微生物通过固定大气中的氮气和将有机氮矿化为可生物可利用的无机氮(DIN),从而为海洋贡献了生物学上的氮。尽管海洋沿海环境中植物和藻类的浓度很高,为微生物群落提供了充足的栖息地和可靠的资源,但微生物组在宿主微生物氮循环中的作用仍然很熟悉。我们通过将有机氮通过将有机氮转化为无机氮,这是否可以增加水柱的氨化,并改善了宿主获得氮资源的机会,这可以被宿主同化。将东北太平洋的公牛海带(Nereocystis luetkeana)与15 N标记的氨基酸示踪剂一起孵育时,海带组织中积聚了15 N,并且在海水中积累了15 NH 4,在海水中积累,在溶解有机氮的转化为氨基二氮含量。对两个内囊肿群的表面微生物的宏基因组分析表明,与两个位置之间的氨化相关的基因的相对性相似,尽管压力的海带种群具有较低的组织氮和稀疏的微生物组的弹药率更高。沿海大型植物上的微生物群落可能通过使铵可用的代谢来促进其宿主的硝基需求。
图4。含有沙门氏菌和隐孢子虫的临床样品的QPCR结果。c t值,用于分离的核酸,而没有珠子珠子的基本工作流程(没有预处理)。错误条表示标准偏差。
古老的益生菌饮料康普茶(KT)的普及部分原因是其所谓的健康益处,其中包括防止代谢性疾病的保护;但是,这些主张尚未经过严格测试,并且尚不清楚宿主对益生菌的基础机制。在这里,我们建立了一种可再现的方法来维护c。秀丽隐杆线虫专门由康普茶相关的微生物(KTM)组成,它反映了发酵文化中发现的微生物群落。kt微生物可靠地定居KTM喂养的动物的肠道,并赋予正常发育和繁殖力。有趣的是,消耗KTM的动物在总脂质储存和脂质液滴尺寸中显示出明显的减少。我们发现,减少的脂肪积累表型不是由于营养吸收受损而导致的,而是由于宿主的肠道中编程的代谢反应而维持的。ktm消耗触发了核心脂质代谢途径内的广泛转录变化,包括上调在脂肪噬菌期间诱导的一组溶菌丝脂酶基因。升高的溶酶体脂肪酶活性,再加上脂质液滴生物发生的降低,是宿主脂质含量降低所必需的。我们提出,KTM消耗刺激了C中的类似禁食的响应。秀丽隐杆线肠道通过重新启动转录程序来促进脂质利用。我们的结果提供了有关康普茶茶中的益生菌如何改造宿主代谢以及这种流行饮料如何影响人类新陈代谢的机械见解。
1犹他州立大学生物学系,犹他州洛根,84321-5305,美国,2 IBBR CNR - 生物科学与生物学研究所 - 通过UGO LA MALFA 153,90146 PALERMO,意大利,意大利,意大利,3个Agronomy,动物,食品,自然资源和环境,di di di di di di di di di di di di di di di di di di。 35020 Legnaro,意大利帕多瓦,4 Umr Ecophyoologie et g Inmique fonctionnelle de la Vigne,波尔多大学,波尔多大学,Inrae,波尔多科学,210 Chemin de Leyssottes,338882 Chemin de Leyssottes,338882 Villenave D'Ornon,France,France,France,France,France,France 5米兰大学Biosciences,通过Celoria,20133年2月26日意大利米兰,7 Max Planck分子植物生理学研究所,Potsdam-Golm 14476,德国和8号生物学系,U.Bassi 58B,35131 Padova,Ital Italy a degli studi dii di dii di dii dii dii dii dii dii dii dii dii dii dii dii divip。
