图3. A-to-I编辑的hsa-miR-497-5p的靶点分析。(a)编辑的hsa-miR-497-5p(hsa-miR-497 25g)的靶点与PD-PC(BA9)中下调的基因和蛋白质的综合分析。(b)hsa-miR-497 25g在OPA1和VAPB上的互补位点,以及来自这些位点的PAR-CLIP测序读段。(c)PC和PD-PC中hsa-miR-497 25g的丰度比较。(d)-(e)PC和PD-PC(BA9)中OPA1和VAPB的丰度比较。*:P < 0.05;**:校正后的P < 0.05;***:校正后的P < 0.001,分别为DESeq2和limma包。 (f)-(g)PC 样品年龄与 OPA1 和 VAPB 丰度的关系图。另请参阅扩展数据图 7 和 8。
1 广东省分子靶点与临床药理重点实验室,广州医科大学药学院和第五附属医院,广州,中国,2 海南医学院热带转化医学教育部重点实验室,海口,中国,3 广州医科大学广州市儿科研究所/广州市妇女儿童医疗中心,广州,中国,4 香港浸会大学中医学院,香港,中国,5 山西大同大学医学院呼吸与职业病研究所肿瘤协同创新中心,大同,中国,6 特里布万大学应用科学与技术研究中心,尼泊尔基尔蒂布尔,7 海南医学院热带医学与检验学院教育部急救与创伤重点实验室,海口,中国
悬浮细胞:在制备复合物之前,板3-5 x10 5细胞在没有抗生素的0.8 mL无血清培养基中。2。对于每个转染样品,请在无菌微中心管中准备络合物,如下所示:解决方案A:对于6孔板,在125μl无血清的无血清,无抗生素的培养基中,稀释的合成miRNA,每个孔的浓度为42-840 nm。有关其他菜格式,请参阅表1。每个孔中的最终miRNA浓度通常为5–100 nm。