XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search Systemmicrobial
解锁微生物生态毒理学的秘密 - HAL
1 BRGM，F-45071Orléans，法国2 Perpignan University via domitia，生物应用程序，生物应用程序 - 环境分析，法国Perpignan，3劳动生物多样性和微生物生物技术学的工资Emmah Inrae/au -Swift Team，228，路线Del'Aérodrome，84914 Avignon Cedex 9，法国5，54000 NANCH，France 6 Marbec，Marbec 6 Marbec，Univ Montpellier，cnrs，cnrs，ifremer，ifrem，ird，ippa uppa uppa uppa uppa u de de timition，u fpre，us efpa use，us e2 Pau, France 8 Agricultur Eislife, Gembloux Agr O-Bio Tec H (Liege Univ Ersity), p Assa Ge des Deportées 2, 5030 Gembloux, Belgium 9 Hydr Osciences Montpellier, Univ ersité de Montpellier, CNRS, IRD, Montpellier, France 10 Institute Agro Dijon, Inrae, University of Burgundy Bourgogne Franche-Comté, Agroecologie, 21065 Dijon, France 11 IGE, UMR 5001, Univ ersité Gr Enoble Alpes, CNRS, G-INP, INRAE, IRD Grenoble, France 12 Inrae, Ur EABX, F33612 CESTAS CEDEX, France 13 University of Perpignan via Domitia, CEFREM, F-66860 Perpignan 14 CNRS, CEFREM, UMR5110, F-66860 Perpignan, France 15 Inrae, Ur Riverly, Villeurbanne, France 16 University of Lyon, University Claude Bernard Lyon 1, CNRS, UMR 5557, Microbial Ecology, Villeurbanne, France 17 GMGM, UMR 7156 University of Strasbourg-CNRS，作者。BRGM，3 AV Claude Guillemin，45060，OrléansCedex02，法国。电子邮件：j.hellal@brgm.fr†微生物生态毒理学生态毒素 - 内部网络； https：//ecotoxicomic.org，fr ance。编辑器：[Marcus Horn]
对Avène热泉水的深入研究显示出一种罕见且稳定的微生物社区
地球上的生命取决于微观连接。很长一段时间以来，我们对微生物世界的理解与疾病和食物应用有关。可能是因为它们是看不见的，除非影响人类的生活，否则不会认真考虑微生物。在20世纪末，分子和遗传工具的出现揭示了微生物世界的新型视野，揭示了在所有生态系统中微生物的普遍性和世界性分布，包括最极端的自然环境，以及包括较高生物体在内的较高生物体，包括人类在内的1,2。它们的高浓度和与广泛功能能力相关的大量多样性使他们成为我们星球上的重要参与者。他们提供了三分之二的氧气活生物体呼吸，并且在所有元素的回收中起着至关重要的作用。微生物还通过促进消化，产生维生素K，促进免疫系统的发展以及对有害化学物质的排毒3来使人类健康和福祉受益。3。作为它们生产的无数分子以生存或繁殖的非常有效的化学厂，它们也是用于工业，生物技术或治疗应用的创新生物活性分子的来源，包括对皮肤疾病的治疗4,5。
微生物社区的合作增长是多稳定性的驱动力