1 Department of Biology, Utah State University, Logan, Utah 84321-5305, USA, 2 IBBR CNR – Institute of Biosciences and Bioresources, via Ugo La Malfa 153, 90146 Palermo, Italy, 3 Department of Agronomy, Animals, Food, Natural Resources, and Environment, University of Padova, Viale dell'Universita 16, 35020 Legnaro, Padua, Italy, 4 UMR Ecophysiologie et G enomique Fonctionnelle de la Vigne, University of Bordeaux, INRAE, Bordeaux Science Agro, 210 Chemin de Leyssottes, 33882 Villenave d'Ornon, France, 5 ENSA, Rue Hassan Badi, Belfort, El Harrach 16000, Algeria, 6 Department of Biosciences, University of Milan, via Celoria 26, 20133 Milano, Italy, 7 Max普朗克分子植物生理学研究所,波茨坦-戈尔姆 14476,德国,帕多瓦大学生物系,via U. Bassi 58b,35131 帕多瓦,意大利
抑郁症是当今最普遍的精神障碍之一。在过去的十年中,人们对与抑郁症相关的肠道菌群领域有了很大的关注。大量研究表明肠道菌群与大脑之间的双向通信途径。在这篇综述中,我们广泛详细介绍了肠道菌群(包括乳杆菌嗜酸乳杆菌和双歧杆菌)之间的相关性,以及诸如短链脂肪酸(SCFAS)和5-羟基丙吡啶胺(5-HT)的代谢产物,例如短链脂肪酸(SCFA)。此外,我们还深入研究了微生物组靶向疗法的潜在健康益处,包括益生菌,益生元和合成生物,以减轻抑郁症。最后,我们强调了在系统医学时代采用基于约束的建模框架的重要性,以将代谢组学测量和整合多摩学数据进行情境化。这种方法可以为复杂的代谢宿主 - 微生物群相互作用提供宝贵的见解,从而为潜在的生物标志物,新型药物和抑郁症治疗提供个性化建议。
摘要背景:婴儿肠道微生物组是一个复杂的社区,会影响短期和长期健康。它的组装和组成受诸如喂食类型之类的变量控制。母乳为婴儿提供了重要的人乳寡糖供应(HMO),这是一个宽阔的碳水化合物家族,其中包括中性,诱导和溶解的分子。HMO与婴儿肠道中双歧杆菌物种的过度分泌之间存在正相关,这是由这些物种基因组中存在的多种分子决定因素维持的。婴儿gut相关的双歧杆菌种类通常具有相似的利基市场,并显示出相似的HMO倾向,这表明它们争夺了这些资源。也有强有力的证据表明,HMO衍生分子和双歧杆菌之间的交叉相互作用。
细菌细胞和真菌孢子可以在大气中雾化并悬浮几天,暴露于水的限制,氧化和缺乏营养素。使用比较宏基因组学/metatranscriptomics,我们表明云与20种空气中微生物(包括真菌孢子发芽)的20种代谢功能的激活相关。整个现象反映了通过雨水重新吹干土壤中微生物活性的快速恢复,称为“桦木效应”。云滴中的营养资源不足会导致饥荒,使细胞结构可以减轻。云中微生物的代谢活性恢复可能有利于沉积后的表面侵袭,但在云蒸发后也可能有25次妥协进一步的生存。在任何情况下,云都显示为浮动生物活性水生系统。
1. 引言 小麦 ( Triticum aestivum L.) 是种植最广泛的谷物(与水稻和玉米一起),是世界 40% 人口的主要营养来源 (Asseng 等人,2019 年)。根据国际谷物理事会 (https://www.igc.int/en/default.aspx) 的数据,2021/2022 年小麦产量为 7.81 亿吨(约 2.2 亿公顷),占世界谷物产量的 30%。全球近 70% 的小麦产量用于食用,其他用于动物饲料和工业加工。小麦粒提供全球总膳食热量的 20% 和蛋白质的 25%。由于预计到 2050 年世界人口将超过 100 亿(https://www.fao.org/home/en),全球对小麦的需求将需要增加约 70% 才能确保满足人类的营养需求(Di Benedetto 等人,2017 年;Zhang 等人,2018 年;Zandalinas 等人,2021 年)。然而,干旱及其与除草剂的结合等主要非生物胁迫导致的粮食产量/质量损失对农业造成了重大损害,