍然仅为50%~65%(2)。目前, 化疗仍然是治疗结直肠癌的主要方法之一(3)。近年来, 随着新型化疗药物、靶向药物的出现以及化疗方案的制定, 结直肠癌的治疗取得了很大的进展, 但仍有大量患者治疗后疗效不佳, 甚至出现复发或转移(4)。研究人员通过探索结肠癌的生物学机制, 发现了许多致癌基因和癌基因, 研究表明某些致癌基因或致癌基因抑制因子表达的改变也可能促使结肠癌的发展。进一步了解结肠癌的发生、发展、迁移和复发机制，寻找新的结肠癌分子标记，将有助于结肠癌的早期诊断和治疗。
通过 pemigatinib 靶向 FGFR 可诱导 G1 期细胞周期停滞、细胞应激和肿瘤抑制 miRNA 的上调
miRNA 调节介导。miRNA 是细胞生物学的重要调节剂，在癌症中经常发生改变。事实上，在我们研究的癌症环境中，许多 miRNA 已被描述为肿瘤抑制因子 [38–40]。已证明 miR-186 和 miR-195 可抑制 NSCLC 癌细胞系和组织样本中的增殖、迁移和侵袭 [41–47]。此外，与 I-II 期 NSCLC 患者相比，肿瘤分级较高且转移较多的 NSCLC 患者的血清 miR-186 水平较高。miR-133b 通常在胃癌中下调，其抑制与更具侵袭性的表型相关 [48–51]。在膀胱癌中，miR-186 和 miR-139 均被描述为相关的肿瘤抑制因子，其下调与侵袭和转移有关 [52, 53]。