微生物群落通常在相同的外部条件下表现出多个可能的稳定组成。在人类微生物组中，物种组成和丰度的持续变化与健康和疾病状态有关，但是这些替代稳定状态的驱动因素尚不清楚。在这里，我们在实验上证明了一个由六个与呼吸道相关的物种组成的跨王国群落显示出四个替代稳定状态，每个状态均由不同的物种主导。在成对的共培养中，我们观察到物种对之间的广泛双重性，为整个社区的多稳定性提供了自然的起源。与双重性与对抗之间的共同关联相反，实验揭示了社区成员之间和之间的许多积极相互作用。我们发现多个物种表现出合作的增长，并且建模预测，这可能会推动社区内观察到的多稳定性以及非典型的成对结果。生化筛查表明，glu污染物可以降低或消除几种物种的增长的合作性，并且我们确认这种补充可降低对整个成对的生态性的程度，并降低整个社区中的多匹配性。我们的发现提供了一种机械解释，说明合作增长而不是竞争相互作用如何在微生物群落中构成多种性能。
使用Musa paradisiaca和柑橘Sinensis epeel提取物对生物合成的纳米层的抗菌活性
这项研究的目的是评估从香蕉（Musa paradisiaca L.）和甜橙（柑橘Sinensis l.）果皮中的水提取物中生物合成的银纳米颗粒（AGNPS）生物合成的抗菌活性。使用特定量的香蕉和橙皮提取物以及Agno 3作为前体，成功地将Agnps成功地生物合成。AGNP溶液中明显的颜色变化，在24小时后从黄色转移到深棕色，是AGNP形成的初始指标。uv-vis分光光度计和粉末XRD吸收光谱均用于香蕉皮 - agnps（bpagnps）和橙皮 - agnps（opagnps）均表现出明显的峰，证实了AGNP的存在。此外，FTIR光谱表明存在有助于AGNP合成的酚类化合物。sem和DLS分析表明，两种类型的AGNP的球形均为球形，平均粒径小于100 nm。此外，发现在这项研究中检查的香蕉，橙色和木瓜的果实样品被塞里芽孢杆菌，金黄色葡萄球菌，大肠杆菌和烟曲霉污染，它们使用MALDI-TOF MS进行了分离和鉴定。这项研究还确定了尼日尔，A。Alterata，P。digitatum和F. oxysporum的感染是该地区水果变质的主要因素。均表现出显着的抗菌活性，尤其是针对土壤传播的病原体。A。faecalis和M. morganii（以30 µg/ml的抗氯霉素抗性），以及某些水果变质真菌，例如digitatum和F. oxysporum和F. oxysporum（对2％酮酮的抵抗），以前曾经在研究过，以前曾经研究过，以前曾经在研究过。均表现出显着的抗菌活性，尤其是针对土壤传播的病原体。A。faecalis和M. morganii（以30 µg/ml的抗氯霉素抗性），以及某些水果变质真菌，例如digitatum和F. oxysporum和F. oxysporum（对2％酮酮的抵抗），以前曾经在研究过，以前曾经研究过，以前曾经在研究过。因此，生物型AGNP显示出有效的抗菌剂在医疗环境中应用以及保存食品质量和安全性。
土壤微生物群落对消化应用的短期反应取决于消化和土壤类型的特征
F. Vautrin，P。Piveteau，M。Cannavacciuolo，P。Barre，C。Chauvin等。土壤微生物群落对消化施用的短期反应取决于消化和土壤类型的特征。应用土壤生态学，2024，193，pp.Art。105105。10.1016/j.apsoil.2023.105105。hal- 04266661
在铜绿假单胞菌菌群中抗菌抗性的降低，铜绿菌菌血症之后的抗菌血症是199大流行病的：一项纵向观察性研究
在研究期间，观察到333例患者的总共493例PA菌血症实例。MDRPA的比例从21％（62/291）前流行降至9％（19/202）后p，调整后或0.38，95％CI 0.18-0.79，p = 0.01）。在最初的非MDRPA菌血症初期住院期间，MDRPA的发生很少见，不太可能比两周后发生。抗菌消耗模式在大流行开始后发生了变化，随着amikacin和ciprofloxacin的使用降低，头孢酸和美皮烯类的使用增加。MDRPA菌血症患者的总体不尸体死亡率仍然很高（28％），大流行前后没有实质性差异（调整后危险比1.57，95％CI 0.43-5.67，p = 0.49）。
垃圾微生物对气候变化的反应
地中海盆地预计将被认为是气候变化的热点。在这里，我们使用了地中海的气候对比，以模仿气候变化对垃圾微生物群落的影响。单特异性（Pinus halepensis and Pistacia lentiscus）和垃圾（Pinus/Pistacia，50/50）的二元混合物的垃圾袋在法国和阿尔及利亚之间的对比气候上转移（从亚果和阿尔及利亚之间的对比气候中）。我们测试了垃圾类型（物种身份，混合垫料）和环境环境（海岸/内陆）对更限制气候条件的微生物反应的影响。在田间孵育12个月后，垃圾化学特性（C/N和固态13 C NMR）和微生物标记（活性微生物生物量（MB），基础呼吸（BR），细菌分解代谢和遗传结构（生物学和T-RFLP）表征。>。在田间孵育12个月后，垃圾化学特性（C/N和固态13 C NMR）和微生物标记（活性微生物生物量（MB），基础呼吸（BR），细菌分解代谢和遗传结构（生物学和T-RFLP）表征。转移后，分解代谢和遗传结构与法国和阿尔及利亚控制的分解代谢和遗传结构不同，并且反应取决于上下文和垃圾类型：在内陆环境中观察到更强的修饰，除了小保障小动物的微生物群落（弱变量）。但是，对于这种垃圾类型的转移，MB和BR降低了。另一方面，对于内陆或沿海环境，松弛垫的MB随着转移的响应而没有变化，而BR会在维持生物量和通过呼吸限制C损失方面反映微生物性能。这项研究表明，对气候变化的微生物反应随垃圾类型以及环境心理环境而异。在这里，垃圾混合物没有减轻气候压力对内陆和沿海环境中微生物群落的影响：在内陆环境中转移后转移后检测到较低的MB和BR，而较低的MB伴随着沿海环境中较高的BR，反映了CO 2释放的微生物生物量较弱的CO 2的增加。
超越生长：非生长生长代谢对微生物碳持续效率的重要性
土壤中的微生物碳使用效率（CUE）捕获碳（c）在微生物代谢物的合成代谢生物合成和分解代谢C排放之间进行分配（即呼吸c废物）。使用C进行生物合成，为土壤中微生物代谢残基的积累提供了潜力。在C循环中被认为是至关重要的控制，在大多数土壤C模型中实现了微生物提示。由于模型对提示的高灵敏度，可靠的土壤C投影需要准确的提示定量。提示的当前测量值忽略微生物非生长代谢产物，例如细胞外聚合物（EPS）或外酶，尽管它们仍然保留在土壤中，并且可能在定量上很重要。在这里，我们强调说，无视非增长的代谢可能会导致严重低估提示。基于两个案例研究，我们证明，忽视外酶和EPS的产生分别低估了100％以上和30％的提示。通过将这些特异性值纳入模型模拟中，我们观察到该模型在64年内投影了34％的SOC库存，当时考虑了非增长代谢物用于估算提示，强调了准确的提示量化的至关重要的重要性。我们在这里概述的考虑因素挑战了目前如何测量提示的方式，我们建议对非生长代谢产物定量的改进进行改进。根据当前关于土壤C稳定机制的讨论，我们呼吁努力在土壤中打开“黑框”微生物生理的“黑匣子”，并在提示测量中纳入所有定量重要的C用途。研究工作应以（i）捕获微生物C使用的多种tude来提高提示估计，（ii）改进技术以量化土壤中的非增长代谢产物，以及（iii）对动态代谢C在不同环境条件下的使用和随着时间的推移以及随着时间的流逝以及随着时间的流逝提供了理解。
在热带和亚热带全球海洋中的跨层区域跨微生物网络
微生物相互作用对于维持海洋生态系统功能至关重要，但是它们的动态性质和复杂性在很大程度上尚未探索。在这里，我们使用关联网络来研究古细菌，细菌和picoeukaryotes之间在热带和亚热带全球海洋的不同深度和地理区域中的生态相互作用。我们的发现表明，潜在的微生物相互作用随深度和地理规模而变化，表现出高度异质的分布。有几种潜在的相互作用是全球性的，这意味着它们发生在相同深度的区域，而11-36％的区域是特定深度的区域。巴基流动带的全球关联比例最低，区域关联随深度的增加。此外，我们观察到，尽管微生物垂直分散，大多数地表水关联并不持续在更深的海洋层中。我们的工作有助于更深入地了解热带和亚热带全球互动，这对于应对全球变化带来的挑战至关重要。
估计与从大麻茎中恢复DNA有关的偏差，以进行微生物群落研究
摘要工业大麻植物大麻是纺织品和生物复合材料应用的植物纤维的来源。收获后，植物的茎被布置在地面上，并由自然存在于土壤和茎上的微生物（细菌和真菌）定植。通过产生降解植物壁聚合物的水解酶，将纤维束结合在一起的自然水泥被去除，从而促进其解离（递减过程），这是生产高性能纤维所必需的。要研究屈曲微生物群落的时间动力学（密度水平，多样性和结构），必须从茎中提取基因组DNA的可靠方案。然而，尽管对最终结果的重要性至关重要，但对核酸提取的方法学方面的关注很少。选择了三个方案并测试了三个方案：商业套件（用于土壤的FastDNA™自旋套件），GNS-GII程序和Genosol平台的自定义程序。在土壤和两种不同的大麻茎上进行了比较分析。通过评估提取的DNA的数量和质量以及细菌和真菌种群的丰度和分类法来衡量每种方法的效率。与其他两个方案相比，Genosol方案在基因组DNA的数量和质量方面提供了有趣的产量。然而，两种提取程序（FastDNA™旋转试剂盒和Genosol方案）之间微生物多样性中没有观察到重大差异。基于这些结果，FastDNA™自旋试剂盒或Genosol程序似乎适用于研究重度过程的细菌和真菌群落。应注意的是，这项工作已经证明了评估与大麻茎中DNA恢复相关的偏见的重要性。